EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
SC007-00001 
Organism
Saccharomyces cerevisiae 
Tissue/cell
Yeast_cell 
Coordinate
chrI:45-755 
TF binding sites/motifs
Number: 140             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ABF1MA0265.1chrI:530-545CATCATTATGCACGG-5.22
ADR1MA0268.1chrI:137-143CTCCAC+3.01
ADR1MA0268.1chrI:736-742CCCCAC+3.75
AFT2MA0270.1chrI:349-356ACACACG+3.15
AFT2MA0270.1chrI:396-403TCACCCT+3.19
AFT2MA0270.1chrI:80-87ACAGCCC+3.28
AFT2MA0270.1chrI:45-52ACACCCA+3.81
ARR1MA0274.1chrI:702-709TTTATAT-3.05
BAS1MA0278.1chrI:87-107TAATCTAACCCTGGCCAACC-4.07
CAD1MA0279.1chrI:327-336CTAACAAAT-3.15
CBF1MA0281.1chrI:352-359CACGTGC-3.96
CBF1MA0281.1chrI:352-359CACGTGC+4.01
CEP3MA0282.1chrI:172-179CTCCGAA-3.14
CIN5MA0284.1chrI:88-97AATCTAACC+3.36
CIN5MA0284.1chrI:712-721CTTATGTCA-3.38
CRZ1MA0285.1chrI:80-88ACAGCCCT+3
CST6MA0286.1chrI:663-671TACGTTAT-3.05
CST6MA0286.1chrI:419-427TTACGTAC+3.16
CST6MA0286.1chrI:714-722TATGTCAA-3.31
CUP2MA0287.1chrI:300-310TGTTCTTCTA-3.38
CUP9MA0288.1chrI:713-721TTATGTCA-3.27
FKH2MA0297.1chrI:357-363GCTTAC-3.23
FZF1MA0298.1chrI:328-333TAACA+3.06
FZF1MA0298.1chrI:65-70TAACA+3.06
FZF1MA0298.1chrI:76-81TAACA+3.06
GCR1MA0304.1chrI:475-482GATTCCA-3.37
GIS1MA0306.1chrI:652-660CCCTTAAT+3.13
GZF3MA0309.1chrI:609-616GATATCT+3.01
GZF3MA0309.1chrI:609-616GATATCT-3.02
HAC1MA0310.1chrI:353-360ACGTGCT-3.08
HAC1MA0310.1chrI:351-358ACACGTG+3.64
HAP2MA0313.1chrI:101-105CCAA-3.06
HCM1MA0317.1chrI:341-348TAAATAA+3.06
HMRA1MA0327.1chrI:681-687CACCAT+3.1
HMRA2MA0318.1chrI:658-665ATACATA-3.07
IME1MA0320.1chrI:625-632TCGGCGG-4.28
IME1MA0320.1chrI:553-560TCAGCGG-4.37
INO2MA0321.1chrI:383-391CCACATGC-4.26
LYS14MA0325.1chrI:476-483ATTCCAC-3.04
MATALPHA2MA0328.2chrI:345-352TAACACA-3.05
MATALPHA2MA0328.2chrI:658-665ATACATA-3.27
MET28MA0332.1chrI:213-218CACCG-3.04
MET28MA0332.1chrI:245-250CACTG-3.23
MET28MA0332.1chrI:552-557CTCAG-3.23
MET31MA0333.1chrI:249-257GCCACTTA-3.27
MET32MA0334.1chrI:599-605TCCACA+3.07
MET32MA0334.1chrI:737-743CCCACA+3.17
MET32MA0334.1chrI:382-388ACCACA+3.34
MET32MA0334.1chrI:48-54CCCACA+3
MET4MA0335.1chrI:213-220CACCGTT-3.7
MET4MA0335.1chrI:601-608CACATTT-3.92
MGA1MA0336.1chrI:294-314CCATACTGTTCTTCTACCCA-3.38
MIG1MA0337.1chrI:736-742CCCCAC+3.4
MIG2MA0338.1chrI:737-743CCCACA+3.85
MIG3MA0339.1chrI:737-743CCCACA+3.85
NCU00019MA0929.1chrI:338-349TCGTAAATAAC+4.1
NHP6AMA0345.1chrI:697-717CTCCATTTATATACACTTAT+3.03
NHP6BMA0346.1chrI:652-671CCCTTAATACATACGTTAT-3.37
NHP6BMA0346.1chrI:713-732TTATGTCAATATTACAGAA+3.38
NHP6BMA0346.1chrI:699-718CCATTTATATACACTTATG-3.42
NHP6BMA0346.1chrI:697-716CTCCATTTATATACACTTA+3
NSI1MA0421.1chrI:146-155TTACCCTGT+3.49
NSI1MA0421.1chrI:128-137TTACCCTGC+3.58
OAF1MA0348.1chrI:170-178CACTCCGA-3.11
OPI1MA0349.1chrI:176-182GAACCA+3.85
PHD1MA0355.1chrI:536-545TATGCACGG-3.19
PHO4MA0357.1chrI:384-391CACATGC+3.63
PHO4MA0357.1chrI:384-391CACATGC-3.63
PHO4MA0357.1chrI:352-359CACGTGC+4.19
PHO4MA0357.1chrI:352-359CACGTGC-4.19
RAP1MA0359.1chrI:154-163TCCCATTCA+3.08
RAP1MA0359.1chrI:51-60ACACACACA+3.49
RAP1MA0359.1chrI:53-62ACACACACA+3.49
RAP1MA0359.1chrI:61-70ATCCTAACA+3.51
RAP1MA0359.1chrI:162-171AACCATACC+3.54
RAP1MA0359.1chrI:47-56ACCCACACA+5.2
RDS1MA0361.1chrI:626-632CGGCGG-3.37
RDS2MA0362.1chrI:173-179TCCGAA-3.06
REB1MA0363.1chrI:92-100TAACCCTG+3.03
REB1MA0363.1chrI:229-237TTACCCAT+3.17
REB1MA0363.1chrI:254-262TTACCCTA+3.97
REB1MA0363.1chrI:359-367TTACCCTA+3.97
REB1MA0363.1chrI:461-469TTACCCTA+3.97
REB1MA0363.1chrI:118-126TTACCCTC+4.01
REB1MA0363.1chrI:265-273TTACCCTA+4.13
REB1MA0363.1chrI:218-226TTACCCTC+4.49
REB1MA0363.1chrI:128-136TTACCCTG+4.79
REB1MA0363.1chrI:146-154TTACCCTG+5.21
RFX1MA0365.1chrI:145-152GTTACCC+3.16
RFX1MA0365.1chrI:217-224GTTACCC+3.16
RPH1MA0372.1chrI:83-90GCCCTAA+3.05
RPH1MA0372.1chrI:580-587CCCATAA+3.08
RPN4MA0373.1chrI:249-255GCCACT-3.54
RTG3MA0376.1chrI:346-365AACACACACGTGCTTACCC+3.84
RTG3MA0376.1chrI:346-365AACACACACGTGCTTACCC-4.48
SFL1MA0377.1chrI:297-317TACTGTTCTTCTACCCACCA-4.83
SIP4MA0380.1chrI:173-179TCCGAA+3.58
SKN7MA0381.1chrI:492-497TGGCC-3.44
SKN7MA0381.1chrI:98-103TGGCC-3.79
SKN7MA0381.1chrI:100-105GCCAA+3
SKO1MA0382.1chrI:534-541ATTATGC-3.01
SPT15MA0386.1chrI:605-625TTTTGATATCTATATCTCAT+3.28
SPT15MA0386.1chrI:606-626TTTGATATCTATATCTCATT-3.65
SPT2MA0387.1chrI:723-732ATTACAGAA+3.42
STB4MA0391.1chrI:173-179TCCGAA-3.17
STE12MA0393.1chrI:321-327GAAACG+3.84
STP1MA0394.1chrI:541-548ACGGCAC+3.06
STP2MA0395.1chrI:535-554TTATGCACGGCACTTGCCT-3.67
STP3MA0396.1chrI:324-332ACGCTAAC-3.47
STP4MA0397.1chrI:324-332ACGCTAAC-3.26
SUT2MA0400.1chrI:165-184CATACCACTCCGAACCACC+3.63
SWI5MA0402.1chrI:178-185ACCACCA-3.07
TBF1MA0403.1chrI:94-101ACCCTGG+3.41
TBF1MA0403.1chrI:256-263ACCCTAC+3.42
TBF1MA0403.1chrI:267-274ACCCTAC+3.42
TBF1MA0403.1chrI:361-368ACCCTAC+3.42
TBF1MA0403.1chrI:463-470ACCCTAC+3.42
TBF1MA0403.1chrI:72-79ACCCTAA+3.82
TBF1MA0403.1chrI:83-90GCCCTAA+4.48
TDA9MA0431.1chrI:398-406ACCCTCAC+3.08
TDA9MA0431.1chrI:204-212CCACTCAC+3.15
TDA9MA0431.1chrI:736-744CCCCACAA+3.56
TOS8MA0408.1chrI:716-723TGTCAAT+3.79
TYE7MA0409.1chrI:352-358CACGTG-3.6
TYE7MA0409.1chrI:353-359ACGTGC+3.85
YAP1MA0415.1chrI:414-433TGATTTTACGTACGCACAC-4.01
YAP3MA0416.1chrI:419-426TTACGTA+3.63
YAP7MA0419.1chrI:507-517TGAATCAGTA+3.2
YER130CMA0423.1chrI:83-91GCCCTAAT+3.01
YGR067CMA0425.1chrI:736-749CCCCACAAAAATC+3.37
YHP1MA0426.1chrI:227-232AATTA-3.45
YLL054CMA0429.1chrI:627-633GGCGGT+3.33
YLR278CMA0430.1chrI:171-178ACTCCGA-3.55
YNR063WMA0432.1chrI:171-178ACTCCGA-3.23
YPR022CMA0436.1chrI:243-249CCCACT+3.26
YPR022CMA0436.1chrI:48-54CCCACA+3.3
YPR022CMA0436.1chrI:211-217CCCACC+3.47
YPR022CMA0436.1chrI:310-316CCCACC+3.47
YPR022CMA0436.1chrI:737-743CCCACA+3.93
ZMS1MA0441.1chrI:735-743TCCCCACA+3.84
Enhancer Sequence
ACACCCACAC ACACACATCC TAACACTACC CTAACACAGC CCTAATCTAA CCCTGGCCAA 60
CCTGTCTCTC AACTTACCCT CCATTACCCT GCCTCCACTC GTTACCCTGT CCCATTCAAC 120
CATACCACTC CGAACCACCA TCCATCCCTC TACTTACTAC CACTCACCCA CCGTTACCCT 180
CCAATTACCC ATATCCAACC CACTGCCACT TACCCTACCA TTACCCTACC ATCCACCATG 240
ACCTACTCAC CATACTGTTC TTCTACCCAC CATATTGAAA CGCTAACAAA TGATCGTAAA 300
TAACACACAC GTGCTTACCC TACCACTTTA TACCACCACC ACATGCCATA CTCACCCTCA 360
CTTGTATACT GATTTTACGT ACGCACACGG ATGCTACAGT ATATACCATC TCAAACTTAC 420
CCTACTCTCA GATTCCACTT CACTCCATGG CCCATCTCTC ACTGAATCAG TACCAAATGC 480
ACTCACATCA TTATGCACGG CACTTGCCTC AGCGGTCTAT ACCCTGTGCC ATTTACCCAT 540
AACGCCCATC ATTATCCACA TTTTGATATC TATATCTCAT TCGGCGGTCC CAAATATTGT 600
ATAACTGCCC TTAATACATA CGTTATACCA CTTTTGCACC ATATACTTAC CACTCCATTT 660
ATATACACTT ATGTCAATAT TACAGAAAAA TCCCCACAAA AATCACCTAA 710