EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM153-14978 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Uterus 
Coordinate
chr4:149944400-149946930 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ELK3MA0759.1chr4:149945127-149945137ACCGGAAGTA+6.02
ESR2MA0258.2chr4:149946316-149946331AGGCCTGGCTGACCT-6.25
ETV1MA0761.1chr4:149945127-149945137ACCGGAAGTA+6.02
ETV4MA0764.1chr4:149945127-149945137ACCGGAAGTA+6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:149946155-149946173GGAAGCAAGGAAGAAAAA+6.21
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:149946151-149946169GGGAGGAAGCAAGGAAGA+7.39
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:149946147-149946165GGAAGGGAGGAAGCAAGG+8.52
Foxd3MA0041.1chr4:149945919-149945931GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:149945923-149945935GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:149945927-149945939GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:149945767-149945779AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:149945771-149945783AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:149945775-149945787AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:149945779-149945791AAACAAACAAAC-6.32
Nr2f6MA0677.1chr4:149946325-149946339TGACCTTTAACCTA-6.59
RXRBMA0855.1chr4:149946325-149946339TGACCTTTAACCTA-6.18
RXRGMA0856.1chr4:149946325-149946339TGACCTTTAACCTA-6.42
RxraMA0512.2chr4:149946325-149946339TGACCTTTAACCTA-6.38
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02749chr4:149942233-149963964HFSCs
mSE_03063chr4:149918354-149972815TACs
mSE_04205chr4:149942596-149944908Cortex
mSE_07265chr4:149941818-149945307Intestine
mSE_07265chr4:149946006-149947491Intestine
mSE_08028chr4:149942108-149945355Kidney
mSE_08028chr4:149945980-149947530Kidney
mSE_09316chr4:149942237-149944782Lung
mSE_11125chr4:149942458-149944843Olfactory_bulb
mSE_11418chr4:149942017-149945314Placenta
mSE_11418chr4:149945989-149947445Placenta
mSE_12123chr4:149941421-149945242Spleen
mSE_12123chr4:149946192-149946733Spleen
Enhancer Sequence
AAACCGTGAG TACAATTGGA CTTTATATAA CTTGGGTTGT TTTTTCCCTT GCTCTGCTCC 60
TGCTGCTTCT TCGAATCTGG GCTTAGGAAA TGGTTCCTTT AACCCCACTC TGTGCCTGAC 120
CCAGGCTGGC CCCGGATTCT TACTTTTCAC TGGTGATTTT AAGATATCAG AGTGACATAT 180
TGTGCTTATC CTTCTGAGGA ACGCCTTGTA ACGGGAAGAA CAGAGTTGGG AGGGGGAGGA 240
TCGCTAGAGA GTTAACATCT AATTTTAAAT CCACTGGCTG AAATGGGAAA TGGCATTTTA 300
TCGCTAGTTT GGATTTGGTA ATTGTCAAAA GTCATCGTCT AAGCCGAAGG ATAGAGCTGA 360
GAGGTTTATG GAACTCTGCT GGGATTTCCC CTCCGTTTGT TTAAATTAAG GTTGTTGTGT 420
TCTAGAGAAA ATTCATTTAA ATCTTTACTC TCTCAGCTTT AAATTTTTTC ACTTTGTAGT 480
GAAAAGGGTT TTTATTAGTT GCTTAATGGG GGCTTTAAAA AAATTCCTTT GCTGTTTCAA 540
AAGCTGAGGG TCAAATGCTG ACCTGACCAT TGCTTTTGAT GAACTTGCTG TGGGAGAGTG 600
TGCGGAGACT TCCTTGGTAG GTGACACTGT AAGGGTACAA GCTCAGTTAC CTGTGGGTGC 660
TTGCCTCCAG GAAGGTGGGG TGGACCACCC ACCTCACCCT GCTGGCAGCC TCCAGTCTGA 720
CCCAGTGACC GGAAGTACCT CCCACCTAGG AGGGGAGGAG GGCTAGGATT GATATTTAGT 780
CTGGCTTTTA GGAAGAGAGG GGTGAATGAA GAATATCCAT TACCAAAGTG ATGGTAGGTT 840
TTCTCAGTTG GTGGTTACTG ATTGCCTCTT GGTGTTTAAT GCTCTTACTT ATTATTAAAA 900
ATGAACAGTT TGTTTCTGGA CTGTAGAACC CTGATAACTG GGGAGAAAGG TTCTGAGATT 960
CCAAGTATAT CCCAGTAAAC AGATTTCTCC AGTTAATGAT AACTAAGTTA AGATTAAATC 1020
ATCATTGTGC ATCTAAATGT GTGGAGATGG GCCACTGAGA GGACTCAAAC TATAGATATT 1080
AAGATATATT GTGGAAACAA CCTGTTTCTT ACTCTTTCCA GAACAGGTTT TGAAGAGACT 1140
TTGTAATGGA GAGCAGAGCA GCAGCAGCGA TGTAAAAACT CTTAAGTGTT CTGAGAATCT 1200
CATATTTTCT AAGTTTGTTA CATACTTTAA TGCTAGGCAG TGGTGTCGCA CACCTTTAAT 1260
CCCAGCACTT GGGAGGCAGA GGCAGGCGGA TTTCTGAGTT TGAGGCCAGC CTGGTCTACA 1320
GAGTGAGTTC CAGGACAGCC AGGGCTACAC AGAGAAACCC TGTCTCTAAA CAAACAAACA 1380
AACAAACAAA CAAAAAACAA AATAAAAAAA GAGTGTCTTG ACTCAAAAGT AGCAGCCTTC 1440
TTTGGGCTGA GTAGAAAAGT CAGTGAGATG TGTCAAGTTG ATAGCTCATT TTTAGCCTAT 1500
CAGCTCAGTT GGTCTTTTTG TTTGTTTGTT TGTTTGTTTT GTTTTTTTTT CTTTTTGTTT 1560
TTTTTGTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTGTTAC TGGTGCTGGG ATTGAGCCCT 1620
TAGCAATTAT CTCAACCCTC CTGCTCTAGA CTCTTATCTG TCTCTTTTAT CTGCTGAAAG 1680
TTGTAAATCG TAAAGATCTG ACAAAAGAAA TCTGGACAAT CTTTTTATCT TGATGCTTTG 1740
TAGGACCGGA AGGGAGGAAG CAAGGAAGAA AAAAGAAAAG TAGTACAATT GAGGATTAAA 1800
CCAAAATCTT AGATGGAGGT GGGGGCTGGG GATGCTGGGA ATCCATCCAG GGTCTTGTGC 1860
TTGCTTAACA ACCTTGGAAA CGCAAGACAG TTTTATTCAG CAGAGTAGCA GAAAGCAGGC 1920
CTGGCTGACC TTTAACCTAG CACAGTGTTC CTTACCTGGT TTCCTAACTA GAAAGTCTGT 1980
CCTAATCCCA CCTGACCCTG GCTGCCCACG TCAGGGTCTG ATTCAGTTAA CTTGTGCCCT 2040
TTCCTGCTGC GGAGCAGCCC TGTCATTCCA GGGATGCTTC CCCTCACCTG CCATGCCTGT 2100
GCCTTCTCTA ACACCGTTCC CTCCCAGTTC CCAGCCGTTT CGTGTGGGCA CAGTCCCTAG 2160
AGTACAGGAA GCAGAGAGGT CTGCAGCCCT GGAGGGCCTC TCCCACTTCT GCTGAGTGTC 2220
ATTAGGTCCC ACTCCCTTCT CCTTGCTTGG GAGGAGTTTG GTAGTTGGGT GAATCTCTTA 2280
ATTGTTCTAG TCAGCTGGGA GAGGCACTTG TCTTATATTT TCCTTAGCTA TCTACCGAGC 2340
CTGGCTAATC ATTACAGACC ACTAAGGGAG GAGGCAAAGG TCACTTCATT CTGTTGCAGA 2400
AGATGAGGGA CTTTGCAGGT ACCAGTGTTC CAGAACTTCC TTGATAAAAA CCTTATGGTT 2460
ATGAAACTTT CTATAGAAAA TTCTTACAAT CTAGATGCTT TGCCACATTT TCTTCTATTG 2520
TATTACGGGC 2530