EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM150-15447 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymus 
Coordinate
chr8:129375860-129377280 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr8:129377229-129377241AAACAAACAAAC-6.32
HNF4GMA0484.1chr8:129376257-129376272TGCCCTTTGGCCTCT-6.13
HOXA13MA0650.2chr8:129375910-129375921ACCAATAAAAC+6.32
IRF1MA0050.2chr8:129376112-129376133AATTTGTTTCACTTTTCCATT+6.27
IRF1MA0050.2chr8:129377217-129377238AAAAAGAAAAAGAAACAAACA-6.57
IRF2MA0051.1chr8:129376111-129376129GAATTTGTTTCACTTTTC-6.22
NFYAMA0060.3chr8:129375986-129375997TCTGATTGGCT-6.32
RREB1MA0073.1chr8:129377260-129377280GGGGTGGGGTGGGGTTGGGG-7.06
SPI1MA0080.4chr8:129376984-129376998CACTTCCTGTTTTT-6.36
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01555chr8:129347495-129453882Th_Cells
mSE_02472chr8:129351918-129414858Macrophage
mSE_03411chr8:129375935-129377263Bone_Marrow
mSE_04318chr8:129376074-129377138Cortex
mSE_06864chr8:129375371-129377263Heart
mSE_07142chr8:129370792-129377557Intestine
mSE_08017chr8:129375644-129377205Kidney
mSE_08552chr8:129375728-129377250Liver
mSE_09029chr8:129375828-129377435Lung
mSE_09437chr8:129371700-129377265MEF
mSE_11183chr8:129376107-129377142Olfactory_bulb
mSE_11598chr8:129375763-129377272Placenta
mSE_12002chr8:129375763-129377418Spleen
mSE_12948chr8:129375645-129377505Thymus
Enhancer Sequence
CCTTGTACTG TAAAAACAGT ATTGAATGTA CACCAGCAGA CACAGTGTGT ACCAATAAAA 60
CTTTATCAAC AACGTATTAT AAACACTCAG TCTAGCTCAG GCAATGTTTG GGCCTGAACC 120
TAAATCTCTG ATTGGCTTCC TTCCCATCAC CTCAGATTCT GCAGATATCA GGGAATGAAC 180
CATCACCGTG TCCCTGCTGC TGTAGATCCA GCCCTCAACT GAGAACAACC AAGGACAAGA 240
AGCACAAGAA AGAATTTGTT TCACTTTTCC ATTAAACATG ATGAGTTCTT TGAATTTCTA 300
ATTGGAAACT TTCACACATC GCTTGAGGTT GCTGCAACTC ACTTCCTGCC ACCCTTTGAC 360
TGTGTATCTT GAGCAAAACT GTGGTAAAGG CCAAGGCTGC CCTTTGGCCT CTGGTGGTTG 420
TCTGGAGTGC ACTGCCCTGA CTCACGGGTA CTCAGACAGC TACTGCAACA TTCTTCACCC 480
CCTTCTCATA AAGCTCTGAC TGCTTTCATA GCCGGGGCCT AAACTAAGAA CTCAAAACCA 540
AACGGAACAC AGCTAGGAAG ACTGCAGCCT TCCCTCCTGT GAGTAGAGAC TATGAACCGA 600
GCAGAAGGAC ACTTACTTGC CCACTTTCTT GTGGGACTCC CCAGAGTTGC TCCCTTCTCC 660
CACAGATCTT CCTGATGAAT CGAGAGGGAA GACAGGGCAG CCTCCTTGGA GCGTCACCCA 720
GCTCCAGTCA GTGGTGTAGA GGCAACTGAG CTAGTCCTCA CACTGAGAGC TATAAGGATA 780
TGAGATATCC TCACCCTGAG GATGTGAGTT CTTCTGTGAT TGGCATTTCT GGATCTTCCC 840
TGAAGAAATC TCACTGAAGT CAGGGCAGCA GCCTCCCTGT GCTGTTGCTC ACACTTAAGC 900
ACTGGGGGCA TCTACAAATG TGCCTCTCTT AGCATCCTCC CAGTGACTCC GGGTCACAGG 960
GAGATGAAGC AGGACCCCGA GGCTCTGCAC TAAGGGCTGC TTTCCTATCA AGGCATATTC 1020
ACATCTCAGA GCTTCCAGGG GACTGCGGCC ACGCATTTCT TCCCTTTTCT TGTTCTATTG 1080
GGATGCTTTT CTCAGCCTTC CCATGGAAAA ATCTCAGAGC AGGCCACTTC CTGTTTTTAT 1140
TTTCTTTTCC TGCCCTTCTG GTGTACCCTT CGACCTTCTG TCCTGTGTCA AGATCCTTGT 1200
CCTGAACTGA GAACTAGGCG CAGGCATGTG TCCCAGCACC GAGTAGCTGG CTCAGCAACT 1260
GGGAAAGGAA AGACCCAGCA TGCCCTGCTC ATTCCTGTCC GCATGCTTGT GGTTAAAGAC 1320
AATGGCTACT TTCAAGCCCT GAGTCACTGC CTCAACTAAA AAGAAAAAGA AACAAACAAA 1380
CAAAAAAAGA GGCCCAGGCG GGGGTGGGGT GGGGTTGGGG 1420