EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM150-12031 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymus 
Coordinate
chr5:66308860-66311420 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr5:66311234-66311253CTTTGCCATCTGGTGGCCA-6.77
IRF1MA0050.2chr5:66309453-66309474AAAAAAAAAGCAAAACCAAAC-6.13
RFX1MA0509.2chr5:66310027-66310043GGTTGCCATGGTTACG-7.47
RFX1MA0509.2chr5:66310027-66310043GGTTGCCATGGTTACG+7.51
RFX2MA0600.2chr5:66310027-66310043GGTTGCCATGGTTACG+7.37
RFX2MA0600.2chr5:66310027-66310043GGTTGCCATGGTTACG-7.41
RFX3MA0798.1chr5:66310027-66310043GGTTGCCATGGTTACG+7.44
RFX3MA0798.1chr5:66310027-66310043GGTTGCCATGGTTACG-7.52
RFX4MA0799.1chr5:66310027-66310043GGTTGCCATGGTTACG+7.87
RFX4MA0799.1chr5:66310027-66310043GGTTGCCATGGTTACG-7.91
RFX5MA0510.2chr5:66310027-66310043GGTTGCCATGGTTACG-6.71
RFX5MA0510.2chr5:66310027-66310043GGTTGCCATGGTTACG+6.75
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01482chr5:66292056-66350147Th_Cells
mSE_12024chr5:66309352-66310073Spleen
mSE_12024chr5:66310099-66311478Spleen
mSE_12821chr5:66309241-66311352Thymus
Enhancer Sequence
ACACACACAC AGACACACAC ACAACATACA CATTCACACA CACAGACACA CACACACATA 60
CACACACACA CACATACACA CACACAACAT ACATACACAC ACTCACAGGA AAATGCTCTG 120
CAGTTTTTGA AATTGATCTA CCTTCAGCGG AGAGGCCATC TATCCACAGA GAGGCATCTG 180
ACTGCAAATA CAGCTACGAA GAAACCGCTC TAGCTCTTCG GTGGAGTCTC TCCTTTTTGA 240
GATTGCTCAA AGTCCCAAGA CTGATCTCAC AACTGTTAAG ATATTTTGTT ATTTTAAAAA 300
CTGAAGCAGG AGCCGGGTGT GGTGGCGCAT GCCTTTAATC CCAGCACTTG GGAGGCAGAG 360
GCAGGTGGAT TTCTGAGTTC GAGGCCAGCC TGGTCTACAA AGTGAGTTCC AGGACAGCCA 420
GAGCTATACA GAGAAATCCT GTCTCGAAAA ACAAAAAACA AACAACAAAA AAACAAAAAC 480
AAAAAAAAAA AAAAACTGAA GCAGGTGTGG CAGAGGCAGA GGGGCAGAGG GGCAGATGGA 540
AAAAGGAGCA AAGTGGACAG GGGCAGAGAG GAAAAGAGGC AGAAAAAAAA AAAAAAAAAA 600
AAGCAAAACC AAACAAACCC ATGAAGCTTT ACCATGAAAT CTGGGGCTGA GCGTTTGACA 660
AAGCTTGTCT GGTGGTCCAG GACTGGAACA GGACTCAGGG ATGTGTAGGG CTCCTATCTC 720
CTACCTCCAC TGCTCATGCC TATTAACAAT GAATGAATTC GTGAGGGGAC GGGGCCAAGG 780
CCAGGTTGCT GGAGACTAAC AACAATGAGA GAGAACTGAA GGAAGAGGAA ACTAGAAGCA 840
GCCTGCCAGA GCCCTCACTC TCTCTTCAGT CTTCTTTTGG GGGCCTGGTT TAGGCTACAG 900
AGGAAGGACA CTTGATCCCT GAAGAATCAG CCCTCATCTG CCTTGAGAGG ACAGGCCCCT 960
GATGATCAGG GATGGAACTC CTACTCTAAC AGGACTGAGT CCCAGCGGGG TGGCAGAAAG 1020
CCTGAGGGAG TGTGGCTGCT TTTAGCACCT TGGGGTGCAG GAGAAGGCTG TCATAGCCTC 1080
TCAGAGAGAA AAAAAAGAGC ACCTCTCCTT CCTGGTTGAT TTAGGCTCAT TTTCAGAATT 1140
GGTCTCTTTA GTAGAGCCCT GGGACTGGGT TGCCATGGTT ACGCTACTTT TAACAGTGAG 1200
GGTAAGTGGC CTCCCTTAGG CCATGGAGCT CTTAGCTACT GATTTCAAAT TTTAATTTCT 1260
CCTCCATGGA GATTGCCCTG TAGAGGGGGA AAAGACACAT GGATAGGTGA GTCCTGGGAG 1320
GAAGGCGAAT TTAATTTGAA AGGGTTTATA CTTTATCCAC AGATCAAGGC AGAAGAGGGA 1380
GGTGGTTCAG AGGGGCCGCA CTTGAGGACA TTTACCTACA CTCCCAGCAC CCAGGGGATG 1440
GAGGCAGGGG ATCACAAGTT TGAGGCCAGC TGAATCTATA TTAAAAGGGG GAGGTTAGGC 1500
TTAGAGTCAC ACAGCTTAGC CTGAATCTTG GCTTTATCAT GTATGACTTG TGTGACCTCA 1560
AGTAGATAGT CTCCTCACAG AAATGGGGAC CCTCACAGTG AGCTCCAGAA GATACTGAAC 1620
TGGAATGGCC CCCCCAGGGA GAACTCCAGG TAGCCTAGGC TAATTAGATT CTTTCTGTCC 1680
TGCTGTTAGC CAAGAGGCCA AAAAATGGAG AAGGTCCCTT TGCTCTTGAT ATCTCTGTTC 1740
TAAGTTACAA AGATGTAGCG GGGGAAGGGA GGCGTGCACC ACTCAAGCAG ACTGTGGTTT 1800
CCACAGTTTC CTGCCTGCTT TGGCTGGCTA CGGTGGCTAC TTCAGTTGTC CTGCCCCCTC 1860
TGACCCAGAC CGACATGAAC GCGCCCCCCC ACCCCCATTC TGTATCCTGT CCAAAGGCCA 1920
GAGCCTCACC CAGGTTTCCG TGAGCTGCCA TCACGGTAGG ATCTTTGTCA TGGCTCTCCG 1980
GCCTCTGTGG GACTGTCTGC CTCGTGGCTT CTCCAGCACA TGTCTCCCTG GTGTGTGCAG 2040
TGCAGTCCCT CTATGGAAAC TAGTTTCTTC TCCTGATTTT CACAGCGGTT TCCTGTATTA 2100
CGGGCTTATT TACATTTTAG ACAGAGCTCA CCACAAGTTA GAAGATGGAG GTTTACAGTG 2160
CAAAAAAGCA AAAATAACAA TCCAGTAGAA ATTACCTTTA TTTTCTGAGA TGTCTGTAGA 2220
AGTTCTGCCA TGGTGTCATC GAAGAGTCCC GCTAAGCTGC TGACCTAACC CTCAGCCCCA 2280
ACGCAGACTC CCAACAGATG CCATGTCTCT GTCTCTCTTT CAGACCAGTG GCGGTTCTCT 2340
CCCATAGCCA ATCAAACATG GTCTTTCCTC TCTGCTTTGC CATCTGGTGG CCATGGCTTT 2400
GTCATGGTCA CACTACAAAC ACAAGGAGCC CATCAGAGAG AGGAGGCAGG GGAGGGCCAG 2460
CTTTCCTCCT CTGGAGGCAG ATGGCTTCCC TTGCTACTCT GCCCATGCAA TCATCCCGAC 2520
TGAGACGGAA CCTGGCAAGT GGAGTCTCTA ACAAGACAGC 2560