EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM150-11409 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymus 
Coordinate
chr4:129235610-129238210 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr4:129237066-129237078GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:129236600-129236612AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:129236604-129236616AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:129236608-129236620AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:129236612-129236624AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:129236938-129236950AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:129236942-129236954AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:129236946-129236958AAACAAACAAAC-6.32
Gfi1bMA0483.1chr4:129238131-129238142AAATCTCAGCA+6.32
Nr5a2MA0505.1chr4:129236312-129236327GCTGGCCTTGAGATC-6.34
PKNOX1MA0782.1chr4:129237597-129237609TGTCACCTGTCA-6.07
PKNOX2MA0783.1chr4:129237597-129237609TGTCACCTGTCA-6.18
TGIF2MA0797.1chr4:129237597-129237609TGTCACCTGTCA-6.02
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01470chr4:129233446-129262849Th_Cells
mSE_12151chr4:129235054-129236484Spleen
mSE_13025chr4:129236805-129237846Thymus
Enhancer Sequence
CCCTCTGAGC CCTCAAGCAC CAAGTTCACA GGAGGCCCAG GCCCAAGGCT AGTCCCACCC 60
TCCCACCTGG GATGGGCAAA CCGCCACAGG CATCTTTGTT AGTCTAGTTA CCCACTTCCT 120
GCCGCCCCAG CTCTGCTAGC CTCCTCCTTT GGGGGACTAC CTGGGAGACA TCACACACAC 180
TTTGCCAAGT TCTGGGGGAA ACCGAGAGTT TCATTCCACC CTCCTCCACC AAGGAGGGTA 240
CCTGTCCCTC TTCATTACAA CTCCCCTGTC TAGCCACCGA AGCTGAGAGG TTCCAGCTCC 300
TTAGAGTCAA CCCTCAGCCT CAGCCCAACC CCAGCACCCC TACCCCCACC ACTCAACCAC 360
AGTCTCCTTC AGAGAGTTTC TTCAAACAGG CTTTTGCTTC TCAGCAGCAG AGAGAAACCT 420
GTTGGCGCGG CCCGGGTGGC TGTGTCTACT TCGGCTCCCT TGCCTGGTTT AGCTGTGGAA 480
ACTTTTTGTC AAATGAAATC AAGCAGAACC TCATAGACAC AGCCAGTAAA GTAGAGTTGC 540
TCTAACCAGG TCAGAGCGAG GCTCCCTCTG TAGCCTCTGG AATTCCCGTG TGTCTCCTTC 600
CTGAGCACTG GTCCTCAATT ATCGGTTTGC CAAGCGAAGA TTAACTTTTA TTTTATTTTA 660
TTTATTTATT TATTTTAGCT AAGGTCTTAC TGCATAGTCT TGGCTGGCCT TGAGATCTGA 720
AACTCACTTT GTAGACCAAG CTGACCTTGA GACCTGAAAT TCATTCTGTA GACCAGGCTG 780
GCCTCAAACC TGCAGAGATG CTCCTGTCTC TGAGTGTTAG ATTTAATAAA GGGGTTCACG 840
ATCATGTTTT TGATGTCAAG AAGACCTATT CCATCTCTCA GTTGTTTAAT CTATTTTGCA 900
ACATACCACA AACACACACA CACACACTCA CACACAGGGC TACCCCACAC ACACGGCTAC 960
AGAGAGAAAC CCTGTCTCAA AAAAAAACCC AAACAAACAA ACAAACAAAC AAACAAAAAG 1020
AGCACTGAGT GCTCTTCCAG AGGTCTTGAG TTCAATTCCC AGCAATCACA TGGTGACTCA 1080
CAACCATCTG TAATGGGATC TGAGACCCTC TTCTGGTGTG TCTGAAGACA GCTACAGTGT 1140
AGTCACATAC ATGAAATAAA TAAAAATAAA TCTTAAAAAA AAAAAAAAGA AGCTGGGTGT 1200
GGTGGCACAG GCCTTTAATC CCAACACTCA GGAGGCAGAG GCAGGCGGAT TTCTGAGTTC 1260
GAGGCCAGCC TGGTCTACAA AGTGAGTTCC AAGACAGCCA AGTCTACACA GAGAAACCCT 1320
GTCTCGAAAA ACAAACAAAC AAACAAACAA GAATTGAAAC TGTGTGTCAC CTGCTCAGAC 1380
GCCTGCAACA CCCATCACTG GGTCCTGGAG ACCAAGCACA GATTCTCCCA CCTACAGAGG 1440
TCTAACCTCT GGTTTTGTTT GTTTGTTTAT GTGTTTATTT TTCAGATAGG GTTTCCATGT 1500
ATTGCCCAGG CTGGTCCAGC ACTCTTGTGT TCAATTAGAC TTTCTGCTCA GCATCTTAGG 1560
TAGCTGGATG CACAGTGTCC TACAGAGCTT TGACTTTTGA TTTTAGACAA TCAAAGCAAG 1620
CCCTGGGGAG GCCCGCCTTG AGCCACACAT TTGCAGTGGA ACAAAACAAG ACTTGCTAAT 1680
TTATGCTGTG TCCAAGTGGA TGTGATAGCA GGGGAGACAT CTGGTTAGCA AAATTCAGAA 1740
GACCCAGCTG AAGAATCTGA AGGCCCTATG CTCAGATATT AGCTGTATTC TAGACGTAGT 1800
CGTGCAGGTA GGTCTGTGGT CCTGGCACTT GGGAGGTAGA GGCTGGATCA AAAGTTCAAG 1860
ATCAGTTCGA GACCAGCCTG GATTCCATGA CATCCTCTCT CAGAAACTCA ATGGATCAAG 1920
AACGAAACCC CTGAAAACAT AATACAGTAA GATAACGCTA GCGTGCCTGA TTTTGTCCAA 1980
ACCTTCTTGT CACCTGTCAC TGAGATTGTC AACTCCTTTT CACCACCCTA CATACGTTAG 2040
TTAGCTCAGT TTACGAGAGT TTGCAAAGGT CCCCACCAGT ACCCTGCAGC TTTACCCACC 2100
CCTGCATGGG ACTGTGAGAA AATGGGACTG GAGAGTAACC CTCTTCAGGC TCACAATCTG 2160
AGCTCGTCAG AGCATCTCAC GGGTCCCGGG ACTTTCAGTG TGCTTTCCTC TTGGGTATTG 2220
GACTTTAAAC AATGTGTACC GATATGGGTG AATAATACAA CATCCATGGA GAAATAAGCC 2280
AAATCAAGAC ACTTCTTCAG AGGGGTTGTG GATATAGCTC AGTGGATAGT GCTTTGCCAA 2340
ATACACTAAG CTTCAAATCT CCAGCACTGA ATAGACTTGG GCTTGATGTG TGCTGCATGC 2400
GGGTAGTTCC AGCACTGGAG TGGAGGCAGG AGGATCAGGA CTTCAAGATT AGTTGGGATA 2460
CAAAGAGACC TTGCCTCAGA AACTTGAAGT GGGGAGGGGG AGACTCAAGA AACGAGTACA 2520
CAAATCTCAG CACTCGGGAG GCAGAGGCAG GAGGATTTCT GAGTTCGAGG CCAGCCTGGT 2580
CTACAGAGTG AGTTCCAGGA 2600