EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM150-03827 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymus 
Coordinate
chr12:88157040-88160490 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr12:88159117-88159135GAAAGAAAGGAGGGAAAG+6.33
MEF2CMA0497.1chr12:88159328-88159343GAGCTAAAAATAACA+6.4
Nr2f6MA0677.1chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.51
Nr5a2MA0505.1chr12:88159712-88159727GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
PKNOX2MA0783.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA-6.02
PLAG1MA0163.1chr12:88159384-88159398CCCCCCAGGGCCCC-7.03
RXRBMA0855.1chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.04
RXRGMA0856.1chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.39
RxraMA0512.2chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.24
SOX10MA0442.2chr12:88157843-88157854AAAACAAAGAC+6.14
TGIF1MA0796.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA-6.04
TGIF1MA0796.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA+6.18
TGIF2MA0797.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA+6.07
TGIF2MA0797.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA-6.44
ZNF263MA0528.1chr12:88159110-88159131GAAGAAGGAAAGAAAGGAGGG+6.75
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00507chr12:88151708-88178129pro-B_Cells
mSE_01277chr12:88127683-88178050Th_Cells
mSE_03860chr12:88156238-88159616Cerebellum
mSE_04026chr12:88156887-88158603Cortex
mSE_04392chr12:88155275-88159353E14.5_Brain
mSE_04811chr12:88156930-88160639E14.5_Heart
mSE_05545chr12:88157021-88158215E14.5_Limb
mSE_06635chr12:88156946-88159646Heart
mSE_08022chr12:88156119-88159455Kidney
mSE_10068chr12:88155514-88159197Embryonic_stem_cells
mSE_10703chr12:88155356-88160063Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
CCTGAAGAAA GAAAGAGGTT TATTTTATGA GAGTAAGGTC ACAGCAGCAG CAAAAGGCAG 60
GGTTCGGCTT CTCATCTGCA AAGTGCCCCT TAGAGATGAC TACTGTCAGA GAACACCCCC 120
AACCCAGTTT GCAATCCTTC TTAGAGCCAG AGCTGTGGGG GGTAGGGATG CCACGCCTAG 180
CTGGCTGGGG ATGCTGCATC TCTGTCTGCC ACTGAAGGAC CTAACTGCTA ATCAGCAGCA 240
CTGGTATCCA GGCAACCAGC CTCCCTGGCT TCAGATAAGC AGAAACAGCT GGAGCTGCTG 300
AGGCTGGGAG CCGCAGGGGA GGAAAGGAGC CAGCCTATCC TCGCAGGTTA TTTTGAGCCT 360
GTTACACGCA CTATCCAGAC ATCAGCTTGA GCTAGGGCCG TTCCCCTGGT GTGTCCTTGC 420
CACAGCCTTT GGGGAAGGGT TTCTAGGGCT CAGCCCAGCA GGGAGCTTGG CACACTCGAG 480
GATGGGGTGG GCTGAAGAAC TCCTGGTTTT TCCCTTTCTT GAGCAAGAGA GGGAGGAAAA 540
TTGGTACTAT ATCTAGAGGT AAAAGCTTAA GTCCATCTGG TAAACCACAG TACTTGAACT 600
CAGCCTTTTG GGGCCTCCTG ACCTTAAGGG AAGTCAGGCC AGGCTTGAGT GCATTTTCAT 660
TTATCCTGTA CAACCTCTTA GGAGCACTCC AGGAGGGCAG TGGCCATTGA GCAAAGGGCT 720
AGGTCAGACA AGCTAGGTCT GGATCTGTCA GGCTCTGTTC TTTTAGGTTT GGCCTTTCCT 780
CTCTGACTCG GGTTCCGTTG CACAAAACAA AGACAAACCC CACCTGCAGA GTGGATGCTG 840
GAAACTGAGG AAGTGGCATG TGGCCTAGCC AGCAGGGTGC CTGGCACAAG GGATGCTGAG 900
GTGGCTCTCC CCTGCCAAGT TGCTGGGCCT GCCCTGCCAG CCTGAACCTC TCTCCCACAC 960
AGGAGCATAT CCGTCCCTCC ACCCCTCTCT CACCCCGGGC TATTTCTGTC TCCCTCTCTA 1020
AAGGTCAATG CCTTTCCCGG GATATGGCAG CTGTCACCTT TTTTTCCTTC TAAGTGACCT 1080
TGGCTCCATG CCCAGGGGCA AGAGGTTGTC CGGATGATGT TCCCCACCCC GTCCTCTACC 1140
ACATCTGGCC TGGGCATGCC CACACTACAG TACACAGGGC CCTCAGGTCA TTTCTGGGTC 1200
TGGTGTGTGT GTGTGTCCAG CTCTGGACTG ACACACTGGC CACACCAGCA GCCAGAATCC 1260
TCCTATTGTC CCCTCAAGTG TGGGACAACT GGGGTGTGTG CTGACGGCTT GTTCCAGTGC 1320
TCAGCCGGCT TGAAGGAGAG CACAGGACGA GGCAGCCTGG CTCCCTGAGA AAGTCCTCAC 1380
GAGAATATCA AAGCAGTGCT GCCCTCCACC AGCTTGGCAT CTGTGCCCTT GAGATCTAAG 1440
TCTTTGACTG GGAACAGGAG GTAATTGCCC CTCACTTTTA ACATTAGAGC AGATCTTTTG 1500
GAGTGGTATA GGAAGAAAAG CAGCAGATGA TAGCTCCTTA TCATCCCAGA GTAGAACCTT 1560
CCAGATCTAA GTCAGCCCTC TGAGAAGGAA ATGGCTTCTT CCAAGTGACC TACAAAGACC 1620
TCTGGAGACT CAGGGCCCCT TAGTACCCTT GGCGCTGTTG CCATGTGACT GACCGTAGGT 1680
AGACCTGTCT GATTCTTATT CAACAGTGTT CCAGCATCAG GAAAGTTCCC TATTTCTGTG 1740
TTGCTCTCAA CTTCATAGAG GAAAGGGCAG ACTCCAAGCT GATTATGTTC AATCTTGTGG 1800
TTCCTGCTGT TCAAGAGAGC TACGGTGTGT TCTGAGGTGC TGGAAGGACA ATGGGGGAAT 1860
CCTGGCTAAA CAGTGAAGGG CCTGCGCTGG ACAGCACAAC TGAATGGGAG CCAAGGTTTC 1920
CCAGAGCCGG GCGTCTCCAT TTCACCAACT AAAAATCAGA AGGGAAGGAG AGGACCCTGG 1980
TGTGGTGTAT AGCCCGCAAA TCTACTGTTC TGAGGGCTGA GGCAGGAGGA TCCTGAAAGT 2040
CTGTCTCCAA AAAAGAAAAG AAAGGTAAAA GAAGAAGGAA AGAAAGGAGG GAAAGCCAAC 2100
CCTTGATCAA TGGATGGTAG AGAGGGGGAG GGAGGACCCA CCCCAGCTGG TCTCTTGTCT 2160
CTCCCATCTT TCCCCCATAT GACACCCTCA GGTCCCCTGC TCTCTCCCCT GATACTGACT 2220
TGCCAGAGGG AATCAGGACT CCAAAGCAAG ATAAGCAGAA GGGAAGGGGG CTCAGGAGAC 2280
ACATTCCAGA GCTAAAAATA ACAGGGTCAG CTGGCAGGCT GGCAGCCTCA GCCTTCCTCG 2340
GGGTCCCCCC AGGGCCCCAG CCAGTCTCCT CCTCTCTCCC AGCTCTCTGC TGGGCCCCAA 2400
TCTGGGAAGC CTGGACTGCA TCTGCTGAGA CAAGGCCAGC ATCTCCTCCC GACTCTATCT 2460
CAGCTAGAGA AGGTAGAGGA GCCACCCTGG CAAGGCTCCC TCCTCCACCT CATCTAACAC 2520
TCTCCCCAGC TCATCATCTT AACCTTTGAC CTACATTCTC TTAATGTTAT CACAAAATGC 2580
AAAATTTTTG GTCCACTAGG CAAAGGCTGT TTGGGTCATT AAAGAAGAGT TCTCCTTTGA 2640
AACATACCCT ACACTCACAC CTGCAGGAAT GGGAGTTCAA GGCCAGCCTG TGCTACACAT 2700
ACCTGTCAAA CTTAAGGCCT GAGATCATGT CTCACTACAA CAGGAGCAAG AGCTCCACAC 2760
AGGCAACAGA AAGCATGCCT AACTGGTTGA CGTGCCTGTT AACTCCTGTG ACACTGTGTC 2820
TCCCACATCT GTGTACAGCG CCATTCACTC AGACTCTGAC AGGTCTGTCC TCGTAGGCTC 2880
TATGGTGAGT TGGGGGTTTT CTTTGACAGT GTGGGCACTG TATTATCTAT CATGCATGCT 2940
GGGACCCTTC ACCTTGAAAC CTGAAGTCTG TGACTCTCCC CTCCCTACCC CAGCCCACAA 3000
ACGGTCCTTG AGAACCAATC CCCCCCCCAC GGTCTAAATT CCCCACCACT CACTTCCTCC 3060
CACTTGTTCT CTACTTCCAG AGACCTTCCT GTAGCCACCT CACTCCTACC CAAGCCAGAG 3120
TATTGCCACA TCCTGTCAGT CCCCTAGACA AACTTCACAA TGGTTATACA AACTCCATCC 3180
TGAGCTGAAA AGCCCTTCAG TGACTGGACC GGCCTTGCCC AGTCCCCTGA TAGCAGCCTG 3240
CCAAACCTCT TCCTCTTGCC TCAAGACCTC CGCACTTGAG GTTCCCTGTT GTGGTTTGAA 3300
TGGGAAAGTC CCCACAGGCT CATCTGTTCG AAGACTTGGT CATCAGGGAC TGGTACTATG 3360
ATGAGATATG GCCCTGTTGT TGGAAATGTG TCACTAGAGG GTGGGTTCTG CAATCTCAGA 3420
TGCTCAAACC ACGCCCAGTG TGGTACTCTC 3450