EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM150-02810 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymus 
Coordinate
chr11:87557110-87560360 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr11:87557707-87557719GTATGTTTATTT+6.11
IRF1MA0050.2chr11:87557649-87557670TTTTGGTTTCTCTTTAGTTTT+6.06
PKNOX2MA0783.1chr11:87559632-87559644TGGCACCTGTCA-6.37
RFX1MA0509.2chr11:87557518-87557534TGTTTCCATGGAAACA+6.11
RFX1MA0509.2chr11:87557518-87557534TGTTTCCATGGAAACA-6.11
RFX2MA0600.2chr11:87557518-87557534TGTTTCCATGGAAACA+6.39
RFX2MA0600.2chr11:87557518-87557534TGTTTCCATGGAAACA-6.39
RFX3MA0798.1chr11:87557518-87557534TGTTTCCATGGAAACA+6.57
RFX3MA0798.1chr11:87557518-87557534TGTTTCCATGGAAACA-6.57
RFX4MA0799.1chr11:87557518-87557534TGTTTCCATGGAAACA+6.11
RFX4MA0799.1chr11:87557518-87557534TGTTTCCATGGAAACA-6.11
RFX5MA0510.2chr11:87557518-87557534TGTTTCCATGGAAACA+6.07
RFX5MA0510.2chr11:87557518-87557534TGTTTCCATGGAAACA-6.07
SPDEFMA0686.1chr11:87558604-87558615ACCCGGATGTG+6.32
TGIF2MA0797.1chr11:87559632-87559644TGGCACCTGTCA-6.04
ZNF263MA0528.1chr11:87560210-87560231TCTTCTCTCCCTCCCTCCATC-6.77
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00485chr11:87558454-87573488pro-B_Cells
mSE_01255chr11:87533857-87574776Th_Cells
mSE_03321chr11:87557850-87560458Bone_Marrow
mSE_07673chr11:87557930-87559542Intestine
mSE_11921chr11:87556861-87571239Spleen
mSE_12805chr11:87556979-87572716Thymus
Enhancer Sequence
TGGAACATAC TTAAAGGGTA CTGAGGCCTG TGCCTTGTGT TCCATTTCCT CTCACAGTGA 60
GGCCTCACTT GCCTGGTGGG CTCTGAGGCA GCTCAGCTGA GGTCCTTTCT CTGGCCTGCC 120
TTTAAGGGGT ACAGCTGCTA TGCTGTGCTT GCTGCTGTAT CGTGGGAAGG TCTGCTGTCC 180
TGAGGCAAGG AAACTGTGCT GACTGGAAAT CAGCGTTCTG TCCTCTAGAC CTGGTGCACA 240
CTCTCCTTTG AAGGAACCCG GGGCTCCTTA GTGCCTTCAC CCTTGATGCT CCTACTTCTC 300
CTACTTCCTG TGTCTCTTTT CTATGCTCTT GCTGTACCTC TGCCAGCTTC AGAGTTCACA 360
TTCCCCTTAG TACCCTTAGT GGCTGTTGGG TCTTGATCTG GGTTTTTGTG TTTCCATGGA 420
AACACAAACT CCTCCTAAGA AGGGAGCCAT CCATGGGTAA TGCCACATTG GCCAAGATGT 480
GTTGTTTTTA TAATAACATA TTTACCATAT ATCCTTAAGT TGCAGAAATT GTATCCCCAT 540
TTTGGTTTCT CTTTAGTTTT CATCTGTAAA ATAGGAGTGA TTATTCCTGT TTACCCTGTA 600
TGTTTATTTC AGGGTTATAA GGCCTGGAAA TGAAGAATAA GAAAAGTACA TAGCAGCGGG 660
GTGGTGGTGG CGCATGCCTT TAATCCCAGC ACTTGGAAGG CAGAGACAGG CAGATTTCTG 720
AGTTTGTGAG TTCCAGGACA GCCAAGATTA TACAGAGAAA CCTTGTCTCG AAAAAACCAA 780
AGGAAAAAAA AAAAAAAGAA AAAAAAGAAA GAAAAGAAAA GTACATAGCT CCCCTAAAAG 840
GATCAGATGT GGCACATGCC TGAAATCCAG CCCCCAGAAT CTGAGGTTGG GGTTAGCTCA 900
AGTCGGCTAC AAAGTGAGAC CCCATCTCAA AAAGCCAAAT AGTAGTAAAG AGTACTGTGT 960
AAAGAGTACT GTGTAAAGTT TGTTGTCTGA CTGTCCTGCT GTTCTTCGGT ATTTACACCG 1020
TCTTCACCAT TAGGCGAAAT TGGGGACTAT GGCCAGAACC TTCTTGGGGG AGCACCACCT 1080
TGCTAGCGGA GGTACCTGCA CTAGGCTCTG TCTCAGCTGT TGTCACCTGC TGACCCTGTG 1140
AGTGTAGAAA GCGAGCTGGT GATGACCAGG CTACTTATCC AGTCACTGGT CCCCACTAGG 1200
AGTGGTTTCA CCTGCACCCT CAAGCTTTGA GGGAACAGAT CATCACCCTC AATTCTAAAC 1260
TGAGCTGTTG AAGGAGTTCT CTAGCCCAGC CATCTCAAAG ATGCCATCGC TAGCGAATTC 1320
TCCAGTGAGT TCCATTTGGA AGGGGCCTTG GTGGCTTGTC AGAGTGGAAC TTACCTCCTG 1380
GAGGGAACGA GAAAGTTTCC CCAAGAGGGT CTAGGCTGTG GAGCCAACAC CTCAGCTTTC 1440
ACTGGCTTTT TCAGAAGTCC CCTGGAAAGC CCCAGTTGCT GTTCTGTGTA CATGACCCGG 1500
ATGTGACTGT GTGGTGAGAA TGGAAACAGT TGTGGGGAGG GGAGGCAAGA AGAGCCTGCA 1560
CAAATAACCA CAGTGGGGCT GCTTGAGTCC CATACCTCTT GGGCCCCAAC TGTCAATCTC 1620
ACAGGAAGTG AAAGACGTCG ACTGTCAGCC ATGGGGAGCA TGGGTCTTGT CAAAGTGTCC 1680
TCCACCTGGG AGCTGCTTTT CCATGCCTCT CATCCTGTGG TACTAGAACC TTCTATATTA 1740
GCTGCTGCCC AGACAGGCAA GAAAGTGCTA GCGTCCTACC CTTGGAGCTG AAAGACGCTT 1800
GAGACAGGAG TTTGGTTCCG GACTCTCAGG GTGGGCTGTT CTGTGGCACA GGGGCCTTTC 1860
AAATTCCAGG ACTGCTGTCT GCATTCTACC TCCTTAAGGG TGCAGTGCTT GCTAAAGTTA 1920
GACCTACCCT AGCTTAGCTT TAAGTAGACC CTGGTCTTAG GCACTCCCTC TGACTCCTTC 1980
AGTGCTGGGG GTTCAACCTG AAACCTCATC GTGCATGCTA GGCAAGCTGC CTACCACTGA 2040
GCTATCTCCA GCCCTTGCAC TTTTGGGGCC ATACCTCACT AATTTTCTGT ACTGGTGAGA 2100
AAGTCAACTG TAATGCAGGC TGGCTTTGAA CTTGGGATTC CCCCTGCCTC CCAAGTAACT 2160
GGGATGGTAG GCTTGCATCA CGAGGCCTGG ATCCTCTTGG TGTCTTGTTC AGTGGTTTGA 2220
CCCCTGTCCC TTGAGGGGGA CAAGGCTCCT CTCCTGTTCA ACGGGTAGAT TCAGCTCAGA 2280
CAAAACTAGC AACAGCACCT GGCAAGCTGC TTTGAGACTG TTGCCTGATC CTCAGGTTCT 2340
GCCCAAAGCT GAGGGGCACA GTAGCAGCGC AGTGGTGACC GAAAGCTGGT AGAGCAAGAG 2400
TCACAATGTC TCAGCAGAGA GCAGTTTCCC TAAGAATAAG GGTGACAGGA TGGCTTGCCA 2460
GGGTGGGGGC AGACCCTGTT CTTGAGGTAG CCACCATGTT CCCCTCAGCC TGTCTTCAGG 2520
CCTGGCACCT GTCAGACGAC TGATCTCTGA GTATATCAGA AGCAGGTGGG CAATGGTAAA 2580
GACAGACTTC ACTTGGAAGT CTAGCTCCCA CTCAGTATCT ATAAAGACTT TCATGTAAAT 2640
AGTATTTGGA AGTTGACAAA AGCCTTTGAC ATCCATGATC TCATCTGCTC TGAAACTCCT 2700
GGGACATGGT CCTTGTTTAG CAACAGAGAC AAGCTGTGAG GGTTAAAGTG GCTTAGCCAC 2760
GATTAAGTCG TGGGGCCTTA GCTCAAACAA TATAATAAAC ACAGTTGAGC ACTGATGTTT 2820
CTCACCTGGT TACTGCCTAT ATGAGGGTTA GGCAGAAGTG TGAGCATTAG CGTTTTCTTT 2880
GAGGTCATAA CACCTAGTCC CCACTACAGA CCGTGCTGAC CTCTCTGCTT AATGCCTCTA 2940
GTCCCCAGTC TGAACTTAGC CATGAGGCAA TGGAGTGCTA GGCCAGAGAG GAGGCCAAAG 3000
GGAAACTGGG CCAGTTCTCT TCAGCAGCAT CGTCCATTCA ACTCCCAAGT CCTAAGTACC 3060
TGCCAACCTG TGCCCACATT TCCCATCCTC TTCCCCATTG TCTTCTCTCC CTCCCTCCAT 3120
CTGAACCTAA TTGTGGCCCC CACCACAACC TGATGGGACA CAGACCCTTG TGTATGGCGA 3180
AAACATGTCC CTGCTGAGGG CAAGAACCCC TGCGTCCCCG ACCTGCTACC TCTGCCAACC 3240
ATGGCCCTAT 3250