EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM149-07807 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymocyte 
Coordinate
chr7:80751380-80754490 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EGR1MA0162.3chr7:80751889-80751903GCTGCGTGGGCGGA-6
EGR2MA0472.2chr7:80751891-80751902TGCGTGGGCGG-6.32
EGR3MA0732.1chr7:80751889-80751904GCTGCGTGGGCGGAA-6.13
FOXA1MA0148.4chr7:80753347-80753363CAATGTTTACTTAGTA-6.13
FOXC1MA0032.2chr7:80753349-80753360ATGTTTACTTA-6.02
FOXD2MA0847.2chr7:80753349-80753362ATGTTTACTTAGT-6.32
Foxa2MA0047.2chr7:80753350-80753362TGTTTACTTAGT+6.44
RREB1MA0073.1chr7:80753721-80753741GGGGGGGGGGGGTATGGGGG-6.01
RREB1MA0073.1chr7:80753720-80753740GGGGGGGGGGGGGTATGGGG-6.44
ZIC1MA0696.1chr7:80751806-80751820CTCAGCAGGGGGGC-6.18
ZNF740MA0753.2chr7:80753720-80753733GGGGGGGGGGGGG-6.03
Number of super-enhancer constituents: 27             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00389chr7:80728813-80754010pro-B_Cells
mSE_01523chr7:80662346-80773459Th_Cells
mSE_02681chr7:80731224-80764627HFSCs
mSE_03000chr7:80728755-80771487TACs
mSE_03459chr7:80752445-80752863Bone_Marrow
mSE_03982chr7:80751273-80752089Cerebellum
mSE_03982chr7:80753028-80753344Cerebellum
mSE_04060chr7:80751282-80753626Cortex
mSE_04416chr7:80751110-80753688E14.5_Brain
mSE_04807chr7:80751431-80753544E14.5_Heart
mSE_05509chr7:80751081-80753496E14.5_Limb
mSE_06583chr7:80751249-80753369E14.5_Liver
mSE_06612chr7:80751246-80753522Heart
mSE_06612chr7:80753757-80754126Heart
mSE_07229chr7:80751242-80753696Intestine
mSE_08080chr7:80751435-80753991Kidney
mSE_08614chr7:80751335-80753561Liver
mSE_09049chr7:80751325-80753714Lung
mSE_09494chr7:80751426-80754236MEF
mSE_10229chr7:80751258-80752906Embryonic_stem_cells
mSE_10773chr7:80751274-80753605Olfactory_bulb
mSE_11288chr7:80751310-80752907Placenta
mSE_11971chr7:80751381-80752954Spleen
mSE_11971chr7:80752979-80753451Spleen
mSE_12651chr7:80751315-80752082Testis
mSE_12651chr7:80752108-80752838Testis
mSE_12880chr7:80751301-80754308Thymus
Enhancer Sequence
AAACTAAATT TTAAATAGAA AAATGGGCAG GTATTTTAAA CGAGGGAATT GTATCACTTC 60
CCCAAGTGAA CATGTTCCTA GAGTTAACCA TCCCTGCACA GTTTAAATCT CCTTCTGAGC 120
TACATTAACA TGAAACAAAT TCAACAAATT TTATCCAAAG AACGTGGGGG ATTGCACCAG 180
TTTTGAGGCC TCCATTCCTA TCCTGGAAAC CATAGCTCAT GTCTTGAGGC ACGCCCCAGG 240
CTTTTCTCCC ATCTAGAACA CTTGTGGGAA GGGAGCTTTG TGCAGTTGTG ATAGTAAACA 300
TTCCACACTC TAGAGACCGA CATACAACTC TCTCTGCTGA GCTCAGGCTG GGCCACTGGC 360
TTTGTTCTCC GCACACATAA ATATAAGTTT TGGAGGCCAT CTTGGAAACA GGAGAACTCT 420
GGGCGCCTCA GCAGGGGGGC TGACCGTAAC TAAGCAACGG AGGCGCACCC AGTGCCGCGC 480
AGCCGCAGAG CGCCGCGCAC GAACGCCCCG CTGCGTGGGC GGAACTGATG GGGGAGGGCG 540
GCGGCGGAAA ATTACCTTAG GTTCTTCTTA AAGGCACAGA GGCCTTACCT GCTAAAGGTC 600
CAATCGCCAG CCGATCTAGG GTGCATGTTT TACAAAGCCT ATTTGTAATG CAGTCGACCT 660
TATATTTCTC TGTGAATACG AATTTTATTT ATCTTCTCAG AGAAATAGAA TCCAATCCCA 720
AATTAACTTC CCCGTGTAAA CTTCAGTCAC TAAGTAAGCA AATAGTGGAA TAAACAGGCT 780
TCTTCAAAAT CAAGTTAACG GGCATGGGGA GGGGAGAGCA AATCAAACAA AACAGCCACC 840
AAATTAACCC TAAAATGTCG AATGGCGAAG AAAGAGAGCT AATGAAGTCA GGAAGGGGAT 900
GAAGTGAGCA CCCAGGAATA AAGTCACGAC TGTGTAGCAG CTTTAAAAAT GTACAGATTC 960
TGAAGCAAGG AAAATTTATT CTTGACAGAT GGATTGGCAG ATTATAGTAT ATACTAAAAA 1020
TTAACAGAAA AACAAGATGT CTGTTAAGTA AAGCGGGATC AGAAAACTCT CCGCATAGGT 1080
CACTTTTTTA CAGCAAATAA AACCATAAGA CTTTTTGCTC TTCTTTTTAG AAAAAGAAAT 1140
GCAGTTTTTA AAAGTGTTTG GTGGCACACG GGTGCTGATG GCGGTGCAGT TATACCACAG 1200
TACGCTTGTG GAGGTCGGAG GACCTTGCAG GGAGTTTGTT CTCCCATGTA TGTTCGGAGG 1260
ATTGAATTCA GGTCTTCAGA CTTAGCAATA ATCACTTTTA CCCTCCGAGC CTTATCTCCA 1320
GCCTCCACCT CGCTTCTTAT CAAAGACATT TCCTTCGATC TAGCAGTTTC TATGATTTAC 1380
AAGTTAAGGA ATAATTCATA ATGGTCCTAC TTATGTGAAA GAATAAACGC AGGGTCTGGT 1440
TCAATGGAAA TCTGCAGGGG ATAATGTGCT GCTCTGCAAG TCTCTACAAT TAATCTCCTT 1500
ACTAAAAGCC TTCCTTGAAA ACAACAACAA AACAAAACAA AACAAAACAA ACAACGGAAG 1560
AAAAAGAAGA AGAAAAGAAA AGAAAAGTAG GAAAGAAAAG AAAAGGAAAA GGAAAAAAAC 1620
GTGTCCTCTC TGAAATAAAG CCATTCCCAC ATTCCGAATC TCCATTTCCA ACGACAGAAG 1680
ATCTTTTGCA CTCCTCAGAT GGTTTGCTTG TTATAAATGA TTTCTCTTCC AAACTGCCAT 1740
TAGGTGTACC CTAATAAACA GCACCATACA TCCTCGGAAG CACCTGGGGC TCTCACCACA 1800
AATGGGGGGA TGTTCCAGTC CTATCACGGC CCTAACAAAC CAATTGTCAA TCCCAGAATC 1860
GACCATTTCT TCCCATGCTT CTCAGCCATT TTAAACCTAA TTTTCACATC TACTTTAAAT 1920
CCCTACAAAT CTTCCCCCTT GTCCCTACTG TAAAGTCTTT ACAATGTCAA TGTTTACTTA 1980
GTAATTTGTA AAGGGTACCG TGTTCCTTTC AGAATATGGA ACCGTGTGAT CTTGATACTA 2040
AGAAAATGTT TTGCAATGGT TTAGTGTGCA GCTTGTTAAG TTTCAATTTG GCTATTAAAG 2100
AAAGGACCAC ACTAACTTTC TAGAAGCACA GGGAGATAAG TCCTTTAGAT TAACAAAACA 2160
AAACAAAACA AAAAACCAAA ACTGTGTGGT GCAGAAGAGG TGCCACCACC ACCTTGAGGG 2220
GAAAGATTTA ATGTCTAAGA ACTGTGTCTT GGAAATAAAA ATACACACAC TTGCAGCTGG 2280
TGGGGCCATG TCCTTAATTG CCTTCATGTT TCATTACCAC AGCTAAAGAA CAGAAGCCTT 2340
GGGGGGGGGG GGGTATGGGG GACTTTTGGG ATAGCATTTG AAATGTAAAT GAAGAAAATA 2400
CCTAATTTTT ACAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAGGG AACAGAAGTC TGAAACGGCT 2460
GCTTTGTAGC CGAGACGGTG TTTCTAACGC TTGCAGAAAG TATGGTGTGG GATGACAGAT 2520
GATGCCGGCT AGACAAGGCA AGTTCTCATG TCCTTACCAC CTTTCTTCCA GAGGTCTGTT 2580
TTCTAGCACA GACTGTTCTG TATAATTCCT AGTAATCTAG GATAGTCCCC AGAATAAACA 2640
GAGAGAAAGG CCAAGAGGAG AGCAACTAGA ACACAGAGAA CAGAGACAGA ATGTAGATGG 2700
AAAGTCACCA GACTCCTCCC TCTTAAATTC TCTATATAAA GTGGGTCAAA TTACTAAGAG 2760
ATCAAATTAT GATAAATTAG AATCCAATTC TCTTTAAGCC ATAATGAAAT GATTTTTAAA 2820
ATTTTATCTA TTTTATGTGC ATGAGTATCT TGCCTGCATG TCTTTATACC ATGTGTCTGC 2880
TTGGTGCCTG AAAACTTAAG AAGACATGGT GAATGCTCTG GGGCTGGAGT TAGGGAATTG 2940
TAAATCACTA TGTAAAAACT GGGAACTGAA AAAAAAAAAA AATGGCGGGC AGTGGTGGCG 3000
CACGTCTTTA ATCCCAGCAC TTGAGAGGCA GAAGCAGGTG GATTTCTTAG TTTGAGGCCA 3060
GCTTGGTCTA CAAAAAAAAA AAAAAGAAAG CTGGGAACTG AACCTGGGTC 3110