EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM149-05832 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymocyte 
Coordinate
chr3:108522860-108524950 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:108523704-108523721TGAATTAATTAATTAAT+7.27
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:108523535-108523553GGAAGGAAGGAAGAAGAA+6.41
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:108523527-108523545GAATGGAGGGAAGGAAGG+7.12
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:108523531-108523549GGAGGGAAGGAAGGAAGA+8.52
FOXF2MA0030.1chr3:108524445-108524459ATTGTTTACCATTA-6.46
Foxd3MA0041.1chr3:108523301-108523313GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:108523305-108523317GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:108523297-108523309GTATGTTTGTTT+6.37
Lhx3MA0135.1chr3:108523709-108523722TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr3:108523705-108523718GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr3:108523706-108523719AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:108523707-108523717ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:108523711-108523721ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:108523707-108523717ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr3:108523711-108523721ATTAATTAAT-6.02
ZNF263MA0528.1chr3:108523528-108523549AATGGAGGGAAGGAAGGAAGA+6.16
Enhancer Sequence
GGTGAGGGCA AGAACTGGGG TTCAACCATC AGGATAAAAG GGAATTCTGT AACCGTGCAA 60
AAACAGAGTT TATAACACAT TTCTAACAGT GGAGAAGACT ATATTTATAT TCTTGCAGAT 120
TCAAGTAAAC TTTGCTCTGT GTCTTTGGAA AGGTTAAAAG CTATGGGAAG TGTTATTTGC 180
TTTAGAACAC ACACACAAAG CGAGACCATC GTTACAAGGG TAGATAGATC CCTCCACACT 240
TCATAACAAA CCACCGACTG TATTGTGGTT TTAAGTAGAA TTATGTGCCA CAAGTGGGAT 300
TCAGAAACAC ATGGCCATTT AAGTGCAGTA GCTGGTGCTT TGAGATTAGG GAGTAGTCTC 360
AATCCCACCA GTAGCCTATT AATTACACAG TTTTAAAAAC AAATGCCCAC AGGTGTGTGG 420
GGTGAGGGTG GGGGTATGTA TGTTTGTTTG TTTGTTTTTA GGTAAGTCTT GGAGTACTTT 480
ATGGGTAAGA AAGGTGAAGG CTGAGGATGT GGTTTGGTTT TGCTCGGCAT ACACCTGCCC 540
TGGATTTGAC CCTAAGCATG TATGGTGCAC ACCTGTAATC ACAGCACTGG GAGGATGGAG 600
AAAGAGAATC AAAGAGTGCA AGGCCAAATT CAGCTATCTG AGACCCTGTC TCAAAACTAC 660
ACTGAATGAA TGGAGGGAAG GAAGGAAGAA GAAAGTCAGC CAGCCATTTC ATACCAGGTG 720
GAATTTGTGC ACATATTACA GCCCAGTAGC TGTAATCCCA GCTACTGGGC TGAGACAGGA 780
GGATTCCAAG TTCCAGGCCA GCCCTAAACA TTTAGCAACA ATAGGTCTCA AATAAATGAA 840
TGAATGAATT AATTAATTAA TAAATGAATA ATCTGGAATT ACCTCAGTGA TAGAACTCTT 900
GCTTAGTGTT CACATGGTTT AGAGTTCAAA CCCAAGTACA GAGGAGGTGA GGTGTGGGGA 960
GCCACACTAT ATATAGTGCA TTACCTTTGT AACTAGCCTA CTATTAAATC TCAGGTTTAC 1020
ATCAAAACAT ACTTGTAATA GTGTATGTCT GACCTACTGA AAATTCAGCT AAACTATTTT 1080
TCCGTGGGAC ACGCTTCCAC AATACTCCAC AGTCTCTGAA TTCATAACCA GTCCAATCCT 1140
CGAATTGTAA GTTAGAAATA GTTTGCAAGA GGGGCCTATG AATGCCTAGA ACCGGCCGGG 1200
CATCCCTGAA CTCCCCCACT GCCCTCAAGT CAAAGGACAG GAACCTTCGC TTTTGAACTT 1260
AGGCGGAACG AATCTCTGCT CTTAGCACGT CGAAACCCCA GGCAAAAGTG CTCTTTACCA 1320
GAAGCAATCA CGATGGTTAC TAACAAGCCG GAAAATCTTC AGTTTAGCCT TCCAAAGAGG 1380
CAGTCTGAAA ATTCTGCTTC GCTGGTGACA AAAACTTACA ACACAAACCA CACAGCAGTC 1440
CAATCAACAC AAAGCACCGA GAGGAGAGTC AAGAACTTAC CTATTCTAAG TCTACCCGGC 1500
GTTTAAATAA TGCATTAAGG CAAATAAACA TTGCCATCAT TACTCGTTTC AACAGAGTTC 1560
AAATGATACT TGTTAAAGCC ACCTAATTGT TTACCATTAA AATACAAGGA AATTACGTTT 1620
TCCACTTTTC ATCTGAAGAT ACTAAGTTTA CAGCTTTCCG GCTAAGATCT CAAACATGTT 1680
ACGCTTGCTA TAAAGCTGGT TACAACGATC TATCAGTTTC GCTTGCCAGT AAGTCTGGGA 1740
TCCGAAAAGT TCAGGAGTTT AAATGTGACT TGACAAAGGT GTCTGGTGTG GAGACCCGGG 1800
GCCGGCGACG TGCCTGGGAT TCGAATCCAC TGGGATTCGG CTTTGTATCC ACCGTCTGTT 1860
ACGCTCGGAA AACGCGTGAA GTCGCTGCAT CCCAGCAAGT ATTTTCAAGG TCTGCAGAAG 1920
CCCGATCCCC AGTCTCCCCT CACTTAGGGG ACAACAGCCT AAATGGTGCG GGTGCGAAGC 1980
CCCCCACGGA GCTCCCGGGT CCCAGCGTCA CCCGAGCCCG TCGAGCCTCG GTGGTCCAGA 2040
GACCCCCGCC CCACGCCCCC ACACACCCCA CTGGGTCACC CCCTCAGGCT 2090