EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM149-05740 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymocyte 
Coordinate
chr3:95467100-95469730 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr3:95467376-95467387TTGACCTTGAA-6.14
HNF4GMA0484.1chr3:95468719-95468734TGAACTTTGGACACT-6.11
IRF1MA0050.2chr3:95468352-95468373GACATAAAAGTGAAAGGAATG-6.08
JUN(var.2)MA0489.1chr3:95468365-95468379AAGGAATGACTCAC+6.28
Nr5a2MA0505.1chr3:95467375-95467390GTTGACCTTGAACAT-6.4
ZNF263MA0528.1chr3:95469579-95469600GCCCCCCCCCCCCCCACCTCC-6.88
ZNF740MA0753.2chr3:95469580-95469593CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr3:95469581-95469594CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr3:95469577-95469590CTGCCCCCCCCCC+6.33
ZNF740MA0753.2chr3:95469583-95469596CCCCCCCCCCCAC+6.92
Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00303chr3:95449171-95480090pro-B_Cells
mSE_01444chr3:95428517-95481073Th_Cells
mSE_02241chr3:95454321-95467552Macrophage
mSE_03289chr3:95468264-95480124TACs
mSE_04834chr3:95467276-95468778E14.5_Heart
mSE_06241chr3:95467169-95473749E14.5_Liver
mSE_06608chr3:95465718-95469586Heart
mSE_07147chr3:95465721-95469575Intestine
mSE_08013chr3:95467224-95469503Kidney
mSE_08533chr3:95465734-95473902Liver
mSE_08948chr3:95467264-95469603Lung
mSE_09406chr3:95465791-95472994MEF
mSE_10020chr3:95465695-95474090Embryonic_stem_cells
mSE_11293chr3:95465868-95469623Placenta
mSE_11924chr3:95467320-95468353Spleen
mSE_11924chr3:95468460-95469327Spleen
mSE_12868chr3:95467814-95469498Thymus
Enhancer Sequence
AAGTAAGGTG TGGTATGGGT CTTTTCTTAT CGCCTTCCTC TCTTGTGCAA GCCTTTTAGG 60
GAAGTCAGTT GAACAAATAG AAGTGAAATA AAAGCAAAAT TCAGTATTGA TTTGCCTTAT 120
GGTAAAGAAT ATAGGACCTG TAATTTAAAT TTGTGGTTAA TGTATTCCTG TTTTAAACTA 180
GTTCGGTACG TTTTTGGGTT GCGGGGGAGA ATGCTTAGCA CCACACCTGG CTTTCTCATT 240
GACAAGTTCC TTGTATCTTA AATTTATTAG TCAAGGTTGA CCTTGAACAT CTATGGTGAT 300
CCTGCTGTGC TAAAGCTGGG ATCTTGGGTG TGTTATCCTT GCCTCTGCAG GCAGTGTACT 360
TGGAGAAATT AGCTTTGCTC CCCACCAGCC AAGTGCAGGC TCCCCTTGGA AGTTAACCAA 420
GTACCAGTGT GCATGAAAAC AATAACAGAT GCATTACAAT GGTTCACCTT GTAATCCAGG 480
TTCTCTTCTC CCATGGTGGC ACCTGGGAGG TGAGACTCCA GTCAGCCATC TCAACAGCCC 540
TATCTTGTGC GTGGTTTTGG TTTTTCGAAA CAGGGTTGGT TTCTCTGTGT AGCCCTAGGC 600
TATTCTGGAA CTCTATAGAT CATGCTGGCC TGGAATTTAG AAATCCACCT GCCTCTGCCT 660
TCCAAGTGCT GGGATTAAAG GCCTGCACCT CCACTGCCTG GCTTTGTTTT GTTTTTATAA 720
TGTAAAAAGA TTAGCAAAGC AATGACACCT TTCTTGGTTT TCAGTGCCCC TTCCAAGGAG 780
GTAAGAATAA GCTGGTTAGA ACTATCCTGC CTTTGTCACA TCCCTTGAAA GGGCAGGGGT 840
GAATCACCAT GGAAATGTGC AAATTTGAGG TTTGCATAAC TGGTTTTCAG CCACAAATAC 900
TAATCATGCA AACAGGATCT GCACCTTCTA CTTAATCCTG CCTGCTTTAA CATCTGTCCC 960
TTCTTCCATG GGTTTTATTA GATGACAGTA ACTTGATTGT AAAGCTGCTT TGTGGTAGGC 1020
ATCCTGACTA GCTCATCATA ACCCCAGCAC TTGGGCTGAG TCAGAAGTAG CTACTGGAGT 1080
TCAAAGCTAA CATGAGCTGT CCTCTAAAAG TCGGAGTTGG AGTGGAGCGC TGAAGAGATG 1140
GCTCTGAGTT AAGTTCGCAA CATCTGTGTA AGGCAACCCA AAATACCTGA TTAAAGCTGC 1200
AGGAATTGGG ATGGCCTCTT CTACCTTGAT CTCTGTTCAC AAATTCTCAA CAGACATAAA 1260
AGTGAAAGGA ATGACTCACT TGTTGGGAAT GTGTGTGGTT CAGTGGTTGG ACACAAACAC 1320
AAGGTCAGCA CAAGTTTGAT TCATAGGATT GAAAGAGCAG AGCTGTGTAC AAGTGTATTA 1380
TTCCCTTAGC AGAGGCAAGT TGGGACAGTG GCACCCAAGG AAAAGCTAGA CTTACTCTTA 1440
AATCTTGCTT GGCATATACC TGTACTCCCA GCAAAAGGAT TACATCAGAT TCAAGGTAAG 1500
CCTGTGCTAT GTGACAAGAC CCCAACAAAC GCCCAAATCT TGACCTAGCT TAAGTTCTGC 1560
CCGGTACTGT TGTTAAGGGG GAAGGGGGCT GTACTTTTGA TACAGAGCTA GGCTTGCGTT 1620
GAACTTTGGA CACTTCTGCC TTAACCCCTT ACCTTGTATG CCACCATGAT GCCCCCCCCC 1680
CTTTTTTTTT CTTTTTTGTT TTTCGAGACA GGGTTTCTCT GTATAGCCCT GGCTGTCCTG 1740
GAACTTACTT TGTAGACCAG GCTGGCCTCG AACTCAGAAG TCTGCCTGCC TCTGCTTCCT 1800
GAGCGCTGGG ATTAAAGGCT TGCGCCAACA TGCCCGGCTT GATGGGCCCC ATTAATGCTT 1860
CATGACATGG TGATGCACAC CTGGGAATCC CAGGGACTGG AGAAGGAGGC CTGAAGGGCA 1920
GCCTTTGCCA CTTGGGGATT TTGACACTGG CTTAGGCTGC CTGAAGGTTT GGGGGGAAAA 1980
GTAAGAAGTG GGTGTGGTGG TGCATATCTT AATTTTACCA CTGTTTGGGA GGAGTTTAAA 2040
GCCAACAAGG ACTTTTACTC AAAGAGTAGC CTGAGTCACT AGAGGCCTCA GTAATGACTG 2100
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACCA TGCTTGACAT AAACTAATGT TCAGGCAGCT 2160
TGTTGTGGGG TCAACCCAGA GCCTTCTGAA TGATAGCAAG CAGCCAGTCA TCTAGCTGGT 2220
TTGTTTTCTT TTTCCTTGTC CTGTGATTTA TATATTTTTC TGAGCTGTTG GTAAGAGGTA 2280
TTGGAGTTTA AACCACAGCC TCGAATATTG TTCGGCTAAG CTACACCTGC TTGTCTGGTC 2340
CACTCACTCT AGGTAACTCA CTCTAGGTCA TGCTGTTACT GAAGAATCTT TTCCAAAGTG 2400
GGAGTGACAC CCATGAAGGG TGTATATTTA ACCTTTGCAA GGTCCCAAGT CCAGTCTCCT 2460
GCATCCTCAC TGCCATCCTG CCCCCCCCCC CCCCACCTCC CAGCCTTTTC CCCTTTTTCT 2520
TGAGATACAT AGGCACTCCA CCCCAGGCTG AGATCAAACA TGGAATGGAA GTCTTGCCTC 2580
TGCCTCACAT CCTAGCATGA GGCAGCCACA AAGCCAGCTT AAAAACTCTA 2630