EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM149-05677 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymocyte 
Coordinate
chr3:88993210-88996060 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hnf4aMA0114.3chr3:88994357-88994373ATTGAACTCTGACCCT-6.28
NR2C2MA0504.1chr3:88994359-88994374TGAACTCTGACCCTT-6.43
Nr5a2MA0505.1chr3:88994917-88994932GAATTCAAGGCCACG+6.17
RARA(var.2)MA0730.1chr3:88994366-88994383TGACCCTTGGATGACCT-8.64
RXRBMA0855.1chr3:88994359-88994373TGAACTCTGACCCT-6.03
RXRGMA0856.1chr3:88994359-88994373TGAACTCTGACCCT-6.11
Rarb(var.2)MA0858.1chr3:88994366-88994383TGACCCTTGGATGACCT-7.86
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01437chr3:88963927-89055714Th_Cells
mSE_12469chr3:88990475-88994826Spleen
Enhancer Sequence
CTCTCTTTGG AGTATTCTGT TATTGTTAAA GTAGTGTTGG GATTTATTAA AGATGTTTGA 60
AATGGACTGG AGAGATGGCT CAGTGGTTAA GAGCAGTGAC TGCTCTTCCA GAGGTCCTGA 120
GTTCAATTTC CAGCAACCAC ATGGTGGCTC ACAACCATCT GTAATGAGAT CCGATGCCCT 180
CTTCTTGTGT GTCTGAAGAC AGCTACAGTG TACTTACATA AATTGTCTTC ACCTCCTCCC 240
TACCTTCTCC TCTTCCTTGT TTTGTCTTGT TTTCCTCCCT GAGACAGGTT TTCTCTACAG 300
AACCCTGGAT GTCTTGGAAC TCACTCTAGA CTAGGCTATC CTAGAACTCA CAAGAAATCT 360
GGCTGCCTCT GCCTCCCAAG AGCTGGGATT AAAGCCCTGT GCCATCACTG CCTGTTTTTT 420
AAAGAAACTA TGTTTTGGTG GTGCTTTTTG GAGAAGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 480
TGTGTGTGTG TGTGTGATAT GTTAGCATGC ACACTCCAGC ATATGTGTGG AAGTCAGAGG 540
ACAATTGTGT GAAGTCAGCT CTTTGCTTCC ACCTTTATGT GGGTGGGTTC TGGGAATTAA 600
ACTAGGGTGA CCAGGTTTGC ACAGCACAGA ACATGTGTGT ATGTGTGTGT GTGTGTGTGT 660
GTGTGTGTGT GTGTGTGTTT TGGTAAGTGT GAGACTGCAC ACGACATGGT ACATGTTCCA 720
TAGCAAGTTC AGAAATCAGA GGACAGTGTT AGACCTTGCC TCCCATCTTG TTTGAAACAG 780
GATCTCTGTT GTCTTATCTG CTGCATCTGC CAGGCTAGTT ATTCCTCAGC TGGGGATTGC 840
CCTGTCTCCT AAATCCTCAT TCTCCCATAC AAGCCAACTG GGATTACAGG GCCAGACTTT 900
ATATGGGTTT GAAGGCTTTG AGCTTGGTCC TCACGCTGAA GGCAAGCACT TACCCACTGA 960
GCTATTTCCC CAACCCCAAC CTTAAACAAT ATATATAAAA ATATTTATTA ATGTGTACGA 1020
ATGCTTTGCT TGCATGTATG TCTGCATACC AAGTGCTTCC CAGTGCCTGC AGAGTCCAGA 1080
GGAGGACTTC AGAGCCCCTA GACTTGGAGT TGCCAGATGA TTGTGAGCTG CCATGTGGGT 1140
GCTGAGAATT GAACTCTGAC CCTTGGATGA CCTTAACCAC TGAGCTGTTT CTCGGGCTCT 1200
CCAAACTTGA ACAGTTGAGT CTTCTGTTGC CACTTGCCGA GTGGCAAGGT TCCAGTCCGG 1260
GTTATCATGT CATGCCGGTT TTACAAAGTT GTCACTCACT TCTGCAATCA ACCAAGATCC 1320
AGCACCAGCA CCTTTCGTGT GAGTTTCCTC CTCATCTTTG AAGACACCAC AGTTTCCTGT 1380
TTTTCTTCTT TCTTTACTCT CTGGGTATCC TTTACCGGCT TTTACACCGC TGAGCCATCT 1440
TACCAGCCCG ACAATGGAAT TCTTGATTCC TGCCCTCACA TCTGGTCTTC CCCTGCTCTC 1500
ATCTCCATAA TAACTCTGCC AGTATCCATT CACACATCCC AAAAGCTTGG TCTTCATTTT 1560
GGTTTCCCTC ATCCAATACA ACAGTCCTAT GATGACATCT CTGTTTCACC ATTTTCCTAG 1620
CTACCCAGCC AACCTGCCAC CTTCTCTCCA AATGATGGTT CAAGTCTGTA ATCCCAGCAC 1680
GTATGAAACG GAGGCAGGAA GACTCCTGAA TTCAAGGCCA CGGGCTTCAG AATGAAGCCC 1740
TACCTCAAAA CAAATAGTTC TCTTCTATCC AACCCTATTG ATTAATTGAT TATTTAAAAT 1800
AGTATCAAAG GCAGTTACTT ATACCATGTA GATCTGTTAA ATCTATGTGC TTGTGTGAAT 1860
CCCAATTCAG AAAAATGTAA CTTTTTAAAA GATAAGGTTT CATTATGTCA TTCTGATTAA 1920
CTGGAACTCA ACCAGGCTGG CATCAAATTC ATGGAGATCT GTCTGCCTCT GCAGCCCAGA 1980
CAGTGGGGTC AATGGCACAG GTCACCATAG CTAGCAAATT ACATTTCCTT CTTTCTATAT 2040
TTTTCTGCTT TAGGATGCTA GTTAAAACCT TAGCAAGTAT CCTGGGAATA AGCCTTCCTA 2100
TGGGGCCTTG TAATATTTAA TAAATAACAC GTGGCTCTTT GGCTGTACAA AATGTGATGT 2160
TTATCTAACA AGGGGAACTG TGAACAAGAA CTGGAAAGAA CCTGTGTCTG TAGAAACCGA 2220
CTGTTTAGCA CAGCAGTGGT CTGCAAAGCC TGGACTATTG GGCTACCTTC AGCCACCTCA 2280
ATAGCCATTC CTTACTTGAC TAACATCAGC ATCCCACGAG CTCCCATGAA CCTAAAAGCT 2340
TAGACAGCAT CTGAGGCCTA CAGGAAAGCG CCCCTTCTCC GTGTAAGTAC CCTTCCTATA 2400
TATTCACCAA CTTTGGTTTG TTTTGGTTTT TGGTTTTTTC TCTGTGTAGC TCTGGAACTA 2460
GCTCTGTAGA CCAGGCTGGC CTCAAACTCA GAGAGATCCC CCTGCCTCTG CCTCCCGAGT 2520
GCTGAGATAT GGGGCCATCT ATGGATTTTA AATTTGCCTG GATGTATGAT TTTCTTTGTT 2580
CTGTGAAACC ATGAACCTGC TTCCATGCTA GAATACGGAA GTTGGGGGTA AGCTAATTCC 2640
CTGTTCCTTG GTCACAGTTA TTAAATGTGG CTTGAGAATA AATCATCCCA AAACAAGCAA 2700
AGAAACAGCA ACGATGAGAC AGCCTAGGTC TGTTTTCCCA GATTCTCCCA CTGAAGCGTC 2760
CTGCCCCTCC CTGGAAGCTG CTGCTCTGCC GCATGAGTGC TTGCTGTATC TGCACTGCTG 2820
GACATTGCTA GCCTAAGTAA AAAATGCATG 2850