EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM149-05588 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymocyte 
Coordinate
chr3:60302110-60305100 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:60304879-60304890CTTTCCCGCCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:60304167-60304182TTTTAATAATTAACA+6.05
HNF1BMA0153.2chr3:60304168-60304181TTTAATAATTAAC-6.14
IRF1MA0050.2chr3:60302571-60302592CATGGCTTTCTTTTTCTCTTT+6.37
Lhx3MA0135.1chr3:60304197-60304210AGTTAATTAATTA-6.64
Lhx3MA0135.1chr3:60304204-60304217TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:60304200-60304213TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:60304201-60304214AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:60302868-60302888ACCAAAAACAACCCCCTCCC+6.22
RREB1MA0073.1chr3:60302887-60302907CCCCAAAAAACCCAAAACCA+6.54
TEAD1MA0090.2chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02212chr3:60275845-60315730Macrophage
mSE_06725chr3:60302694-60304136Heart
mSE_06725chr3:60304246-60308185Heart
mSE_07877chr3:60302536-60304206Intestine
mSE_07877chr3:60304291-60306932Intestine
Enhancer Sequence
ATGTTTATAA AAATAAAACT ATATCTATAT ATATAGTTTT ATTTTATCTG AAATAGTTTT 60
CTATAATTTC TCTTTCCTCC TGAAAATGGC ATCCCTTTTG TGCTAAGGGC TGTGTGCATT 120
CATGAGCCTG CAGAAGATAA CGACAACTCA CAGTGTAGGA GAAACCTAAG TGCTCTCCTG 180
GCACTGAAAA GGAACCAGTA GATTCTAAAT GGGGCAGCGA TTAGCTTTTT ATTGCTATAA 240
TGATTTTTTA CTGTTTCCAC AACTTGAAAT GTGACTATTG CTAGTTGAAG GTAACATACT 300
TTAATATTTT TAACATATGA TTAGATAGTT TGTTTTTTTT TTTCTCCTAG TGGTTCAAAC 360
TTTTCAATAA TAACAGGTTA GGCTTACTGA TGGCAACATT GTTTCAGGCC TTACTTTATT 420
TTGGCTCACG TCTAAGGTTT AGATTGGCTT GGATGCCTTG TCATGGCTTT CTTTTTCTCT 480
TTATCTCTGT AAAATAACAT TTTCCTTTGA TTTGCTCTTT CCTAGACTAT TGTATTGTTT 540
CTAACATTCA GGTGCCTTTC TTGTATTCCT TTTTTGTTCT ATTTGATGGA GCAGAAAATT 600
TGAGTTTGTT TCGATTTTTC TTTTGTTTCT AGCAGTTAGT CACCCTGCAG TGTTAGAGTT 660
GATAGTTTCC CCTCTTGTAC TACACGGAGG TTCAAAGTTC TGTTTTTTAC TGCGTTCAAT 720
TGCAAAGGGC AAATTTTCTA GCAAATGGGG GGAAAAAAAC CAAAAACAAC CCCCTCCCCC 780
CAAAAAACCC AAAACCAAAA AACCCAACAA GTCTCTAACT CTGAGTGGGT CTGAGTGCAA 840
CTGTAAATTA ATCCTTCAAA CAGGATTAGG TCTAGGCAGT AGGCAAGGAA GCTAGCTCAC 900
ACAGCAGCAG GTGCAAAGGT AGCCTATGCT TTCAGGAAGC CAGAGCTCTT TGATAGAAAA 960
TGGAAAGCAA CTGAAAACAA GGAAAGGCTA GAAACAATCC TGTAGGCTAA GCTAGCCTTG 1020
GGAGTTTCCC AAGGCCCATC CCTTCCTCCA TCCCTGCATG AGTCAGTTTT CCAGTGGGTC 1080
TACACCCATT TACCCTTCCT TTGCCAACAT CCCTGAATAC ATTCTCAGTA ACCCTCTAAG 1140
CATTTGCCAA AGATCTTTCT AGAGTGCAAG TCCAGACTCC ACCCTATCGC CCTGGTCCTG 1200
CGAACTAGTT CATAGTTTGC TGAATAACGT TGAAGTTCCT GGCTTCCTTC TCTGCCGACA 1260
AGTTAATCTC CTTTTAAAGA AAGGAAACAG ATGACTGTAT TGATTCTACA GGGCATTGAA 1320
ACAGATAGGC TTCTTGCACG TGCTCTGCAC TTTGCTCCAC CGTCCCAGGG CCCACTTGTG 1380
CCACACTCCC TGTGCCTATG ATTGTGTGCA CGTGGAAGCC AGGGGTCCAC ATTAGGTGTC 1440
TTCTGAAATT TACCTTCCAT CTTATTACTT ACTTTTTTGA GTGTCTCTCA TTGAGTCTGG 1500
AATTCAGAGT TAACTGGCTA ATGGGCTGTG AATATCTCCC ATTCTCTACC TGATCCCAGC 1560
ACTGTGGTTA CAGACACTTG CCTAGATGTT CGGAATTTGA ACTCAGGTTC TCAGACCTGA 1620
GCTCCAGCTT CTTTACGCAG GAGTCATCTC CCTAGCCAGC TAGCCTATCC AGGCAACTCT 1680
CTTTTTATCT TAGCAACTTC TGCACATCCT TCAAGGCGCT GCTTGCATAA GTTCCTCCAG 1740
GGAGCCTTCC CTCCTTTTCT CAAGGGCATT TTGGATATTT GCCTACCATC TTAGCACCAG 1800
CTGGCTGGTG CTCTTTTCTA CCATGCTGCT CCAAAAAGTA CAATCCGTGT ACTCCATCCT 1860
CCTGCACTTA CCTCCATCCT ACCTATACTT AACTACTTCT GCCATAGCTC ACATTCCATC 1920
CAGTTGCTGG AATGAATGCT GAGAAAGTCC TCAGGCGCTG GTGGTTACTA ATTGTCAGTT 1980
AGAAACTCCC TGTCTCTGTT CTCTGAGAAA ATGCTACTGT CATTCTACTT TGTTTCCATT 2040
GTTGGGGACT TGGGAACTTT TAATAATTAA CACTGAGAAG TGGTACTAGT TAATTAATTA 2100
ATTATTTCAG GAAGGGATCA GTAAGCAGCA AGTCCGTGTT TCATGGACCA GCAGAGGATC 2160
AAGATCTGTT ACTAGTACCT CTGCAAACTA GTGGAGTACT TTATTTATTT ATTTATTTAT 2220
TTACTCCGCC TAGGAGAGTG TGCCTGACCC ACTCAACAGA AACAGGGAGG GAGAAATCCA 2280
GTTTGCATTC ACTCACCTCA ACTCATGTTC AAACCATGAA ACAAACGTTT TTATAGTTAA 2340
AAATCATCCC TGACGAAGTT ATCAGAATTC CTTGAAATTC ACTGGAAATC CCGTCCGCAG 2400
ATCTTCAAAC TTTATCTCTT CTCAGAAGCC CAGAATTCTT TTCTTTCAAA GCCAAGTTAC 2460
AGGACAGCAG CTAATGAACT AGGAGCTGGT GTTTCATTTG CTCAGGCGGG CAGTTGCCCA 2520
GGGCTTGTTT GCGTGGGAGT ACCTCTGCAG CGCCTAAGAT GTTATTTTAT TTTAAAAGAG 2580
GGAGCCCTGC TTGCTTTCTG TACACCACAC TGCAGAGTTG GAAGTAAGGG AGCCTTTAAA 2640
CTGCAAGTTT TATTTGCCGA TAGGACAGGA AGGTGGCCTG GGTTTGTGTT TGGGTGACGA 2700
TCAGTTTTCT CGCAGAACTC CAAAACTGTG AGTGCTGAGA AAGATACCCA CCAACACCCG 2760
TGCAAGCTTC TTTCCCGCCC TTCGCCTTCC AGGTTCCAGG CGATGCGCTG CTTCTGCTGC 2820
TGCAGGCCGG GCAGCTAACT CTAACCTTCC GTCTAACCTT GCGGGCCTCG CGGGCTGGGC 2880
GCGGAGCCCC GGGAGCTGGA GCGGCGGTGA GCGGCGCGGG CCCGGGCGAG CGAGCGGGCG 2940
GGCGGGCGGG GGCCGGGGCT GCGCGTGGGA GCTCTGCGCG TCCGCGCGCC 2990