EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM149-00623 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymocyte 
Coordinate
chr1:193268130-193270810 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr1:193268536-193268551GATTAATGATTAAAT+6.53
NFIL3MA0025.1chr1:193270218-193270229TTATGTAACCT+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:193270268-193270283TGAACTCCTGACCTT-6.04
Nr5a2MA0505.1chr1:193270260-193270275GCTGACCTTGAACTC-8.73
RARAMA0729.1chr1:193270265-193270283CCTTGAACTCCTGACCTT-6.5
RREB1MA0073.1chr1:193269745-193269765TGTGTGTGTGTGTTGGGGGT-6.17
RREB1MA0073.1chr1:193269743-193269763TGTGTGTGTGTGTGTTGGGG-7.29
RUNX1MA0002.2chr1:193269157-193269168CTCTGTGGTTT+6.14
RarbMA0857.1chr1:193270268-193270284TGAACTCCTGACCTTC-6
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_08818chr1:193266977-193269424Liver
mSE_08818chr1:193269476-193271037Liver
mSE_09193chr1:193268073-193269209Lung
Enhancer Sequence
TGTGCTAAGT CACCATGATG ACTTTTGGAG TCCTAGGCTG TCAGCAAGCT TGTAAATGTC 60
TCTACTGACA GCAAGGCATA AAACCATCAC CAAATACAAA CACTGGTCTT TTTCCTGGTC 120
ACAGATACAC GCTCTATTCC ATGGACAAGG TCACTCACTT CTTGTGAACA TAAGCTGTCC 180
ACGACAGCCA AACACGTGCC CACACACACC TTCAAAGAAG AGAACAAAAA AGTTCTTAGC 240
AATTAATTCC CTGATGAGAT CACTTATGGC CATCTCCACA AATGGAGAGG GACAAGGCCC 300
AGAAAAATAC AGAGAAGAAC AAGAAAGCCA GATAGCCAAG CAATTAACTG TGGTGTGTAC 360
ATGCATACAG ACTCCACAGT GAAACTCCCT AGCAATGTTT TGCTCAGATT AATGATTAAA 420
TGGCTGTGTG TATTTTGACT AGAAGCCAAC AGCTGGGCAA GGTAAGAGGG AGACATGGTG 480
CCACGGTCAG CCAGGAATGA GAATCAGTCA GGCTTCTGTG CAGATAACCC AAGGCCTTGC 540
ACATGGATTC CCCCCAGGAC TTCAACTTTG TTCTTTAGAG AAAGGTGTTT TTTTTTGTTT 600
TGTTTTTTTA AGTCCAGACT GACTTCAAAC CCATGATCCT CCTGCATCAG CTTAACAGTG 660
CGGGGATAGC ACAACATCCA GCTAGCTTCT CAAAATATTT AGCTCACCCT CTGACCCAGA 720
CCTGACGTTT GAACCAATGT TGGTTGTGTC TGGAGGGCAG AGTCTGGGGC TCTGAGGTCT 780
GCTGCTGAGA GTCCTCTCCC CTCCGAGGAG CATGCCTATT CTTGACAGCC CACCCTTTCA 840
ACAGCACGTT TATTCCTCTT GATTCATTTT GTGCTCAGAA ATGTCATTGC TGTGTGCGGA 900
ATCACGTGGG AGTCACCTGT TAGGGAGACT AGAGGCAAAG ACAATCCAGT GCAGACTCCT 960
ATTTAGACAA TGCCAGATGT CCATCTTGTC TCAGAGACGT CTGGGGGAGC CCAGGAAGGA 1020
AGACAGACTC TGTGGTTTAT GTAAACTGTC AGCTTGGCAA GACCTAGAGT CACCTACTTA 1080
TTTATTTATT TATTTATTTA TCTATCTATT TATTTATTTA TTTAGAGACA GGGTTTCTCT 1140
GTGTAGCCCC GACTGCCCTG AAATTGGCTA TGTACACCAA TTTGTCAGAC TCAGAGACAT 1200
CTGCCTGCCT CTGCCTTTGG CGCCCTGGGA TTAAAGCCAT GTGCCACCAT GCCCAGCAAT 1260
CTTAGTTACA TCTGCTGTTG CTGTGATGAA ACCTCAGGAC CAAAGACAAC TTACGCAAGA 1320
GAGAGTTGAT TTTGGCTTTC GGTTCCAGAG GGCAAGAGTC CGTCACGTCA CGGTGGAAAG 1380
CCATGGCAGC AAGCAGTAGG CATGTGGAGC AGGAACGGAG AGCTTACATC ATCATTCAAA 1440
AACAGGAGTC GGAGAGCCGA GTGGACATAA GTAAGGTTTT AAACCCTCAA AGCCCACCCC 1500
TAATGGCTTA CTTCCCCGAA GTGAGACCAT ACTTCCTGAA CGTCTTCAAA CAGCTCTACC 1560
AACTGGGGAC CAAGTATTCA AATACTAGAG CCTATGGCGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1620
GTGTGTGTTG GGGGTGGGGA AGTTGGGGGG CAGATAGGGG TGACACATCT TATTTAAACC 1680
ACCAGAGTCA TCTTTGAGCC AAGTCCTCCG GGCACAGCTG TGCAGAGAGT TCTAGATTAG 1740
CTTATCTGAG GTGGGTGATG CACCTGGCGG CCGGATAAAC AAGCACCCAT CGGTCTCCTG 1800
ACTGCAGATG CAACGTGACC AGCTGCCTTC CTCACGGTGG TGGACTGCCG GTTCAAGGCA 1860
TGAACCAAAA CAAACACTTC TCTCCTCAAG CGGCTCTTGT TGGTGTTTGG TCACAACAAG 1920
GGGAAAGGTG ACTAACACAG TCTCCTTCAG TGAAATGCAC TCCACAGCAG GAAACCACAC 1980
TCCTCAGATC AAAGGAGGGG GTCCCTCTCT GAGACTTCTT CCCTTTCTGC CTATCCTTTT 2040
CCATCCACAT TTAAATTTAA AAAAAAAAAT TTTTTTTGAT GCAGGGTCTT ATGTAACCTG 2100
GGCTAAGGAC AACCTTTCTA TATAGCACAG GCTGACCTTG AACTCCTGAC CTTCCTGTCT 2160
GTAGCTCCCA GTTCCTGAGA TTACAAGTGT GTGCTGCCAC AGCTGCCCGC CCCCCCTCTA 2220
TCCTCTTTTA CTGACCACCT TCGTGTTAGG TTCAAGAGCA GAGAATACAG AACAACAACA 2280
ACAAAAACTA GAGAGCGTGA AGCACTGGGT AGTAGAGCTA ATGAATAACC AGCAAGTTCC 2340
ATAACCCGCC TTGTGCACCT GTATCTCAGG GCCTGCTTTG ACAGCAGGGC CTTGGTGGAG 2400
GAGGCTGCTG CCAGCAGCTC ATTCAGCTAA ATCAGTAATA ACGTGGGTCT CAGAGCATCT 2460
TCAGCACTGT GCTCTATAAT AACAGAGGAG AAATATATCC TAACTAAATC CAGGGTAAGG 2520
GTGTTGACTG GATGTGTGAA TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGAGAGAG 2580
AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGCCAA CACCAGCTTT AGCTCACTTG GTAACTGAGG 2640
CTGGCTTCAA ACTTGAGATC CTCCTGTTTC AGTTTCCAAG 2680