EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM149-00323 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymocyte 
Coordinate
chr1:89532630-89535020 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYBMA0502.1chr1:89534251-89534266CTGATTGGCTCAGCC-6.05
Nr2f6MA0677.1chr1:89534468-89534482TGACCTATGACCTT-7.1
RXRBMA0855.1chr1:89534468-89534482TGACCTATGACCTT-6.18
RXRGMA0856.1chr1:89534468-89534482TGACCTATGACCTT-6.44
RxraMA0512.2chr1:89534468-89534482TGACCTATGACCTT-6.34
Tcf7MA0769.1chr1:89533801-89533813TCTTTGATCTTT-6.74
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00240chr1:89516600-89556311pro-B_Cells
mSE_03427chr1:89532686-89534513Bone_Marrow
mSE_06310chr1:89532523-89535947E14.5_Liver
mSE_09143chr1:89534614-89535883Lung
mSE_12014chr1:89532904-89535860Spleen
Enhancer Sequence
CAAACAAACA AAAAATCATC AGTGCCAATC AAAGCCGGGG AAGACCACCC TTGCAGTGTT 60
TGTGTGACAA ACACAGGGAC TTGTCTGACC ACAGAGTGTG GCAGCTGAGT GATGTGGAAG 120
CCAGAGAAGC TAGTTTTTGC CTGACTTCAT TGGGGAAGCA TGGGGGCGTG CAGAAAGGAG 180
GTGACAGCCC CCATGTCCTC AGTAGAGGAG AGGGCTGTGT GTCATTAAGC TCACAGCGAC 240
CATAGTAAGA GTCACAACAG CAGATGGGAC ATCTGTGTGA GCAGTGCAGT AAGGAAAGAC 300
AAGCATCTAG GGACTGGGTC ACCAGAACAA CAAGGAGCAA AGTCTTCAGG ATTTTGCTGA 360
AAAGAAAGGG GTGGGAAGGG AGATGTGAGG CATGTTGGTG GCTTCCGGAA TGTGACAGGA 420
ATGATGAATT GTTTCGATCA AAGGGGTAGA CTCAGAGCTG CCTTGTTGAA AGGCAGTCCT 480
TAGGCAAAAG GCCCCAGAAA CATGGAAGCG AGAGAGAAGT TATGAACAGA GGCAAAGCCT 540
CGGAGGGCAG CTCATGATGG AATTCAAAAG AAACCACATC AGTACTTCCA ACAGTCACTT 600
CCTCCAGACG GTGGGACTCG AAGGGGGCCA GTTCCATCCA GGGTGTGGCA AAGCTTCCGT 660
CTAGGGGAAG GGTCTGCTCA TACTGAGCTT CATGGGAGAG GCCAGCGTGA ACCACTGTGG 720
GCTGGAGTAA CGGCTGTACT GCATAGCATG GTGGTCAGGC TGAGCACAGT TCATACTTTT 780
TCTCGTGTGC GCATGAACAC CAGGATGGAA GGCGGGGCGG ATGGGAGGCA GGGCGGATGG 840
AAGGTGTGGT CTAGGGGTCA GGGAGTCCCT TTCCCAGCCC AGTCATTGGT GGGAAGCAAC 900
AGAACAAATC TGAGTACCCG CAAGCAAGCG CCCTTTTTTA AGCTTGGCAG GTGTTCGTTG 960
CCTGAATACT TTCTGAGATG TGGACGCCAC CAGCTTCTGG AGACATGGCT CAGGGGAGGT 1020
GGCTTAGGCA TGCAGCCGTG GTCTCTACTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TCTAAGCCTA 1080
GGACTGTGTG AACTTTGCCT GGTGGCTTGG TGTCCTTGGC AAGTGGCTTC CTGCTAGGAG 1140
TCAACTCTCT TAAGTTAAAA GTTAGTCGGC ATCTTTGATC TTTCTCCCCT TTTGTGGTTT 1200
CTTCTGTTCC TTCAAAGTGA TGAAGACTTT AAGTATGACT GGAAAAGAGG TGACTCTGCG 1260
GCTTCTTGTT GAGGGTTTGT GCCCACAGCT TGTGAACCCA TAACTCTGCC TGTCTGGAGT 1320
CTGTACCCAC GTTCTCTTCA CTCTTGCTTC CGTGGCTTCC TGTGACCCCA GAAATGACCA 1380
CAGACCTTCA GTGGGACTAG GAGCTTCAGT GTGCTTTGGG AGTCCCTCTG GCTGATTTTT 1440
TTTTTTTTTT TTTTGCAAAG GTTTAGTGCC TTTGGTGGCC TGAAGGACAC TAGAGAAGCC 1500
CAGGCCTTGG GACCAGAGGC TCTGGGGCCC TGGCTGGGTT CTACCTCAGT GAGTCAGCTC 1560
TTCTCTGTGG GTTGCTCCTC CCCTGCTGAC AGCACTGCTC TTCTCAGATC CCAGAGGGAA 1620
CCTGATTGGC TCAGCCACCA ACAGCTCTCT CTGCCTGAAC CACTCACCAG CTACTGAGCT 1680
CTTTGCTGCT TGGCTGTTAG GAAGCAGGTA CCTGCCCACC ACTGACAGAT GAGGACAGAT 1740
CATAGCCTCC TGTGGCTACC TCAGCCAGGG CAGTGAGCAG GCAGTTTTTA TAGAAGAGAT 1800
ATGGCCTTGC TGGACACAAT TGGTTTCAGT CTTGCACTTG ACCTATGACC TTCTTGGTCA 1860
TCTATACCAG CCAAGGGACA GGAAGCCATG GGCCTAAATG GTTTGAAAGT CCCCACCTAT 1920
AAGGATGTCT TGTCCTATAA AAAACAAACA AGCAAACAAA ACAACAACAA CAAAATCCCC 1980
ACACATTTAC AAGTGCTGGA GATGTAGATA AGCTCAATTG GTAGAGAGCC TATCTAGCAT 2040
GTGCAGACAT GGTTCAGTTC CCTAGTACTG TGTAACACCT GGCATAGTAG CACATCCCTG 2100
TAATCTTAGC ACTTGGGGAT AGAGGTATAG AGTTAAGAGG ATGGAAAGTC TTCAGGTACA 2160
TAGTGAGTTA GAGATCGGCA CACATGCATG TGCACACGCT CATGCACACA CACATGCATG 2220
CACATGTACA GAACACACAC CAGACATGCT AAAACAAACA ATATAAGGAA CAAATCAAAG 2280
CTCACAGCCA GTGAAGGCAA GGCAGAAACA TTCTTCAGGA AGCGTTGGTA TTTGGCCACT 2340
GCTTATTTTA ACTCCAGTTC CTCTTTTCAT GTTGAAGCAA AACCTGCATT 2390