EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM149-00177 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Thymocyte 
Coordinate
chr1:72271940-72274090 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:72272724-72272742GGAAGGCAGGAAGTGAGG+6.53
KLF5MA0599.1chr1:72272573-72272583GGGGCGGGGC-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr1:72272902-72272915ATTAAGTGGATTT-6.2
PKNOX1MA0782.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-7.22
PKNOX2MA0783.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-7.22
SP3MA0746.2chr1:72272558-72272571CGCCACGCCCCTC+6.18
TGIF1MA0796.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-6.92
TGIF2MA0797.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-6.92
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_10125chr1:72271505-72272551Embryonic_stem_cells
mSE_10125chr1:72273712-72274091Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
AGCCAGGGTT ACATAATGAA TGTGAAGAGA GAGCCCCTGC CCTGGTCCTC AGAAACTTAC 60
ATCTTCCCCA CCTGACTCTC CCACCTGTTT GATGTCCTAC TACTTCAGAT CATCTTAACC 120
TTGAATCAGG CCAGGGCCCC TCCCCAATTG ATTCCGGGGG TGTTCGCATC ACGATGTACC 180
TAAGGCTTAG TCACCCAAAA ATTTGCTGAA AACTTACTTT TTTTTTTTTT TTTTTTGCGC 240
ACCTGATAAG GGCTGGCGCA CTGAGAAAAG TCCAGATGAT ACTACAGCCA ATAAAGAGAG 300
CAGACTGGAG TAAAAGAGTC AAAAAGCTGA ATTAGCTGTG AATGCCTGGG CGACAGAACA 360
TCCCAGGATC GCGCTTGTGA TGGGCTCAGG AGAAGCTTTT GGTAGTTAAA TAGCCAAGTG 420
AGAAAGGGGA GGATACGGTG TCAAGTCACA TACAGCCTCA GGACTGGAGG AAACAGCACG 480
GACGAAGAGC AGACTGCCTG AATCGAAACC AACCCTCAGC TCCTCAGGCT ACCTGTTCCC 540
ACCTCGCTTT CCTCTGTGGA GGAAGAAGCG TAGGTGGGCC GCTTTGAGAC TGCCAGGAGG 600
AGGCGGCTCA GTGCGAACCG CCACGCCCCT CGTGGGGCGG GGCATGCAAA TAATACTCGG 660
CGTGCGCGCT CGAGAACGCC GGGAGAGCCG GGGTCGTGGA CGTTGTAGCT GAAGCTGTGG 720
GTGCTGGAGT GGGAGTGAGG CGTGGAGGAT GCAAGACGCG CACGGGAGGA GGAAGGAGCC 780
GCGGGGAAGG CAGGAAGTGA GGGTTGCGAG CGGTCACCAC GAAGTTAATG TGTCTCGCGG 840
ACGCAGAGCA CGGCTGCATG GTGTGTGCTG GGTATCGCTT CTCGGCCTTT TGGCTAAGAT 900
CAAGTGTAGT ATCTGTTCTT ATCAGTTTAA TATCTGATAC GTCCTCTATC TGAGGACAAT 960
ATATTAAGTG GATTTTTGGA ACTAGGAGTT GGAATAGGAG CTTGCTCCGT CCACTCCACG 1020
CATCGATCTG GTATTGCAGT ACCTCCAGGA ACGGTGCACC CCCTCAGGGG AATAATATTT 1080
GTTTAAAATT AGAGCTAATT ACTCGTTTTC CCTTTGTCTT CCAAAGGTTT GTTTGATTTG 1140
GGGCTAACTT TAGAAGCATC TTTTCAGAGC CCTAATACTT GAGAGGCAGG TGAATTTCTG 1200
AGTTCTGAGG CCAACCTGCT CTACAGTGAG TTCCAGGATA GCCAGGGTTA CGCTGAGGAA 1260
CCCTGTTTTG GAAAACCAAA TAAAATACGT TTCTAGTCTT TATCTTTTGT AGTATTTGAG 1320
TACCTAATAA AACTCTGAGC TTCTAGTGTT ATTATCTGTA TCCTTTGTAG TCAAGATTAT 1380
TATTATGATG TGCAAGTTCC AGCTTGGCGT AACACAAAGC ACCTAATGAC TGTTGTATCT 1440
AACACCCTTG ACTAAGGAAC CAGCTGGTGG TGTCAAAAAC TCTAGTATTT ACTAAAACTT 1500
TTGAAAGTCA ATTTTTTAAA AATAGCTTTC TGTGTATGCA TATGCGTAGT GTGTTTGTGG 1560
GCACACAGCC ATAGGAGTGG GTTCTTTACT GACTTCAGGT GAGTTCTATA CTGGCAGTAT 1620
ATGTCAGGGA AAGCTGTGCG TATTTATACC TGCCTTAGCC TCCTAATTTC TAGGGGTTTC 1680
CCCCTCATGG TCTTTTTTTT TTTTTTAAGA TTTATGTATT TATTATGTAT ATAGCATTCT 1740
TCCTGCATGT ATACCTGTAG GCCAGAAGAG AGCACCAGAT TTCTTTATAA GTGGTTCTGA 1800
GACACTATGT GGTTGCTGGA AATTGAACTC AGGACCTCTG GAAGAGCAGC TCTGAACCTG 1860
ACCCATCTCT CCAGTCCCTG TTACAGTCTT AAAACTTTTT GACACCTGTC AAAGAATGTT 1920
AGGATTCAGA GAACTGGCTG TTCTCCCAGA GATCCCTGTA ATTTCAGGTC CCCCATGCTT 1980
CAGGTCCCAA TACTCAGTTG GGAGCTCACA GTGTTTTGTA AGTAAATAAA CATGCCCAAA 2040
CCACCCGTGA ACACACACAC ACACCACAAT AAATCCAAGT TTAAAGAGAA AAACTCGGGG 2100
GGGAGGGTAT GGGGGACTTT TGGGATAGCA TTGGAAATGT AATTGAGGAA 2150