EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

MM147-16256

Organism

Mus musculus

Tissue/cell

Th1

Coordinate

chr5:137625220-137627630

Target genes

Number: 10
Name	Ensembl ID

Fis1	ENSMUSG00000019054
Plod3	ENSMUSG00000004846
Znhit1	ENSMUSG00000059518
Vgf	ENSMUSG00000037428
Ap1s1	ENSMUSG00000004849
Serpine1	ENSMUSG00000037411
Trim56	ENSMUSG00000043279
Ufsp1	ENSMUSG00000051502
Srrt	ENSMUSG00000037364
Slc12a9	ENSMUSG00000037344

TF binding sites/motifs

Number: 3

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

BATF3	MA0835.1	chr5:137625871-137625885	TGGTGACATCATCA	+	6.01
TFAP4	MA0691.1	chr5:137625392-137625402	ATCAGCAGTG	-	6.02
TFAP4	MA0691.1	chr5:137625968-137625978	ATCAGCTGTT	-	6.02

Enhancer Sequence

NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 60
NNNNNNNNNN NNNNNNNNTA ACTTCAGCAG TGGTGGTGAC ATCAGCAGTG GTGGTGACTT 120
CAGCAGTGGT GGTGACATCA GCCGTTGTGG TGACATCAAT AGTGGTTGTG ACATCAGCAG 180
TGGTTGTGAC ATCAGCAGTG GTGGTGACAT CAGCAGTGGT GGTGACATCA CCAGTGGTTG 240
TGATTTCAGC AGTGGTTGTG ACTTCAGCAG TGGTGGTGAC ATCAGCAGTG GTGGTGACAT 300
CACCAGTGGT TGTGATTTCA GCAGTGGTTG TGACTTCAGC AGTGGTGGTG ACATCAGCAG 360
TGGTGGTGAC ATCACCAGTG GTTGTGACTT CAACAGTGGT GGTGACATCA GCAGTGGTGG 420
TAACATCAGC AGTGGTGGTG ACATCAGCAG TGGTTGTGAC ATCAGCAGTG GTTGTGACTT 480
CAGCAGTGGA GGTGGTATCA GCAGTGGTGG TGACATAAGC AGTGGTTGTG ACTTCAGAAG 540
TGGTGGAAAC ATCACTAGTG GTTGTGATAT CAGCAGTTGT GGTCTCTTCA GAAGTGGTGG 600
TGACATCACT AGTGGTTGTG ACATCAGCAG TTGTGGTGAC TTCACCTGTG GTGGTGACAT 660
CATCAGTGGT TGTGATTTCT ACAGTGGTGG TGACTTCAGC AGTGGTGGTG ACATCAGGAG 720
TGATGGTGAC ATCACTAGTG GTTGTGACAT CAGCTGTTGT GGTGACATCA GCAGTGATGG 780
TGACATCAGC GGTGCTGGTG AAATCAACGG TGGTTGTGAT TTCAGGTGTG GTGGTGACAT 840
CAGCAGTGAT GGTGACATCA CCAGTGGTTG TGACTTCAAC AGTGGTGGTG ACATCAGCAG 900
TGGTGGTGAC ATCAGCAGTG GTGATTACTT CAGCAGTGGT GGTGACATCA CTAGTGGTTG 960
TGACTTCAGG AGTGGTGATG ACATCAGCAG TTGTGGTGAC ATCAGCGGTG CTGGTGAAAT 1020
CAACAGTGGT TGTAATTTCA GGAGTGGTGG TGAGGTCAGC AGTGGTGGTG ACCTCAGAAG 1080
TGGTGGTGAC ATCAGCTGTG GTGGTGACAT CAGCAGTGGT GTTGACAACA CCAGTGGTGG 1140
TGAAGTCAGC AGTGGTTGTG ACTTCAACAG TGGTGGTGAC ATCAGGAGTG GTTGTGACAT 1200
AAGCAGTTGT GGTGACATCA GCAGTGGTGG TGAAATCACC AGTGGTGGTA ACATCAGAAG 1260
TGGTTGTGAC ATCATCAGTG GTTGTGCTTT CAGCAGTGGG TGTGACATCA CCAGTGGTTG 1320
TGACTACATC AGTGGTTGTG ATTTCATCAG TGGTTGTGAC TTCAGCACTG GTGGTGACAT 1380
CAGCAGTACT GGTGACTTCA CCAGTGGTTG TGATTTCAAG TGTGGTAGTG AGGTAGGCAG 1440
TGGTGGTGAT TTCAGTAGTT GTGGTGACAT CACCTATTGT GGTGATATCA CCAGTGTTTG 1500
TGACATCAGC AGTGGTGGTG ACATCACCAG TGGTGGTGAC TTCAGCAGTG GTAGTGACAT 1560
CAGCAGTGGA GGTGACATCA GCAGTTGTGG TGACATCAGC AGTGGTGGTG AACTCAGAAG 1620
TGGTGGTGAC ATCAGCTGTG GTGGTGACTT CAGCAGTAGT GGTTAAATCA GGCATTGTGG 1680
TGAGATCTGC AGTGGTGGTG ACATCAGCAC TGGTGGTGAC ATCACCAGTG TTGGTGAAGT 1740
CAGCAGTGGT TGTGACTTCA GCAGTGGTGA TGACATCAGC AGTGGTTGTG ACATCAGCAG 1800
TGGAGGTGGT ATCAGCAGTG GTGGTGACAT CACCAGTGGT GGTGACTTTA GAAGTGGTGG 1860
TGACATCACT AGTGGTTGTG ACATCAGCAG TTGTGGTGAC ATCACCTGTG GTGGTGACAT 1920
CAACGGTGCT GGTGAAATCA ATAGTGGTTG TGATTTCAGG TGTGGTGTTG AGGTTAGAGG 1980
TGGTGGTGAC CTCAGAAGTG GTGGTGACAT CACCACTGGT TATGACTTCA GCAGTTGTGG 2040
TGACATCATC CATAGTGGTG ACATCAACAG TGGTGGTGAG GTCAGCAGTT GTGACATCAG 2100
CTGTAGTGGT GACATCAGCC ATGGTGGTGA CATCTGCAGT GGTGGTGACA TCACCAGTGG 2160
TGATGAAATC AGCAGTGGTT GTGACTTCAG TAGTGGTGGT GAGGTCAGCA GTCGTGGTGA 2220
TTTCAGCAGT AGAGGTGACA TCATTAGTGG TTGTGACTTC AGCAGTGGTG GTGAGGTCAG 2280
CTATTGTNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 2340
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 2400
NNNNNNNNNN 2410