EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM144-00550 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Stomach_neonate 
Coordinate
chr1:88377470-88379640 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr1:88378473-88378484TCTGATTGGCC-6.02
Nr5a2MA0505.1chr1:88378707-88378722GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
RREB1MA0073.1chr1:88379386-88379406CCCACCCCCACCCCCACCCC+6.27
TFAP2B(var.3)MA0813.1chr1:88377822-88377835TCCCCTTAGGGCA+6.34
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02944chr1:88330130-88420834TACs
mSE_05516chr1:88377944-88379398E14.5_Limb
mSE_06338chr1:88375157-88378626E14.5_Liver
mSE_10015chr1:88377368-88379289Embryonic_stem_cells
mSE_11278chr1:88377349-88379466Placenta
Enhancer Sequence
GCCCCTTGAG ATAAGTCCGG GCAGAGCAGA GCTGGAGGCT TCTTGATATG TCAAAGGTCC 60
TGGAGGAGGA GGTAGCTCAC TCCGGTGTTC TTGACTATCA CCAGGTGAAG CAATCTGAAA 120
GATGAGGCCC CTGGGATATT TTCTGATCGC AGGGACTCAT GGTCAGTCAC CTAATGTGAA 180
ATGACCCTGG ACATCTGGGA GAAGAGCCCA GTCTGCCACT CTTGCATGGC TTTATCACCC 240
AAGGGCTTAG AGGCACCGGA TAGAGCAGCC ATCCATGTAT ACTACAGACA GGCCTCCTTC 300
CAACCAAGGC AAAGTGTCCA GGGTGGCTGA GACAGTCTTC AGTCTTGCTC TGTCCCCTTA 360
GGGCAACTCT ACATTATACA CAAAGGGCTG GAGTAGGGTT GGCCCACTCT GAACTGCTGG 420
ACTTCCAGGA CTGAAGTCTG TTCTCCTCCG GGCCACACTT TCAGTGCGCT TAACTCAGTG 480
TGATTGGGTA AAAGAATGTC AAGGCCCTTG TTAAAACACA AACGGCGGTT CAGTGGGTTG 540
GAGAGGGGTG GGAGACTGCA CTGCTTTTTT CTTTTTAATA TTTGTCGTGT GTGTGTGTGT 600
GTGTGTGTGT GTGTGTACAC ACACACACAA AGAAGGTAAG AGGAACAAAG AAGGTAAGAG 660
GACAACCATG TCCGGTATTG ACCCTTGCCT CACATCTTGC TTAGAGCAGG CGCCTCTTGA 720
TTACCGCTGT GTACTCCAGG CGGGGTGAGC CTTGAGCTTC TGGGAACTCC CATCTCTGCC 780
TTCCATCGCT GTAGAGTGCT CAGATTACAG ACCTGCCTAG CATGCATGAT CAGCTTTTAC 840
AGAGGCCTGA ATTCAAGCGT GGCCAGAGGT GTCTGTACTC ACTGAGCTGT GCCCCCTGTC 900
CCCTGACATT TCTAACTAGT GTTGGTGGGA AATGTGGGGC TCTTGGGACT CACTAATCAG 960
ATTGTGCCTA GAATATGCCA TCAAGAGCTC GTAATCTGTC CCTTCTGATT GGCCTGTGAA 1020
TGTCCATCAA GGTGTGGGTA CCCAGTAGGC CATAATTGCC CTGACTTGTA ATCCCAAGAT 1080
GTGAGATATA AGAGGAAGGA GCAGAAGCAT TTAGTGTTCT AGGCCAACCA AACCTGAACT 1140
ATATGGTAAA GTCCTGTCTG AAAAAACAAT CTAGCCAGGC GGTGGTGTCG CACGCCTTTA 1200
ATCCCAGCAC TTGGGAGGCA GAGGCAGGTG GATTTCTGAG TTCAAGGCCA GCCTGGTCTA 1260
CAGGGTGAGT TCTCCAGCCC TGAGAGATCC TATCTGGTGG AGAAAAAAAA AAGGTGATAG 1320
AAAAACCTGA CACTGATTTC TGGTTTCCAT ATGCACTGGT GCATACACAC ACACACACAC 1380
ACACACACAC ACAGGCAAAG CAGGTAAAGG TTCGTTCTGC TAAGTCTAGG ACCTGAATTT 1440
AACTCTCAGG ATCACATGGT AGAATGGAAG GAGAAAACTA AGTCCTGTTG ATTGTCTTCA 1500
GACTTTCGTG AGCTGGAGGC CTAGAACAGG CAGTGATCAT GCACGCACAC GCACGCACAC 1560
ACAGATGTGC GCGCTCTCGA GCACACGCCC ACACACACAG TTTAAACTGG ATGGTGCTGG 1620
GGCACGCCTT TAATTCCAAC ATTCTGGGAG GCAGAGGCAG GTGGATTGCT GGTCTACAGA 1680
GCAATTTCCA CGACAGCCAG GGCTACACAG AGAAACCCTG TCTCAAAAAA CAAACAAAAA 1740
CCCAAAAAAT ACAGTTAAAA GGGGAAAAAA AAGGCTACTT AGCAGGACAA ACAAAATGTA 1800
GCTGCCAGAC ACAACTGGAC CAGTTAATCC TTTAAATTCT TGTCACTGCA GCTAAGAGGA 1860
GCAGGGGTTG GTGACAGGCT CACTAGCTGC TAATGCAAAC CTCCTCTACC CTGTCTCCCA 1920
CCCCCACCCC CACCCCCAGA GGGAGCTTTT CATCAAAGCC TGGCACTGCA GAGGGGTCCT 1980
GGTGGGGTAG AACAGCCCTG CCAGCCCGCC CTCCCCTCCC CTTTAAAGAA GTGCCTCAGC 2040
TGCCTAGACA AGCCTGAATT TCCCAACCTG CTCATAAAAC CAGTTTCCCC AGGTTCTTGC 2100
AATACAGTTT CTATTCATTG GGTATGCCTC CCCCATCTAG TTGAGCTATA GACACTCTGT 2160
CTTAAAAAAA 2170