EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM141-00341 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Spermatid 
Coordinate
chr1:89750240-89752970 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr1:89752919-89752930ATGACCTTGAC-6.32
EsrrgMA0643.1chr1:89752919-89752929ATGACCTTGA-6.02
HOXA13MA0650.2chr1:89751209-89751220GTTTTATTGGT-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:89752926-89752941TGACCTTTTGATCTT-7.29
Nr5a2MA0505.1chr1:89752918-89752933CATGACCTTGACCTT-6.8
Nr5a2MA0505.1chr1:89752889-89752904GCTGGCCTTGAACTT-8.42
RARAMA0729.1chr1:89752923-89752941CCTTGACCTTTTGATCTT-7.86
RarbMA0857.1chr1:89752926-89752942TGACCTTTTGATCTTT-7.61
ZNF263MA0528.1chr1:89750500-89750521TCCCTTTCACCCTCCTCCCTC-6.73
ZNF263MA0528.1chr1:89750485-89750506CCCTCCCTCTCTTCCTCCCTT-7.26
ZNF263MA0528.1chr1:89750473-89750494TTCTCCCTCTCTCCCTCCCTC-7.51
ZNF263MA0528.1chr1:89750497-89750518TCCTCCCTTTCACCCTCCTCC-8.24
ZNF263MA0528.1chr1:89750482-89750503TCTCCCTCCCTCTCTTCCTCC-8.27
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00241chr1:89743208-89763671pro-B_Cells
mSE_12094chr1:89747088-89752209Spleen
mSE_13016chr1:89749882-89752282Thymus
Enhancer Sequence
GGTGGGCGCC GCCGCTGAGG AGACCGAGGC CCGGCGTGCT GCTGGGGCCG CTGCGGGGAC 60
CGCTGCGGGG GCCGCAGGCG CGTGCTCCCC GAGGCCTGGG GGGTCTGTAG GTCTGAGCAC 120
CGGGTGCAGC TTCCCGTACT CACCTGCGTC AGGCTCTCCC TCCACTGCTC AGCCCGCTGC 180
GGGGTCCTCA CCCCTATGTT CCGAAAGGGA AGGGATGCGC GTGTAGTGGC CGCTTCTCCC 240
TCTCTCCCTC CCTCTCTTCC TCCCTTTCAC CCTCCTCCCT CCTTGGGAAA GCCGGGACTC 300
CTCACCCGCT GGGCTCAGAA CTCTCTCCGT GGAGAACTCC AGCCGCTCGG GTTGCAGTGC 360
AGAGAGACAC ATGCCTTTTT GTTGTCTTTC CCTAAGAATA AAGTTGCACC CTTTGCTTTT 420
CCTTTCTGGT TCCTCTTGAA AACTGCGTAT GGTTTCTTGC CGAGGTGAGC CCTCCTTGTT 480
GGAAGGGCTT CCTCAGGCAG GTGGCTGGAC AGGTGGTGGC TAGCAGGTTG CCACCGTGGG 540
GCAGCCTTGG CAGTTCCGGC TGGCACGGGC TTGCTCATCC TGCTGCAGTG CGCTTTTCCT 600
CCGAGGCCAG TTAGTTACCC TTTACTGGAA AAACCATTTC TTGCTTGATC ATCTGCCACC 660
CTCTGTTACT TGCCGGGGTT GGGGATTGGG GTGCCATTTA GGTGCTGACG TGGTCCATTT 720
GTTATGTGGT ACCCAAGTCA TTCAGCACAC GGGACCTAAC ACCTGTGTTA TTCTAGCTAT 780
AACAATTACA GCCCCAGGAA CAAGTTTAAG GAGCCTTGAT ACTAATGGAA ATGCCCTTTC 840
CTAGTGCTTG GTCCTTAAGA TAGGTAGTGG TGTGAGGCAG ATCAGACTCT CTGACTGAGG 900
GGAATGGTGA GTGAAGGCCA GGATCGCGGT GGGGACGGTG GACTCCTCCG AAATTGCATT 960
GAGTCCAGAG TTTTATTGGT CAGGAGGTGT CTCCCTGCCT TTCCTCTGGA CAAAAACAAT 1020
AGCTGCTATA CCAGCTGTTC TGGTTGTTGT TGTTGGTAGG AGTGACAGTT GTGGTGTTAA 1080
AAATACACCC GAGGACTTGT GTTCTGAATA CATTCACATC TGCTGTACAG ATAGCTCAAG 1140
GCTGATTTTT CTTCTGGGTT GCTAGAGCTT GTTAAGAAGT GGGAAATAAG AAGTTTACTG 1200
TGTGCAATAA CTTCCCTTTG TAGCAGAGAG GCCATTCACA AAGATTTCCT GGTAATATGT 1260
GTGTGGCATA TAATGCTAAG TTCCAAATGG TGTGATCAGA ACCCACTCTT ACTGTTTGAC 1320
CAGAAGAGCT TAGTGCAGGG GCGCTGTGAC ACAGGTGCTG AAGAACAGAG AGGGAGCTGC 1380
ATTGAGGCAG TTCAGAGCCG AGGCCATTAG CAGGAAGCCA CTGCTACCAC CCAGGGGTGG 1440
GGGAAGAAGG TCAAAGGGAG AAGACCACAT CAGACTCCAG GGCCAATGGG CCCCTCCAGA 1500
AACTGGGTCA GAGGAGTCCC ATCTGTCAGA GCTCTGGGAG GGCAGAGCTG CTGCTCCATA 1560
TATACTAATC CTTTGCCTGG GAATCCTGCT TGTAAGGGTC ACCCCCTCTG CAGTTTGAAA 1620
ACAGAGGACG GAGGATGGGT CAGAGGGCCC TGATCCAGGA TCAGAGCTGG ATGTATGGCA 1680
GGTCTTCAAA CACATTAATT TACTGTAACC TTTAGACATC ACAATTCAGG AGAGAATTGG 1740
TAGTGGTCCT CAGATTTCAG AGTGCAGACA CATCCCCTGA GGATCCTCTT AAGTCTCTGA 1800
TGCTGGTTGA GAAGGACTGG GTGGGGCCTT AGAAAGTATA TTTTTAACAG GCTCCCAAAG 1860
TTGCTGCTAT TGTCCAGGAA GCATGCTTTG AGAACCAAGA CCCTAGGGTG GTCCTGTAGA 1920
GAAAGAAACC TCACCAAGCT CCATGTACTT CTGGTCACAA GGAGTTCTGA AAGTTTTCTC 1980
TAAGCCTCCC CTGAAAATTA GATGTATGGA GCAGATCTGG GGTGGCCATT TATGACATGT 2040
TTGATTGGTG TCTCCCCCAC CCCTCTTTGA ATTCTTTTCA GTTGAAACTG CCCCCAGCAA 2100
CCACATGGCT CTATTTGTGT TTTCTGACAA CTACACAATG ATAACATAGT TGGGTTGGTA 2160
GTAGAAAGAG AGACAGCTAA TTCGCTGAGC AGTATGTGCA TTAGCACTTT GGAGTGTATT 2220
TTGAAATCTG AGAAAAGAGC AGTGTAACTC TTTGAAGCTG TTATTTAAGA TAGAATTTTG 2280
TTACAGGTTT TTAAAAAGTT AACTTTTTTT TTTGATTTAT TTGAGTATAG AAATGTTTGC 2340
ATTTCTTTTG TCTTTTTAAG TTTTCTTTTT TTGAGACAGG ATTTTTCTGT GTAGCCTCAA 2400
CTGACCTGGA ACTCATTTTA TAAACCAGGC CGGCCTCAAA CTCAGAGATC TGCCTGCCTC 2460
TACCTCCCAA GTGTTGGAAT AAAAGTCATG AGCCACCACA CCCTGAAGAA ATGTTTATAT 2520
TTTTGATGTC AAATGTAAAG TGTTTTTTTT TTTTCCTTTG CGAAATGAAA AGTAACAGAA 2580
AGTAAGTAAA GGGATCAAGT TTTATTTTTT ATTTTAGTGT TTGGAGGGAA ATGGTTTCAT 2640
GTAGTCCAGG CTGGCCTTGA ACTTGCAGTG CAGCTGAGCA TGACCTTGAC CTTTTGATCT 2700
TTTGTCCTAC CTCCTGAGTA TATGCTATAT 2730