EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM139-09049 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Rib_chondrocyte_P1 
Coordinate
chr5:22918150-22920680 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr5:22919426-22919438AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr5:22919430-22919442AAACAAACAAAC-6.32
Foxo1MA0480.1chr5:22919510-22919521TCCTGTTTACT+6.32
MecomMA0029.1chr5:22918404-22918418AAGATAAGATAAAC+7.14
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02660chr5:22892037-22926078HFSCs
mSE_03090chr5:22905878-22925828TACs
mSE_04396chr5:22919120-22921244E14.5_Brain
mSE_06642chr5:22917650-22922405Heart
mSE_07213chr5:22919259-22920429Intestine
mSE_07985chr5:22917771-22922374Kidney
mSE_08464chr5:22915282-22921770Liver
mSE_08964chr5:22919065-22921063Lung
mSE_09525chr5:22918652-22921037MEF
mSE_10518chr5:22918610-22919157Embryonic_stem_cells
mSE_10518chr5:22919209-22920415Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
TGATTGCATC TTGTTTTCAG ATTGTATACA CTTGGCCACG TAGTTTCCAG TTTTTCCTGA 60
CTGTAACCAC CACCTCTTTC TCCAGACACA ATGCAGAACT CATGTATCTG GAGCCAAGAG 120
GTTTATGTAG GAAGGCTGCC CAGGTTGAGT CTTCTGGCTA CCTGGCCTCT TAGGTAATGT 180
GGAGAACTGA AGCCACACAT GCCAATGATA ACTCAAATGA ATTTGGTGGT TGTAATTGCC 240
CAAGCCATAG CACAAAGATA AGATAAACTA TGGAGCAGCA GCACTTTAAA AGCTATCTTG 300
AAATACTTAA CCCAGTTTTC GTGGGTCAGG GCTGTGGGGC GCAGCTTACC CGGGTGCCTG 360
TAACTCAGAA CCATTCAGCA GGCTGTGGTC AAAGTGCTGA ATCATTTCTC ACCTAGGTGG 420
CTATTAGAAG AGCAGGTCCT CCATCCAGCA GCAACTTAAC AGAAATCTTC ATGTTGGGGG 480
CTGGGTCTCA GGAGTACAAA ATATATTTGC TTTCCTAGTT GAGGTTGCTC ACTGGCCAGA 540
GAGTTCTAGG TGAGACGTTT TTGGGTATCA AAGGGTTTCC TTTATAATCT TCAGCCATAA 600
ATTAAAGATG GGTTATCTCA AGCTCTTCCA TTAGCAACTA CAGTTTATGT ATGGTTGTTT 660
TTCAACTTCA CTGCCATTAA AAACTGAATG CCAAATACAG CTCATGGCTC TGAGAATCAC 720
CTCAAAACCT CTAGCTAAGG CACTCTTTGA TCCCAGGGAG AGGAACTTGC TATTGTTTCA 780
TTTCCTCTGG GTTTCAAAGG AGAAATCTGA AAAGTGGCAA AGCATCAGGA TTGAAAGCTT 840
CGAGCAAAGC CAAAGCTAGA AGCTTCCAGG CCTGAGCTGG TCCGGAGGCT GGAAAAGCCA 900
TTAGACAGCA TTCCAGTCCA GTCAGCATCT TCAATGGGTA GCTTTGTTAT TTGCTGTAAA 960
CAGTTGTAAA TTTCCAGAAC CACAGGCACA CCCATATTAA AATGTTAATT ACCAAAGTGT 1020
CTCATAACCC CAAGTGCAAA TGAACAGTGA ATTAAAGGTC CCGTGGGATG GTCTCTGGAT 1080
CTCCTCCACT AACACGAATA GCTGAATATT CTAAAGAATT CACTTTTTAA AAAGACATTC 1140
AGTCATCTCA AAGTTGAGCC CATCCATCAC TCCGTGAAAC TTCTAGATTG AGGAGATAAT 1200
ATCAGTGCTC TGACTCTGAG CTTTATGCTG CTTTGAAAAT ACCAAACCTA GTCTGCTGAA 1260
GAAGAGACGA ACTTAAAAAC AAACAAACAA ACCAACCAAC AACCCAGGCC TTCTTTGGAC 1320
ACTGATGTTT TGCTGAGGCT ACTGGAGATG GTAAACTAGC TCCTGTTTAC TCTTTCTCAA 1380
AGTCCCAGAA ACCCTAGTGC CCCGCGCCAA AACAGCAGAC CTTAAGAGTC CACAGAAGGC 1440
TTACTGGGAT TATGAAAGAG GCTCATTTGT TTTCAAACTG TGGTCCCTCC ACCCAGAGTC 1500
ATTCCACTCC CACGCCAGTG TCTGCGGCTT TGATTGCTAA CTAACCATCC ACCCACAGAG 1560
ACTCTAACAT TGACTGGGAT CCTTCAAAGA GGCCAAGGTA TAAAGCAGGA GGAAACTATT 1620
AAGAACAGTG TTAGGAGTTA AGGGTTGAAC ATCAGAACAT CAGAGAAAAA AGGCAATTAA 1680
TAGAAATCTC CTGCTTGGCC TAAACTGAAA GGGAACATGG GTATGGAAAG TGTGTGTGTG 1740
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTC CTGCTGTTGG AAGGACTGCA GAATTTGTGT 1800
CCACCAAGAC AGAACTTTCA GTGCTGTGGC CCAGCTTGGC CCAGGACAGC TCATAGCCCA 1860
AAGCGCTGTA ACCAGGACGG CTGGCTGGCG TGTGAACCCC ATTCCCTCCC GCTTTGTCTA 1920
GATTTCTTTT GTATGCTTTC ACTGCCAGAT TGAAGTTTTC CCAGCTGGAA GGCTTGGGAT 1980
TTGCTGCGTA TCCCCTGGGG AATAACTAAC AGCAGCTGCC TTCTTCTTGC TTCTCCAGCT 2040
TAGAGGATCA ATGGATGACA CAAACAAAAG GTCCCCAAGA AGAGATAATG TCAGAACGCC 2100
TGTGCCAGCC TTCCAAAACG GTGAGGTATG GCAAAACTAT GAGCCATAAT TACCATTACA 2160
GCAGGGTCAG ATAAGTGGGC TTTCTTGGAA AGCAAGAAAC TTAAAAAGAA AAAAAAAAAA 2220
ATCGCTGGGC GTAGTGCCTC AAGGAAGCCC AGATTCTTCT TTGTCAGACT CCCACAAACG 2280
GCACTCAAAG TTCTCATTGC AGTGTTTCTG ACAGCTGTTT CCATTGGCTT TAAATAGAGG 2340
CAGCTTTAGG TCAGAAGTCT GACTGCCACT TAAGAGAGCC ACTAGGAGTT TTGTGTGGAA 2400
AATGGGATCG TACTTTGCAT CTTACTGATC AGAGCTGTGA AGGTTAAGTC ATGAATATAA 2460
AAATGCTTAG TACAATGTCC TGACATTAAC TAGGGCTCAA TTAAAGGTTA ACCAGTTCAC 2520
AAGAAAACAA 2530