EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-12772 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr9:86560600-86564330 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr9:86562220-86562231ATATTTACATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr9:86563605-86563618AAATTAACTAATC+6.03
Nr5a2MA0505.1chr9:86564056-86564071GCTGGCCTTGAACTC-8.25
Enhancer Sequence
AAGTGGAAAA ATAGCCACAT ACAGTAGATA CCTGCACAAA AATGCACCAA CTACTTGTCA 60
GGCATCCATC CTGCACTTCC AGTTTGAGTC TCCAAATCCT ACCCAAATAG CATGCTTACT 120
TAGTGCCATT TTGAGGCTGA TAGCTTAGGT TTTCTTGAAA AACTTACATA TAATAAGGGA 180
ATACAGAAGA AAAAAGTAAC TCTCACTTTC AAGGGAAAGC ACATATATCC TATCTGACAT 240
TTATTGGCAA CGCAAAGAAA ACAACGTTTC AGTTACTTGA TGGCTATGGA ATGCAAGTCC 300
TATGGAAGGC CAATATAAAC TATGAACTGG GAACGCCACA GGAAATCGCA GACAATGATG 360
GAAGTGCAGT GGCTTCCATC AGAGCAGTGA CACTATTTGT ATGCAGAAAG CCAAAGGCTC 420
TCCAGCTAAG AAAGGACAGT GGGGAAAGGC TACAACAGAA TTACACTTGA GCTACAATGC 480
TTACTTCCAA CTTCCAAATC TTCCCGGCAC CTCTGAAACA ATGTAACAAC TTTCATCAGT 540
CTTGCTGCCC CTGCTGCAGG CTGCTGAAGT TGACTCCACG CCTACATTCA CGCCTGGGAC 600
AAGCAGCATC CTCAGGGAGC AAGTCCTTCA GAGCTGAAGC TTTGTTTTGG GGATCGATCC 660
TTCCAAATTA CAGAATGACA TACACCCAAC AGTCTTAACT CTGGGCCTTT ACTTTTGCTG 720
GTCTTTGCTT TGTGACTGTG TTCCTAAAAG ATGGTTGATC TAAACTCAAC AATAAATGAT 780
CAAACTNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 840
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNGTTG ATCTAAACTG 900
CAACACTAAA TGATCAAACT ATTCCATCAG TAAGACTTAC TTGCTTTTTT TGTTTCAGAC 960
AACTGACAGA AACCCATGCA CATGTGCTGA TGATTATGGA AATGGGCCGT ATTAACCCAA 1020
ATGGGAAAGC CTTGGTTTTG TTTTGGTTGT ATTTTGTATG TGGAGTTTTT TCCCCTTGTA 1080
GTTTCCTTTT TAGAGAAAAA ACTTAATCTA ATAAAAAGAA TAGAGAGAAC AGACCCAGCA 1140
ATAAATAAAT ATAAATCACG TGGGCTGAGG TTGGGTAGCT GTAGATCACT GTGAGGAGCT 1200
ACTCAACAGT GGGAAACTGA GCAGTAACTG TAGGTGACAT GGAGTAGAGA TGACTTGGAA 1260
GTTCTTAGGT TACAAGGAAG AGAATGCACA GAATGGAGAC CATGCCCCTG AATAAAACCC 1320
GCAGAACACG ACACTGACAT TTGTGTGGGT GGAGTGGCTC ACCAGACTCA GCTGTAAAAT 1380
TAAGAAAGAA ATGTATTTTA TTGACAAGGG ACATATATTA GATTTAACTC ATGAAATGAA 1440
ATGTTAAGCC AGTGAATTCA TCAGGGGGTA TGGAGAGAAA TATATGAGAT TCGGAGAATA 1500
AGTCAACAGA GTGTTTACAT TCTTATGAGC CCAGAATAGT CAGCCAAAAC CCGCTGGAGC 1560
CGAACTCCTC AGAGCAGAAG GTTCAGAAGG CGACTGCAGT GTTCCGCACC CATAGTAATA 1620
ATATTTACAT TTAAAATAGG TGCACAGAAA TGAAGTGGAA AGGATTTAGT GTTGGGATAA 1680
TACACGGTCT AGCTGACTCT TCCTTAGCTC AGGATGGGTT TGTGCAGTGA ACAGAGAACA 1740
AGATCAGAAG GGGCGGGAGC TTGGGTTGCA AAGCAAACCT GTACTAAGTC TGCAAACTCA 1800
GACTTCATAA ATCCAGCAGA GCCTCTGACT GCAGCTGAGG CACTCAGAGT ATAAATACAC 1860
CACCAGTGTT ACATATCCGT GTCACCTCAC CTACTTACGG CCACCACAAT AGAACTAAAG 1920
ACTATCAACA AACTGCCATT GTTGGCAACT GTGTGAGTTT GCAGCCTTGC TTGATCTCCT 1980
TACTCCAAAG CCTAAGCGGA TTAAATCTAT TCAAAGCAAT CAGGTGATGC AGGCAGGCAG 2040
TGCTGCAAGT CTCACTGGTC TTTCCATTCC ACCCCAGCAT TCTGTCCATA TGGAAATCAG 2100
CGAAAAGTCT AAAACTGTAA TTGGAGGCTA CTGTCCCCGT CGTCCCCCCC CCACAGGACA 2160
AAGGACTACA AAGAAACCAT ACCCCAGCCC AGCCTTTGCC TCATGCCTAC CGTGCCACCC 2220
TGCTCCATGC CAGAGCTTCT GACAATACAA TCTGCTTGGC CTCAGCCCCC TTTTGTTTTC 2280
TTTTGTATTT TACAAACTGT CACCTCATCC TGCATATAGA AACTATATAC AGGAGCTCTT 2340
GTTACTCTCA CTATCCTGTT TAATTTCTTT ATAACAGCCA TGTACCTTCT GTTCACATGT 2400
TAATTCTTCT TGTTCACAAG GACAAGACAT ATATTCTGAT GAGACATCGC TTGATAAAGT 2460
ACTTAGCACT CAGGACATGC TCATGGAACT CCTGGTACAG GAAAGGAGGG GAGAAATAAG 2520
GAACACAGAC TTCTGAAGAC GTGGCCGAGC CAGGAAGAAC AGTGAGACCT TTGCAGGAAA 2580
CTGAGTGCTA GAAAGGGGTA TTCGATAATT CATAAAACTG GGTTTAAATA TCAAACTACT 2640
GTCATTAAAA GGTAGAAACC TTAGAAAAGG AGACAGGGGG GCTGGTGAGA TGGCTCAGCG 2700
GATAAGAGCA CTGACTGCTC TTCTGAAGGT CCTAAGTTCA AATCCCAGCA ACCACATGGT 2760
GGCTCACAAC CACCCATAAT GAGATCTGAT TCCCTCTTCT GGTGTATCTG AAGTCAGCTA 2820
CTTACATATA ATAATAAATA AATCTTAAAA AAAAAAAAGT AAAGAAAAGG AGACAGGGCT 2880
GGAGTGATGG CTGCCAAGGC TGACAACCTG ATCCACATGT GAAAGGAGAG AACCAGCGCT 2940
TACAAGCTGT CCTCTTATGC CCAAATACAC AGTGCCACAC ACACACACAC ACACACACAC 3000
ACACAAAATT AACTAATCAA CATAAAGATT AATGAAATAA TTGTAGAGTG ACATACAGTC 3060
ACATGAAAAA CCTATGAGAA TTCTGCTGTT TGGGGAAGCA AACATTATAA GCCCTATGAA 3120
GACTGTATTT TATAGGTAGT GCTCATTAAC AAATGCATCA CTTTAACTTT TGACAACTGT 3180
CCCTAAGGAA GGAAGGGTCC AAGAAGCTTC TCTGAAGAAC TCAGACCCAA GACAGAAAAC 3240
TTAGCCCAAA ACAAGTAGGC TCAACATGGT TTAGGGAGGA TATGATAGCT AATTTCATGT 3300
GTCAACTTGG CTAACACCAT TCTAGATGTT TCTACAAAAG TCATTTTGTT TGTTTGCTTG 3360
TTTAGTTTTG TTTGTGACAG GGTCTCCTTA CACAGCCCTG GCTATCCTGG AACTCACTAT 3420
GTAGACAAGG CTAGGCTTTG AATTTACAGA GGTCAAGCTG GCCTTGAACT CGCAGAGATC 3480
TGCCTGCAGG GATTAAAAGT GTACACCAAC AAACTCAGCT ACTACAAAGG TCATTTTAAA 3540
GTAAGATTAA CATTTACTAT GTAGGCCTTA AATTACTCTC CATAATGTTG GGTCAATACA 3600
AGGGGTTAAA GATCCTGCTA GAGAGTTACT GTCCCTGGAG AGAAAGAGGA GGGTCGATCT 3660
GTGCCACAGG CTGACTTCAG GCCTCACTGT AGAACAGCCC TTCCCTGGCG CTTCAGCAGC 3720
TCTGGTGCAG 3730