EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-12419 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr9:43561600-43568130 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFE2L1MA0089.2chr9:43563804-43563819AGAGCTGAGTCATAT-6
NR2C2MA0504.1chr9:43564200-43564215TGCCCTCTGCCCTCT-6.62
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr9:43567131-43567142CTTGAGTGGTT-6.32
RREB1MA0073.1chr9:43565285-43565305GGTGTGTGGGGGAGTTGGGG-6.09
TBX20MA0689.1chr9:43565034-43565045CTTCACACCTC-6.02
ZNF263MA0528.1chr9:43565205-43565226GGAGGATTGGTGGGGGGGGGG+6.11
ZNF740MA0753.2chr9:43565216-43565229GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr9:43565795-43565808GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr9:43565219-43565232GGGGGGGGGGCAG-6.33
ZNF740MA0753.2chr9:43565214-43565227GTGGGGGGGGGGG-6.92
ZNF740MA0753.2chr9:43565793-43565806GTGGGGGGGGGGG-6.92
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02650chr9:43565540-43598362HFSCs
mSE_02942chr9:43545542-43614142TACs
mSE_08514chr9:43558748-43567849Liver
Enhancer Sequence
CATCGTCCTT TTGCTACATT AGAGTTCTAG AAATTCAGTT ATTGCATTCC TGCCCCTCCT 60
GCCCCTGCTC GTGTCCCTAC CCATCCTGGG CCTCAAGAGT GTTCATTGGC TGGGCTGGAA 120
TGGAATAGAT ACGATGTTAT CATTCTTTCA TCCTGAGTCT ACACATTACT CGTGGCATCG 180
GCCTCCTGCC TTGCTCCATG CAGACACAAG CAGGTCAGTT GGCTTCTCTA GAGAACTTGC 240
CAAAAGCTAC TCCCAAATGG AATCAAGGTT TCTGGGTTGG GTACTGATCA TGAGTGAGTC 300
CGGAGCTCAG CCCAGACTTC TGGAAGGTTA TGATCTCTCT TGCTGTCTCC TAGAGATCCC 360
AAAAGATGGA AAGGGAGGGG CCTTTGCTGG GGTGGATCTA GGGTGTTCAC CTGTGTAGGA 420
AGCTTTGATC CCTTGGGATG AAAGGGCCAG GGCTTCCTCT GCCCGAGGGT GACTGGGGAC 480
CGGGAGCTGG AGTGGAGGCA GTGTGCTCCT GAGGCCTGGG ATTCTCAGCC ATGCGGCAGT 540
GTGCCCGCAG TAGGGTAGAG AATGAGCCCA GCAGAGACAA TTTCAGGCGC AGAAAAAAAT 600
CAGACCTTTC CCTGTATTAT GGCTAGGGAC TAACCATGGG TTCTGCAAAG AGTATGAACG 660
TATTACCCTC TCAGGGCTAC ACAGAGTTAG AGCTTTTCCT GGCACCCATG ACCCTACAGG 720
TCACCCAGTG GACTCTGGCC TCATAGCTCC ACTGGCTTAA TTAGGAAGCT AGCTGGGCTG 780
AAACACAGTC ATCTGATCAG CTTCGAAGCC AAAGAGAAAT TCCTCCCAGA CCCTCTGATT 840
GTCCATGCTC CATTAGCTTG AATCACGATG TGGCCCCTGT GGCCCAGACA CCAGCCGGAG 900
CCATGCTCTG GATTCCCTAG ACTGGAATCT GCTTGAAATC CCCTAGAAGA AGCAAGCTTA 960
GGACCTGTTT GGATCCTCCC TAAACCCAAG GATTGCCCAG TGATCACAAA GGCCCACCCA 1020
TCCACCCACC CAGAGCTTGC TAGGGGTTTG CATGGCTGAA TTCTGCAGCA TCCCGAAACC 1080
TCAGTTGGAG CACACGCAGG GACAGGCATC TCCCACGTGT AAATAAGATA CTGACGGAGG 1140
AGCCACACCA TGCACGAGAT GATTTTATTA TTACTGCCCG CCACCCCCGC CCCGAAGCAT 1200
CGCCATCTCA TTGGCCTAGA TTGCTGCATC TCTCAGAATG ATGGATGGGC CTTCTCTCCC 1260
TTCCCAGGCC GGGCAGCAGC CCTGCTACCC AGATACCTCC TACACAGCCC CTTCCTAAAT 1320
TTATTCTTTG TGTCTGTGGT GCCCAGAGAG TCATCAGTGT CCTGAACCAG CTGAGCACTG 1380
ATTATCTCCG ATGGCTTGAT GGATGGGCCT TTAGGGGAAC TTAGGCGACA GACCCTACCC 1440
CCTGCTCCCT CCTCTGTCCC TGCTACAGCA CCCTTCCCAG CCCTCCCAGG AGGCAGATAA 1500
TGGGCCTGTG TCTGTGCTGA GGAGAAGCAG GGGTGATAAA GGAGAAGAGG CGGTGACAGT 1560
CCTTGGCGCC CACCTCACAG TGCTACTGCC GCAGAGATAG CTGGGAAGTC TCCATACCCA 1620
CCCCGCCCCG AGCTCTGCAT GGACGCATCT TTCCAGGCAG TGTCTCCTAT TACCCTGCCT 1680
GCCCCCATCA CTCCATTATC CTGTCCCCTC AGCACTGTGG ACGCGGTTTG CACCGTGGTA 1740
ATAATCTGTG TGGTTCACGC GAGTTCTTCA CTAGTGTTTT TATGTCCTCT GAGTGTGTAC 1800
TAGGGAGGTT TATGGCTGTG TGTGCGCGTG CGCGCATGCA TGCGTGCTCC TGACTAGATG 1860
CTTGCCTTCT TCATGGAGCA GGGCCTCTCA CTCAGCGCCT GCTGCTGCTG CAGAGCCCGG 1920
CTACTGGAGG CAAGGTGGCC AGACTGGCTG ATGCTGAGCC AGGATCTGCC CTCCCCACAG 1980
TGTCACAGAC ACGCAGAGGT CACTTTCATA ATTGTTTTGT CTATAGGATC ACAAACAACT 2040
TGTTTCCCTG TTTTTCCTCT CAACACTGAA CCCGCAGGTT ATCTTGGTCT CAGGATTTTA 2100
TGAGTGACCT GTGTTGGCCT GTGGATCGAT GCCAGATGAT ATCTAAACAT GGCTTCCCTT 2160
AACTGCTAAG TTGGGGATGG AGAGTTTGAA AGGGGAAGCA ACTGAGAGCT GAGTCATATC 2220
ATATCACGGC TGTTTGTTAC TAGCTCTTTA CCTAAGGACT CTCAGTCTAG AGAGGAAGGT 2280
TCAGGCTCCA AAGAAAGACA CTCCCCCTAA CCCCCATAGC AGCAATGATA CACTGTCTTG 2340
TCAAGAGATT CCTCCACCAA GCTGGGAGCA GATGTGTGTC CTTAGAGGTT TTTCCACACC 2400
TCAGATGGTC ACCTGGTGGC TCTTTGGGAC CATTTGGTCT CCTTTCTTAA GAGGTAGTTG 2460
GAAGCCAGGA TTAAATGGCT CAGACTCCCC CCCACATACT TCTGACCATC CTTGCACAAT 2520
TGTGGTGGTG AGCAAGGTTC ATCCCTACAG CCAAGGACAC AGCAGCAAAC ATAATGTCCT 2580
GGCCAGCAGT GGATGGCATC TGCCCTCTGC CCTCTCATAC AGCATGTGAC ATCTCAGGGT 2640
GCTGACTCCT TTAAGCAAGA ATGTCCACAG CACAGATGCC TGGAAGGCAG TATAGACAGA 2700
GGGTTGCGGC CTGGTGGGTC ATGTCCACGC TGACCTCCCT GAATCTTCCC TGTATAGAAA 2760
TTAAGGAGAG CAGGGTTAGA CTAGGTACTG TGTTTTCCCT TCCCTTTCAA GGAGAGCCCC 2820
TGCTTCCCCA GCAGACCCAG GTCTAGGGAG AGCCTCCCAG TAGACCCACA ATTTAGGGAG 2880
TTTCCCTGCA GCAGAGGGCA GAGCAGATTG GTCCGAATCC TGGAGTCTCA GCATTGGAGG 2940
CAAAAATTAA ATAAAGTACT GCCACAATGA CATCCTGAAC CCCTTACCCA AACTCCTACC 3000
ATCTGGTGCA GCTTCCAGCC ACAGTGTGAG CCCCTCTAGT GACAGGGAGC TCACCTCTCT 3060
CCTTGGAAGC CCCACACTCT CCATGCAAGG ATGCCAAGAT CTGTGTCCTG ACACCCCACT 3120
CCCAACCCCA GCTCTGTTTC TGCCCCTTGG AATTGCCTGG GGCACATTGG ATGCCCTTGT 3180
GATAATCTGC TTCAGAAAGC CCTGAAGCCT GGCTCTTCCC AGAGTGCGTG TGCTTCCGTG 3240
GCCCAGGGTC ACACACTTCC CCATCGTGGG TGCTTTTTTG GGGAGCGAAC CGTCCAGATA 3300
TCTATTAGCA GAAGTAACCA CCCCAAATGG GACCCAGTGC AGCTGAGGTG GACTGACTGA 3360
GCAGCCTGGG ATTGTAGCCT CAATTCCCAA CTGCCTGTGA GAGATCTAAG AGGAGGCGGA 3420
GTGGGGCAGG CTGGCTTCAC ACCTCCCGCC ACCCTCACCC CTTCCTCTCC CAGCCCTCAC 3480
CCCTTCCCAC CCCTGTTTTC TTTTGGATTA ACTATAAATT GCAGTGGAAG ATCGGCTTAT 3540
CTCCAGTGGG AATTAAGGAA TTAAGTTAGT GGTGGGAGAG AGGGATGGTA GAGGGAGCAT 3600
ATTGCGGAGG ATTGGTGGGG GGGGGGGGGC AGGGGGCAGC CAGAGTGATG GGATAGGACC 3660
CTGTCTGCCT GTATCTGTTA CCTGAGGTGT GTGGGGGAGT TGGGGTGCGT AACTTGGGCT 3720
CCCGGGACCA GACTCATGAC TGCCTGCCTT AGAGAGTGTG ATGACTCCAT GGGGAGGGGT 3780
GGCAGGCACA TGGGGTACCA CTGGTGGACC GATCTCCTAG TAGCCTCTTC TTTCCTTTTC 3840
TGGTGTCTCA TGATCCAGTA CAGCAGCTCT GTGGCATGTC ACAGCATAGG ACAGGCCAGC 3900
CCCAGCATGT GGCAGGGTGG GGCACTCTAC TTCTCGACGC TACAGTGCCC AAGCAAATTC 3960
TGCAGTCAGA AGTTCAGGGG CAGGAGTGGG TCAGACAGAA CCGGCCTGTC TTTGAAGCGA 4020
GTCCAGGCGA GCCTCATTGC CTGCCTTGGG GGTCCTTACT GGACGATGCC CAGGAGTTGC 4080
GCTGAAACCC ACACACCCAC CAGCCTCTCA GGTCCCCAAG GCTGGGGGGG GGAAGAATCA 4140
GCTTCCTCTA CTTGCAGAGC CACCCAGAAG CCTTTGTGAA TGCCAAGTGA GAGGTGGGGG 4200
GGGGGGGGTC ACACAGGATC TGCTTACCTG TCGCCACCTT ACCCGGTCCC TGCTCCCCGC 4260
TCCCCTGAGG CAGGCCTGTA TAGAGCCCAT ACATGCCCCA GGCATCCTGC CTGGCATCAG 4320
TATGTCTAAA ACAGAGATGG TGTTTTATAG GGTGTCTCTC CTCTCCTTCA TTCAGACTCC 4380
TAGCCTGAGC CAAGCCAGTC ACAGGAGAGG CTGGAAATGA AGAAGAAGTG ACAAGGCTAA 4440
GGACCTCCCT GTTGGCTCAG ACAAGCTGGG GGACCTGTCC CAAAACAACT GTCAATCCTG 4500
GTTGTAGGGG TCACTGAAGA GTGGCCGCCA TCAGGGCACC AGAAGACAAG ATCCAGACCA 4560
GAAGTGGCTG GGAGAGGGGG TGGTACTTAA CTCTGATGAC AGAGGAAGCC AACCAGCCCA 4620
AAGGTCCAGG CATTTGGTGG GTTAATCATT GGTGACTCTG GTTAATAAAT CATTGGCAGT 4680
TTTGTCCCCA AATTTCAGCC CCTGCCAACC CTAAAGGTCT TTCTGGCTAT GTCCTGGGAC 4740
CTTTCACTTC CAAAGCAAGA GCCTCTCATC ATGTGTCGCC CACCCCTAAG CTGGTCTCTG 4800
GCATCCAGAG TCAGCCTGCT GTGTAATCTC CAAGAGAGAT TAGTGGCCTG CCTTCCCTGC 4860
CCTCCCCCCA CAGGCTGTGG ATGCCCCTAG ATACTTCCTG CTGGGAGGGT AGGCCACCCA 4920
CAGAGGGTCT CCAGGTGCCC TAGTGAGCAG GGCCCCCTTG TATGTAGGCC CTTTCTGAAG 4980
CTCTATGGTG CTGTGAGAGG AATGAGCCAA CAGATTCTCT TGAGATAGCT CCTTTTTTGT 5040
GCCAGGTACT CCTAGCACAA ATGCTCTTTT AGCAACCTGA AACAAACAAG CTTAGAGACT 5100
TTGTTCAGTG GGTACATGCT GGGGGCACCT GAAACCACTA TCACCGGGCC CTACATTTAG 5160
GATAAAATGA GGCAGGAGTC ACACACTCTG AGGTTTTAGC ATTTTCTTCC TCTGCCTGCT 5220
GGGGCACTTG CTGGTTGGAG GTTGGCCAGG TTTCCCGCCT CTGACTTATG ATCTTGGGCA 5280
ATAATCCTGT CCTGGTGGCC ATTAGAACAG TTTTCCTAGC TGGTTTTTAC AAGCCTGTTA 5340
TCAAGGGACA GAGTGACAGA AAGGAAGCGA AAGAAAGGCC TCTCCTTTCT GAATCCAGAG 5400
TACCAGGGTG GGCTCTTCTA GTCTCCCCCC TCCTTCACAT CCCCTGGAGC CAAGCACTCA 5460
GTGCTGGGCT GACCTCAACA GTTGGGTTCC TGGCCCCTGG GAATGGTGCT ACAGGGCATC 5520
CTACCTGCTT GCTTGAGTGG TTGAAGAATG CAGAGGTTGG GGTGGAGATG CAGGAGCTGG 5580
CCTTTGTGAG GGTGGGTTCC AGAGGCTGGA GACATCAGGA CCACCCCAAG TGGAAGACCC 5640
ATGCCTTCAG GGGGTCTGTG GATGGTGGTG GGCATGAGGC CTTGGGGAGC CCCCTTGGAG 5700
AAGGGGGAGG GCTAAAGAGA AGCAAACCCA CCCTATTTCA GCCTGACCTG TGTGCAGTCT 5760
CATACCCCAA GATCTGCAAA CCTCCCCCCC TTCTCAAGCT ACAGCTCACC CTGGACTCTT 5820
CCCATTTGTG CTGGTGGAAC CCCCAGGTTC TGTTTGGTGT CCTCCATTCT TTCCCTCTTT 5880
GCTGCTGTAA GACCTGGGTG TCCTTGGGAC ACCTCTGAGC TTGGAACTGT TATTCTTCCT 5940
CAGGGACTCT CCCCATTCCT GAGCAGCCAC TCATCAAGGC AGAATGATGA GAAGTTTGAG 6000
CGTATCATAC TCTGAAGCCC TCGCGAGCTC CTCATGGCTG CTGATCTCAG CTCATGCTCC 6060
GTGACCTAGG CCAGGCCCTA CAGCCTTAGC CCTGCTCTCT CGGAGCAAGA CGAGCCTTGG 6120
AGCGTGCCAT CCTGCACACC ATAGCATGGT TAGCAATGGT CCTAGCCTCT ACTCGCTAGA 6180
GGCTCATAGC ATCCACTTCT ACCCCCCAGC CCCCATCCAT GTACTATGAC AATAGATATC 6240
TTCAAGCTAG ACATGGTGGT GATACCTGCC TGTAATTCCA GAACGCAGAA GGTAGAGGCA 6300
GGCAGATCAC TGTGGGTTTA AGGCCAGTCT GGGCTACAGG GTAAGAAGAT GTCGTCTCAG 6360
ACAAACAAAC AACCAAAATG AAGCAAACCA CCAAAAACAT TGCTGCAGCT CCCACCCAGG 6420
CTGCCTATTC AGCATCACTG GTCTAGCCTG CTGCAGCCAG ACCTCTTTTT TTTCAAAGCT 6480
ACCTCCCATG TTGTTCCCTG AGCATAAAGT CAGCCACTCC AACTTCTGTT 6530