EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-12369 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr9:31086780-31091470 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr9:31087207-31087219GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:31087211-31087223GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:31087215-31087227GTTTGTTTGTTT+6.32
NFYAMA0060.3chr9:31087809-31087820TCTGATTGGCT-6.32
POU1F1MA0784.1chr9:31088096-31088110ATTATGCTAATAAG+6.56
POU3F3MA0788.1chr9:31088096-31088109ATTATGCTAATAA+6.44
PPARGMA0066.1chr9:31089826-31089846GTAGGTGAGCATGACCAAGT+6.58
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03005chr9:31086137-31110110TACs
mSE_03985chr9:31086933-31089612Cerebellum
mSE_03985chr9:31090072-31090806Cerebellum
mSE_04489chr9:31086757-31090928E14.5_Brain
mSE_05696chr9:31086667-31089663E14.5_Limb
mSE_06169chr9:31086134-31089925E14.5_Liver
mSE_06169chr9:31090101-31091174E14.5_Liver
mSE_07925chr9:31086045-31089520Intestine
mSE_08887chr9:31086157-31089776Liver
mSE_10639chr9:31086151-31089694Embryonic_stem_cells
mSE_10639chr9:31090004-31091098Embryonic_stem_cells
mSE_12636chr9:31086126-31089871Testis
Enhancer Sequence
GTATACTGCT GGCTGGCCTG GAACTGTGTA TGCCTCAAAC AAGTCTGCCT TTGCACTCAG 60
GAACTGGGAC TAGGAGTTTG GGTTATCTTG CTGTCTCTCT GAAGGCTTTA ATATCACTAA 120
CATTTCTGTT TCTTAAAGTT CTAGTCAGTG TTGGAAGAGA ATTTTAAAGT ATGATCTCAT 180
TTAACCTTCA AAGCAACACA GCAAAGTACA GGTCATGGGC AATGAAAATA TTCCCTGCAG 240
ACACAAAGAG CGAAGGTCTC TGGCCTTTGG TTGCCATTCC TGTTTTCAGT CGGGGAGTTC 300
CCAGTTTGTC TCATTTCAAA GCCTGAGCTT GTTTCTACAC ACCTGGCTGA ACTTTGAGAA 360
GGCAGTCTTT AGGGACAGTA TGATGTGGAT GTCCTAAGTT AAGAAAGAAG GGAGTTCTGT 420
CATTTTTGTT TGTTTGTTTG TTTGTTTGTT CACTGTTGAC TAAACCTCAA CCAGTCCCAA 480
GTAGCTTAAG CTGGCCTTAA CTGCTCCTAC TGCCTCCACC TTCCGGGTAC ACCACAACTC 540
CAGGGTTATG TGGTGCTGGG GCTGGAGCAC CGGACTTAGT GTGGTAGGCA AGCACTCTGA 600
GACACATCCT CACTCCGATT GCTTCTGAAA AACGCCTTTC CAGAATGGTA AATGGTGGAA 660
AAGAGAGGGG TAGTGTAGGC GCTCTAAGGG GATGGCAAGG TCTGATGACC CAGTCCCCTT 720
GTGTCTGGAA GGCTGATAGG CCACTCCTGG GCCCGCGGGC CGCAGTCTGT TTAACCGGTT 780
TCTGTAGTCC CGGAAAGGCG TGTCCCAGTA GTGCCCCAGG CGCGCGCGTT CTGGGCAGGT 840
CCGCCCTGGG GCGGGTATAT GCACAGCCCA CACCTCGAGA GCTTTCCAGG ATCGGGACAG 900
GTGGGCTGGG AACTCGGGTG TGCATTGGAT CTCCCACAGC GGACGCTCAA GCATGCTGAA 960
CTGTGCCCCT TCACTTGCCC GCCAAGGTTC TTAGATGGGC CTTGACCCCG AATGCAAACA 1020
GTAGGGCTTT CTGATTGGCT TAGAGTACAA ACGCAGGCGA GCACCGCCAG AGACCCGCTC 1080
TTCTATTGGG TTTTACACGA ACTGCAGAGC ACGAAATAAA GAGGCCTTCA GTCATTGGGC 1140
CATTGTGTGA GTCTCCTTTT GGCTTCTCTG CCGACTGAAT TAGCGTCCCA GGATTTTCGT 1200
CATGACTCTT AAATCTGGGC TTGTCAATTC GGCCCAGCGT TCCCAGTCTC TAGGAACAGC 1260
ATGGGACTTT CAGAGTTTAG CCAATCACAT AACGTTGAGA TCAGGTTGCC AGGCAGATTA 1320
TGCTAATAAG ACCCCGCCTT TTATGCTGCT CCCACTCTGC GGCGGGAAGA ACCACCTGGA 1380
GGCGGCGGGG GGGTTTGATT TCCATCACCC CTAGGGAGAG AGGATCCGGG ACCCGCTGAT 1440
CTTCCAGCTC CCCTCACCCA ACGTCGTGTA AGTACCTAAA GGATTAAGGG AACCGGATAA 1500
ACCGGGGTCC AGAGGATCCC ATCGCCTGGG AGAGTGTTTC GTCTTTGCTT AGTCCCACCC 1560
AAAATGGCGC CCAGCTCTTT CTGCGTCTCA GCGCCCGGCC GGGGCCAACC GACCGCGGAC 1620
CCGGGTGGGG GGGGAACTGA TGGTAGTGGT GGGGGGAGCA ATCCCGGCGG CACCGCCCGA 1680
TGGTACAGTC CAGCCGGGGC TGGGACGAGG CACCTCGCTC GGGGTGGGGG GTCAAACCAT 1740
CTGCACCTTC TACGCGGAGA GGGGAGAGTC CCCTTCGGGA AGCCGTCCGG GCCCCGCGTC 1800
CAGCGTGGGC TTCGGCGCCG CCCGCCTCGA CTCCCCGGCG CGCCGCCTGC CCCGTGCCCC 1860
CCGAACGGCT CGCCTGCCCG GCCGGCCGTG CGCTCCTCTC TCCCCTCCCG CGTTGGTTGG 1920
GCCGGGACGG CGGTTGGGCT GCCTGCGCGC CGGGCGGCGG TTGGGCGGGC GGGTGTCGGC 1980
CGGCCGGACC CGTGCGGGGG GTGGTGGCGC GCGCGGCCGT GGGTTCTCGT GCGGGTATCC 2040
CGGCCCGCGA TTCCCAGCCA CCCCGCCCGC AGAGGTGTGG GGATCGCCCC TGCGGGTCGG 2100
TCTGCAAACG CGATGGCGGG CTGGGTAGGG CGGAGGCCGA GGACCAAGAA AACTGGCGAG 2160
CGAGGCGGGT CTCTTAGGAG TCGGGCTCTC ATTGAGCTAA CGCTAAAACT AGGAAAGTCT 2220
GTAGCCAGGT TGAATTGGTA CTAGGAAAAA TGGCATAGTT GCGATCTGCC TTCCCGGTGT 2280
ACGAAGGCTA CTAAATTCGG GTGCCATTAA TTTTAGCCTT GTTAGATGGA TTAGTTGGAT 2340
TTCAACCGAT ATATATGTGT GTGTACACTT AAGCCAGAGA GTAGGGGGTG GTTTTGTGGT 2400
GTCATTGATG AAATCCACCC AGCTAAAAAT CCCATACCCT GAATTCTTAA GAGCCTGCCT 2460
GCACATCTTT CACTAATCTT GTGTTTAAGG GCAAATGTAT CTACTTTTCA TTAAAGCAAA 2520
AGGTACTCTT GATTAGCCTC GCTTTCTGAC CTGTTCGCGC CACTGCAGCA GTAAGGTCTT 2580
TGTGGGCCCG AGGGTGTGCG GCATTACATT GTATTCTTTT GTACCCATCG CCTCCGCTGG 2640
GGCCACCACA ATACCTTCTG CACCCATGAA CTGTACTTAT TTGTTGCTCT AGGACTGAAA 2700
AAACGAAATC GGGATTGGTT GGGGGCAAAG TAACATACAA TGTTTGCGTC ATCTAGTATA 2760
TTTAGTAACT TCACTGGGTT TACTTTTTAC AAAATGAGGC GAAATTGACA CAAAATGAAC 2820
TATTTTCAGG AGAACGACTT CCTCTGTCAT TTAGTAGGTT TACATTTTTA TTATGGATCA 2880
AGATTTTTTT TTTTTCCAAC GGACTCAATT ATTCCAATAA CATACACCTT CTAGTTTTCC 2940
CTTAAGGTTT GTTTTTTTCC CCCCCAGATT AAGTCATTTT TACATTTTGT AATGATTTGT 3000
AACATTCCAC CAAAAGCAAT TTGTACATTG TATTGCAGAC CTTGATGTAG GTGAGCATGA 3060
CCAAGTGAGG CAAGCTGTGT CTTCAGACCC CCTAAATGCT TTTTATTTAG TGATTATGGA 3120
ATGCCACTCC AGTATGACCT CAGAGTGCAC TGGCCAATTT CCTTTTTAAT ATAAGTAACA 3180
CATGATTATC ATAGAAACAG CATAAGAACT AAAAAGCCCT AAAACATAAT GACTAGATAA 3240
AATCCTTACT ACTAATATTG GTGTGTTTTA GATCTTTGCA TGCAAGGACA AATGTACACA 3300
AGATATTCGT GTGAGCACCT CCTGTGGCTT AATATCTGTT TTAAGTGTAG ATGGGTGCTT 3360
AAATACTTCA CTGGTGATTT GCCACACTCA GTCCTATGAA CTAAAAGAGT CATTTTCTTC 3420
TTCATTTTAC TTAAAACATT ATTTTGAGAC GTGCAGTGCT GGCTGGCTGG CCGGCCTGGA 3480
ACTCTCAGAG CAGCTTGTGT CTGCTGGGAT TAATGGAGAT TAAAACCAAG CCCTGCTACT 3540
CCGGGTTTTG CTTTGTTCTT TTGAGACAGT CTCACTGTGC AGTTTTAGCT GGCCTGAAAA 3600
GATAGACCCA GGCTGGCCTG AAACGCAAGG ACATCTGCCT GCTTCCACCT CCTGGGCTTA 3660
AAGGTGTGTA TGCCAGTACA TCTGGCTCCT TTTACTTTCT AAAAGCAAAC CCTGGGTCAG 3720
TGAGAAGATG CTCAGCAGGT AAAGTTGTCT GCCTGGAAAG CCCAGTTCCC AGAGTTTGTT 3780
CTCAGGAACC CATATACTAG TGGAAGGAGA GAACTAACTC CACATTGTAC ACCTGGACCC 3840
CTATCCCGAA CAATTAAAAA AAAGTTGGTA TACACCTTTA ATCTCAGCAC TGGCGAGACA 3900
TAAGCAGATC CATCTATAGA GCTGAGTTTC AGGACAGCCA GGCTACACAG AGAAACCAGC 3960
AAAACTTTGG GGCCAGTGGA TTGGTGGATA AAGTGTCTGT TGTGTAAACA TGAGGAACTG 4020
AATTCTAATT CCCAGTACCC TCATAAAAGC CAGTTACGTC ACAGCATGTC TGTGACACAG 4080
CACTTGGGGG TGGAGACAGG CTGATCTTGG GGAGTTGGTG TTTCCCCCAG TTAGGCTAAG 4140
TGGGTTCATG AATGTCTCAG TTTTAGAAAG TAAGGTGGAG AGTATTCGAG AAAGATACTT 4200
GGTCTTTGGG CTCCCGGTAT GCAGCCACAG GCCAGTAAAC ACACACACAT ACCCAGGAGT 4260
AAAAGCAAAA ACAACAGAAA AGGATAGGCT TCTAGACACC AGGTAGAACT GACTGACCGG 4320
CCGAGAACCG AGGAGCACTG AGTTGTAATT TCCATTTCCT CAGTAGGCTT ACACTTCACA 4380
GTAGTAAATA CATGGTGACT GCAGGATTTC ATTTGATAAA AAGATTATAT GGTGAAAACT 4440
CGTAAGCATC TGGTTGTAGT TTATTTTAAA CTTGAGTGCC ATTCAGATGG TTACTGCCAT 4500
TGAAATACAT ATTCTCCTAG AAGGGTAGAC ACTCGCAGTC CTGCTGTCTG CTTTCCTACA 4560
TGCAGAACTT GTTTCTGTTT TTGATAGACA CTCTGTCAGA TTAACAAGTG GAAATTAAGC 4620
CTAGTGAGTT AAGAAAAGTG CAGCGAGCCG GGCGTGGTGG CTCACGCCTT TAATCCCAGC 4680
ATTTGGGAGG 4690