EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-11973 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr8:87301620-87305060 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr8:87302856-87302873GAAATTGTTTACTTTCA-6.6
RREB1MA0073.1chr8:87303440-87303460ACCCCACACCCCCACACCCC+6.09
RREB1MA0073.1chr8:87302180-87302200CCCCAACCCCACCACACAGA+6.16
RREB1MA0073.1chr8:87303438-87303458CCACCCCACACCCCCACACC+6.98
Stat4MA0518.1chr8:87301755-87301769CTTCCAGGAAACAA+6.37
ZBTB18MA0698.1chr8:87304545-87304558TTTCCAGATGTTG+6.25
ZNF263MA0528.1chr8:87304091-87304112GGTGGAGGAAAAAAAAGAGAG+6.43
ZNF263MA0528.1chr8:87303887-87303908CTCTCCCCCTCTGCGTCCTCC-6.7
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02612chr8:87290029-87318326HFSCs
mSE_02989chr8:87300807-87318815TACs
mSE_03671chr8:87301870-87304434Cerebellum
mSE_03995chr8:87301781-87304606Cortex
mSE_04771chr8:87303258-87304250E14.5_Brain
mSE_08598chr8:87298295-87302767Liver
mSE_09565chr8:87294678-87311562MEF
mSE_11002chr8:87302972-87303994Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
AAAGGAGAGG GAAGAAAACT AGCTAGGAAA ATGGTGGCTC TCAAAGCAGT CCTGTGAACT 60
GAGGCCTTGT GGATTGTGGT AGGAAAAATA GAGAATACAG CCAGTCCTTC ACTTACATGT 120
ACATTATTAA AATTTCTTCC AGGAAACAAA ATAATTTCCC AAAACTGATA CAGACTTTGT 180
AACTGGCCTT TGCCTCCCAA TAGATAGTAA GGACAGCTAA TAAGCACAAG AAGCCTTGTT 240
TTAAATGCTC AGCCACCGGT AGGTCTCTTT ATCTTTAAAA ACAAAATCTT ATTTGTCCCC 300
AAGCCGCTGG CTTCTGGGCC TAGATAGACT TTAGATCCTG GGCACCTTGG CCTAGACTGA 360
TTTGGCTAAG TACCCACAGT TTAAGCACAT GGCTGTGCTG TAAGTTAAAA TCACCAGATA 420
TCCCAAGGTC CATTTTACTG CAGACTAGGT AAGGAAAGAT ACAGGAAATT AGAAAGGCCG 480
CAAATCGAGC CCTGGAGAGT TCACCTAATT CCTGGCACTT ATAATCCTGC CTGTGTCTGG 540
ACTTAAGCTT CCTACATAAC CCCCAACCCC ACCACACAGA GACGTGTGTC TCCCATCTCC 600
ACAGAACCTG TGCTCCTCCC TCAGAAGGCT ATGAGAAGCC ATGGGCAGAC ACTGTGGACA 660
GGCCTCTGGC AGCGGCAAAG GAAGAGACCT GGCTGCTTGT CCTATGCTTG TCCTATGGGT 720
GGGTAGGGCC TCCCTCTCTG GGGGAGGTGA ATAGAAGCTT GATGCTTAGT GAAACTATCC 780
AAGAGTCTGG AAATGCTAGG AATGGAAACC ACCGGAAAAT GCACTTTCTA AGGAGGAGAC 840
TCTCCGATAA TTTGGACAAA GCGGGTTTGG GCTGATTTGA GCTTGTCTTC CTCTGTTCGG 900
GGAAACAACA GTGACAGGGC TTATGTGAAA GGTGTCCTTA GGCAAGATGG ATGGATTTGC 960
CCACACCAGA GCTGCGGCTC ACTTAGGGTC TATCTCAGAA CCAGGCCACA TAATACCCCT 1020
ATAAAAATGC CCCTGGCGCC CCCACCCCAC ACACGCTGCC TTTTCTCCCC TTTCTACAAA 1080
TCGGGAGCTG TGGCCTGGTA CCCGGCCAAC AAGCAGCCTC ATTCCTGGCT GGAACGCTCC 1140
TCTGCTCCAA GCACATCTCC CCTCACCCTC TTGGCACAGA ACTAGGGTAG GGATGGGGGT 1200
GTTAGAGGAG ATGATCTATT CTCTCCAGTG CCTCTGGAAA TTGTTTACTT TCATCTTGTC 1260
TTCTATGGGG AATAGGAAAC AAAAACCCTA GTCTTTAATT CATTATTTAG CTAGAAACTT 1320
CCGTGTCACC AAATACAAGT AAATGCTGGG AAGCCAGAAC TCTCTCCCCT AGTCAATGGG 1380
CTGAGTGGGG ATATGGCCCT TCAAAGAACA GCAGGACAGG TGACAGCCAA AGGCTTCAGG 1440
AGGCAAAAGC AGTATGGTGC CTAACCCACC TGGTTGGCTT TGACAGTGTC ACTCCACAGT 1500
GGCCCAGGGC CCAGGAAGAG GGAGGGACCC CACAGACCAG CTTCACAAGT TTCTCTAAAG 1560
AAGAACAGAA AAACTGACTA AAGGTGAGAG AAGGAAAAGG GCCTGCGATA GGGTAGGACG 1620
GGTGAAGCCC TGTATCCCGC ACGAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAGTCTGCA GGAAAAGAGT 1680
CCAGGGCAAG AGCAGGTGCT GACGCTGCCT TTGCGGCTGC TGTAACGAGT CCTCTCCTTC 1740
AACAGCAGCT CCACTAACAT TCTAGCACCG GCAGTGGCAC TCCCAGGCAC CCTGACCCCC 1800
GAGAGCACCA TCAGGATCCC ACCCCACACC CCCACACCCC CGAGTTGCTC CTCAGTGCTT 1860
CCTCTGCGGA AGGCCCAGGC TTCTCAACAT CCCTGTGCCC AGCCTGCCTG CACCGTGGCA 1920
CCCTTGGCCC TAAGGGAGCC CCTTTCTTCA GTTACTGCAG CAACAGGCAG AGCCCGGAGA 1980
GCTAGGGTTT TCACTGCTTG ACGGTTCTGG GAAAGCTGGG CTGGCTCTGC CTGGGCAAAG 2040
CTGCTTACCC AAAATGTTCA GCTTCAGACA TTTTCCAGTC CCTCAAAATG TATTGCTCCC 2100
AATTATTTTA TGACCAGAAC CACTGCCAAG GAAACCCTAG AACCCTCATT TCCCTGGTGC 2160
CTAGCTCCTG CAGAGAAAGG CTGGCACCAG GGCCTGAAGG ACTTCGGACG GTGCCCACCC 2220
TCTGCTGCCC GCTCATTCCC TCCCGGGCTC CCTTTCTTTC TCACCCTCTC TCCCCCTCTG 2280
CGTCCTCCAG CTCCAACACA AACTGTTTGC ACGGGAAGTC TCCCTCTATG ACCCGATTCA 2340
GCACACACAA GAGAAAACTG TGGGCGACAG ACCCAACGTC CTAACGAACT TGAGTTAATT 2400
AATGCTAAGG AAGAAAAGAG GCGCCCTCGC TCTGTTGAAT CACGGTTCAC TAGTCCTTTC 2460
AGTTTGCTGT GGGTGGAGGA AAAAAAAGAG AGGCTTTTTG GTTCAAATAT TTTTGGGGGG 2520
CAAAGAGAAA ACAAAAACAC CGCAGAAGGG CTGTGGGGGG TGGAGGGCGA TGCAGTCGCT 2580
ACCTGCCCGA GAAGTGTAGA GGCGAAAAGA AGGAGCCAGT CAGGGCTGCT GAGCGGCCTC 2640
CCTCGCGCTT CGGGCCAGAG CCGGCAGCAG AGAGAAGGAA GGCGAGGGAT GACTATCATT 2700
GGCCTGCTCA AACACATTGC TCCAAAAATT ATACTGTCAG ACTAGAAGAT GCACGTTTTA 2760
AAAAAGTCCA AATCTAAAAA TTCAATTTGA ACACAGCCGT GAAAATGTTT TTACACTGCA 2820
GAAAACTGAA GTATGGATGG CAAGCTCACA GAAAATGTAA GTGCAGAGGA GAAAAAAAAA 2880
AAAGAGGTGG CAATGGAGGG GCAGGGAGAA CAGCTGCAAT TTCACTTTCC AGATGTTGAC 2940
AGCGAAATGT AATTGGCAAG GAAGGTGCTC TGCACTGCTT CTCATGCTCG GCTTCTGACA 3000
CTAAATCCCA CGTCTATACC TAAGTCTTCA GGCCGCATGC AGGCCTTCTT CACTTGTGGA 3060
TGGGTCAGGA AGCTGTGCGA ACTACCGGGC CTTGGAGGAT TTTTTTAAAA AAAAAAAAAA 3120
AACAAGGCTT CTTACCATTC TTAGCAGGAA AAACTGAGTA AAGCAAGCTA GAGTACATTT 3180
TTATTTAAAT TTGTATTTTA AATTTGTAAT GGGCCACCTT TTCTTTACCT TTGGGCCCAG 3240
AGTTTTTTCA ACTTTTAGCA GAAGCCGCTG TGTATAAAGA ATGCTCGCAT TGTAAGTACA 3300
TGGCTCCATA CATTTCCACA AAGAGAACAC ACCCATGCAA CTCCACCCAG ATTAAGAAAG 3360
AACCATTTAC AGTACTGCTA AACAGGCCTT AAAATCTTAA GCTATAGAGT TTCCAGAATT 3420
TAGGAATCCT TAACAACAGT 3440