EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-11970 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr8:87251860-87256110 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr8:87252336-87252353GTTCATTAATTAATGCT-6.67
Alx4MA0853.1chr8:87252336-87252353GTTCATTAATTAATGCT-6.44
Foxd3MA0041.1chr8:87256089-87256101AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr8:87256093-87256105AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr8:87256097-87256109AAACAAACAAAC-6.32
POU6F1MA0628.1chr8:87252340-87252350ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:87252340-87252350ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01091chr8:87248650-87259880Myotubes
mSE_03537chr8:87253311-87256112Bone_Marrow
mSE_03671chr8:87253285-87261032Cerebellum
mSE_03995chr8:87251994-87257302Cortex
mSE_04466chr8:87252044-87256136E14.5_Brain
mSE_04899chr8:87253773-87256208E14.5_Heart
mSE_06307chr8:87252077-87257174E14.5_Liver
mSE_06705chr8:87253165-87260955Heart
Enhancer Sequence
CGGATTCTGC AGGAGAGACA AAAGGGAGAA AGGGTCAGGA GAAAGGTTTC ATACATCTAC 60
TGACCAAGCA GGCACCCTCC AGCCTTGGGC ACTGACCCTA GGCAAAAGAC CTTGTTCACC 120
CAGGCTCCAG GGCTAGCCCA GGGGGAATGG GCGGGGGGGG GGGGAACAAT GACAGTAAGT 180
ACTTCACTCA ACATTTGGGC TGGAATGGTC ATTGTGGCAG GGGGAGAGGC ACCCTGGGCA 240
GAGTGTGCAG CCGCATCTCT GGCCTCTACC TACTAGACGC TAATAGCACC TTCATTGTGA 300
CAACCCAAAC TACCTCCAGA AACTGCTCAA TGAGCCCCGG GGGAGTTGCC ATGGATAGAT 360
AGATAGCACG GACCAAGAGT CTGAAGTCAG GAGGAAGAAG CAGTGATGGG CACAGTTCGT 420
AACGGGGGCA GACCCCTGGG GCCCTCCTTC TCCCAGAGGG GCATTCCCAT CCCTAAGTTC 480
ATTAATTAAT GCTGTTCCTA TGGACTCACG CCCCTCCATC TCACCTTTAT GCTTACAGCA 540
ATGCCTGGCA ACCCAGAGGG GGGAGGTGTG CCCTGCTGCC ACCCAATTCT GTGCCAGTCT 600
GTCTGGGCTG TCTCATGCCC CACTGCCACA GCTGCTCAGA GGGAGCCCTG AGACAAGGGC 660
CTATTGTGTG GTGGAAGCCA CAGAGGGCTG GGGGCAGGGT GGAGTGTGTG TGTGAATATT 720
TTGCCGAGCT TGAGAAAGCC CCCCCTCGCC CCCTAGGTCC TCCAAAGCTT TGTGTGTGCC 780
AGGGGCAAGA TGGGGACCTC CAGAATGCCT GCCTGGGCAT GACAGCTGGT GAGAGGGTGG 840
GGGTGCTGAG GTAGGTTGTA AGGCACTTGG TGAAGACTCA GTTATATATA AGGACCACAG 900
CGGTGGCATC TGACACTGTG CCCTGGTTCT GGCCAAGGCT TTGCTGGGTT CTTTGTGGAG 960
TGGCCCAGGC ACCCTAGCTG GGCCACTGGG CCATTCACCC ATAGTTCCAT GTACAGCCTG 1020
CTGGTTTCTA GGTGGGGTTG GTAGGTCCTA CTCTAAAAGT CAAGGCCCTC TACATCTGGG 1080
GCTGGGAATA CTGGACAGGC TCCTGGCTAT CTCATGGTAT GATAAGTAGG AGGCTGTTCC 1140
ATTTGAGGGC CCTGATATTC TTTTCTTTCA TCTTGTTCAA TTTTTTTTTC TTTCTTGTCA 1200
GTACTGGGGA TCGAACTTAG GGCCACACCT GTGCAAAACC AGAGCTCTAC CACTGACTGA 1260
GCTATGGACC CAGTCCTTTA ATTTTTTTTT CAATTCCAAA AAATAATAGT AAATCTTGCT 1320
ATGAAATCAG AGGTAGAGAT TATAAGGAAC GTGTCCACAA GCTTCCCCCT CCAATCTGAG 1380
GTGCATTCTT CCATGACACT GTGAGTCAGT CACCTCTGTG CCATGGAGGG GGGGTGTCTT 1440
AGGGCCTCCT CCTATAATCT CTAGCTATAT CTTGAGACCT TGCTGTACCT TGGTATCACA 1500
TAGTATGGAT TTCCTTCTTA CTCTCTGGAC CCCTGGGTCT GATGCAAGTC CAAGCCAGTC 1560
CAAGCTAGTC CAAATGGAAG CCAAGGGGTC TAGGTGGCAT GTGGCCTATG CTAGGGCCTT 1620
CCTGAAACCC CACTGTGAAG CTACCTCAGT ATGCTGAAGA AGGGCAGAGC CTCAAGACTG 1680
GCATGCAGAG TCCATCAGAG GATACATGGC ACACGCCCTG CTGCCCATAG TCTGCCATGA 1740
ATCCCACCCA TCCTAGGACT GACACAGCCC AAAAGACCTC CAAGTCTGGG TCAGTTTGAG 1800
GGTGCACAGA GTTCACCCCA TAGGAGTACA ACTGGCCCAC TGCAAAATGC CAAATAGAAA 1860
GGGAGAGCTG GGTGCATGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGCTTGTGTG TGTGTGTGTA 1920
TGCACGCACG TGTGTGCAAG CATGCTTGCA CATCCAGCCA AAGGACAGAA AAGAGTAGAG 1980
AACGTGACAA AGAGATGGAG GTGCGCCAGC GCCGGCGCCG GCAGAGACAA ATAGGGCTCC 2040
AGGAGAGTGC GACAGACAGG AAATCCTTTT AAACCAGGAC ACTTCCCAAA AGGGTGCTGC 2100
TGTTATTACT ATTAGTTCAT AGAAAGGAGC AAACAGGAGA AGCTGGGGAG GATGAGGCTG 2160
GCTGCCACGC GCCACTAGGC GTGGCTCTGG GCGCTGCTGG CAGCCATTTT AGACCTTGGC 2220
AGCCATCTTA TGGCTGGCGG CCTTGGCCAG CATTGCCACA ATGCCGCCAC CACCAGCCCC 2280
CAACAAGCTC AGCTCAACTC CAGGACAAAA GGCAGAAACA CTGGAAGCCT GGATCTAGAC 2340
TCGCCGGCAG AGGAGCCAGC CCTAGAGCCA GGGCAGCTGC AGCCGGGGTC CTGCAGGTCT 2400
GTACTAGCCT CAGCTTTTAT GATCCCTGCC TGGGCCATGA TAGGGCAGGG AGAATGAAGC 2460
CGGTGCCCTG GCATCACTGT AGCTTTGCTG AAAGGCAGCC GGAGCTCTGA GTACCAGGTC 2520
TAGGCCCAAG GACCTACCAG TTGAGCAAGA ATGGACCCCT GCCCAATAGG GACAAGAGTA 2580
TCTTGGAAGT AAAGGATGTC AGCTCAGGAT ACATCTTGGG TAGACATGGC AGGGAATCGG 2640
AGAGGCCACT GGATCCTCAG TGGTCAGGCT CAGGGGCCAG CCAAGGGACA TCCAGAGATG 2700
AGAGCTGGCG GCCAGCTTTC CCATGTGGCA GGGCTCTCTG GGATGCCTTA AAACAAGGTC 2760
TGTGCCTGTT CTGGACATCC CTAGGGACCA GCAGCTGGGC CCCAGGGCAG CATGCCACAG 2820
AGTGTCCAGG CACCTTGCCT CCCTCTTTTG CCTGGGACCC CAGCAGAGAG AGGGAAGGCC 2880
CTTTACAATA ACCCCTCCCC TGGCCCCGCC TCGTGGCTGC TTGGCTTTTA TCTGGCAGAA 2940
TGGGGCTTAT CAGAGCCACC AGCTGAACAA ACACACAAAT CCACGGTTAG TGAGAAAAAA 3000
TACTCTGCCT GAACTCTTTA TCTCCTGTTC ACAGGCCTTG CCCACTGCCC ACTGCCAAAA 3060
GCACAGGAGG GAACCCGAGG CGGTGCAGTG GGGGCTGAGT TCTCGCTCTG GAGGTGGAGG 3120
GTGGCCTTCC CTAGCCTGGC CTTGCCTTGT CTAACTTGCC ACCTCAGCCA CCCCCTTCCT 3180
CCCTCCTTGT CCCCAGCCCA TCCACAGTCT TCTCTGGGAG TCCCTGCCAG TGGGTGAGTC 3240
CCGGCCCACA CAGAACCCCC CTCCAGTGTC TGCTTTCTCA CTGGGGACAA TGGGCCAGCT 3300
GGTGGCCTGT GGAACAGTGA AGGGACAGGG ATGATACTGG CTCAGACAAG GCAGGCAGGT 3360
GCTGCTTCAT TTCTTACCCT GCCCAGCCTA CCCTGGTCCC CTAGTCTGTC ATGGCCCTGT 3420
CTCCTGCGGG CTTTTCTTGC TTCAACCTCT CCAGTCTGGC TACCATGGAA GCAAGGGTTA 3480
CAGTCTCCTC TGTTCAGATC AGCCTGGCCC AGGCTGGGAA AAGAAAACAT CTCCTCTCTG 3540
CGCTCTCCTT CTACAGAGCC CGGGGCTCCT GCCACTTCCT CCAGAGACAG AACCAGGACA 3600
AAGGGCTCAC CACCACCTCC CCTGGACTCA ACCCAAGACA ACTCAATGGT CTCCTGAGTC 3660
CTGGAGTCGA AGAACCACAC TTCCCTAGGC TCCAAAGTGT CTCCCACTCT GCCCGGCAAA 3720
TGAAACTACC TACCTGAGAA CCAAGCCCTA CCCATGTTCG ATAGAGGCCC TCGATGGGCA 3780
GGTAGCTTGG CCCTGCCCAC CTGAGCCAGG TTTGGAGAGA GCTCACAGTT CATTCTAAGT 3840
ACTGTTGGGT GGTTGGCTAT AGGTCAGGCA CCTTGCAACA AGCAAGCTCT TGTCTTTCTC 3900
TGAGGACCCA GGCTGCTCAT ACAAGGCATG AGCAGAGGCC ATCCCTGCTA GTGGTCTTGG 3960
CTACTCCACA GGGTGTCTGG AAGGCAGGAC TGCGAAGGAG CAGGTGAAAT GATGAATTGG 4020
GATTGACTGG GCACGGGCCC AAGTGGGTTC TACAAAAGGA CCTTGGCTGT AGGTTTCCCG 4080
CCTGCTCTCC AGTCATGCCT ATCCCAGAGG TCATTTCCCT GCTGCTACAA CTTATAGACC 4140
AACCGCAGAT GTCAGACAGC ATGCCACTGA CAGTGGCCAG CATGGGCCCC TCCTTTCCCC 4200
ATGCCTCTCA ATGGCTCCTG GGACAGACCA AACAAACAAA CAAACAAACA 4250