EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-11965 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr8:87183760-87185220 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr8:87184875-87184890CAGGTTCAAAGTTCA+6.53
Hnf4aMA0114.3chr8:87184876-87184892AGGTTCAAAGTTCAGT+6.82
RXRBMA0855.1chr8:87184876-87184890AGGTTCAAAGTTCA+6.63
RXRGMA0856.1chr8:87184876-87184890AGGTTCAAAGTTCA+6.67
RxraMA0512.2chr8:87184876-87184890AGGTTCAAAGTTCA+6.55
SMAD3MA0795.1chr8:87184063-87184073CGTCTAGACA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00413chr8:87183683-87188381pro-B_Cells
mSE_03414chr8:87183660-87187212Bone_Marrow
mSE_04947chr8:87182845-87190074E14.5_Heart
mSE_05527chr8:87183459-87189917E14.5_Limb
mSE_06569chr8:87183492-87190001E14.5_Liver
mSE_06917chr8:87182849-87189177Heart
mSE_07264chr8:87183114-87189546Intestine
mSE_08750chr8:87183516-87187934Liver
mSE_09043chr8:87183347-87189642Lung
mSE_10028chr8:87179809-87188012Embryonic_stem_cells
mSE_12064chr8:87183466-87189579Spleen
Enhancer Sequence
TTTACTAATC CTCCTGCTTC AGCTTCTCAA GTGCTGGGAG TCCAGGCTGT GACTGTGACA 60
GTTTTTCATG TAGCTCATCA CCCCTGCGAG AATGCGTGCA GGAGCTGAAG ACTTGCTTTC 120
AGTCCTCATC CTACAGTGAC TGCGGCACCG GAAGTCCTGG TATGGGTTGA ACAAACCACC 180
TCCCTGGGAA GGAAGGGCCC CACGGTTCCT GGGACAGGAT GTACACCGAG GCCCCCTCCC 240
TAGCCACCAG GGACTTCCCA GGCCTGGCCA CGTTTCTGTG TCCAAGTTCC ACGAGAACTC 300
GAGCGTCTAG ACAAAGTGGG CAGCGCTAGG GATCTTCCAC GTTTTCAAGA AAATATCAGT 360
TCTGGTAGAG GCTCGGCTGG GTCTCCTGGG AGTGCAGAAC CCTTACTTTC TAGGAGGGAG 420
AAGCTGGGGG CTGGGACTTT CTAGGAGCAA TCCCCTCCCT CCAGCTCTCC GCCCTAGGGT 480
CAAAAGAGGC CGGAGGAGGC GGGGACTGCT GTCGGGCGCT TTCCTTGAGC TTCCTGCACC 540
TGCGGTTCCT TTGTCCTTAG AGCCTGGAGC TCCCTCCTAC CCTCGTTCCC AGGTTATGCC 600
TAAAGCATGT CGGAAACCAA AGTGAGAGAA ATTCTCTCTG GTTGGATAAC CCGCAGCTGG 660
ATGGGAAAGT AGCCTGGCTT CTTGGAGAGC CACGTGCCTC TGCTTTCCTC TTTCTGGGAT 720
TTAAAGGTGC GCAGCACCCT GCCCGATTTA AAAAACCAAA AAACATTTAG GGACTTGCTG 780
TTTCTTGAGC TGGTCTACCC ACGAAACCCC GTTGAATTAA ACGTGAAACA CCAGCGTTAA 840
CACTGTTAAA ACCTAAGTGT TCTGAGGAAG CGGTTTATAG GTTCATTTAT TTCGTTTTTT 900
TACGAGATAG GGTTTCTTGT GTAGCCTTGG CTGTCCTGGA ACTCGTTCTG TAGACCAGGA 960
TGGCCTCGAA CCTTCTACTT CTGCCTCCCC AGTGATAGCA TTGAGGGCTT TAGGCATTAT 1020
GCTCGTCTTA GGGATATTTC ATAGACAGGT AACTTAAGTT AGCACTCAAT TATCTGCCTG 1080
AGCCACACTA AAGAAATCGT GTAAGGGGCT GAACGCAGGT TCAAAGTTCA GTCACCGCCA 1140
CTCTACCCGT GGGGGCCCTA CGCAATTCCG GTCGAGGGGG AGAAACGCCA TCATTTAAAA 1200
TTCCTCAGCT CTTCTTGAAA CACTGCACCC AATACCCCCC TCCCCAATTG TAAACTAAGC 1260
TTTCCACACA CTATTCCCCC AGAGTTTGTT AATTTCTAAG GCACTCCCAA ATTACAGGGC 1320
TAGCTTAAGC AGGTAAACTT GTGGCAAAGA AATGGGGCCC GGCCTCCCTC TGGCTCCGCA 1380
CCCAGTCAAA CCAGTTCCGG AGGCTTAGGG AGCGGCTGAC CCCTTAACCC CACCCCTCCC 1440
CCACCAGGGA AGCAAGCCAG 1460