EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-11151 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr7:80751260-80754510 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EGR1MA0162.3chr7:80751889-80751903GCTGCGTGGGCGGA-6
EGR2MA0472.2chr7:80751891-80751902TGCGTGGGCGG-6.32
EGR3MA0732.1chr7:80751889-80751904GCTGCGTGGGCGGAA-6.13
FOXA1MA0148.4chr7:80753347-80753363CAATGTTTACTTAGTA-6.13
FOXC1MA0032.2chr7:80753349-80753360ATGTTTACTTA-6.02
FOXD2MA0847.2chr7:80753349-80753362ATGTTTACTTAGT-6.32
Foxa2MA0047.2chr7:80753350-80753362TGTTTACTTAGT+6.44
RREB1MA0073.1chr7:80753721-80753741GGGGGGGGGGGGTATGGGGG-6.01
RREB1MA0073.1chr7:80753720-80753740GGGGGGGGGGGGGTATGGGG-6.44
ZIC1MA0696.1chr7:80751806-80751820CTCAGCAGGGGGGC-6.18
ZNF740MA0753.2chr7:80753720-80753733GGGGGGGGGGGGG-6.03
Number of super-enhancer constituents: 26             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00389chr7:80728813-80754010pro-B_Cells
mSE_01523chr7:80662346-80773459Th_Cells
mSE_02681chr7:80731224-80764627HFSCs
mSE_03000chr7:80728755-80771487TACs
mSE_03459chr7:80752445-80752863Bone_Marrow
mSE_03982chr7:80751273-80752089Cerebellum
mSE_04060chr7:80751282-80753626Cortex
mSE_04416chr7:80751110-80753688E14.5_Brain
mSE_04807chr7:80751431-80753544E14.5_Heart
mSE_05509chr7:80751081-80753496E14.5_Limb
mSE_06583chr7:80751249-80753369E14.5_Liver
mSE_06612chr7:80751246-80753522Heart
mSE_06612chr7:80753757-80754126Heart
mSE_07229chr7:80751242-80753696Intestine
mSE_08080chr7:80751435-80753991Kidney
mSE_08614chr7:80751335-80753561Liver
mSE_09049chr7:80751325-80753714Lung
mSE_09494chr7:80751426-80754236MEF
mSE_10229chr7:80751258-80752906Embryonic_stem_cells
mSE_10773chr7:80751274-80753605Olfactory_bulb
mSE_11288chr7:80751310-80752907Placenta
mSE_11971chr7:80751381-80752954Spleen
mSE_11971chr7:80752979-80753451Spleen
mSE_12651chr7:80751315-80752082Testis
mSE_12651chr7:80752108-80752838Testis
mSE_12880chr7:80751301-80754308Thymus
Enhancer Sequence
GGCCTCGAAC TCAGAAATCC GCCTGCCTCT GCCTCCCGAG TGCTGGGATT AAAGGCGTGC 60
GCCACCACGC CCGGCCTCCA ATACAGATTT TCATAGCACC ATCTGACCCT ATCTGGGCAG 120
AAACTAAATT TTAAATAGAA AAATGGGCAG GTATTTTAAA CGAGGGAATT GTATCACTTC 180
CCCAAGTGAA CATGTTCCTA GAGTTAACCA TCCCTGCACA GTTTAAATCT CCTTCTGAGC 240
TACATTAACA TGAAACAAAT TCAACAAATT TTATCCAAAG AACGTGGGGG ATTGCACCAG 300
TTTTGAGGCC TCCATTCCTA TCCTGGAAAC CATAGCTCAT GTCTTGAGGC ACGCCCCAGG 360
CTTTTCTCCC ATCTAGAACA CTTGTGGGAA GGGAGCTTTG TGCAGTTGTG ATAGTAAACA 420
TTCCACACTC TAGAGACCGA CATACAACTC TCTCTGCTGA GCTCAGGCTG GGCCACTGGC 480
TTTGTTCTCC GCACACATAA ATATAAGTTT TGGAGGCCAT CTTGGAAACA GGAGAACTCT 540
GGGCGCCTCA GCAGGGGGGC TGACCGTAAC TAAGCAACGG AGGCGCACCC AGTGCCGCGC 600
AGCCGCAGAG CGCCGCGCAC GAACGCCCCG CTGCGTGGGC GGAACTGATG GGGGAGGGCG 660
GCGGCGGAAA ATTACCTTAG GTTCTTCTTA AAGGCACAGA GGCCTTACCT GCTAAAGGTC 720
CAATCGCCAG CCGATCTAGG GTGCATGTTT TACAAAGCCT ATTTGTAATG CAGTCGACCT 780
TATATTTCTC TGTGAATACG AATTTTATTT ATCTTCTCAG AGAAATAGAA TCCAATCCCA 840
AATTAACTTC CCCGTGTAAA CTTCAGTCAC TAAGTAAGCA AATAGTGGAA TAAACAGGCT 900
TCTTCAAAAT CAAGTTAACG GGCATGGGGA GGGGAGAGCA AATCAAACAA AACAGCCACC 960
AAATTAACCC TAAAATGTCG AATGGCGAAG AAAGAGAGCT AATGAAGTCA GGAAGGGGAT 1020
GAAGTGAGCA CCCAGGAATA AAGTCACGAC TGTGTAGCAG CTTTAAAAAT GTACAGATTC 1080
TGAAGCAAGG AAAATTTATT CTTGACAGAT GGATTGGCAG ATTATAGTAT ATACTAAAAA 1140
TTAACAGAAA AACAAGATGT CTGTTAAGTA AAGCGGGATC AGAAAACTCT CCGCATAGGT 1200
CACTTTTTTA CAGCAAATAA AACCATAAGA CTTTTTGCTC TTCTTTTTAG AAAAAGAAAT 1260
GCAGTTTTTA AAAGTGTTTG GTGGCACACG GGTGCTGATG GCGGTGCAGT TATACCACAG 1320
TACGCTTGTG GAGGTCGGAG GACCTTGCAG GGAGTTTGTT CTCCCATGTA TGTTCGGAGG 1380
ATTGAATTCA GGTCTTCAGA CTTAGCAATA ATCACTTTTA CCCTCCGAGC CTTATCTCCA 1440
GCCTCCACCT CGCTTCTTAT CAAAGACATT TCCTTCGATC TAGCAGTTTC TATGATTTAC 1500
AAGTTAAGGA ATAATTCATA ATGGTCCTAC TTATGTGAAA GAATAAACGC AGGGTCTGGT 1560
TCAATGGAAA TCTGCAGGGG ATAATGTGCT GCTCTGCAAG TCTCTACAAT TAATCTCCTT 1620
ACTAAAAGCC TTCCTTGAAA ACAACAACAA AACAAAACAA AACAAAACAA ACAACGGAAG 1680
AAAAAGAAGA AGAAAAGAAA AGAAAAGTAG GAAAGAAAAG AAAAGGAAAA GGAAAAAAAC 1740
GTGTCCTCTC TGAAATAAAG CCATTCCCAC ATTCCGAATC TCCATTTCCA ACGACAGAAG 1800
ATCTTTTGCA CTCCTCAGAT GGTTTGCTTG TTATAAATGA TTTCTCTTCC AAACTGCCAT 1860
TAGGTGTACC CTAATAAACA GCACCATACA TCCTCGGAAG CACCTGGGGC TCTCACCACA 1920
AATGGGGGGA TGTTCCAGTC CTATCACGGC CCTAACAAAC CAATTGTCAA TCCCAGAATC 1980
GACCATTTCT TCCCATGCTT CTCAGCCATT TTAAACCTAA TTTTCACATC TACTTTAAAT 2040
CCCTACAAAT CTTCCCCCTT GTCCCTACTG TAAAGTCTTT ACAATGTCAA TGTTTACTTA 2100
GTAATTTGTA AAGGGTACCG TGTTCCTTTC AGAATATGGA ACCGTGTGAT CTTGATACTA 2160
AGAAAATGTT TTGCAATGGT TTAGTGTGCA GCTTGTTAAG TTTCAATTTG GCTATTAAAG 2220
AAAGGACCAC ACTAACTTTC TAGAAGCACA GGGAGATAAG TCCTTTAGAT TAACAAAACA 2280
AAACAAAACA AAAAACCAAA ACTGTGTGGT GCAGAAGAGG TGCCACCACC ACCTTGAGGG 2340
GAAAGATTTA ATGTCTAAGA ACTGTGTCTT GGAAATAAAA ATACACACAC TTGCAGCTGG 2400
TGGGGCCATG TCCTTAATTG CCTTCATGTT TCATTACCAC AGCTAAAGAA CAGAAGCCTT 2460
GGGGGGGGGG GGGTATGGGG GACTTTTGGG ATAGCATTTG AAATGTAAAT GAAGAAAATA 2520
CCTAATTTTT ACAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAGGG AACAGAAGTC TGAAACGGCT 2580
GCTTTGTAGC CGAGACGGTG TTTCTAACGC TTGCAGAAAG TATGGTGTGG GATGACAGAT 2640
GATGCCGGCT AGACAAGGCA AGTTCTCATG TCCTTACCAC CTTTCTTCCA GAGGTCTGTT 2700
TTCTAGCACA GACTGTTCTG TATAATTCCT AGTAATCTAG GATAGTCCCC AGAATAAACA 2760
GAGAGAAAGG CCAAGAGGAG AGCAACTAGA ACACAGAGAA CAGAGACAGA ATGTAGATGG 2820
AAAGTCACCA GACTCCTCCC TCTTAAATTC TCTATATAAA GTGGGTCAAA TTACTAAGAG 2880
ATCAAATTAT GATAAATTAG AATCCAATTC TCTTTAAGCC ATAATGAAAT GATTTTTAAA 2940
ATTTTATCTA TTTTATGTGC ATGAGTATCT TGCCTGCATG TCTTTATACC ATGTGTCTGC 3000
TTGGTGCCTG AAAACTTAAG AAGACATGGT GAATGCTCTG GGGCTGGAGT TAGGGAATTG 3060
TAAATCACTA TGTAAAAACT GGGAACTGAA AAAAAAAAAA AATGGCGGGC AGTGGTGGCG 3120
CACGTCTTTA ATCCCAGCAC TTGAGAGGCA GAAGCAGGTG GATTTCTTAG TTTGAGGCCA 3180
GCTTGGTCTA CAAAAAAAAA AAAAAGAAAG CTGGGAACTG AACCTGGGTC CTCTGCAACA 3240
GCAATAAGTT 3250