EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-10746 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr7:16631550-16634620 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr7:16633112-16633132CCCCCCAACACACACACCCT+6.31
RREB1MA0073.1chr7:16633114-16633134CCCCAACACACACACCCTCG+6.42
Sox3MA0514.1chr7:16631930-16631940AAAACAAAGG-6.02
ZNF263MA0528.1chr7:16632743-16632764GGAGCACGAGGAAGGGAGGGG+6.19
ZNF263MA0528.1chr7:16632158-16632179CCTCCTCCCTCCTCCTCCACC-7.82
ZNF263MA0528.1chr7:16633561-16633582TCCTCTTCCTCCTCCTCTTCC-8.02
ZNF263MA0528.1chr7:16632155-16632176CCTCCTCCTCCCTCCTCCTCC-8.78
ZNF263MA0528.1chr7:16633567-16633588TCCTCCTCCTCTTCCTCCCCT-8.78
ZNF263MA0528.1chr7:16633555-16633576GCCCCCTCCTCTTCCTCCTCC-9.17
ZNF263MA0528.1chr7:16633564-16633585TCTTCCTCCTCCTCTTCCTCC-9.35
ZNF263MA0528.1chr7:16633558-16633579CCCTCCTCTTCCTCCTCCTCT-9.39
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03384chr7:16629319-16635607Bone_Marrow
mSE_05776chr7:16629077-16633546E14.5_Limb
mSE_05776chr7:16633626-16634808E14.5_Limb
mSE_07209chr7:16628127-16633502Intestine
mSE_07209chr7:16633623-16635136Intestine
mSE_08775chr7:16628408-16633550Liver
mSE_08775chr7:16633708-16635500Liver
mSE_09637chr7:16627400-16633481MEF
mSE_09637chr7:16633739-16634774MEF
mSE_12018chr7:16628115-16633564Spleen
mSE_12018chr7:16633695-16635776Spleen
mSE_12737chr7:16631708-16632809Testis
Enhancer Sequence
TGAGGTAAAC AACTGATAAG TCCCGTGGGG CCGCCTAGGA AAGGGGTGGT CTCTAAGCGT 60
GGCTTCCCCT GTTTCCTCAT CTTGGGGGTT GGGTCAGAGT GGACTTAGAG TGCAGGTGTG 120
GGGAGGGGCT GTGTGCCAAA GATCTCTTGA CTTTCAGCCC AGAGTCTTGG ATGTTCACAC 180
ATCTCCATAT TTTTCTGACA CTACGTTGGG GGTAGCGACA AAAGGGGCTA GAGGTTTAAG 240
ACTTGGGGGT GGGGTACCAA ATGCAAGTGT AGAGGCTGGG GACCTCGAGG GCCCTGTCAT 300
CAAGACTTCC CCAGGAGAGC TGACCCGGCA GCCTCTGACC CCACCTCCAG GGACGTTCAG 360
CTGCTCAGAA CCACAAAGCA AAAACAAAGG GGCGCGGAGA GGAAGGAGCC ACTATGCCTT 420
CCAATCACCG CGGTCGCCCG AGCCCGCGCC CTCCCGCGGC TCGTCGCCCG GTCCTCCGGC 480
TGGCGGAGGC CCAAGGCCTG GCTGGGTAGC TCCCTGGTCC CTTGTCTCCC CGCGGCTGCC 540
GGTGACAGGA GCCGAGGAAG CAGTGTGGGG CAGCCAAGGC GATGGGAAAA CCAGATGGTC 600
CTAAACCTCC TCCTCCCTCC TCCTCCACCT ACCCACCCAA CCATCCATCC ATCCATCCAT 660
CCATCCTATT CCATCCCTCT CCCTCCAAGC CCGCGGCCTG GCCGCCTTCC GCAGGGACCT 720
GGCCGGGATC ACTCCGGGGA AAGGACTGCC TTTGTCTAAA GGTCACCACC CGGAGCGCGG 780
TGCCCGGGCT GGGCCTGGTG CCTCCCATTC CTAGGCCCAC GGAGTTGGAG TTCAGGGGCC 840
GCCCCAAATC CCAGAAGGTG ACAGGCGTGA AGGCTCCCTT TTTTCCCTCC CTTTGATCCC 900
TAGGAACAGG CCTCCTGCAG GACTAGCCAG CTGAAGGGGC GGGGGTCCCC TACGCTCTCT 960
GCCGGGGATA GGAGAATCAA GTCAACTCCT CTCATTGTTT AGGGACGATG GAGAGGGGAG 1020
ACCCAGTGGC CTGCATCCCA GTTCATCTCT TCCTACAAGC CTGCAGAGGA CCCCCGATTC 1080
TCCCTGGCAC CCCCCAAGAG GAACTTGGGG AGGGGGCGCA CGGGACGCGC GACAGGAGGG 1140
GAGATGGATC GAGCTGCCTT TCTGTGGCCC TTGGCTCTCC CCAGAAAAGG CGGGGAGCAC 1200
GAGGAAGGGA GGGGGGTCCC CAAGGCGGGC GGGGGGTCCC CGCCCCTCCC CCCCGTGGGA 1260
CGTTCACGCT CGCCCCTCTC CTCCGTTGCA TTGTATCCCG GGAAGGACCA GGGAGGGAAC 1320
CGGGGCGCAA GGTTTGAGAT CGGGGAGCAA TGAAGGGGGA GCTCTCTGCA AGATCGGGGT 1380
GGCGGCGGTG GCGCGAGAGA CCTGGGATGG GGGTGTGCGG ATAGTGGTGG GCGCTGATCA 1440
CAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAATCCAG CCTGAGCAGC GGCAGCAGGC GCTGCGCCCC 1500
GGTTGGGGGG CTGAGTGTGG AGTGTCGGGG GGGAGTGGGT TCGGCCCCAG CTCTGGCTCT 1560
CCCCCCCCAA CACACACACC CTCGCCGCCG AGCCCCACTC CCCCCCTCGC TTTTGCGCCC 1620
TGTCACAGCC CCGACTCGCA GGTAGAGAGA GTTAAGAGAT TTAAAGAGAA ATTGCTACAT 1680
TGTGAGAAAC TCACCCTGAT GTTTGAGCAG CCGTCGGCGC GGGGTCTCCG GGACGGCCCC 1740
GCACGGGCTG CACAGGGAGG ACCCAGAAGG GGCCGGCCGG CCGGGCCGGT CAGCGCACTG 1800
CCTGATCGCA TGGCGGGCCC CGGCTCCGCT GCGCCCGGGC CCGCCGCCGC CCTTGCAACG 1860
AAGCGGCCCC GCGCGGCCCG GCCCCGCGCC CCGCTCCGGG GAGCGCCCCT CGGGTATGCA 1920
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAATTTTT TTTAATTAAA TGCAAAAAAA AAAAAAAAAA 1980
AAAAACCTTG CTGGTTTTGT GTCCCGCCCC CTCCTCTTCC TCCTCCTCTT CCTCCCCTCC 2040
GCCCAGCTAC GAGGAGGAGC CACAGAAGGC TCCGCCTGTA GTGTGGCAGC TAATCAATCG 2100
TAGCAAAGAG CGCTAGAGCG GCAGATCTGA TAGCCAATAA AAAGATGCAC ACTCTGTGGG 2160
CGGGAGCACG GAATGTCGGC ACCGCCCCCT GCTCCTGGCA CGGCCGGGCT GCTTGGGTGT 2220
CTGCTGGGCT GTGGTCGGCA ACCTGGAGCT GGTGTTCGAG TTGGTGGTGG TGGAAGAGGA 2280
GCCAGAGGGT TGATACGTGT CCGTATCCCT GCGCCAGGCC CGCCTAGGAA TGGGCCGTTG 2340
TGCTCCCTGG TCCAGGATGG TGGCTTCTGA GGGAGGATGC TCCACAAGGC ACTTCAGAAG 2400
ACTTGCAAAG ATAGTGTGGT CGAGGCTTCT TGAGGAGGTG GGACAGTGTT TCCCCGCGTT 2460
GGACCCAGAG GGTGCCAGGC GATGGGGAGA TTGGGGGTGA CCTGGACTCC AGACGTGGCG 2520
TATAAAGTCT CTCCGAGCCT GGGGATTTTG AGCCGCTGTA GCGCAAGGAC TATGGTTAGC 2580
CCTGCTAGAT AGCCTGCTTC TTCACGCCTG GCCGGCAGCG CAGATCCGAA GCTCAAAAAT 2640
CCTTTGAGCG ACGCTTGGAT TCACAGGTCT ATTCCCAGAG CACTTGGTGA GCGGGCATTT 2700
TTAGCCCTGC TCAGCACGTC CCAGACCGCA CCGGCCTGCC CTTCTGCACA GAACTGGTCT 2760
GATTTCTTAA CGTTCCGGTC TCACATGCCC TTGTTTCTCC CGAGCTATAG AAAACCTGGT 2820
GCACAACAGT AGGTATCGAA TAAATGCGTC GTATAAACGA CTGGCTGATC TGTTTTGTAA 2880
GTCTTATCGT TGATTCCATG GCGGCACTAG GGTTTGGCGG GGAACTAGGT CTTGCTATGA 2940
AGCACAGGCT GGCCTGGAAC TCGCGCTCTA CCTGCCTTCA CCTCCCAGGC GTTAGGATTA 3000
TACTTGTGTG TCACTATGAC GAGCTTAATT TCTTTTTATT GCTATCGTGA GGTCTAAGGA 3060
TATATATAGT 3070