EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-10448 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr6:114831160-114834930 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARAMA0729.1chr6:114834629-114834647GAGGACACAAGGTCATGC+6.15
Sox3MA0514.1chr6:114833450-114833460CCTTTGTTTT+6.02
mix-aMA0621.1chr6:114834071-114834082CCTAATTAATT-6.32
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02801chr6:114823687-114843363HFSCs
mSE_03012chr6:114822880-114866200TACs
mSE_04097chr6:114831305-114834204Cortex
mSE_04484chr6:114831615-114834437E14.5_Brain
mSE_04929chr6:114831948-114834647E14.5_Heart
mSE_05556chr6:114832029-114834742E14.5_Limb
mSE_06862chr6:114832188-114834204Heart
mSE_07926chr6:114832145-114834188Intestine
mSE_08000chr6:114831472-114834179Kidney
mSE_08379chr6:114832092-114834078Liver
mSE_09062chr6:114832272-114834055Lung
mSE_09938chr6:114832772-114834331MEF
mSE_10810chr6:114831996-114834185Olfactory_bulb
mSE_12520chr6:114832877-114833939Spleen
Enhancer Sequence
ACAGACCTCG CCAGAAGCAG CCAAAGATCT TAAGACTTCC ATCTCTGGAG CAGTGAGCTA 60
TATAAACTTC TTTTTATTGT AAATTAAACA GGTTTAGGTA TTTTGTCATA GCAACAGAAT 120
CCCTCTTAAA GTTTCTGGAT AGCAGGGCAT GGTAGCACAC ACAAATCCCA GCACTTGGAA 180
GACAGAAGTA GACAGATCTC TGTGAGTTCG AAGCCAGCCT GGGTCTTTAT AGGGAGTTCC 240
AGAATAGTCA GAGATGCATC CGAAAATCTG TCTTTTTTTT TAAAGGGCAC AGGGAGAAGG 300
AAGAAAAATC TTGGGAAGAG TGGCTCCCAA GGTAGAAAGG GGAACACAAA AAGAAGGGTC 360
ATAGGAGGAT CAGCCAAAAG AGATTCCTTC TGGAGTCATC ACAACATGGA ATTACAAGTG 420
TCCCCCAAAT CTGCCACCTT GTGGGCAGAG CATCAGGGGG AACCTGGCCC AGCTTCCTCA 480
ATCTCTCGGC CCTCAGTGGA CACCCTGATA GTTCCCTCTG TTAAAGGGGG GCACTCAATA 540
GCCTTGTATC GGGGAATTGA CCAGGTACTT CATTTTCCAA GTTAAGCTTC GAGGGTCTGA 600
AAGTTTACAA TGGAATTCTG AAATCAACTG CTCGTTATGT CGGGCCACAT CTCTGAGAGA 660
AGTTTTGCTC CACAGTGAAT CGACAACAGA TCTAAACAAC ACGTTAAACG ACAGTCCCTG 720
GAGGCCTACG ACCCGTCTGT ACCACCGCTG GCAAGTCATA GACGCTCGCT GTCCTCCTCT 780
GAATCCTCAT ACAGAATGAA GGAACAATGC ACTGTGGTCT CTTCTTCCCA GGGCATTAAC 840
CCCACATGAG CAGGGCTCAC CTCCTAACCT CATCTAACCT TAAGAACTCC AAAGACCTTC 900
GCACTGGAGG AGAGGGGCTT CAACTCGTGG ATTGTGAAGG ACCACAAGCC AGACTACCAC 960
AGGCCCCAGA GCTCTTTCCC TTGGAGAAAC TCTGGGCTGA AAACTATGTC TGACCCAGAA 1020
CCTGGAAATT TGCATAGACA TTCCGCCATG TACACCCAGC AGCTCCTCAG ACAACCTCAG 1080
CAGTGGCTGA GCCCCTGACT TGCTGATCTA ATGAGAGCCA ACGGACTCCC ACGACACTCA 1140
GTGCTGAAAC TGTTCCTGTG ACCATCCATG AGCTCCCACC CTCCCTTCCT TTGCTGGAGA 1200
CCACTGCTAT GTAGCCCAGC CTGGCCATGG ACTCTCCAAT CCCCTGTTTC AGCATCCCAC 1260
GTGCTGGGTC ATAGGGTATG TACCACTGGG CCTGGCATCC TCGGGCCATC TCTTAGGACT 1320
CCTCAAGGGA GGCAACAAGA AGCCAATCAG CAGGAACAGC AGAGGCCGGG CTTCTCTGCC 1380
AGCCAGGGAG CTGAGGCTCC AGAATTCAGA CCCTCCTGTG GGCAGGCTTG TCTCTGTCAC 1440
CAGACCCCAG GACAGCTTTA AGCTCTTTGA GTATGCTCGG GAGATATTAT AAAAATAAAA 1500
AGTGTTTCGA CCGAACAACA CAGCAAAGCA AGAGACAAGT GCCGTGCTGG TCAAGTGTAA 1560
ACACCAGAGC TGCTCCTGCC TCCTCCTGCA GTGAGGCCCA GCGAGTAGGG AGTAGGAGAT 1620
CTCGGAGGAG GGGAGGCGCC ATCAACCCAC ACCCTGGCCA ACCCCTCAGC AGTGTCTCTA 1680
TCTTTCCTCT TTCCTCAGTT GGATCTTTCA GAGACCTAAG AGAACAGCAC TTTATTTCAG 1740
GACAGGCTGG CTTTGTGTTC CAGCAAGAAG AGTTCTATGA ACTAGGCAAT GCCCAGATTA 1800
ACCATCTGTA GTCCAAACAG CTGCACTCTC TGTCCCCAGC TGAACGCCTT GGGGCCTGGG 1860
CAGGGGACCT TCTAATTTTG AATAAATATC TTTGATGTAA CGCATCAGTC ACTCCTGCTT 1920
TGCTGATTTC GGTGTGACCC TTTAGAACAC GACCCTGCAC ACACTCTCGC TCCTGGTAAG 1980
CCTCCCTTCC CCAAAGTTCT GACCCACTTC TGTAACCCCC AGGACCGATT ACAGCCACAA 2040
AGCTGGCGAG TCCCCACACA GCCAGGATTG CACTTGGTTG ACAGTGCTTT TGTTCTGTCC 2100
CCTGGCTCCT GACACCCTTG GCATTTCTTC ATTTCATGTG TTATTCGTTA TTCAGCCAGA 2160
AAAATGCCAG GAGCAAGATG GTGGCCTGCC TGAGCAGCTC TCTGCAGAGA CTCTTAAGGC 2220
AGAGGCGAGG CCGGCCAGGA AAAGGCTGAC GTCAGCTCTC TGAGAGCAGC TCCCTGCAAG 2280
GATAAGGCGG CCTTTGTTTT CAGCTCAACT GTGAAAATGA GAAAATGCCT CCAGCCTCAC 2340
AAACAAGAAA CCCACACAGC CCAGGTCAGG CCTGTGACCT TTACTTAAAG GTACCACACT 2400
TCATTAGCAG AGGCTGTCGA CAGAACCCAG GAGGTGTGGC CACAACCACC CAGGCCACTG 2460
CTAAAAATCA GCTGTCTGTC CAGCACAGCG CAGGCTAGTT CCCCAGCTCT TACTAAAGTG 2520
TGAAAGGCAC AGTTAACCGC AGGCAAGCCA GCTCCGAGCT CACACTGCTC TGTCAAGAAG 2580
CTTTTCTTTA CAGACATAGG CTCTCTTCTA ATTTCTGCTG GCAAGTCAAT CACGTGTAAG 2640
CCAGAAAGAA GGAAAGAAGA TCCCAGCTTA GCAGTAGCTT GATTTTTGAG TTTCTGCTCA 2700
GGGGAACTAA GATCTTGGCT GTAAAACAGT TCCTTAAACA CCAGAATACC TCCAGGGATA 2760
CTGGGATGAC TGGTGAGCTC CGGGTTCAGG GAGAGACTCT GCCTCAAAAA AAAAAAAAAA 2820
AAAAAAAAAG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGCG CTGGTTTTAT GTCAACTTGA 2880
CACACCCTAG AGCCATCTGA GAAGAGGGAA CCCTAATTAA TTAAGAAAAT GCCTCCAGAT 2940
CACACTCTAC ACAAGCCTGT AGGACATGTT CTTCATTAGT GACTGATATG GGAGGGGCCA 3000
GCCATTGTGG GTGGGGCCAT CATGAGCAGC TGTAACCCCC ACCCCAAAGT ACCAGCAATT 3060
ACATTTTGAT TGTCCTGAAA CGTCAATCTG TCCAAAAGGT ACAACAATAA AGTCTCGTGA 3120
CAGAGCTAAG ACTCAGGCAT GTGCCATAGC TGCCACTGTG AGGCAGCTGC TGGGGGTGGA 3180
AGGTGGGAAA GCCTGCCGTG GCTATCACCA GCCAGAGGTG GACCCTCATA GAGTTACAGA 3240
GGTCCCATGC TGCTCCAGAG GTGGACCCTC ACAGGGTTAC AGAGGTCCCA TGCTGCTCCA 3300
GAGGTGGACC CTCACAGGGT TACAGAGGTC CCATGCTACT CCAGAGGTGG ACCCTCACAG 3360
GGTTACAGAG GTCCCACGCT GCTCCAGAGG TGGACCCTCA CAGGGTTACA GAGGTCCCAT 3420
GCTGCTGTCT TAAAAGGGGG AGAGCAGGAA CATGGATGTC CCAGAACAAG AGGACACAAG 3480
GTCATGCCCA TGATTCGGCA CACGGCTGGT ACCCAGCGCA CTCAATGGCT GCTGTCACAG 3540
AGAAGCCCTC TCTAGCAGCG GCCTCACGCT AAGTGACAGG ATGTCCACAA CCTCTGCAGA 3600
ACACCTCAGC CGACAAGCTG CCCTGGGAAG GCTCCCTGAC TTCCAATCTC AGTTGAGCAA 3660
AGTTAAGGAA GCAACATGTG CCCAACTGCT CAATCTCCGC TCAGCTCGGT CTTAATGTTG 3720
GTCACACACA ACGGGACCAA AGGGACTCAG GAAAACAAGA AGCAGGGTCG 3770