EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-10446 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr6:114823710-114827170 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MAFFMA0495.3chr6:114826745-114826760CTGCTGTCTCAGCAC+6.12
MAFFMA0495.3chr6:114826745-114826760CTGCTGTCTCAGCAC-6.18
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr6:114824565-114824580GAGGTCAAGAGGTCG+7.26
RARAMA0729.1chr6:114824565-114824583GAGGTCAAGAGGTCGCTG+6.18
RarbMA0857.1chr6:114824564-114824580AGAGGTCAAGAGGTCG+6.54
SPI1MA0080.4chr6:114825362-114825376CACTTCCTCTTTCT-6.51
ZNF263MA0528.1chr6:114826111-114826132GGAAGAGAGAGGGAGGGAGGG+6.21
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02801chr6:114823687-114843363HFSCs
mSE_03012chr6:114822880-114866200TACs
mSE_04097chr6:114823315-114827006Cortex
mSE_04484chr6:114823619-114826808E14.5_Brain
mSE_04929chr6:114823617-114826906E14.5_Heart
mSE_05556chr6:114823486-114827268E14.5_Limb
mSE_06862chr6:114823438-114827211Heart
mSE_07926chr6:114823393-114826682Intestine
mSE_08000chr6:114823151-114831438Kidney
mSE_08379chr6:114823276-114831380Liver
mSE_09062chr6:114822575-114826869Lung
mSE_09938chr6:114823826-114826837MEF
mSE_10810chr6:114823327-114826982Olfactory_bulb
mSE_12520chr6:114823650-114826826Spleen
Enhancer Sequence
CTCTTTAAGG CTGAATGTAT TCCACTGTAA CACGGAGACC CATGCTTTTA GCCACCCACT 60
CATTAGTGGG CATTCTCCTG TGCTGTTCCC ACGTCTTGAC TATGTGAACA GAGCTACTGT 120
GAGTCTAGGT GTTCAAACAG GACCTAGTAC GCTCTGCTTC CAATCATTCT GTGTAAATTC 180
CCAGAAGAGG AGCTGTTGGG TCACAGTGTG GATCTCAGTC TAACACCCAG TCCTTAGAAG 240
TTCTGACAGA TCACCAGCAG CCTATCAGGT TGGGTCTCTC ATTCACCACC TGTCCCGTCT 300
TACTATGACA GAGAAACCAA AGAAAGGTTG GCTGGAGCTC AGGGCCAGCC CTCAAGCACA 360
GAACTGATCA GCCTTCATAA AACAGCCTTC CTGGATTGTG GGAGGCTCAC CAAACACTGT 420
GAACATGCCC CCACAGAAGT TAGCGCACAC CCTCCTCCCT GCCACCAGGA CACAAGACAG 480
TGCGGACTGG GACAGTGGCT GCGATCAGCT GTGAGCTTCT GGGAGACTCA CAGCCACATA 540
ACTGTGGTTC CCATTTCTCA CTATGAGCCC GGAACAATTG CTTCAAGTCT TCAGAGGGTG 600
GCTAAATGTT AACAGTAATA GCTACCATTT GTGTGGCAGC AGTATGTGGC GGGACCAAGT 660
CCTCAGTGTG TCTGCACCAC TCCTACAACA AGGGCACTCT AACCCGCAGG TCCCTCCCCG 720
GGCTCCCAGG GGCAAGGCAG GATCGCAGCT TAGCTGGCCG GGGTGCAGCT CTCAGAGTGG 780
ATGAGGGTAG AAGTTGGTAG AGCAATGGTG CAAGTTCCTC AGAGTTGGGA CAAAAGCATT 840
TTCTATCAGA CCCGAGAGGT CAAGAGGTCG CTGGCTGATG ATGAGCGACA AGGGAGCCTG 900
AGTGGTGTGT CCAGGGGAAA GCGGCTGAGG TCAGAGACTC TAGACTCTGC CAAGTGCTTT 960
TCTCGTTGTC TTCTGTTACG AATAAACTTG AGAGCAGAAG CACAAGCCTG GCGTCTGGGC 1020
TGAGAAGGAA CAGGGGCCCC CAGCATCTGC CCCCCTCACG TGACAGCCTC ACCTGAACCT 1080
GGGTGCTCCT TAATCCTGCC AGCTACCTCC ACACTGCTCT TCTGTGACCG CCCCCTAGCC 1140
CTAGCAGGAA GATTTGGTGA TTGCATGGCT CAGCTTGGGA CAAGGTGCGG GTGGCCAGGA 1200
GACAGGGACC CAGGGAACAT CCCTGCTGCG CCCATCAGTT CTGCCTCCCC CAGCTTAAAT 1260
TAATTACAGC TGAAAATACA GCGCTGCCAT CTGCTTTGAA AACGGCAGGA TAAGGGAATA 1320
AAATGAAAGG GGGTTTTGGT ACTAACCTCA CTTTAATCAT TGCCAAAGAG CATGAAGACA 1380
GCCCAGCGTC CTCCCACAAG AAAGCCTGGG GCCTCACAAA CTTGGCAGGC AAGGCGGGCG 1440
CGCACCCCGT CAGAATAAGA GTCCCCGGGA GGAGGGTGTG AGGTGCGGGG CCGCCTGCCC 1500
CTCGCTGCAG GGGAAGCTTC CTGCGGGCCT GGGAGAGGCT GGGAACTCCT GGGAGGCGTT 1560
ATTTACGGAG TGCCGCCTGC CAAGAACGTT GCATGCATCG CTGCAGTTCC ATTTTCAGAG 1620
AAAACAGATC TGCTGTCAGA ATTACAGCGA GTCACTTCCT CTTTCTTTGT TTCCCTACCT 1680
TCCATAACAT CAGGCTTTTA GCAAACTCTA CAACTTGGCC AAAGGAAATG CTGGCAGGAA 1740
GGGGCGAGGC AGGAGGGAGG GGACGGGCCT GCAGTTCAGC TTCTGTGGGT TTTCTGGTCC 1800
TCTTGCCCTT CTCACAAACC CCACTTGAGA GGCTGTTCTG TTACAAGTGC TGGAGGCCAG 1860
CACTGAGACC CAGCTAGCCC CGGTGAGGAC ATTATCTGCT CCCATCTGCA GATTTCTGAA 1920
CCTTATCCCA GGCCAGTGGC TTGATTTCTA GGGGAGTCAC CTGCCTGCCT GGTTCCTTCA 1980
GATCCTAATT TTCCTTGCAG CATGCATGGG CCTGCTGGCT CCTTTCACAC CACAACAGAA 2040
CAGCATTTAT ATCAAGCAGG CTCTCCTAAA CCAGACCTGT AGCACGAGGA TGACCGCACC 2100
AATGAAAGAG CAGTTCTTGT GGGAGGAAAA CACATTTAAA AAGAAAAAAG AAGAGAAAAG 2160
AAAAGATGCA AAGGCTGTCT TCCAAACCTG CCAACTGTCA CTGTCTATAG CAACCGTGTC 2220
CATAACACTG CGTCTCAGGA GTGTGACTTT CTAGTAAAGG CTACATCCAT CAAGCCCAAG 2280
GGAACATCTG GGAAAATGGT TAAATAAAAA CAATTGCATT TTTGATTTCA GAGTTTACTA 2340
AGGATACCCA ACAAGAGACA AGTCTCACAC ACTCCCAGTT CAGCTCAGCA GCAAAGGTCC 2400
TGGAAGAGAG AGGGAGGGAG GGACGACAGC CAGGGAGGCC TTTGGACGCA GACCTACCCC 2460
TTCTCCAAGG GGTGAGGAGC CCTGTTCAGC TCCACTCCAC AGTCACAGCC CACCTCTCTC 2520
CCCAGGGCTA AATCCCTCCA GCTCCCACCA CCTCTAGTGT GGAAGCCATC AGGACGAGCA 2580
CAGATACACA GAGCACAGAG GCCCATGCAC ATAAAGCTCC TTCATTCTGT CACAGGAGTG 2640
TCCTGAGCAG TCACAATGGC CCTGTCCTAG CCACGGGGTG TGGGTGTTCT TCAACACACT 2700
TCAGTCCTTT CTACAACACT TTTGGAAGGT TTTCCTGCTA AAGAAAAAGA TCTAGTAAGT 2760
GATCCAGCCG CATCCAAACA AAACATTCTG CATGTTGGGG AGGTGTGTGT GTGTGTGTGT 2820
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGA GAGAGACATG TGTGCATGCC AGCATAGAGG TCAGGCTCCA 2880
ATGCTGTTCA GTTCACCTCA GACCATCAAC CTTGGACTTG TTTTTTTGCT GCTGCTGCTG 2940
CTATTATTTT TGGTTTTTTG TTTTGTTTTG TTTTGTTTTT TAAAGACTGT GTCTTTTTCA 3000
CGGGCTCTGC TGACCAGCCA GGGAGCTCCA GGGAACTGCT GTCTCAGCAC GGGGTTCTAG 3060
TGTGAGCACC CTCAACCAGC TTTCTCACGT GGTTCTGGGA TGGAAGAACG CAAGTCCGAA 3120
TGCTTGCAAA GTAGGTACTA TTTACCAACT GAGCTATTAT CATAGCCTGA AAGGTCTTTC 3180
TTTTACAAAC ACTGTAAATA CTTGGAAGAC TTCGGAAGAC CAAACATGCT GGACAGTTAG 3240
TCACAGACTA CACACGGCTA GCAGGCACAC CTGGAGAGCT GCAGGGCTCT GAGTGAGGAT 3300
GCTAACCCTC ACAGATGCAA TCGCTAAAGA AAGGAAAGTT GAGGAGGACT GAGGGAATCT 3360
CGGAAGAAAT GCCCCCGTCC CTGCCCCCTC CCAGCACTGG GGAGCATGCT CACAAATTAC 3420
ATATTATAGC CCCACGAAAG AAATATGACA AACAAGCCCA 3460