EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-10371 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr6:91656160-91658890 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr6:91657105-91657115GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr6:91657105-91657115GTCACGTGAC-6.02
HNF4GMA0484.1chr6:91657538-91657553TGGACTTTGGCCTCC-7.22
Hnf4aMA0114.3chr6:91657536-91657552CCTGGACTTTGGCCTC-6.26
MEF2AMA0052.3chr6:91657222-91657234GCTATTTATAGC-6.32
MEF2BMA0660.1chr6:91657222-91657234GCTATTTATAGC-7.22
MEF2DMA0773.1chr6:91657222-91657234GCTATTTATAGC-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr6:91656932-91656947AAGGTCCTGAGGTCA+6.13
PRDM1MA0508.2chr6:91656250-91656260GTGAAAGTGA-6.02
RFX1MA0509.2chr6:91658385-91658401GGTTGCTATGACTACG-6.47
RFX1MA0509.2chr6:91658385-91658401GGTTGCTATGACTACG+6.48
RFX2MA0600.2chr6:91658385-91658401GGTTGCTATGACTACG-6.25
RFX2MA0600.2chr6:91658385-91658401GGTTGCTATGACTACG+6.33
RFX3MA0798.1chr6:91658385-91658401GGTTGCTATGACTACG+6.21
RFX3MA0798.1chr6:91658385-91658401GGTTGCTATGACTACG-6
RFX4MA0799.1chr6:91658385-91658401GGTTGCTATGACTACG+6.62
RREB1MA0073.1chr6:91657142-91657162GGGGTGGGGGTGGGGGGAGG-6.45
SCRT1MA0743.1chr6:91656171-91656186AAGCAACAGGTGGGC+7.44
SCRT2MA0744.1chr6:91656171-91656184AAGCAACAGGTGG+7.34
ZNF740MA0753.2chr6:91656794-91656807GGGGGGGGGGCAG-6.33
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_07362chr6:91655019-91656725Intestine
mSE_07362chr6:91657431-91658498Intestine
mSE_08160chr6:91655271-91656730Kidney
mSE_08160chr6:91657505-91658864Kidney
mSE_08519chr6:91652607-91658949Liver
mSE_10103chr6:91654766-91656717Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
CTGGAGGTCT TAAGCAACAG GTGGGCAGAA GCCCGGAAGA GCATTACCCA GAGAGGAAGC 60
AGTGTGTCTA AACGCTTGAC GTGGCCGAGA GTGAAAGTGA TGAGCGACTT TCAGGAAGCC 120
AAGTCTTAGC CTGGCCTTTC TTCTCAGCAG GGGCGGGGAA GGGGAGTGGA GAAGAGACTG 180
TCACCTGGTG ACCTCAGAGC CACTTGTCAT GTCCGGGCGG GCGTTGATCT TGATCCACTT 240
AGGGGAACCA GACCCCTGGG GATCAGTGGC CATATTCTGT AGCTCCAAGT AGGGGCTATA 300
AGGTTTGGGC GATGGGCATC TGTGAGGGAA AGGGCACAGC TGGTCTCTCA CCCCAGCACA 360
GTGGCTGGAG GTTCTGGGAG AAATGCTAAG TCTCACCTAG TCAGACATTC CACAGGGCTT 420
GGGGGTTGGC CATAGCGAAC CAATTTGCCA GAGCTCCTGT TTTACACGTG ATGGAGAACC 480
AGAAGATCTG GTGTTGTCCC CGAGGGACAC ACCACCAGCT CTGGCTTTGT TTCTTCCTTT 540
GGTGGAGTTG AGAGGGGCCT GGTCAGGGTT AGTGTTTGTT TGAAAAGCTC ATGAAATAAA 600
AGCTGGTTGG TCTTGGGGGG GCGGGGACGG GGGCGGGGGG GGGGCAGAGG GTGTGTTACG 660
TCTCCTGGAG CAAATCTGAT CCTGTGCTGC AGCCCTTCCT CCAGCCTTAC CTTGTGTAAT 720
TTGAGATGGT CCATTTAGTA GATGGTGCTA CTGAGGCCCT CTGGGAGAAG CCAAGGTCCT 780
GAGGTCAGCA GTGACCCATT AAAATTCCAA TCAAAATCTA GGTGAAGCAG CAGAGGAGGC 840
CAGTAGATTT AGGGACCAGA TTCTCAGAAG GAGGTGTCTT CCGCTATGGA CTTCAGAGAA 900
TAAGGCTGCA GAAGCCAGGG GAGGGACCCT CCTTTCCAGT CACCAGTCAC GTGACACCAG 960
TATTAATGTA GAACTCGGCC ACGGGGTGGG GGTGGGGGGA GGTCAGAAGG AACTCCTTGA 1020
CCAAATAAAT AGACGAGTCA ATTAAAAAGG ATGGAGTTAG GGGCTATTTA TAGCGGTGGC 1080
CTGAATCACA GGTATCCTTG CCCCACGGAG AAAAAGGAGA CCTTTTTTTG GGTGGCCCAG 1140
GCTGTATACA TGATAACTAA GCTGATTAAG CTTTGGGTTT CAGAGGGTGG GACTCTGGAG 1200
TCTGTCTGAG TGATGAGCCC TTGAGAATGA CAGCTCAGGA AAGGTGAGGG GCGGGAGCGC 1260
TGCTGGGGCA GGCAGGGGGT GGGGAGGAGC CATCAGCTTG TAGAAATGGC TTGCACTGGG 1320
ATAGACCCTG GAGTTGGCTG TCTCCACCAA TGATAGTCAC TGGAGAGTAT CTGTTCCCTG 1380
GACTTTGGCC TCCTGGTTGA ACTTAATGGG TGAAAAAAAA GAGCCCTTTC TCTTAGCTGG 1440
AGGGGTTGGC ATTTAGCAAT TACAGCTGGT CTCCCTGACG CTCACCTGAA AAACACTTAG 1500
CAAGGCCCGT GTGGCATGTC TGTTGCTGCT GTCACTGCCA TCTGCCACAT AGCTGCCCCG 1560
CCACGCGGCT GCATCCGGCC TGTGAAGGCA ATTATGGTTT GGGTTAGATC TGAAGATGAG 1620
GGCTCTTAAT TTGGTGGAGG AGGGTTTATT TTGCACAGTG TTCCCTCTAC CTTTTGCCAC 1680
TGTCAGTACC TTCCCATGCC AAGTTGAAGG GGTTAGGACT TTGTGGTATT AAAGGCGATA 1740
ACCTGGAAAC AGTCCTGAGC TCAGCAGTTA GGGATCCAAG ACTCCAGAGT GTGTTTCTTC 1800
CTGCTTGCGT AAACCTTGGT CAAGCGGCTT AACCTCTTGA GCCTTGGTTG GGCATCTACA 1860
AAGTGGGGCA ATGGCTCTCA TCTCGCTGGC TGGTGAGGGT TGGGTACCGA GAGCCAGCTG 1920
GGCATCCTGG CATGTATTGG CTGAGCAGGT GGGTGTCTCT TGGTGTGCAT ATGACATTTC 1980
CAGAGTGCTT TTGTTCCTGC AGGCTAAGAT GCTCTGACGT CTCATTACCT TTGGACTAAT 2040
TAGGAGATAA GTGAGCGGCG GCAATCACTG GAGAAGGATT TAAGGGAAGA AGGGAAATAT 2100
TTAGCCTGAT TAAAAACAAC TGCTATTAGG TGGAATTATA TAAAGCACCC AGAGCTGTGT 2160
GGCCACATGT CAGCTGCAGT TATTATTTCA ACCATAGGAA AACAGTTGGA ATTAGAGGAA 2220
CAAAGGGTTG CTATGACTAC GGCAAACCCA GGTCTTTCTC AGTGCACCTG GGGCAGACCC 2280
AGCCCCCGCC TGGTACAGAA AGCAATCTGA GGCTACCCAA GAAGGTTCAG GATTACAGCT 2340
GGGGAACCAG AGCCTCATCG CTGGGAGATG GGTGTAGGCT GGGTAGGGAG GGCTTCCCTG 2400
AGGAGGTAGC ATTGAAGATG GAGGAGGGCC AGAAATATAT CAGGTGCCTG GGAGTATATC 2460
CCTCTGTGAA TTGTCAGGGC TGCCATGGTG ATTAGAGGTT GGAGGAGGTC TCCCTTTCTG 2520
GCTTTAGCTC CACTAAGAGA CATCATATTT CTCTTGTGCG CGCACTCTCT CTCTTCCCCC 2580
TTTCTCCCTC TTACCCCTCT CTCCCCCTCT ACTCCCTCTC TTTGTCTCTC CCTTTCCCTC 2640
GCCTCTCTTT CCATCTCTCC TTCGCTCACT CTCTGTCTCC CTGTCTGTCT CTGTCTCTCT 2700
CAGTGTTGTG CTGAGGACAG ATGGAACCAG 2730