EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-09731 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr5:120009050-120010600 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr5:120009370-120009391TTTTGCTTTTGCTTTTGTTTT+6.47
RARAMA0729.1chr5:120010229-120010247GAGGACATAAGTTCAAAG+6.07
Enhancer Sequence
GTATGTATGT GTGCATGTGT TTGTGTGTAT GTGTCTGTGT GTACATCTGT GTATATGTAT 60
TGTGTGCCTG TGTGGCTGTG TGTGTGTGTT TGTATGTGTG TGTGTGTGTG TATGCAATGT 120
GGTGTGTCTG GTGTGTGGGT GTGAGTGGGT GTGGCAGGCT GGACGAGGCT GTGAGTAGCA 180
CAGAGGTTAG ACGACAGCTA GAAGGAATTC ATCCTGTCCT TCTACATGGT TCCAGTGACT 240
GAACTCAGGC CATCCGCTTT GGTGGCAAGC TTCTTTAACT GAGTGCCATC TTGCCAGCCC 300
ATCATTTTAA GAGCAGCATT TTTTGCTTTT GCTTTTGTTT TTAAACTTTA TGTAATTCAA 360
TATTTCTATG CTCCCACCCA TTGCCTTTAT ATTTAGGGAG GGTTGCAGAA AGTCCTCTCT 420
GGCCCTCAGG TACTCTGAGT TCCTGGGTCA TCCGGCTCCT TCCTCCATGT CTCCATCTGT 480
AAAATGGCAT CAGTGATAAC CCTAAGAATA GCATCCACTA ATGAGCTGAG GACTCCTGGG 540
TGCTCCAAGC ACTCTCGGAA GGGCAGGGCA GGGGCTGTGA GCCGAGGTGC CTTTTCTGCT 600
GTGCGATGCT CACTTCCATC CTCCCGCCTG AGATGCATGA GGACAGCCCA GCCTCTGGGA 660
AGAAGCCACA CAGGCACTGG GAAGGCACAG ATCCCAGAGC CATGGGCCAA ATGGCAAGAG 720
GGGACGATGA TGTGTGTGCT TTTATGTCCG GGTCACTTAT TCCAGTGTAG CCTGGCAGCT 780
CCCAACCGAA TGTTACTACC ATCTGCTCCG TGACCTCAAT CCATGTGGTC CCATGCGAAC 840
CGCAACAGGC GGCCCCAGCG GGCAGGCTGG CACCAACTGA GCCTGGAAGT GGGTCACCTC 900
CAGGAGCCTG CAGCTTGGTC AGAGCATTGG TGTGAGGCAG GGTGTGAGGC CCGGGCCCCA 960
TCTAAGAGTA ACTGTCAGAA TCCCATCGGT GGATGTCTCA TCCTCAAAGG AGCATCCAGA 1020
TTACGAAAAC CACATGACAC ATGTGGCACA TGACACCCAC GCTTGCAGGA ACAGGATGAC 1080
TTCAGCAGGA CACAATGGGT TAAAGTTCAT GTGTTAACAA CAGCTGCCAG GTGGGCAAGG 1140
CGGAGGCCTC TACATCTAGT ACTTAGGAGG TTGAGGCAGG AGGACATAAG TTCAAAGCCA 1200
GCCTGGGCTA CAAAGTAAAA TTCTAACGAT GATGATGACA ATGATGACAT CAACAATAAC 1260
AATAACAATA ACAATAACAA TAACAATGGC TGCTTAGAAC AGAAGAGATG GCTCAGTGGA 1320
TAACATGCTG AGGACCTGAG TTCAAACCCA AGAAGAGGTA GAGACAGAAG GATCCACAGG 1380
GATTGCTGCC TGGCCAGCTT GCACACACAC AAATAAAATA ACATCACCGC TGGAGAGATG 1440
GCTCAATGGC TAAGAGTGCT GGCTGCTCAT CCAGAGGACC TGACACTAAT TCCTGGCACC 1500
GACATGGCAT CCCATGGCTA TCTGTAACTG CTGCTCCAGG GGATCTAGCT 1550