EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-09562 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr5:104183760-104186050 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr5:104186026-104186044GGAAGAAAGAAAGAAAAG+6.06
EWSR1-FLI1MA0149.1chr5:104185961-104185979GGCAGGCAGGCAGGCAGG+6.1
HEY1MA0823.1chr5:104185728-104185738GGCACGTGTC-6.02
HEY2MA0649.1chr5:104185728-104185738GGCACGTGTC-6.02
Npas2MA0626.1chr5:104185728-104185738GGCACGTGTC+6.02
PHOX2AMA0713.1chr5:104185218-104185229TAATTGGATTA-6.02
Phox2bMA0681.1chr5:104185218-104185229TAATTGGATTA-6.02
Rhox11MA0629.1chr5:104185209-104185226AGGCTGCTGTAATTGGA+6.07
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02599chr5:104164023-104208030HFSCs
mSE_03113chr5:104161732-104190104TACs
mSE_06045chr5:104181200-104187935E14.5_Liver
mSE_06741chr5:104181449-104184306Heart
mSE_09531chr5:104181151-104184258MEF
mSE_12045chr5:104181212-104184228Spleen
mSE_12045chr5:104185125-104186162Spleen
mSE_12968chr5:104181352-104186580Thymus
Enhancer Sequence
CCTGGTGAGT AATATAGTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTCCTGCTA 60
GAATGTACGA TTCCACATAA AACGGCACAG TCAGAGTGAA TCTGCTGAGT AGGCAAAGGC 120
CGGAATGCGC TGGGTTGGTG AAGGGGAGCC TGGCTAATGA CCCGCAGTTG CTGTCAGGGG 180
AGTGCCCTGT ACTGCAAGGA CCGAGTCTTG CCTTCTCCCG GGTTTGAAGG TTTTGAAAGG 240
AGCCTTAAAA CTTGGCCGTA CACCGGTGCC CAAGATTGAG GCTGTTGGGT GTCATCGCGC 300
TTCGGTCTCT ACAGCTGTTG GTTACGGAAA ACAGGACCCG TCGAACCTTT TCAAAACTTA 360
TGCCAGAAGG CAGTGTGATT GCACAAGTTT ACAATTATGG AAATGTTCTT TAGCCTTAAT 420
ACTTGATTTA GGATAGTGAT TTGGTAACAT ATCTGGACGC TGAGCTGAGG TAATTTTAGT 480
AATTTTAGGT CTAAAGATCA TGGAGAACAG TAGATTTGTA AACGTTAGAG ACTGAGTAGA 540
TAGAACTTGA ATTTTTCTAA GAGATAAAAC TTCCTAGAAG GAACTTCTCT AAACAGAAAA 600
CCTTCTAAGT GTGTCTTACT TTAAAAACAA GTTTAATCCT CTCAACTTGG CTTAGTTGTG 660
TCTTCATCTT ATTGAGTGTT GGAAGGAAGG GGTTCCTAAC GGGACAGAGG AGTAGGGGAA 720
CAGAAGTTGC ACCTCAAACT TCTGCTAAAT CTTAACTAAA AAGCAACCGT TAGCTTTTAG 780
CACAAACAGA ACCTGTAGAT TTTCATATTA CAGTGACTGC AGATGTCTTC AATCTCTAAC 840
GTTTCCCATT TGCTTGAAAT TAAGGAACTG TTTGTCGTTC ATGGCTAGTA ATTAAAATAT 900
GTTATAGCTG GATATGGTTG CCCATGCCTT TAATCCCAGC ACTTGCCTTT AATCCCAGCA 960
CTCAGAAGGC AGAGGCAGGA GGATCTCTGA GTTCTGGGGA AAGCCTTGCT CACCTTTTAA 1020
TCCCAGCATT CAGAAGGCAG AGGCAGGGCG ATCTCTGTGA GTTCTGGGGA AAGCCTGGTC 1080
TACAAGGAGA GTTCCAGGAC AGCCAGAGCT GTTGTTTGTT ACACAGAGAA ACAGTCTCAA 1140
CACCACCAAA CCAAACTATT ATGTCCTTAC CTTGTCAATG GTGTATTTTA GTAGATACTC 1200
TTCTAGATCA TTTGTTTCCT TTGTATTACA TAATTTACTT GTGAAAGTAT CCTTATGTAT 1260
CACGCTGCCT CAGGATCCCT TGGCATACAG CCCGAGATTA AGGTACCTCT TATAAAATAG 1320
TTAAAGCTGC CAGAGCATGG GGATTTGAAC CTTGGTTCTA TTGTTCCAAT TCCTTGACTC 1380
TTAAACTAAC GTCGAACGTA AAATGAAATA AAAGATAAAC TGGGTCCTGT GTATGCCAGA 1440
CACAGCAGTA GGCTGCTGTA ATTGGATTAC CTCTTGGTCA CCTAAGCAGA CAAGCAAGTG 1500
CTTGATTATT TGCCCTTGGT AGTTAAGGAA ACTGAGGCCT AGCCGGGTCA CACAGGTTTC 1560
GTGCTCAAGG TCACACAGGT GCAACCTGCC TGACCCCAGA TGGACCCCTG TAGTCTCTAC 1620
AGTGTAGCAC TTCCTGCTTC TTGTTGCCTC TGCTGTGCCA GCTGCAGAAC TTCAGAGGAA 1680
GAGCCCGAAA GTGATTGCAG CTAAGTTTGC TCTGGTGCAG CATGTTTAAT CTAAGTCATC 1740
AGCGTGGCTG CTCAGCTCAG CAGCAAAGAC CCTGCTGTGC TTTCCTGGCT GGCTCACAAG 1800
CTCTGGCACT AGAAACAAAA CCACACGGCC ATCACGGTTG CCTTCCTGGT GTTTTCTTAG 1860
CCCTAGTGCT GAGTATCTAC CCTGTTGCAA TCATCCCTTC AATTTTGCCT TGAGTGTAGT 1920
CCAAGCACTC AGGAGAAACT GAAGCATTCT TTGTGATATA AAACTATTGG CACGTGTCTT 1980
ATGGAGGACA GATTGGTTTG CTCTTGTGAC AGTTCATTTG AATGGTCAGG CTCATTGGAC 2040
TTAGAGATTC AGAGCTCACT GTTTTAACCA TAGCGGTTAA GAGCACTTCC TGCTCTTAAA 2100
GAGGACCAGA GTTCTGTTCC CAGTGCCTAC ATGCAGCTCA CAACCACCTG TAACTCCAGT 2160
TCCAGGAGAT CCAGTGACCA TTCTGGTCTC CATCGACATC AGGCAGGCAG GCAGGCAGGA 2220
TACATACATA TGGGCGAAAA TGCACACAGT CAAAAGAAAA AAACAAGGAA GAAAGAAAGA 2280
AAAGAAAAGA 2290