EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-09400 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr5:44171800-44173200 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr5:44172140-44172152GTTTGTTTGTTT+6.32
HNF1AMA0046.2chr5:44172358-44172373AGTTAATAATTACTT-6.06
ZfxMA0146.2chr5:44173021-44173035CAGGCCGCGGCCAG-6.31
Enhancer Sequence
TGCAATGAAA AAAAAAATCA AAAGGCAGGG AGATTACAAA CAACACAACC ACTAAATGAG 60
AACTACCGCG AGTATACATA CTCTTCTGCT CAAGGCTTAG CCAGTCCTTA AGCCTCCCCT 120
GGGAAGGTGG TACTCACCAT TGCTGGGCCC CACTCTCACT GAGAGCTCTA AACTGTACTT 180
GACATCTGGG TTCTATGCTC AGAGATTCCA ATTTGAGTTA GGGTTCAGCC ATCAGGATTT 240
TAACAGCAAG CTTGGGCAAC CAAGTAGTGT GAGCCATGAG CCTATGGTCT TGGTGTTTAA 300
AGGTCCACTG GCTTAGGACT AACTGGGTTT GAGTTTATTG GTTTGTTTGT TTTTCTTTTC 360
CCAAAATGGA GGGAGAGGAC TGTGCAGCCA AGATGCTAAG ATCCTACACT TCAAATTGCT 420
GGTCTTCCCG TGGCCTACCA GGGAAGACAT TGGCCTCCTT CCTAGCACCT CTCCAGATTG 480
AAAGACAACT CTTGTTTGCT GTTAATAGTG GTGCTAATTC CACGTAATCT CTGATAATTC 540
AATTTATTTT TACGTTTAAG TTAATAATTA CTTAACAGCT ATTTATTTGG TTCACCTTTT 600
TTGCAAAACA TATGACTGCC CAGAATTTAC TCATATATGA TCTTCCGAAC ATAAAGTGAC 660
AATTCAGAGT TTTCAGCATC ATTAGAAAAA GGTTCCCAAC TCATCTTCAC AAGAGTGCTT 720
CTTCAACTTC GGCTACACCC ATTAAAAGTC CAAAGTGAGT TCCACTGCAA GGCAACTTTT 780
CCTAGGGGCC CCTCTCATTT GCTTCCAGTA AAAAGTCCAA CAGAGGAACA AATTCTACAA 840
GGAATAAAGT ATCCAGGAAA AATAAAAACT GGAAGGAAAA AAAGAGTAAC CAGGAAAGAG 900
GAGTGCAGGT CTTCCCAGTC CGTGTACCGG GCTTGTGTAC GGAACCAAAC CAGTGCAAAG 960
CAGGCAGGTA AAATAAGCCT GCTCCAGGGG CTGCAAGACG CTGCCTGTGG AGCCAGGAAG 1020
CAAGTCAAGA GGTCCAGAGA GAGGATGCAG TGTTTGCAGA GCGACTAAAA GAGCCCGAAG 1080
GGACCGGGCG AGCGGTGCTG TGGCTGCGAG TAACCGCAGA AGCGGCCTGC GGACGGGGAG 1140
CGGGCACCCC GCGGGCGGCC GAGCCGGACG GCCGGGAGCG CCCCTCACCC CGGCACAGGT 1200
CAGTCCCGCG AGCGCTCGTC CCAGGCCGCG GCCAGCGCGG GCTCCCGGGA CCCCGGTGGG 1260
AAGGTTCGGG AGCCGCGCGG GTGCCGGGGC GCGGGCGACG GGCTCGCGCG GCGCCAACGC 1320
GGGGGTTGCG GGAGGCACGC AGGCCAGGCC TCCCGGAACC CGGCCGCTCC TCCGCGGCCG 1380
CCCTCCGCCC CGCGCTCCTT 1400