EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-08809 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr4:133774420-133776950 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr4:133776879-133776891AAACAAACAAAC-6.32
RARAMA0729.1chr4:133776707-133776725CCTTGAACTCATGACCCT-6.22
RarbMA0857.1chr4:133776710-133776726TGAACTCATGACCCTT-6.59
Enhancer Sequence
CCTGAATAGG GGAGCAGCCC ACAAGGGTCT ATCAAGCCCA GCCCTGTTAG CATCCTGTCT 60
GCACTACCAC ACACACCCCT CTAAAGGAGG GGTCAGCACT CCTCTAAGAA CAAAGCTAGA 120
CAGCTGCCAT CTCGTGGTTA TCACCCTATT GTTGTCCCAG CATGCTGCAA ACACAAAGAA 180
TCACAGTCCT ATACCTATGT CAACAGCCAT TCTCATATAC AGTGAACACA CACACACACA 240
CAAGGCTAGC CCCTTAGCCA GTGACTTGAC CTACAGTTAG GTGACTTGAA AACTCCCATT 300
GGCTCCTGCC TTCATGTGAA TTGTAACACC CACTATAATT AACCCAATTA AAGTAGCTAG 360
GCCTGGTGGT TACTCAGGAG GCAGAAGCAG TGCGATCTCT GTGAGTTTGA GGCCAGCTTG 420
TTCTACAGAG GGAGTTTCAG GCCAGGCAGT GTTACATAGT GAGACCATCT CTAAATAGAT 480
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 540
AGAAACAACT AACGGGGACA GCAGTGAGAG GTTGACAGAA GAAGTGATTG CACATCTATG 600
ACACACTAAT ATTAGAGACA GATTTCTAGG ACCTCTGTAA GTACCAGCAA CTTAATGCAA 660
AGTGCTGTTC ACCAAAGGCT ACAGTCAGAA AAGAAAGCGC TAAAAATACA TGCCTATTTG 720
CTTAGGATTA TAACCCAGCC TCTGAGCAGA TAAACAGGAG CTCTAAGAAG ATTACCCAAA 780
GAGGTAATTG AAGACAACGG ATTGAGCAGT TGGAGTGGAC CCAGGACTCC ACATGGTTTT 840
CAATAAAGTT TTGGCCACTG TGTGTCTGAA GAAAATGTTA AAAAAAATCG AACCCTATAT 900
TTTAATGGAG GATGTCCTTA AATTTGGGAA ACAATCCAAT AAATACAAGT CTGCCTCACG 960
ACTGCAGTCT GTGCCACATA CCACACACAT ACAGGGGACA CAGGCCCCAG CCACTCAGGA 1020
GACTAAGGTG GGGGTTGGGT GGTGAAATGG GGAAGGGTTC TTTATAAAGT TAGATGTGTC 1080
GGATGGTGTT TTGCTGGGGC AAACACGGGA AGGGGTGTTT CGCTGAAGCA GACACAGGTG 1140
AGAGGATGCT CTGCTAAAGC AAGCACGTGA AAGGATGGTT AAAACTTCTG GTGGTGGGCT 1200
GCGGCTTCTT GCTGCTTCTG GAGACTCGGG CTGATCGGCA GAGTGATGTC AGCTAAGACA 1260
GACTCACATC TTGTTGAGGC AAGACACGTG GTGAGGCAAG ACCTATGCAG GACACATGAT 1320
GTTTGGCGAG AATATAAAAG GACTCTATGG GACAGTGACA GGGGGCAGAG CTTGGCTTGC 1380
TTATAGAACT AGCTGTGCAG CTGTTGGTCT CCTGTCTTCG CTGATCTTTG CTTCACGGAG 1440
AGAGGCACAG CCAAGAACTT CTCATGGCAT CCCTGCTGGT CCTTCCTGAT AACTCAAACT 1500
AAGGCCTGGA TGTTCCTGCT AGGTCATGCC ACCGCTCTTG CTGTCCTGAT ACTACCAAAC 1560
TGGACTGCTG ATATATTCAT GAAGTATTTG CGAGTGGATC GAGCTGTCGC TGGGGACCTT 1620
TGAACTGAAC TGCTGATTTC CTGACAACAC GCATGGATTT GCTCCAAAGA ACCATTTCTA 1680
AACAGGTCCA CTTCCCCCAT ATCCCTTCTT TTCCTGCTGC CATGCTTCCT GGTCTGATGA 1740
TAATGAACCA CCCCTCTGAA ACTGTAAGCC AGCCCCAGTC AATACTTTCT TTTATAAGAG 1800
CCTTGGTCAT GGCGTCTCTT CACCACAATA GAACAGTGAA TGATACATCT GGTAAGTGTA 1860
AGACCCTTGG CTCAGTTCTC AGCACTGGGA GTCAAAACAA AAGCCCAGCC ACACTGACTG 1920
GTCTACAAAT CCACCCAGAA TTAAGCTACT GCTGGATCCC CTATCTTGAT CCATTCTCTG 1980
AGGATACAAT TTTTTTGCCT TGCCGGGCTC ACAGATTCTT TTGAGAGAGG CAGATAGAGA 2040
ATATACTTTA TCTCTACCAG AGAGAAACTC AGAAGGAGAC TCGGAGCAAC ACAGGCCTAG 2100
CCTGGAAGAG CCTTTCTGAA GGCATCCTAC GAAGTCAATG CATAGTTTTT AAAGCAAGGG 2160
GGTGGGGGGA ATGAGCAGAC TGGCTTGGGA AATGTGAAAC TTACACGAAA CTCAAATTGC 2220
AGTTTTCACA CACAAAGTGC TTTGTCTGTC TCCTGGAGAC GGTGCCCCAT TACTTAGGCC 2280
AAGGAGGCCT TGAACTCATG ACCCTTCTAC CTCAGCCTCT TGACTACTGG GATTGTTAAA 2340
TGTGCATTAC TGTGCGTGGC ACAAATGAAG TCTTACTGGG CTAGAGACGA TCCCAATAGT 2400
AGTCCCTGTT AGTTGGAGCT CAGGAGTTTG GGGTGATCCT GGGCAACATA GTAAGACTCA 2460
AACAAACAAA CAAATGCTTT ATCAACAAAA CGCTTTTATG AACACACCTC GGAGGAAGAA 2520
AGAGCTTTTC 2530