EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-08782 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr4:132629270-132631430 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr4:132629645-132629661GGTAGCTATGGTAACA-6.34
RFX1MA0509.2chr4:132629645-132629661GGTAGCTATGGTAACA+6.35
RFX2MA0600.2chr4:132629645-132629661GGTAGCTATGGTAACA-6.4
RFX2MA0600.2chr4:132629645-132629661GGTAGCTATGGTAACA+6.56
RFX3MA0798.1chr4:132629645-132629661GGTAGCTATGGTAACA-6.42
RFX3MA0798.1chr4:132629645-132629661GGTAGCTATGGTAACA+6.49
RFX4MA0799.1chr4:132629645-132629661GGTAGCTATGGTAACA-6.29
RFX4MA0799.1chr4:132629645-132629661GGTAGCTATGGTAACA+6.56
RFX5MA0510.2chr4:132629645-132629661GGTAGCTATGGTAACA-6.07
RREB1MA0073.1chr4:132630132-132630152TCCCCACCCACCACCCTCCC+6.1
RREB1MA0073.1chr4:132630135-132630155CCACCCACCACCCTCCCCCA+6.73
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04132chr4:132628613-132631740Cortex
mSE_10014chr4:132628070-132630768Embryonic_stem_cells
mSE_10836chr4:132629236-132631460Olfactory_bulb
mSE_12883chr4:132628447-132630101Thymus
Enhancer Sequence
GAAATCCGTT TCTGGAGGCA TAGACCAGGG AGCGGAGGTC GAGCCTTAGC GCATGCCCTA 60
GCAGGAAGTG GGTGTGGTAC ACAGTTTCTT ACCAGGAGTG TACCCTCCCT TCATAGAGAG 120
AATGGTTCTC TGGGCAGCCA GATCTCTATA TGATCCCTAG CACTTTGAAT CTCTGCCCAG 180
GCAAAGACCA CCGAAGTCTC TAAAACTGCT GGAGTGTGAG GGTGCAGTGG ATGTGGTTCT 240
AAGGTTCCTC CTGGAGCCAC TAAGTAACGC AGTTGGTGTC CTGGGGCCAG GTGCATACTG 300
GAACTGAGGG TTCCGAGGTG TACCACACAC AGGTCCCTGC TCTAGCAGAG CAGCATGGGG 360
AATGGCAAGT GCTCTGGTAG CTATGGTAAC AAGGCCTTCT AAGAAGGCAT CCTATAGGCA 420
TGTGAAAGCT GAGGTGGACA CTCTGACATG CTGACCAGCC GTAGACCTTT CACAACGCTG 480
CCATTTGTCC ACACGTGTGT GCCATCCCAG CATGCTGAGT GAGCTCTGAA CTCAGCAAGT 540
TCAGAGCTAC AGTCTTCCTT CCCAGTGAGT GCAGGGTTCC TCCTCGTCCT GAGCCCCACA 600
GGCCTTGCCT TGGCACAACC CTCTACCTGC AGATGACCTG GATTAGGACG CGTCTGCTTT 660
GCTGTCCCTC CACGTCAGCA GGCTTTTTAG GGTGGATCCA GAGCGACTGT GCTCTCTGCC 720
TTGTTCCTAA TCCCTCAGCA GGGCTGCCTG GCACCTTAGC ATTTGGTTCG GTTTTCAGGA 780
CTTGAGTCTA GCTAAGTCTG CAGTCTGCCC AGCATAACAT CCTCCCTGCA CGAAGAACAC 840
CCCCACCCCA GCCTTTGATT CTTCCCCACC CACCACCCTC CCCCAGATTC TGCTTGTGCC 900
TCTGGCTGGC CAAGTCCTAG AAGCTGGGAA GGCAGTGGGA GGGAAGGGTA AGGTGCTCTG 960
GGCAGCTTAG CAGAGGGTGA GAAAGCCTCC TGCTGCCTGG CCGCAGGCAC CATGGGAAGG 1020
AAGGTTCTGG CAGGAACCGC CTGCTGGGCT GAGATCACCA TGGAGACCTG GCTTACAGAG 1080
GGTCACTGGC AGTGGCTAAG GGCTGGTGGG GGTGGGAGCG AGGGGGATTT ATGCAGGATT 1140
TGTGCTCTAG GCCCTTGGGG GAGCAGGCAA AACTGGGGTT CTTCATCACT CACTTTGCCA 1200
AGTAGTTTGC AGGAGCCCAC CCTCTCTCCC CGTTAGTTAC CCAGAAGATT GTTCATCTTG 1260
GCAACTGTCC CTCAACTGCA GAGACGTCAG CTTCTGGATT GAGGCCCCCA GTGCTTGCTG 1320
AGCCTGGCAC CCCACATGTC ACGGTCCTTT CCCTTCATCT CTGCAATTGG TCGAGCTTGT 1380
CACCCTAACT GTAGAGAGCT GACATTCATC CCTGCAGCAC CTCTGCTCCC AAGAGCTGCT 1440
TTTCTGCTTA CTGCCCCAAT TGTGATGCAT CTGTCACCTT ACAGACTCAC CGGCTTGTCC 1500
TCCCCGCTAC CCCTTACTGA GGTACAGATC TGATGTCTCA GGCCTCACCA ACCCTTTTGC 1560
TTCTCTCTGC CTGGCCTCAT CACCAAAATG GGGTGCTTCT CCTTCCCTGC AGGAGCCCAC 1620
CTGGTGCCCC TGGCTCTCAG GGGTGTCCTG GCTAGTCCAA CCAGAGGACA AAAGTCATCC 1680
CTGGGGCTGA TTGCCCAGCA GACAGCAGCT GAGGCTGAGC GGAATGCCAA TGTGGTCCTG 1740
TTGGAGAGGC AAGCCAAGAA AGTACAGGGA GAGAGGCTTT CTGTCGCTGC TGCCTGGCTC 1800
CTGCGGCTGT GGGGGAGGAC AGGTGGCTCA CAGAGGAGAC TTAGAAGTCA GTTTAGCACC 1860
CCAGCCCTGC TCCTCTTCTG GGGGAAATGG TCTCGCACTT GGGGGTGGGG AGCCAGGATC 1920
CCAGACCTCT GAAAGGCAGG CAGTCTAACG GCCCAGGGTT CTGGGAATGA CCAAGCTGGT 1980
CCTGTCCTGG CTATATCTCA TCCCTTACAG CCACAGCTAT GGATCTGGGT GAGGGGGTTG 2040
GGCCAGACTG GTGGTCTGCG TAGAGAAGAT AAGTTCCACA CACGTGATCA GAACTGTCTA 2100
TGGAAAAGAG GTACCCGAGT GGCTGTGGGG ACTGGGGAGT TTGCTAGCTT CAGGAAGGCA 2160