EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-08744 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr4:130151740-130153710 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr4:130153592-130153604GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:130153596-130153608GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:130153600-130153612GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:130153604-130153616GTTTGTTTGTTT-6.32
POU1F1MA0784.1chr4:130152402-130152416TTTATGCAAATTAA-6.55
POU2F1MA0785.1chr4:130152402-130152414TTTATGCAAATT-6.11
POU2F2MA0507.1chr4:130152403-130152416TTATGCAAATTAA+6.39
POU3F1MA0786.1chr4:130152403-130152415TTATGCAAATTA-7.22
POU3F2MA0787.1chr4:130152403-130152415TTATGCAAATTA-7.22
POU3F3MA0788.1chr4:130152402-130152415TTTATGCAAATTA-6.74
Pou2f3MA0627.1chr4:130152401-130152417GTTTATGCAAATTAAT-6.62
RFX1MA0509.2chr4:130152571-130152587GGTTGCCATGGATACA-6.39
RFX1MA0509.2chr4:130152571-130152587GGTTGCCATGGATACA+6.4
RFX2MA0600.2chr4:130152571-130152587GGTTGCCATGGATACA+6.52
RFX2MA0600.2chr4:130152571-130152587GGTTGCCATGGATACA-6.54
RFX3MA0798.1chr4:130152571-130152587GGTTGCCATGGATACA-6.66
RFX3MA0798.1chr4:130152571-130152587GGTTGCCATGGATACA+6.74
RFX4MA0799.1chr4:130152571-130152587GGTTGCCATGGATACA-6.45
RFX4MA0799.1chr4:130152571-130152587GGTTGCCATGGATACA+6.95
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03801chr4:130151422-130153925Cerebellum
Enhancer Sequence
GCTCACATAG CGGGCAGGTA GTGTCATTAA CTGGAGCAGT CTGACTTCAG AGCACTTTCT 60
GCCTCTTGCT GTCATCATAA ACTGCTTCCT GCTGTCCAGC GTTAGTGGTG CTGGGACCAG 120
AGATGAGTTA GGGCCCTTCG CTCCACCGGG GAAGGGTGGG AAAGCGAATG TCCTGCTTCT 180
GAAACAAAGC CCATAGGAGG TATCAGGAAA AAGTCAAACG CACAAGTTGG CAGTCAGGTT 240
TGAATCTGTC ATGCCAGTAC CCAGAAATGA GGGTCCAGGT CCAGGCGGGA GGCGTCCAGA 300
CGCGAGGTGG GAGCAGTGCA GCCCCAGATT CAGGTGCGAG CTCTATAGGG CTTCTGGGGG 360
CTTTCCTGGG TACAGAGTGG GTGACAGAGG TGACAGTTGG GTAGTCCTGG AGTTGGGAAA 420
TGAATCTAGA CAACACTGCA AGGTGTGTAG CCTTGTCTCC ATCTCCAGAG GAGGAAACTG 480
AGTCACAGAG GCACGTCTGA AAACCCTCTG CGCTACTTCA CCCTGTGGCC TCTAAGGGTT 540
TACCAGATGG TGAATAAAGA AACAGGCCCA GTTGGGGGCA GGAGGAGGGG GTACTGTGAT 600
TTTTTTTTTT TTTTTTTTGG TCGGGTTTTC CCCTCACGGT CCTGCCCTGG GCTGTTCTAG 660
GGTTTATGCA AATTAATGTA GATGTATGTT AATTGGATCA CTACCAGTCA GCAGGCTCTA 720
ATGGAGCTGC CAACTCAGAG ATATAGTGAG GCAGAGTTGT CCAGAAGGGG CCCAAGAAGC 780
CCCCAGCTGA GAACGGGGTA TGGGTCAGTG GCCACTGAGA TGAAGGGCTG GGGTTGCCAT 840
GGATACAGAG GCCAAGACCC TGCCTCTTGA CAGAACCAGA CTGGCCAGAT CAGCCTGCTG 900
GGCCTCACTG AAGCTCCAAG CTGGTCTCTG AGGATTAATT ACCCGGAAGG TGATGGCCAA 960
CTGCTTTCCA GCTCCCTCCC TGACCCAGTC CAAGTGGAGG GAGGACTGGG CCACAGCGGG 1020
AGGGCCAGAG GACAGACAGA TGGCAGTCCA AGGTTTGGAT ACAGAGATCT GAAGTGAGAA 1080
AGGAGTGCCT GCTTCCTCCA GCAGGCCTCT TAGGGGCAGG AGTCCTAAAT ACTGGCGCGT 1140
CTGGACAGGC TCAGTCGCTG AGCTTAGAGA GTGTACCGCA GGGAAGCCAC ACAGAGTGTC 1200
TAGAACCCGA CCGAGTTCTT TGGCAGTGGC GTATGTCAGC CTTCCACAGC TCTGGGGCCT 1260
CAATCTCCAG AGATTGGGAT GAGGATTAAC ATGGACACAA AGGTTAATAT AAGCAGTACC 1320
AGGCTGGAGA GATGGCTCTG TGCTTAAGAG CACTGGCTGC TCCTCTAGAG GGCCTGGGTT 1380
CAATATCCAG CACCCACATG ACGGCTCAGA AGTGTCTGTA ACACCAGTCC CACGGGATCC 1440
AACCCCCCAG GCATGCATGT GGTGCACATA ACTGTGCATG CAATCAAAAT ACATAAACAA 1500
GTCTTTTATA TATGTGTGTG CACATATATG TATAACATGT ATATATGTGT TATATGTGTG 1560
TTATACATAC ATACACAGCA GATACTTAAT AAAGTATACT AAGATAAACT CTTGAGGTTG 1620
TCAGTGTCCT GGGGGCTTTG TCCCTTTGTA TGAGGACACT CCACACTTGT CCATGTTCTC 1680
TGGGCTTGGA TATGTGGCAC TGGTGTTCTT AGAGGAGAGA AAAGACATGA GCAGTGTCCC 1740
CAACACAGGA GCTGAGCTCT TTACTCGGGG CCTTGCAGGG TCATGTGATC AGGCTTGGCA 1800
GCAACCGCTT TACCCAACAA GCCGTCTTAC CAGCCCAGTT CATTTGCTTT TTGTTTGTTT 1860
GTTTGTTTGT TTGTTTTGTT TTAAACAAAG CCATATATAT AGCCCAGACT GGCCTCGAAT 1920
TCAATATGTA ACTGAGACTG CCCTTGAATT CGTGGTCCTC TTGCCTTTAC 1970