EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-08666 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr4:123352570-123355870 
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr4:123354061-123354074GGATAATTAATTC-6.32
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02563chr4:123232649-123354875HFSCs
mSE_03990chr4:123353562-123355847Cerebellum
mSE_04159chr4:123353614-123355848Cortex
mSE_04693chr4:123353943-123355472E14.5_Brain
mSE_10993chr4:123354012-123354836Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
TCACTCTGTA GACCAGGCTG GCTTGAATTC ACAGACATCT GCCTGCATTT GCCTCCTGTG 60
CACTGCAAAT TAGAAGCACG TGCCACAGCC CAGTTAGGAT CGGGGATTCT TGTTTCTGGG 120
TAATGGGCCT TCAGAATACC ATCCTCTCTA CTCTTGCGTT TGTCTCAGGC TTTCTGGAAA 180
GAGTGAGGGC TTTAGCATCA GTTGGGCCTG AAGCAAGGGA ACATCGCGCC TGTGAGACTT 240
CAGGAGACAC CATGCATATT GATAATGCTG AACTCTGGCT TCCTCTAGCT TCCTGGACAA 300
CTCCAGACAA GTTGCTTGGT TTTACTGTTG CAAATAGCCA TGATTTCCCA GGGATCCCTG 360
GGGGTGAAAT GACATGCATA AAGTTCCAGT ACACATCTAG GAACTCAGCA GCAGAGCTAC 420
CAGCAGTGGC GTGAGCTCTC AGGAGCTCCC AAGCTGGGCC CAGAACTCAG CTCCCAACCC 480
ACCCTCTGTG TTCTTCAATT CCTAACTCCC ACCCAGCTGT TCTCAAGTCA TTTTCTTCCC 540
TTCCTACTGA GGACAAAGAA AGGAGAGAAA GAATAAAAAC ACATAATGGG TGTGCCCTCT 600
CTTTTCTGGG TGCTCTAGCA AGTGCCTAAT TCTTTTCCAA GTCCCAGATA AAAAGCCTTC 660
CATTGATTCA GGTCCCAGAC GGACAGATAT AGCAGGAGGC CCTCTCCCCT AAGAACCTCC 720
ACACAATTTT CCTCAGTTTC AGTTCAGCAC AGCTCGAGCA GTATCCCCAC TGCTTTCGTG 780
GGCAGGAGCT GGACCCTGAA ACCTTGAACA AAGCAACTAA AGGAGTCAGC AATACATGAC 840
CAAGGAAGAA GCAAGGGAGT AAGGCGGCAC ACTCACAGAC CAATGAGAAA CTGTGTCTGA 900
ATCAAAGATA CTCAGGGGAG CGGCCACTCT AGATGAAGGG TTACCTGTAG AGCAGACACA 960
GGGCCAGGCC ACTTACTCCC ATGACCTTAG CCCACTTTAT AAGCCTCTGA AGCAGCTCTC 1020
TTGCTCCCCG ATTTTAGCAA TAAAAATGTG GGGCCCAATC AGGTAAGTAA CTTTTCAGGG 1080
ACAACAACTG AGATATGGAA AGCCATTCCC TTGCATGAAT GAAAGGAAGA GAAAAATAGC 1140
CGTGGAAATG AACGAGTGAC AGCCAGAGAG CAGCATCCCC CAAGGCAACT CACTCACAGA 1200
GGCTCCGAGC AGAATCCTCC CCTGTGAAAA CCTCCGGGGT AAGAGCCCGT TACTCGTTCT 1260
GCAGATTACA GGGGTTTCAC ATCTTTTTAG CAGCAGCCTT AGTCCAAAGA GAGATCCCAG 1320
CTCCGGAGGA GCCCCTTTCT GTTCCTACAG AAAAGTCCAG GCAGAGCCGG GAATCTGGCT 1380
TCTGCCCTGA CTGCTTCAGG CAGTCCATAA AGCCAGACCA CAGCCGGTCT CAGCTACAGC 1440
AACCATGAAA AAAAGATGCC AGACTGCCTC AGTATAACAC GTGGAGATGG TGGATAATTA 1500
ATTCTCACAC CCAGGTATGG TCACAGGCCT TTCTGAGGTG GCATACTGCT AGAGTAGAGG 1560
CTTAGTGCAG TTCAGGATTC TAATACAGTC AGTTCTGCAT TTCTTCTAGT GGCATCTCAT 1620
CTCTAAGAAA TGACAGCCTT CCACAGTCCC CAAAGCATCC AGTCCTTCCT CTTCATTCCT 1680
AAACTTCAGA ACAGATAGCC ATGTGCTGTG CCAGACTGCC ATTCCTCTGG ATTACCTGGA 1740
ACTCACTCAG AAAGCATGGT GGAAAGCCAT TGGTAAAGAC AGGATTGTAC ACTGCGATGC 1800
AGCCACCACC TCCCTGACCA GCTGGGAGTC CCAAAGGGAC CCTGAGCCTC AGAGAAAGGA 1860
CAGCTTGGCT ATCTTTTTTG CCGCGTGCAC GGAATTCTGC CCACGTGGTC ATTTTCTATC 1920
CCTCCAGTGA ATGTGACCCA GATTTGCTTT CAAAGCACTG CAGCTGAGCT GGTGGTGTGT 1980
AGCTACCGTT CACTCTGCCC CACTTTCCCA GGCCTCTCCC GCTATTGAAA CCAGGCTCCA 2040
GGACAGAGCC AGGCACTCAG AACACACAGT CAAAAAGGAG AGAGAGAAGC TGGAAAGAGA 2100
ATGAGCTTTC TTGGGTACAA AGCTGCAAAA TGCTCAGGAT GAGAAAGCTT GCTTGCCCAG 2160
GAATATGGGT TCCCAGGAGA ATTCTTCCTT AGGGTCCCAC TTCCTACCCC TATAGCCTTC 2220
AATTCCATCT GTGGCTTGGA TAGAATAAAT CACTTCCATC TGCTCTCTGA CAAGGCCTTG 2280
GAATGAACAA AAGAAAGCAA CAGAAGCGGC AAGCTCAGGC GCATTCCTTG CTGGCCTAGG 2340
AAAGCACTGG CCTCCTGCAG CCTTCCCTGC CTCTTTTGGT CGGTATCCAA GTAATAGGAA 2400
GGACAGCACT AAGTGTAGTT ACAGGTATGG AAACCTCATT CAGTGATCCC TGGAAGCAGG 2460
TATCCATGGT CACCCTTTTA CAGATGAATC TATGAAAGCA CCGCAGGGTA GTTATCCGGC 2520
TGGACGTCCT GACTCTGAAT AAAATTGTCA CTGTAGCTCC TGGTACATAG CTGCAGTCCA 2580
GTCTCTCTCT CTCTCTCTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTGGTTTTT CGAAACGGTT 2640
TCTCTGTAAA GCCCTGGCTG TCCTGGAACT CACTCTGTAG ACCAGGCTGG CCTCGAACTC 2700
AGAAATCCGC CTGCCTCTGC CTCCCAAGTG CTGGGATTAA AGGCATGGGC CACCACCGCC 2760
CGGCCAGTCC AGTCTTTTTA TGGCAGGTGA GTGGGTGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT 2820
GGACGAATGA ATCTGCTGTC CTAGAGGAAA GCTGCATAAA GGAAAAGGGG GAGCAGGTGC 2880
CCTTCTGTGA AGAGCATGAG AGCATGCTCA GGACTGCCCA CCCAGGGTGA GAAAAGCAAG 2940
AAAGAACTCC TGATTATAAC AAGGTCCATG TCTGCTGTGG ACCTGGGACA AAGAGCTGGA 3000
ACATAAGACG CAGAAGTGTT AGGAAGAGAT ACGCTGTCTG ATAGGAGGGA TCAGAGGCAG 3060
CTTCCTGGAG CAGGCTCTAG TGGAGCAGTT GTTAGAAATG GGTAAATGAC TGACTCTACG 3120
ACGATGCTGC CCAACTGGGT AACCAGGCTG TGTGCATTCT TAGCCTGAGT TCTTGTGTGC 3180
CCAGCTTTCA CAATGTAATC AATTTCTTTT CTTCCATCCT CTCAGCTAGA CTGAATTCCA 3240
TGAAGAAAGG ACCATATCTT CAGCTATCTT TTTTTCTTTT AAAGATTTAT TTATTTATTA 3300