EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-08400 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr4:53644480-53648510 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr4:53646745-53646756AAGAGGATTAA+6.14
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:53648211-53648229TCTTCCTTCCTTTCTTTC-7.55
NR2F1MA0017.2chr4:53645596-53645609CAAAGGTCAAAAG+6.87
SP3MA0746.2chr4:53644514-53644527GGTGGGCGGGGCG-6.14
STAT1MA0137.3chr4:53647305-53647316TTTCTAGGAAA+6.14
Sox6MA0515.1chr4:53647396-53647406CCATTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
GAAAGTAAGC GGGGGCGCAG CGCGGGGCCG AGAGGGTGGG CGGGGCGCGC GGGGCTGGGC 60
GCGGAGGACG AGGCCGGGCC TGGGACCCAC CCGACCCGAC CCGACCCGAC CCGACGGGAC 120
CTGAGAGCCC GCAGGGAGCG ATGGCCGCGC CCGGGACCCC GGACGACCTC TGTCCTGCTC 180
TTGGCTCCGG GAAGGCACTG CGGGGAGGAA ACCGCGAGCC GCACCCGGGT CTCTGCCGCC 240
CTCTGCGGGC GCTAGGCCCC TTTCTTCCCG CTGCCCGCGG CGTGCTCCGA GGGTGGGTCC 300
CTCCTCGGTT GGAGTGAGGA CCAAGGCTCG GCCTCGCGTG GGGGGATCCC CGCCCGCGCG 360
GAAGCTGGTG TCTCTTTTCT TCCACCGTGT CTTCAGCATG GTCTCTGCGC TGTAGGTCCG 420
GGGACTGAAT CTCCTTTGTA CATCTGCCCA CTGCCTTGCT AGTGGTTTAT TTATAAGCAG 480
ATCTCAGTGT TTGCCTAATT GAGGAAAAAG GCAGTTGTCA GGGCCGCTGC CCCACCCTCG 540
TCCTTCAGTT GGTGAGGCTG GCCAGTAGTC TTGTTTCGGA ATGTTTAGTA CTTTGAGAAC 600
AAGTTTAAGG AAAGAGTTAC ACAATAGCCT TTTTTAATTA AGCAAATAGT GCACTGAATA 660
CAATTGCAAC TGAATTTTTA ATATTCAGTA GTAATTCCTG TATTAAAAAA GTAAGCCACC 720
TTGCTATCTT TGTTATGTTA TAGTGTAATT GCAATACATT GCGGTATAGG AAAGAAAAAC 780
ACAAGTGTTA TTAATAATAC ATCAGGGAAA ACAAGGGCAT TTCTAAGAGG CCATTCTTTT 840
TTTATTATTG CATAGAAAGT GCCAGAAAGA GTTAGAGAAA AACTGCAATT CTTACCTGGA 900
TTCATCTTTC TGAGCTTGCC TTGAGACCCA TTCATTTGGG TATATCCAAT TATTATTTCC 960
ACAACTATAC TATAGTATCT TTTAAAGAGA TTACTAGTAT GTCTAAGAAT GTGTATTTTG 1020
AGTGTGTATA AATTTAAAGG ATTCTCTGTT AGGCTGATAA AACATTGCAT GACTTATTAG 1080
AGGAAAGGCA TCATGTGATA TTTAAGTGGG CATTAGCAAA GGTCAAAAGG AAGAAGAGCA 1140
AGTGCCTGGA GAATCCGGAA AGATGAGTTT CAGGGTGCAG TGTGTTTGCT ACCTGTATGC 1200
AGCGCACATT CCTCTCTTTC ATCTTCTGTT CTGTAGAAAT AAGAAAAGAA TATACTATTA 1260
GAAAGTCTGG ATAAAATACT CCATTCGGAA AACAGTATTT TCAAGTTTAT GAATAATTAG 1320
TACTAAAATA GTCTGTGCAT GGTAAAATGC TAAAAGTGCT TCAATGTAGA TCATCTTATC 1380
AGGGGACACT GAGGAATCAA GTGTTTGACG TTGTGAGTTC TATAAGGACA AACATGGTTT 1440
CAACCAGGTT TTTCTCATTT TAGACAATGT ATTTGTGCAC CCACAGGATC CCATAAGTAG 1500
TTTCCCCAGA GGTAGTGAAG AGTTAGCTGT TCTTTTACTG GTGTTGATGT ACTGGATAAT 1560
TCTGAAAAGT CAACTTTTCA ATATTAAAAT TTTGGTGGAG GTATCAAGCA ATCTTCTAGC 1620
GAGGAGAGCT TGTGCTATGG CTTCTGATGG ATATCTAGGT CTAATGTTTG TAATTAGCAC 1680
TCGTGCTGTC AACCTGAGCT TCATTTTCTT ACGGTTTGCT GCAGAGTCAG TTAGTTACTA 1740
GCTACAAATA GTAATGAACT AATTGGGTAT TCTTGTCTAT TATCTAAGAC AGTAGTGCAC 1800
CTGTAGCATG AGGTTTCCAG ACTATTTCCT GTTGTAGAAT GTTCACATAA AAATGGTAGC 1860
AGAAATGGTC CCCAGGTCTA TAAAGAAAGT AGCGACATGC TGTAAGTGGC AAGGAAGGCC 1920
TAGGGATTTG GGTTGTGAGT TATTAAGAGG AGCCAGCTCT CTGGTCATAC TGTTTATGGG 1980
CCATCATAGC TTAGATGATT TGCCATGAGT CTCCATTTCT TCATCTATAA AATAGAATAT 2040
CCACTGCAGT CTCTTTAAGA GTTATGAGGA TTGTGTCCAT TTCTGGAAAA CCACCCAACA 2100
GTATTATCTG TGAGCTCTTG TTAATCGCAG ACGCTCAACC TCAAAATCAC GTTTTTCTTT 2160
TCAGAGCCAC TCCTAGACTT CCTTAAGGTG TGTTCTCTCC TTGTTTATCT TTAAGAAATT 2220
ATTTCAGTTG GTGGTGCCAA GAGACAGTTG TTAAGTCCCA ATACAAAGAG GATTAAGAGT 2280
TGTGAGTCAG GCAATCTATG ATAAAGACAT TAACTGGGTG TCTTACAGAA GCTTGCTGCT 2340
GGCTGCTCAG TACATGGGTG CTGCTGGCTG GTCAGCACAT GGGGTGGCTT CCCCAGATGC 2400
CTTTTTTTTT TCTCTTTTGT CTGTGGAAAC GACTTCAGTG TTTTGTTAGC AACAAATGCT 2460
CTATTTCAGT AGAGGAGGAA GACGAAGTTG CTGTGGGTGT GTAAGGCATA CTGTAGGATA 2520
CAGAAGCAGT ATTATCTCCT AGAAATGGAC AGAGGGATTT TGTTTATGTA GAGTTTCTGG 2580
GACACTTTTG TGAGCAGGAT GTGTTATGGA TAGGTGGCTT TGTTTGATCC CCAGACCTTT 2640
TGAATATGTC CTTAAGTGGT TCTAAGATAA AATCTGGAAG GTTTCTTTAC CCGATGAAAT 2700
AAATGTGCAC ATTCAGAGAA AACACTGAAA CAAATAAGAC AGCTGAGCCT CTTGGGTACT 2760
TCTTTTGAAG TTGGTAGTGC AAGGTAAATT TCCGTGCAGA TCACTGGTAT TCATGGGGCT 2820
TTCTGTTTCT AGGAAAGGTG CTTGTTACAG CAGTGGGGGT GAGAGGGTGG GCAGAGGGAG 2880
GATGCTGTTA GGAGCTGGCT TTGTTAAATG CTTTCCCCAT TGTTTTTCTG AGTGTTCTTC 2940
CTAGCTGGGT AGGGACTCAA AGGTCTCCTT TATACTACAG GGTAAAGCTC GACTGGGGAC 3000
ATCTGCATTT GTCTTACCTG TTTCCTCTTA AATCCTGATA CTTGCTGTAC TCCATATCCA 3060
ATTGGGTATC CATAGCTATC CAATTGACCC ATCCGTGTCC CTTACTTGCT TTCAATTTAA 3120
AAAAGAAAAA GTTTCTCAAG GGAAGTGAAG AAGACTGGAA GTTGGGTGTT GTGCATACAG 3180
TACCATGTCA CACTACACTC TCACAGCAGA ATTCTCTCAT GGTTCACACA GTCACTCGGC 3240
TAGCAAGTGG CAGTCTGGAT TCAAACCAGG TTGATATTTT TGTTTTTGTT TTTTCCATAT 3300
TCCACACTTT TTCATTACCT CTCTCCAGGC CTGTATTCTT GGCTTCTAAA TACTAAAACA 3360
ATTAAGGTTA TTAAAATTTA AAATATTAGG TCCCAACAGT TAGGAGCTGG GGAGATGGCT 3420
CATCAGTTAA GAGCCCTTCC TGCTCTTGCA AGAGGGCCAG AGTTTGATTC TACGACCCAC 3480
ATCGGATGAC TCACAAGCAC CTGCATGCAT GTGCGCCTCC CCACACACAT ACACATAATT 3540
AAAAAGAAAA TAGATCTTTT AGACAAATAA AATGTTATTA GGGACAAACC CCAGTACAGT 3600
GGTCAGGTTT GTTGGTTTGT TTTAGACACT TGTCAAGTGT AGTGAAGTGT TGATACGTGG 3660
TATAGAGTAC AAGTGAGAGG AAAGTCTGGC ATGCAGGTCA GGTAAGATCT CTGTCCTGCA 3720
TCAGCGTCTC CTCTTCCTTC CTTTCTTTCT CTTCTTGGAG GGAGGGGTGG GAATCTTACC 3780
TCTCTCAATA GAGCTGTAGA CCATGAAGTG CCACAGAAAT GAACACCATG TGAGTGCCCA 3840
TGCACTCTAT ACTCACATAT TAGTACCTTC GTGTTTTTAA TTGAACTTGG CAGTTTCTAA 3900
ATATCAGTAA TGAAGCAGGC TTTTTTTTTT TTTTTAAGTT TTAACACAAT GCCTCTTTGC 3960
AATGCTTGGC TGAATGTCAA CAGGATTATT CATGCAGCAA GCACATACTG GATGTTGGCT 4020
GTAGTGGTGG 4030