EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-08349 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr4:44039350-44043080 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EBF1MA0154.3chr4:44042974-44042988GTTCCCTGGGGACT-6.41
Foxd3MA0041.1chr4:44042157-44042169GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:44042161-44042173GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:44042165-44042177GTTTGTTTGTTT+6.32
MEF2AMA0052.3chr4:44041231-44041243GCTATTTATAGA-6.37
MEF2BMA0660.1chr4:44041231-44041243GCTATTTATAGA-6.27
MEF2DMA0773.1chr4:44041231-44041243GCTATTTATAGA-6.18
NKX2-5MA0063.2chr4:44041164-44041174ACCACTTGAG+6.02
TFAP2B(var.3)MA0813.1chr4:44041495-44041508TGCCCTGAGGGGA-6.22
TFAP2C(var.3)MA0815.1chr4:44041495-44041508TGCCCTGAGGGGA+6.13
TFAP2C(var.3)MA0815.1chr4:44041495-44041508TGCCCTGAGGGGA-6.21
Enhancer Sequence
GGACAAAAAC AGATCCCAAG GCAGACTGGG CCTTAGGTTA TTCGCTGTGG GCTGGGTCTG 60
GCATTTCGGG GGCAGCTCTT AGAAGGAAAT CTTTCAGAAA ATATAGCCAG CTGATGCCAT 120
TGTGAAGCAA CTATGACAGA ATAAGTGGGC TCTTATTAAG ACAGTCCTTT AAAACTCCCC 180
GTGTTTCTTG ATCATCTTTG ACATTGTCCT TTGATGCCAA GCCTAGGCCT CTCAACCTGG 240
ACATGTCTCT GAGGGGTGTA CTCTAAGACA GTGCCTTTCA GGTTCCATTT GAGTAAGGTG 300
GGAAGGACTT TGGTCAGGGT CAGTTGCCAT CCGGCCGCCC AGAGCCTCTG TGCTGATGTG 360
AAGTGTGAAA TGTCAGGCTC CTCTGCTCTT GCCACCTCAA GACGATTCCC CTCCAGGATC 420
AGGTGTGGCT CTGCAGTAAA GAACGATGTT GCAGTGGGGA GTACACCCCA GCAAAAGTGC 480
CTCAGCACCG CTCCACTCTG GAGGCCCTGG GGCAAGTCCA CTAACATCGA GTCCCATGGC 540
TTCAGCAACT TGACAAATAG ACCTTCAAGC TTAATAATGA AGACATTGGG AACAGGCTTT 600
CTATTGCACA AGTTTGTGCT TATTCCCTTT ATTTAAAGGA ATACCCCACG TCTATTAGAG 660
GAACTTAACC TTAGAGGGTG AGGTTCTGAG CATGTAGTCA GATTGCAGTA CTTTAGTTTA 720
CTCGGAATTG TAGAATGTTG AGTTGCCTGA TCCTCCCTAG TTTCTGATTT TTTTTGGGGG 780
GGGGGTTGAG ACAGGGTTAC TCTGTATAGT CCTGGAACTC ACTCTGTAGA CCAGGCTGGC 840
CTGCCTCTGC CTCCCAGGTG CTGGGGTTAA AGGTGTGCGC CACAACTGCC CGACCTCCCT 900
AGTTTCACAG AGAAGAGATT TCTTATGGAG TGTTAACACG TCGATGTCGG AAACCAGCTG 960
AGTCTGCCTT ATAAAAGCTG CTCACAGCTC AGGTCTGAGT GCATAAGGTT AGGGTATGCT 1020
AACCACCATC CCCACATCCT AGGACAGAAG ATACGTTTTC TACTCTTTAA TCCTGTAGAT 1080
TTTGTTTTTT GTTTTTGTTG TTTTATTTTG ATACAGTCTT TTCTGTGTAA TCCTGGTGGC 1140
TGGCATCAAA CTCAGAGAGA TCCTCCTGCC TCTGCCTCCC AAGTGCTGGA ATTAAAGGCC 1200
TGTACTACCA CTGCCTGTCT TCGAGTGATT TCTTTAGAGG ATGGTGGTTA GGAGAATTTA 1260
TAAATCATTT GAGGTGCTAG GAATGAAGTT CTGTGATGCA GGACTTTGTG TTAAATCCTC 1320
AAAATGACAT AGGGAAGGAG GGGTATCAGC CAAGCCATTG GTGGTACCAC ACTACTATAA 1380
TTGGATACTC TGAAGGCTGA GACAGAAAGG AGGCTAACCT GGAACATAGA GACCTATTCT 1440
GAAATAAAAC AAAACCCTTC ACCACTTGGG AGCACATCCA GGCCAGGTCT TCCTGAGTGA 1500
GGTGAGGAGG AGTCAGCAGA AGGGTGGGGG CAACGCGGTG GTGGTGTTTG GTTCCTATGT 1560
AGCCGGTACT GTGTTGTCTA TGCCAAACCT TATCTTTTAC CCCAAGTTAG GGCCTACCTG 1620
TTGTTGCACC AGAGAGTGAA TCATTCAGTT GTGGCCTATG AGAAAGAATT CCCTTTTCAG 1680
AGACTCAGAA CAGTGGAAGT CTCCTGCAGT TCATGCTTGG GGGACAACTC TGCAGCATCT 1740
CCCTTCCCAA GCAAGAAGAG AAACATTCCC CTTGTTAGAG GTCTCTTGTG TTAGGACTTT 1800
CAGCTCTAAC CAAAACCACT TGAGGAATTA AATCCACTAT TCTTAGCAGT GGTAGACTTC 1860
TTTTTCCATG CCCACTGTAG AGCTATTTAT AGAATGGAGT TCTGAATTGT TATTTTAGGC 1920
CTTTGGTCAG GCATTCCTCT CCCCGTTTCA GGCTTCCCTA AGCCCTGACA GGTGCTGATT 1980
CCAGGTCGGC CTTACCCTGG GAGGAGAGCA GACAGGTGGG GCGCCTGTGC GCTAGTGTCT 2040
CTAATTTTGT CTGTCAGAGG CCCTGCTTGT CTTAGAGACA AGCTCTTTAT TCTTGGGGCT 2100
AGTAGTGAAG AGGCAGGGCC TCACCAAGGC CTTTGTTGTG AGTGATGCCC TGAGGGGAGG 2160
CTGCAGACCT TTCTTCTCCC CCAGTGAGAG CAAAGCAGCA TAAATGGATT AGGCTAAGCC 2220
TTCTGTAAAC TAAAGGGATT AGGGTGTAGA GCTGCCTGCC CTTCTGTGCC TCCCACTCGC 2280
CTGACTGACT CACCCGCAGC TTGTTTCCCT GAGTTACAAC CAGGCTGCTC CTTTTGCTTT 2340
CTTTCCGTTT CCACAGATAT CCTCTGTGTA GAGAATTAGG AAAGAATGAA GGGTATGTGT 2400
GTATTTTAAA AGTAAACTAA AACCGCCGGA GGTCTAGGTC AGTTAGTCGT GATTGCATGG 2460
CCTGTGTGAG GCCCTGGGCT TGGTCCGCAG CACTGCCTGA AGGGGATCCT CGCCATCCCC 2520
GCATTCCTAA GATTGGGAAC GAGAGTAGGA GACCTAGAAC ATCAAGGGCA TCCTCGGTTA 2580
CCTGTCAAGT TTAAGGCTAG CCTGGGCTAC ATGAGGCCCC GTATCAAAAT GAAATAAATA 2640
GAAACTGGAA TATATGTTAC TAGAATTTGC TTTCAGATAA ATGTGTGTGT AAACTGATGA 2700
GTGACCTGAT TGTCCTTTAA ATGGCCTTCC AGCCAATGTC TGCCGCCTCA ATTTTGGGAG 2760
GCCAGGACTA CAAAGTGAGA TCCTATCTCA CAAAACAAAA TTTTCCTGTT TGTTTGTTTG 2820
TTTGTTTAAA TCCTAAAACA ATATAGCAAA GAACAAGCTG AGGTTTGGCA GGGTCATTCC 2880
CAGTGTGCCT GTGCCCTGGT TAGTTGGGTC CTGCACATTC CCACCCCACC TGCCTCCCGC 2940
CCTCGAGTAT ATAAGGACTT GGTGAGGTCA GGATTTTAAG CTACACTTTG TCAAAAGCCC 3000
AGACTGGCAT GTGTTTAGAA ACTGCCCTGG CTTCCTGAGC AGACACGGAA CCCTGGGGCC 3060
CAAACTAGCT TCCATTTCCC CAGAGCACTT ACCCCAGCCT CTTCTACGTC TAAGGCGCAC 3120
TGTGCAACAG CCACAGGTTT TTTGTTCCAC CAAGCAAGTG TGGGAAAGCA ATGGTTGGGT 3180
CCAAGATTTG GGATTAAATC TTTGGGGCTG TGCCCATCTG TTGGCTGGCA GTGGTCATAC 3240
CCAGTGATAA TTCCTGAGGC TGACAGAAAG TCAGCATGGC ACCCTGAGCT GGCAAACGTT 3300
AGTGTGTAGT GAGGAAAACA CGTGCACTGC GATCCACACT GCCACCGGCT GACCAAGTCT 3360
TCATCGCTGA GCCTCAGTCA CCTTGCCTGG GAGGAAGGCG AGGACACCGT CAGCAACGGT 3420
GCTGACTAAC GGTTGCCGTG TGTGGAATGG CATGTAGCCC ATAACAGAGT GCTTACTAAA 3480
GGCTGTCGCC GGTGAAGCCC AAAGCTGACG CTGCAGTGCT CTCCTGTGGC GGGCACCAGG 3540
AAGGCCAGTT TCCAAGATGC CCCTCTCTGT GCACTGGAGT GCCCACCGCT GGAAGGCCCT 3600
GGGTCAGACG GAGCCCGGGG AGCAGTTCCC TGGGGACTGT CAGGTGCAAT ACTGTGGGGT 3660
TTAGATGTTT TCTGCTTCTC AATGTTCTCT CTTTTTTCCT GCCTGCTTGC CTGCCTTTGG 3720
ACTTCTTGCT 3730