EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-08303 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr4:40793400-40797080 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:40795630-40795648GAATGAAAGGAAGGTAGG+6.1
POU2F2MA0507.1chr4:40794053-40794066TTCATTTGCATGT+6.92
PPARGMA0066.1chr4:40794412-40794432TTAGGTCACATTCACCCAGA+6.74
PPARGMA0066.1chr4:40794411-40794431TTTAGGTCACATTCACCCAG-6.74
TEAD1MA0090.2chr4:40796845-40796855CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr4:40796845-40796855CACATTCCAT+6.02
ZNF143MA0088.2chr4:40793714-40793730CACCCACAATGGACTG+6.22
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01469chr4:40768588-40801538Th_Cells
mSE_05015chr4:40794236-40795140E14.5_Heart
mSE_06403chr4:40793339-40795453E14.5_Liver
mSE_06403chr4:40795753-40801985E14.5_Liver
mSE_06840chr4:40790593-40795590Heart
mSE_06840chr4:40796030-40797128Heart
mSE_07481chr4:40790757-40795415Intestine
mSE_08715chr4:40793286-40795657Liver
mSE_08715chr4:40795938-40801100Liver
mSE_09210chr4:40790727-40795229Lung
mSE_11265chr4:40790587-40795637Placenta
Enhancer Sequence
TTTAAAGATG CAGGACCCAG ATTGTAAGAG AACCTTAAAT GAAAAAGGAT AATCACCAGG 60
CTACTGCATG AACTCAGATC AGTCCATTCC TCTGGTTAAG ACATCAGCCA TGCTGGGTGT 120
CTTAGTTAGG ATTCCTATAG CTTGATAAAG GCCATGACCA AAAGCAACCT GGGGAAGAAA 180
GGGCTAATTT CATCTTAGAA GTGAAGCAGA AGCCATGGAG AGAGGCTGCC TACTGGCTTG 240
TTCCTCCTTC ATGGCTTGCT TGGCAGCTTT CTTATAGCAC CCAGGACAAC CTGTCCAGGG 300
GGTGGTACCA CACACACCCA CAATGGACTG GGCCCTCCCA CACATATCAA TCATCAAGAA 360
AATGCATCGC AAGCTTACTC ACCGGCTAAT CTAGTGGGAG CATTTTCTTA CATGCAGTTT 420
CCTCTTCCCG ATGACTCAAG TATGTGTCAA ATGACATAAA AACTAGCCAG TACACGGAGT 480
ACGGAGAGGC AGGAGCTAAA AGCCTAGGCT ACCTTGCAAG ACACTGCCAG ATAAAATAAA 540
ATAAAACAAC CCAGGAACAA GTTATCAGCT GTATTCTTTT CTTAAACATA CAAGAAGGGA 600
AGACGAGTAG AAAACGGGAG GGCAGGCTTA TCTTAGGTGA AAAGAATGTG GCTTTCATTT 660
GCATGTTTTC AGAGTTGAAG ATCACCAAAC CTAGGACTTA CCTACAAGTG TTCTACACTG 720
AGTTATACCC TCCCATTCCA TATTACTTTC CACAAAAATT AAGATTACTA ACACCCTCAC 780
AAAGAAAAAG GCAAATACAA AACCCATAGC CTTTGTCCTA ATACCTAAGA GGCAAATCAT 840
TACAGTTACG CAATAGACCC AGAACGTACT TAAAATCACT GCCACAGAAT TCAACAACAC 900
CCAATAAAAG ATACAGCCCC TGGCCCTCAT TTGTATAAGG AAGCCAAGCT GAAACAGAAC 960
CTGAACCTTA GCACGTGACT CACCCCTCTC TGTCTTCTAG TGACCGATCC CTTTAGGTCA 1020
CATTCACCCA GAACTACCTC AGGCCAAACC ACTACAGGCC TCTAACCTAG AGAGCTTTCC 1080
AAACAGGCTT TAGAGAGCTC TCTCCTGGGG CAAAGGCTCC CTCACCTCAC CCTGCACAGT 1140
CCCAGACACA CAAGGGGTCA CAACCAAGGT CTTTTCAGCC ACAGCTACAG TCAGCTTTCA 1200
GGAGACTTTG CCCTGTTTAG AAACAGGAAG GCTAGCTCTA TGAAGATCAT GAAGTTCAAA 1260
CCGAGCAACG TTGCAGGGAC TGGCCACTGG CTCAGGGAAC ACATCATGTA TGGCAGGATC 1320
AAATGTAAAC TCATCACACT GCCAAAGTCT CAAAGGGTTA GGACCAAAAG GGAAGTCTGT 1380
TTGTCTTAAG ACCAGTCCAG AGCTGAGGAG ATGGTCCAGT GGGTGAAGTT CTTGCTGTGA 1440
AATCATGAGA CCCTGAATTT GAATCCCCAT GTAAAAGCCA GACCATAGTA TGTCTATATT 1500
CCCAGTGCTC TTAATAGGGA GATAGGGAGG TGAAGACAGG AGAATTCTGA ACAGCTCATG 1560
GGGCAGGTTC CGCTGGTGTA TGCAGCAGCA GACAAGAAAT TCTGATTCAA ACAAGGTGGA 1620
AGGCAAGGAC TACTAATGCC TGAAATTGTC CAGTGACCTC CATAAGACGA CCATGGCCAA 1680
CATGCCTACA GACATACACA CACACTGATT TTTTTTTCTT ATAAAAAACT TACCACGCCA 1740
CTGCATCATA AACCATGCAA ATTTCAAATG GACATTAACT CAAGCAGATT TCCAGTCTCC 1800
TTTGGCAGGA ACAAACAGGG GACAAAGAAC AGAGGCCATA AATAACTGAG ACATGAAGGA 1860
ATCACCAGGT TTGACCAAAA ATAATAGCTA GGTTGCTTTC ACAGGGACCC TTAGCCCACT 1920
GAGCCCAAGG TGATCCAGTG TCTGAACGGT CCCAGGGCAG AATCTATGGG AGGGCTCCGA 1980
GCGACTTGGC ATCAACTGCC CCATCATCCT CAACCCCTAA ATTAGCCTGG AAATCCCTAC 2040
CCTGCTGCCA CTCAAAGACC ATAATACCCA GGCAGATGGC GGGCGATATC TCATTATAAT 2100
CATTATAGCG CAGCAAGTTA AGATTACCCA GCACAGCTAA TGTATGGCTT CGGAAAGAAA 2160
AGGAAAATTT TCACACAATC AAATAAAACC AGGACGGAAG AACTGTGACA TCAAGCCTGA 2220
GTTTCTTTCT GAATGAAAGG AAGGTAGGAT ATAATATTAG AGAAAGGAAC ATGGGATCTC 2280
TTGAGTGTGT GCAGCACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACGTGGGGT 2340
GTTCAGAGAC ATTAGCACAA TAATTAAGTC TCTCTTGCTT AAACTGAAAA TTGCTACAAG 2400
GAAGACATTT TGTTTTCTTT ATAGTTCTAG CTCCACACAG CACACACTGT AAATGAATGA 2460
TGTTACCGCA GTCGTCCAGA CATCCGTATA AGACCTATCA GAGGAAGGGA TACGAAAGCA 2520
TAACTTAGAA GGATCTTCTT TCCAATCTCT AGAATATATC ATGACAATTC CTGGTCCTCT 2580
GAACTAGTCT CTTTGGACAT TAACCTGAGG CAAAAATACC AGACTCCTCT TCAGGGATGC 2640
TAAGCCAAGA AACTAGAGTT TAAAGCCAAT CCCACATTTG GCTCTTATTT TCCATGTCCC 2700
AAGGACTGTC TACCTGTTCT TCTGCCACAG GGGGTTCCCA CACTTGTTCA GAACCTGGGA 2760
TATTTCTCCC TGGTGCTGGA TTAAGCCCAA GGCCTTGTAT ATGCAACCAC TTAGTCACAC 2820
CCCTAAAAAG TGTAGAATAA ATAACTGTCA GGGATCACTC TTATCCTGCC ATAATGCTAT 2880
TTGGAAGAAA TTAACAGGTT TCACCATGAA AAAGACCCAG ACTGTCATGG AGGGTATTTC 2940
TCAATGACCT TGGCAAACAG GTTTCCGTAT TACGGCCACC TGACTGACTG AGTTGGGAAG 3000
AGCTGAGACC TTGTAATGGT TTTACTGGAA TGTACATCTC TGCTCCGGGT AGGAAAGGGT 3060
ATGTCCAATA TGACTGTAAG ATAAAAGACA GTAGGATCTG TGTGTAATCA ATAAATTATT 3120
GCCTCCAGAG AAAAGCAGCA AGACAAACTG GCTTGTTACC CAAAGTCAAA GCTGCAAGAT 3180
CTGCGTCCAA GAGAGGATCT CTGTGCCTCC TCTAAAACCC AGGATGAGAT TCCACCCTAA 3240
AGCAGAGGGT GCTAGAGTCC CAAGAGCCAT CTCAGAATGG GTAGGTCCAG GACAGCCCTC 3300
TTCCGAGCCT CACAGTACAG ACTGTTCTAA TCAGCCTGCC TGTGTCTGCA CATGCACAAA 3360
TGGGTGAAGG TGGCAGCATG ATAAAGAGGA ATGCCTGAGA GCCAAGAGCC CAGCAGAGAC 3420
GTAGTAAGTA TTTCATCTTC ACCATCACAT TCCATGGCAG AGGCTCAGCT AAAAGTAGCC 3480
CCCAAAAGCC AGGGAGTTGG GCTCATGAAC AGGGCTCTAC TCTAACTGGG CTGTTTGCTT 3540
CTAGATAAGA ATCCTGGGCC AGCAAGATGG CTCAGCAGGT AAAAGGTGCT TGCCACCAAG 3600
CCTGACAGTG TGAGTCCTGT CCCTGAAACC TCTGAGCTCC ACATTCACAC CATGGCATAT 3660
GGGTCTACAC ACCATGGCAT 3680