EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-08231 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr4:8675190-8678470 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:8676280-8676298GGAAGGAGGGAAACAAAG+6.39
PKNOX1MA0782.1chr4:8676888-8676900TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:8676888-8676900TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:8676888-8676900TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:8676888-8676900TGACAGCTGTCA-6.92
PPARGMA0066.1chr4:8677168-8677188GTGGGTCAGTGCCACCCAGT+6.11
TGIF1MA0796.1chr4:8676888-8676900TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:8676888-8676900TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:8676888-8676900TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:8676888-8676900TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
TGGAGCCCAG GGTTTTGTCC GTGCTGGGCC AAGGCTAGGA GCTACCTTCT CAGCTCACTG 60
CTGGTTCTTT GTGCTGTTTA CTTGTTTAGA CCTGCCTGTT GATTCCCAGG GAAATGACCA 120
GCAGTCCCCA CTTGGTCCTC TTACCCGCTG TTCCTAACCG TGCGCTCTGA TGGAGTTCCT 180
TGAGAGGAAT GTGCTTCTGT TTGGTGAAGA AGCTGTGCTT CATGGCCTGG TCTCTGACCA 240
AGGTGGAGCT GATGTGAGCC CCTGCCCGCC TTCATCCCTG CTCATTCCTT ACAGTTGCCT 300
GTCCATTCAG GGAACTGTTT GCCATTCAAA CTTTAATCTA GGTTCCATTA ACTTATATAA 360
GGGCTTTTTT CATCTGTGAA GAGGAGCATG GGCCAGAGGC CCAACAGTGC TTGCCAGCTC 420
TGAGCTGCTT GCAAGTGGCA TCGAGCTTCT GCCCATGCTG ATGGTCCCCT TCGGTCACAG 480
TCCTGTGCCC CCCTCTCACC TCGGCACCAG TGCATCTTGT GAACTCTCTT TGAGTTACAC 540
CCCAGTTATT AAAATGTTTC TCTAGGGTGC ATTTAATGCA TAACTACTAG GAAGTGAAGC 600
ATTTTTTCTG ATTGTTACTC TTAGGTGTGG CCCTCTCGAC AGTGATATAG GCACAGGTGG 660
CATTCAGTGT AGAGAAGGGT GCAGCCTTCA AAGTGGAGCT TTATTTTAAA CATGTTATAA 720
AAACTGAGAC TCATGTTGCA GCTGCAATTT GGGAAAGTGG TCATTCACGT GGTCTTAATA 780
AAAAAAAAAT TGACCAAAAT CAATTAATTA AGTTAGGTCA GATCGAAAGT ATGGACCATG 840
GTTACCAGAT GGATTCCTGG CACAGTTGCC AGTTGGTCTG AGGTGTCAGA AAAGATTCAA 900
GGTGGCCTTG GTGGCCGGAG AGCTAGCAAT CACTGATGGT AGATTTCGAT CCACAGGTTT 960
TTAAGTCCTG CCTGGGCCAC ACCTGAGGTG GTCACAGCTG CAGTGGGTCA CATGCTCACT 1020
TGATGCCGTA CAATGCTGGC ATTTTTCATG CCTCCGGGAG TGGATTCTTA ATGGGAATGA 1080
ATAGGGAACC GGAAGGAGGG AAACAAAGCC AAGCGTCTGG TATAATTACT CTCAGCGAGC 1140
CTGGTTTGTC TCTTCTTGTG CCCGTACAAC TTCTTTTCCC CTTCTGCTGG GTCCTTAGCT 1200
GATAAAAAGC AAGCGTCAAG TCCACTGCTG CTACTTCAAG CAGGCTCTGC AGGGCCCCGG 1260
GCTTCGGGGT GTGCCCCAGC AGACGAAGCT GTTGGGAAAT GAAGGAAGGT CTTCCAGAAC 1320
ATATAAGTGC TATTACCTTC CTTAAACTGC GTGGTAAGCT GGCTGCATGG CTGGCTTAAG 1380
CTGTTATCAA TTACATTGTA ACATTTATTT CCTTGGAAGT TAAGAGTGAG CCTTGAGCAA 1440
ATGAAGACTG ACTTTTTAAG TTTTTTTAGG TTACGCACAA ATTCAGTTTA TCAATATTTG 1500
TTGCACTTGG CACTGGAATT TCTACTCCCT GCTCTGGACT TTTATTTGTT CTGGGGGGAA 1560
AAAAAAACCC AGCATATTTT TAGAGAAACA GCTTTCCTAT GTACTTGATT CTCTCCTGTC 1620
TGACCTCTGT ATTTGGAGAA GGTAGATCAG AAAATATATG GCAGGTAGTG GCAGAGTGAG 1680
GCGACCTTTG ACGTTGGCTG ACAGCTGTCA CCTGAAAGCT ACAGACCCTC TCAGGTGTCA 1740
TGTCTGTAGT GCTGACAGTG AGCAGGAATG TTGTTTACAT TTCCATAAAC AGAGTCTCCT 1800
CCGTGTTACG AATACGTTAG GATAGGGCAG GTAGAAGAGA GGGTTATCTG TCTCATGGGT 1860
GACTCCTTAC AGAGTTGGTT ATATGCATAT TCTTGTGGCA ATCCGCAGTA GAATTCACAA 1920
CTGAGTCTGT CCAGAGCATC TCTGGAAATT CTCCATCGTG TGCTTCTGTG TGTCGCAAGT 1980
GGGTCAGTGC CACCCAGTGC TTAATGTGCT GTGAGAGGAG ATCAGCTGGT GACAGTCCAA 2040
AGGAGTCTCA GGGTCCAGGC ATTTTTCTTA TGCGAAATCA TTCTTGATTA GTTTGTTGAT 2100
TCAGTAAGCA TTGAACAAAA CCACTTTTCT GTTTTGGTTG TTAAAGCAGT CTTCAAATCA 2160
AATTGGTTAT TTTAATATGA CCCCAGATCT ATCAGAGTTT ATAGCTAAGG CAGAAAGCTG 2220
GGATGCTATT CGGTTAGCAT AGGAGGTGAA GGGATGTGCC AGCTAGCCCC ACTCCCTCCT 2280
GCTGTGTCCT GCTTTGTCCT ATAAGGTTTT TAAAAGGTCT GGTGGATATT TTTAACTTTT 2340
TTTCTGTTAA AGTACCATCC AGTTTTGGCT AGTTTCTGAA GAGGTCTCTG TCTCTACCAA 2400
CAGGAATAGT CAGTTGTCTA CAGCTAGTCT TTGAGTAGTC ACTTAGCCCT CACCACAGCC 2460
AGTGGTGGGG TAAAATGGAG CCTGTGTCTT GACCCTGCTA CCATCTGCCC CACAATCGCC 2520
CCACAATTCT GGAACGTGAT GGGCCCAGAG CCATGAGTGA AATCGGTCCT CACGGAGAAT 2580
GAAAGCTTCA CTTGTGGTCT CTTTCTGAAT CTTGCCTATT CCTGCTATTA AGCATAATGA 2640
AATTATGAAT TTATTGTGTT TTCAAGCTCG CTTTTCAACC TCATTACGGG TGCTTTCTTG 2700
TTAGATGCGT CTGTTGCCGT TGCAGAGTTG TATGTGGGCT GTAAATATCT AATTTGTACA 2760
AAATGACTGA TTTTGGTATT TGTATAATCC TCCAGTCAAT TTAACTAAGT TGGGCTTTTC 2820
CCAGTCCTCG GTGCCACGCT CGCCGCTCAT CTGATTACCG CTCATGGGAG TGAGGTTAAG 2880
GGGTGCTGTT GGGAACCAGA GCTTTAGCCC AGCAGATGGG CTGCCGGCTA TATTCATACA 2940
TCTGCTTGCC TGCTGTGGCA GCTGCTGCTG CTTCACGTTG TGTCCTTTTG TTCTGTTCCA 3000
TCCAAGAACG GAATGTGAGG AAGTGTAGTG AATGGATTAA TTTAAGGTTA GGTTAGTGTT 3060
GTGCTGCCTT TCCACGTAAC CGATCAGAGT GCTTCTGGTA GAAGCTAATG AGTTTCCCTT 3120
AAACTGAACT AGGTTTGTAA AATACAGCTC AGCAAGGGGC CTGGGTTGGC ATTGTTGATG 3180
GGAACTAAAT TCAAATGTGT AAAATACCGG CAGCTTTTAT CATTTGTTCC TAATTCTTTG 3240
TTTCCTTTTT TCTCTCTTCT CACCCCCCAC TCCTTTCCAG 3280