EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-08115 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr3:127432410-127433690 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2F1MA0017.2chr3:127433642-127433655CCCCTGACCTTTG-6.13
PKNOX1MA0782.1chr3:127432902-127432914TGACAGATGTCA-6.52
PKNOX1MA0782.1chr3:127432902-127432914TGACAGATGTCA+6.74
PKNOX2MA0783.1chr3:127432902-127432914TGACAGATGTCA-6.52
PKNOX2MA0783.1chr3:127432902-127432914TGACAGATGTCA+6.62
TGIF1MA0796.1chr3:127432902-127432914TGACAGATGTCA+6.62
TGIF1MA0796.1chr3:127432902-127432914TGACAGATGTCA-6.74
TGIF2MA0797.1chr3:127432902-127432914TGACAGATGTCA+6.62
TGIF2MA0797.1chr3:127432902-127432914TGACAGATGTCA-6.74
Enhancer Sequence
CTGAGGTACC TGGTGAACAA AAGAGGGGAA GGATGATTAA CTAAAGCATC ATCAATTATC 60
TGCGAGTCTC AAGCAGGGAG GGATAATAGA GCAAACACAT GAAAATACAT GCCGGGTCCT 120
GAGGATGCTG TTCGGGGAGT GTGTGAAATG ATGACAGCAC CTCGAAGGCA CACAGTGCAG 180
AAGGGAGAGA GGCTAGCTAT AGAGCTTGGT CACCCACGGC GAGGTTGGTG AACTCACACG 240
GGCCGAATGA AATGAATGCA CCCTGTGATT TATTCACTTT CTGCATCTTT CACTCGGTGC 300
CTCTGGGTCC CAGTAGCCCT GAGCTTTCCC CTTTCTGGAA GTCTACAGGA AGCATCTGGC 360
TAACAGTTCT AATAGCCCCA CGGAAGCACA TGGTAATATG AAGTTCACCA ATCTCACAAG 420
CCACTACTGA TTTCCCCTGT GCGGTATTCT TCATGGTATT TAGCACGGTA TCATTTGGAC 480
CAAGACAGGC AGTGACAGAT GTCAAATTTA AAGCTCTTCA CTGCCAGGCA CTCTGCCAAG 540
AGAAGTGGAA ACATGGTATT CCAGAAAACT CAATTTCCCG GAGCTCGGAT GTGGATGGAT 600
CCATCATGTA GATGGATGGG TTGATGGATG TTGCCAGATA ACAGGTAAGC AGTAGACTCC 660
TTATGCAGAA TGTAAAGGAG ATAGAAGGAC CCGTGGCAGT CAAGGTAACT CTGTGGACAA 720
AATAATTTAC CAGCACCATG AATATGCCTA GCCAATGGAC AGAAGCAATA CTTGGTTAAC 780
AAATACTTTG ATCTATCTTC CTTTTGTTAA TGTAGTCCCT TGCAAACAAA AGAAATTATC 840
GTCTTTGCCC AAAATAAGGA ATGACATTTC TCTGGTTTAG ACACTTGGTC TTGTTTTGGT 900
TTGGTTTGGT TTGGTTTTTT GGTTTTTCGA GACAGGATTT CTCTGTGTAG CTCTGGCTGT 960
CCTGGAACTC ACTCTGTAGA CCAGGCTGAC CTCGAACTCA GAAATCCACC TGCCTCTGCC 1020
TCCCAAGTGC TGGGATTAAA GGCATGTGCT ACCACTGCCC AGCTTGGTTT AGACACTTGG 1080
AGTGGGGTGG CATACAGAGG TGCATTAACA GAGCAAAGTC TGAAAGGGGA GGTGGTACCA 1140
GCGACAAGGA TGGTGATACT CAGCTCATTC ATGCAATGAA GAAATCACGT TAAAGCAGAA 1200
TTTCTGAGTT AATATTAGAT GTGCCCTTCT ACCCCCTGAC CTTTGTTTAA ATCAAACAGG 1260
GTATTAGAGG CTTATTTCAC 1280