EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-07851 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr3:85483120-85486830 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:85483201-85483219GAAAGAAAGAAAGGAAGG+7.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:85483205-85483223GAAAGAAAGGAAGGTAGG+7.45
FOXB1MA0845.1chr3:85485711-85485722AATGTAAATAT+6.32
GLI2MA0734.2chr3:85486374-85486389TGGCCACCCACCTCG+6.04
HSF1MA0486.2chr3:85484278-85484291TTCTAGAAGGTTC+6.74
HSF2MA0770.1chr3:85484278-85484291TTCTAGAAGGTTC+7.12
HSF4MA0771.1chr3:85484278-85484291TTCTAGAAGGTTC+7.04
NFYAMA0060.3chr3:85483422-85483433AACCAATCAGA+6.62
NR2C2MA0504.1chr3:85485993-85486008GGAGGTCAGAGGTCA+8.03
Nr2f6MA0677.1chr3:85485994-85486008GAGGTCAGAGGTCA+7.42
RXRBMA0855.1chr3:85485994-85486008GAGGTCAGAGGTCA+6.84
RXRGMA0856.1chr3:85485994-85486008GAGGTCAGAGGTCA+6.91
RxraMA0512.2chr3:85485994-85486008GAGGTCAGAGGTCA+6.88
ZNF263MA0528.1chr3:85483254-85483275GGAGCAGGAGGAGGTATGGGA+6.15
ZNF263MA0528.1chr3:85483260-85483281GGAGGAGGTATGGGAGGTAGA+6.39
Enhancer Sequence
ATCAGCCATC ACCAAAAGAA AGAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAAAGAAAG AAAGAAAGAA 60
AGAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAAAGAAAG AAAGGAAGGT AGGTTTTATG AGCTTTGGAG 120
AGGACACGGG ATGTGGAGCA GGAGGAGGTA TGGGAGGTAG ATATATATGA TCAAGACACA 180
TTGTATACAT GTAAGAAATT CTCAAAGAAT ATTTTTTTAA ATAGGTCACC ATTCATTTTA 240
GCCAGTGAGT AACAAGTGGT GACACAGAGC ACACATGCTT ACTGATAACC TAGCAAGGAA 300
ACAACCAATC AGAAGGCAGA GGCGAGGGAC TGAAGCATAG TCCGTAGACA GAAGACTGAC 360
TGCGAGCAGG CAAGTGAGGT TCCAGAGATC TTCACTGCTC ACCATAGTTC TGGCCATGTT 420
TCTCCTGTTC CTCCCTCCCT GGGCTGGCTG TCCACCTCTG CCACTGTCCC CCAGCTCCTC 480
TGCAGGACAG AGGTGTGCCT GAACTGTGCA CACGGCTTCT CTTCAAGTAA AACTGCCCCT 540
ATCTGGACAC GACAGGCAAC AGAGCTCACA AACTTGCTAA AGATACACTA AGAGGATTCA 600
GAGATGCCAA CCCAGGCCCA AGCAGTTGAT TTTCCCCAGA ACTGGGACAC TCCCGGAGCA 660
CAGGGTCTGT CACACCCCTG CCCACCAATA TTCCCGGTCT TTGTCTGGCC TCTCACAGGT 720
GCACACACCC AAGGGGGCCA TTTCTCCTGG GATTTCTCTC TCTCTTTGCA AATCTCTCAT 780
CTCAACGGAC TCCTCTGACA CTTGGCCAAA GGAGAAATTT GTATCAGTTA TTAATAGAAT 840
ACTACTCTGA AGTATCAATA TTTAGGAGCA CTTAAGGCAC AACAGACAGA GATATGGTAA 900
TTTATTTACC ACGTAACAAC TTCATTAGGA GGGATCCACA CAACCATGCT GCTCACAAGC 960
TCTCGGGCCC CCAAGCTTAT CATGCGCAGC CAAACAACTG CACAGCAGGC AAAAATGGAA 1020
AGGGTAGATT ATAACCTAGT TTTATATTCT TTCCAACAAA GTTTAAATGC CTAGAAGAAT 1080
AAAGTTCTTT GTTGCCCTCG CTTCAGGGAC AGATTCTAAA TCAGAAAAGA CATAATTTTT 1140
ATGAGTTTAA AATATATTTT CTAGAAGGTT CCCATCCTCT AAGTATATAT AACACCCCAC 1200
ATTGTTTCAA AATGCTTTTG TGGATATCAC CACAATTGTT CCTTTCAATC ATCCTACGAG 1260
GTAGCATATT CCAGAAGTAG AACAAGACAA TCTGCAGCTC AGAGGGAGGG GAGGGAGCCA 1320
GAGGTCTCCT GCACAGGTCC TCTCGGGTGC TTTTCTCTGG CATCCACACG AAGTAGAGTA 1380
GGAAATAGGA AGTACTCAGT AAAGAACAAC TGTGCTACTG CAGTAGCACC ATCAGCTCCA 1440
TGGAACAAGG AGCCGGCCAG AGCACCTAGG GAAGGTGGTG TCGAGCTGTC TGCACCTCAA 1500
GCCTGGCACC CCTCCTTCTT CCACAGAACT TGTCATAGTG AGATGCCCTG CAGGCACCTC 1560
TTGGACATCA CAGAACCAAC TAGCCCAATT TAGACATGTC CACACTCAAA CACAGGTTTA 1620
TTTCTCATCT TCCTAAGGTC CAGGCCTGGC TCTCAGATGC AGCCATGTTT AACACTGCTG 1680
CTGAGGACAG ATGTGAATGC TATGAGCAGA CAAAGGGGCA GAGCTTATCG TGTAAAGCTT 1740
ACCAGATGTC CAGCAAGCAA GCCTGCCACA ACTCTGGCTT TGCCTGGCCT TGGTGACCCA 1800
CAGGAGAAAG CAATGGACCT CAGATCCAGT CAGGCTGCCA TTTCAGGGAC ACACACACAG 1860
GAGAGAAAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA 1920
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAAC ACGCTTTATC CCTGCTGTCA GCGGAGCAGC 1980
ATTTAGGAAT TTAACATTTA AATGCAATCA AGCTTTGCCC ACCTTGAGTA AGAGCCTGGG 2040
TCTGAGCAAT AGAAAATGCT TTGCCAAGCT TTCTGCTGGA TTTCACTCAG GCCCTGCTAA 2100
TGCATTCTGT CCTGTCTGTA GATACTTGCT GGGGAGCTGA AGTAATCCTT TTAAAACAGA 2160
CTACCAGCTG CGTCCTTATG ATCGGATTTG TTCTCTGCTA ATGCCTTAAG ATTAGTTACT 2220
GATGACCTGA TTTAAACCCG AAAAGTTCAA AAACGTTGTT TTACTTAAAA ATCTTAGAAA 2280
TGATAGTCTC CCATAAAGCG ACAGCCTGTA AGGCCCTCCA TGGTGTGCCA CCAAGTTTTT 2340
CAAGACTTAG ATTTAATTCC CCTTTAGTGG GATGCTATAT TCACATCAGC AATCCCTCCA 2400
GCCAGTGATG CTCTAACTCC GGTGGGAAGC CAGGATCTTC TAGACTAATG CCACTCAACC 2460
TCCTAACACT GTGACCCTTT AACTCCTAAC ACTACGACCC TTTAACACAG TTCCTCATGC 2520
TGTGGTGACC CCCGACCATA AAATTATCTC ATCGCTACTT CATAACTGTA ATTATGCTAG 2580
TTATGAATTG TAATGTAAAT ATCTGAAATT CAGGATATCT GATACGCAAC TTGGGGGTTT 2640
CGACACACAG GTTGAAAAAC ACCACTCTAG AGCATCTGTT AAGACACAGC TCATAGGCCT 2700
TACCCACAGA GCTTCCGATT CACCAGGTTC TGGGGGAATC TGCGTTTCTG ACCAGTCCCA 2760
GGCATTCCCA GAAAGTCCCA TCAGTGAACC TGGATTCACC TTAGTAACCC CCTCCCTCTC 2820
CTTCCCTGCC CCACTCCCTC CTCAGCCCCC TCTGTGTACA CATACATGCA TGTGGAGGTC 2880
AGAGGTCAAC GTCATATACC GTTCCCCAGG CACCTTTTAC CTTGTTTGTG CTGAGACATT 2940
GTCTCTCATC CTGTCTCTGC CTCTCCTGCA TTGGGATCAC AAGCAGACAA TACCACACCC 3000
AGCTATTTTT AAAAATGGGT TCTGGGGGTC CAATCAGGTC CTTATGTTTG CATGGCAAGC 3060
TCTTTACCAA ATGAGCTGTG GCCCCAGCCC CTTTCAGTGA TTTCTATTCA AGTCATATCA 3120
AAACCCAGTG GTGGACTAGA GAAAGCCCAG GTCTACCTCT ACCCCTGTTC TCAGGTTCAC 3180
TGGTCCTTGT GTCCACTAAA GGAGGAGGAG TGCACTCAAG GGTGTGCTGG CTGACCCTCC 3240
TCCACTATAC CTGCTGGCCA CCCACCTCGG AGAACAGAGC TCCTCAGGCC AGGCCCACAC 3300
ACTTCTGCTG CCAAGGCTGT CTACTCTTCT AGTCCCTGCC CATCAGAAAG CACAGCTCTG 3360
TGTCTCTATG CCAGCTTAAG AGCTGACAGA ACAACCCAAC ACATCTCTGT GGGAAGCTAA 3420
CTTCTTCGAC GTTTTGCCCT GCCTCTGCTT TATGCATAGC AGTTACAAAG GAGAGGGTCA 3480
GGTCATTTTG CTCCAGCAGT CTTCCAATGG GGATCTTAGC TCTATGGCCC CTCTTTACCT 3540
ACCCTGTAGC TCATGTCAGG GTGGGTCTCA CTGGAGGGGC CCGTTCCGAG ATTTAGAATT 3600
TGGGTTCAGC ACAAAGGAGG AAACGCAACC TCAGGGGACC AGCCTGGTGC TTCTGAGGCT 3660
CAGCACTGGG ATTCAGGACC AAACCTCATG TTAGCAATGA AGCATGGTCA 3710