EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-07805 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr3:63701690-63704070 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:63703915-63703932GGCATTAATTAACAAGC+6.05
Alx4MA0853.1chr3:63703915-63703932GGCATTAATTAACAAGC+6.62
FOXA1MA0148.4chr3:63701818-63701834GTTTATTTACATAGCA-6.55
FOXB1MA0845.1chr3:63701820-63701831TTATTTACATA-6.02
Foxd3MA0041.1chr3:63702523-63702535AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:63702527-63702539AAACAAACAAAC-6.32
NRF1MA0506.1chr3:63702639-63702650CGCGCAGGCGC-6.14
RFX5MA0510.2chr3:63702623-63702639TGTTGCCATGGTATCC+6.13
ZNF263MA0528.1chr3:63703771-63703792CCCCCTCCCCCCTTCTCCCTT-6.15
ZNF263MA0528.1chr3:63703768-63703789CTTCCCCCTCCCCCCTTCTCC-6.97
ZNF263MA0528.1chr3:63703761-63703782CCTCCCCCTTCCCCCTCCCCC-8.18
Enhancer Sequence
GCATAGTGTT CAAAACCAGG ATGCAGAATC CTTAAGCTAC TTCACTCAAG TTATTTTAAG 60
CCCTACTTGG TCCCAAGAAA AGCAACTCCA TTTTAAACTT TTATTAACAG TGATCTGAAT 120
TCTAATCAGT TTATTTACAT AGCAAGTAGC TCTCGATCGC GCTGCGAAAT AGGGATGCAG 180
TCTAAGAAAA CATAGTAACA ACAAGTTATA GCACCCACTA GAAACCGCTG GAGATTTGTA 240
CTCTTACCAA ATGCTCCCCT GGGTGCAAAC AAATGAAACT TAAAAGACGG GAAGAGGTTT 300
TTCAAGACAC AATTTTAAGT CGTCAACAGA CGGCTTAAGA AAGACTAGTC TGCAATAATG 360
CGTCTTAAAA CATTCATTTT CTGAACAAGA TCATAATGCC AGCAGTAAGC AACCCACATC 420
TTAAAAAGCA ACGTCTCTGT TGACAGAGAG AACCTTTGCT TCCCTTCACC GGCATTTAAC 480
ACACTAGTTC ATTTGGAGAG CATCAGGTTC TGTACGTTAT AAACAGGTTG TATGCAGAGT 540
ACACAGGAGC TACGATGTCG TCTGCACACT GTGGAAACCC AAGCTTAATA CAATTGTTTA 600
AAAAAGCCGC ACCAGGAAAT AAAGTCTTAT TCATATCTTC CTTTTCACAG GATAAAAGGA 660
GGTAACTTGA ATGCTCCAAT GAGCAGTTTC TCAGCATTAT TTTTCTACCA TGATCAAAAT 720
GATGACAGAA GAGAGAAAAA AGTTATATAT TTTTTATTTC ATACCTCTGG CTATCACTTC 780
AATGCTAAAC TCTTAAAAAA CAAAAATGAG ATCGTAAGTT GATTCCAAGC TACAAACAAA 840
CAAACAAACA AAAAGTCTAG AGAAAGACTT GGGCTCCACA GTGAAGCAAA GCAAAACAGC 900
TCTGCTCTTC AAGTGGCGTC TCCGACCCGG TACTGTTGCC ATGGTATCCC GCGCAGGCGC 960
AGAGAACACC TTCACAGCCC GGGCGTCGCT TCGGTAACCC ATGATTTGTC GCTAGGAAAG 1020
GGCAGTTGGA GTAAATCCTT CTCGCACCTA ATGCCCGGAG CTTTTTGAAC AGTAAGACTC 1080
GCACCGGCAA CTAAGGGCGC GCTTCTGGGA CCGCAGAACT GCTTTCCAGG CGGCCAGAGC 1140
CAGGGGAGGT CTTGTGGGAT CATTCCGCCG CGATGCGGGA CCCTCCCGGT GGCTGGACCT 1200
CTGCCACCAA CCAGGGCAGG GAAGGTCTTG CTCAGGCACA AAAGCCCACG CGCTCCATTA 1260
GGAGCTCACG AGCTACTGTG GTCCAGTTCC TGGGCCGAGG CACCCTGGCA CACACCACAA 1320
CCCGGTGCTC GCGGCTGAGA TTGCCCAGAA AGAATTCGAG CACCTGCTCG CGCAACGCTG 1380
GAGAGGCAGT CCGGTGCTCC TCTTCCTGCT CCCGGCCCTC TCCCTGTCCC CCACCCCCAC 1440
CCCCTCCAAA GCACTGACCT GCTCAGCTCT GAGTATCCCG CTGATGAAGG ATCCTCGGAG 1500
TTTTTGTAAC CGGCTCAACC TCCCAAATGC TGGAGTGATC TGCTAGTGTC CCGGTGTGAC 1560
TCCAACCCCA ATTCCTCCAA AACAGCCCCC CAGCCCAAGA TGGGCACCAC TACACACCAG 1620
CCAACAGAAC CAACAGAGGA GCTCCAAGTA AAGACCAGCG CTGCCGCCAC AACCTGCTTT 1680
CTCATTCAAA TCCTCATGCT CACATTGGAG CACCCTCCCT CTTAACCCTC AGCTCAGGGC 1740
AAATCCGGAA CTGGAGCGCG CGCGAGTGGA CTGGAGCGCC ATCGAGGAAC AGGAGCCAAG 1800
AACTGGACGT GGACCCCTTA TGAAGATGCT ACTGCTAGGC ATAGGCCAGA ACCCCTGGGA 1860
ATAAAGATCT TCTTCTGTCC TCCCTCGCAG CAAATTTCAA AGAATTCCAA GACCAGGGAC 1920
ACCTCTGATA GATTTTCAGT TTAGGTGGCT AGCGGGTTAA AGACGCTGCT GGAACAAAGT 1980
TGGAGAGTTC AGGGGAAGCG AACTGTGCAA TGTTCTTACA AGAGTTTGAA CCGCTTCAAA 2040
AATAAAACAC CAAACGACTA ATCCTTTCTT TCCTCCCCCT TCCCCCTCCC CCCTTCTCCC 2100
TTTCCAATAA ATATAGCATC TGTTATTTTC AACTATCCAT TTTGAGTAAA ATCAAATTGA 2160
GGAACAGGGA GTGCAGGTTA TAGGATGCTT TGTTATCCCT CAGTCTCTTC CAAATATCAC 2220
TCGTTGGCAT TAATTAACAA GCCAGTTAAT TGTCAGTTCA CCCGCTAGCG GGCTGGAAAA 2280
GCTAATGTGC TGTTAAAGAG CACACAGGCG GCAGCGGAAC GTTTGCACCC AGCAAGTGTT 2340
CAAAAGCTGA GTAAAGATGA GATCTGAGCG CACTAACAGT 2380