EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-07799 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr3:60303700-60305100 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:60304879-60304890CTTTCCCGCCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:60304167-60304182TTTTAATAATTAACA+6.05
HNF1BMA0153.2chr3:60304168-60304181TTTAATAATTAAC-6.14
Lhx3MA0135.1chr3:60304197-60304210AGTTAATTAATTA-6.64
Lhx3MA0135.1chr3:60304204-60304217TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:60304200-60304213TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:60304201-60304214AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT-6.02
TEAD1MA0090.2chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02212chr3:60275845-60315730Macrophage
mSE_06725chr3:60302694-60304136Heart
mSE_06725chr3:60304246-60308185Heart
mSE_07877chr3:60302536-60304206Intestine
mSE_07877chr3:60304291-60306932Intestine
Enhancer Sequence
CGGAATTTGA ACTCAGGTTC TCAGACCTGA GCTCCAGCTT CTTTACGCAG GAGTCATCTC 60
CCTAGCCAGC TAGCCTATCC AGGCAACTCT CTTTTTATCT TAGCAACTTC TGCACATCCT 120
TCAAGGCGCT GCTTGCATAA GTTCCTCCAG GGAGCCTTCC CTCCTTTTCT CAAGGGCATT 180
TTGGATATTT GCCTACCATC TTAGCACCAG CTGGCTGGTG CTCTTTTCTA CCATGCTGCT 240
CCAAAAAGTA CAATCCGTGT ACTCCATCCT CCTGCACTTA CCTCCATCCT ACCTATACTT 300
AACTACTTCT GCCATAGCTC ACATTCCATC CAGTTGCTGG AATGAATGCT GAGAAAGTCC 360
TCAGGCGCTG GTGGTTACTA ATTGTCAGTT AGAAACTCCC TGTCTCTGTT CTCTGAGAAA 420
ATGCTACTGT CATTCTACTT TGTTTCCATT GTTGGGGACT TGGGAACTTT TAATAATTAA 480
CACTGAGAAG TGGTACTAGT TAATTAATTA ATTATTTCAG GAAGGGATCA GTAAGCAGCA 540
AGTCCGTGTT TCATGGACCA GCAGAGGATC AAGATCTGTT ACTAGTACCT CTGCAAACTA 600
GTGGAGTACT TTATTTATTT ATTTATTTAT TTACTCCGCC TAGGAGAGTG TGCCTGACCC 660
ACTCAACAGA AACAGGGAGG GAGAAATCCA GTTTGCATTC ACTCACCTCA ACTCATGTTC 720
AAACCATGAA ACAAACGTTT TTATAGTTAA AAATCATCCC TGACGAAGTT ATCAGAATTC 780
CTTGAAATTC ACTGGAAATC CCGTCCGCAG ATCTTCAAAC TTTATCTCTT CTCAGAAGCC 840
CAGAATTCTT TTCTTTCAAA GCCAAGTTAC AGGACAGCAG CTAATGAACT AGGAGCTGGT 900
GTTTCATTTG CTCAGGCGGG CAGTTGCCCA GGGCTTGTTT GCGTGGGAGT ACCTCTGCAG 960
CGCCTAAGAT GTTATTTTAT TTTAAAAGAG GGAGCCCTGC TTGCTTTCTG TACACCACAC 1020
TGCAGAGTTG GAAGTAAGGG AGCCTTTAAA CTGCAAGTTT TATTTGCCGA TAGGACAGGA 1080
AGGTGGCCTG GGTTTGTGTT TGGGTGACGA TCAGTTTTCT CGCAGAACTC CAAAACTGTG 1140
AGTGCTGAGA AAGATACCCA CCAACACCCG TGCAAGCTTC TTTCCCGCCC TTCGCCTTCC 1200
AGGTTCCAGG CGATGCGCTG CTTCTGCTGC TGCAGGCCGG GCAGCTAACT CTAACCTTCC 1260
GTCTAACCTT GCGGGCCTCG CGGGCTGGGC GCGGAGCCCC GGGAGCTGGA GCGGCGGTGA 1320
GCGGCGCGGG CCCGGGCGAG CGAGCGGGCG GGCGGGCGGG GGCCGGGGCT GCGCGTGGGA 1380
GCTCTGCGCG TCCGCGCGCC 1400