EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-07781 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr3:55581210-55586430 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr3:55585756-55585767GTTTTAATTAA+6.14
PROP1MA0715.1chr3:55585427-55585438TAATCAAATTA+6.02
ZNF263MA0528.1chr3:55582012-55582033TCTTCCTCCTCCTGTTCTTCC-6.01
ZNF263MA0528.1chr3:55582009-55582030TCCTCTTCCTCCTCCTGTTCT-6.09
ZNF263MA0528.1chr3:55582000-55582021CTTTCTTCTTCCTCTTCCTCC-7.44
ZNF263MA0528.1chr3:55582015-55582036TCCTCCTCCTGTTCTTCCTCC-7.93
ZNF263MA0528.1chr3:55582018-55582039TCCTCCTGTTCTTCCTCCTCC-9.12
ZNF263MA0528.1chr3:55582003-55582024TCTTCTTCCTCTTCCTCCTCC-9.98
ZNF410MA0752.1chr3:55585439-55585456TACATCCCATAAGATTA+6.59
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03795chr3:55582758-55583454Cerebellum
mSE_03795chr3:55583851-55585934Cerebellum
mSE_04718chr3:55582937-55583596E14.5_Brain
mSE_04718chr3:55583783-55585294E14.5_Brain
mSE_04718chr3:55585525-55588573E14.5_Brain
mSE_05863chr3:55585786-55588516E14.5_Limb
Enhancer Sequence
AGGAGGTCCA TTAGCAAACA CTTACAGTCT ATACCTATAC ATAAAAGACA ATTCCTATTT 60
GTATATTAAC TTCTTTTTCT ATAAAATATT TGTCGCTGCA TAAATGTGGT AAGAGGTGAT 120
CATTTTATGC AATATAATTA TTTTCAACTA GCACTTTGGT TAATAATTCT TAAAATTTGC 180
AATAAAGCCC AATTTATAGG AATTTTTTTC CATTAAAAAA CAAAAAACAA AACAAAACAA 240
AACAAAACCC CCTCCAAACA CTAAATAGGA AAAGAGGGCG ATTACTTTAG GCAACACTCA 300
CTGGAAGTTC ATTAGTTAGA ACCTGTATGC TAGTCTCAAG GTCACACTGT ATGTTTTCAG 360
TGGCTTAATC ATGCACAGTA TGGCGTGATG ATAACGGCAG CAGAGCAGTC CTAGATTAAC 420
AAGCTAATCA CACCTGCTTC CACTGCTTTC TCTAAGTACA ATGAAAATGC AGCCTACTCA 480
AGGGCACTGG GGCTGCAGTC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 540
ACCATACAAA CCGCCTGGAA ACTCTTGTTT ACTATTTGGG GGGGGGGTGT CCTTGTTTTC 600
ATACAGGAAA AAACAAAACC AAAACCAAAA TATAAAGTGA AGAACACACT TATCCTGTCT 660
GCTTATTTCC ATAAGATGTG AATGAAGAGT CAGGCAGAGA TCTAACAAAG CAACCTTAGT 720
TTGTCAGAAA GATACCAAGG AGGAGATGAG GATATTACCA ATTCTTTTCA TTGATGGCTT 780
TCCACTCAAC CTTTCTTCTT CCTCTTCCTC CTCCTGTTCT TCCTCCTCCT CACTGACTCT 840
CCTCCCTTTC TTCTCCAATT TACAGAAGTA ATGTGAAATA CCCTGCACCT CTAGGCACAC 900
ATTCAAATGA GGGAAAGTAA CCTGCAATAA TTACATATAC AAGCTGGGGT TTTTACTCCC 960
TTATCTATAA AAAGAAACAT TTAGCTACCA TCAACAAGGG GGTGGTGACT CTTAAAAGCT 1020
CCACTTCTAA CTGCATCTTT AATCCCTAGG TTACTTTTCT TTTCAACACT TAGAATGGCA 1080
ACACTAAGCA ATAATGTAGA AAAAAAAAAT TGACATGACA AAATGTGACC ATGTGACTGC 1140
CCACTAGGGT GACAAAAGAA CACTGAGGCA ATGGACTCCA TTATTCAACT TAAGAAGAAG 1200
CAATTTTTAA AAAGTAACCT CCATTCTTAG GGTGCTCAGG TTGAAGGAAG AGAACAGGAG 1260
TATGTCATAA CCACTGATCT TAATCCTCGG CCTGACTTTG TAATGAACCT GGCACCCAAA 1320
CATGGAATAA TGACTTTTAA GAAATCCCTG AAACTTTCAA GTTAATTTTA AAAGTGTTTT 1380
TAAACTCACA ATAGAAAGGT ATAAATAGAT GCCATCAAAT TACCACAAAC TCTCTCTATT 1440
TTACTTTATT TAATAAGACA CATAAAAAAA CCCTACACAA ATATCTGTCT TTAATTTCTC 1500
TAGTGCAAAA AAAGGGGAAT GCATTATGTC TGGCAGAAAG AAACAGTTAA ACAGTTAAAG 1560
TAACATGGGT ACATTTTTAG AAAAGGGGAA GGGAAGAAAT CAGATGCACA CAATGAGCCT 1620
TCAAAGCCAC TCCAGCAGTA GAGATAAATA ATTTAATAAA ATCAACTTCA TATTCTTTAG 1680
TCCCTAGTGT AATAAGCACA TATTAAAAAA AACTTAAATT CACGAACAGT TGTGAATAAA 1740
CTAGCTGCTG GCAGATAATG AGAGCACGGA GAACAGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1800
TGTGTGTGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGCGCG CGCATTGGAA GGGCTCAGAT 1860
CCCTGCAGAT CTTCCAGAAG GTTGCCACTG GAAGTCAGTG AAGGTGCAAT TCAAGTGTAA 1920
ACAGTCACTG AGAAACGAAC AACAATACAC AACCCTTAGG CCCTACACTT CTGAGCATAC 1980
CAAGTTTTTC TTTATCCCCT TGTAGATGGT GTGGACATGG CTTTGCACAG GCCAAGGAAG 2040
TGCACCCCCA CTGGGACAGT CACTCAGGAA GCTGCACTTC AGAAATGCTT GTCTTGTCCT 2100
TGTTATTTGG GATATTCCAA GTGTTAAAGT TCACATTTGC TTTATGTTCA CAGATATGGC 2160
TAGATGTTAT GATACTAGGC TGTGTCTTCG CTGGATTTGT TCTCCCTAAC TGAACATTTT 2220
TAAATCCAAG CTGCTCTAGC TAAATCCTAA ATACCATTCC AATGCAAGCA TCTCAGTGGT 2280
GACATCATGA GATTCTTGGC TATTTCTTTC CCCTCCAATT AGGTCACTTT TCTTCAATTA 2340
TCGGTCTATT ATTAGCTTAT GTCAAGGATG TCTACATGCA TACCACTGAA AACAATTAAC 2400
CATTTATGTC TTAAAATACA AGGGGCACAG AAGCTTTTCT TCTGGTACTC GGTAAGACTG 2460
TATTTTAAAA ATTGTCTAGC GTCAATTCAA TTCTTACATA TAATAAAACA GACTTTATAT 2520
TACATTGTGT ATCACATCAG CAGTTCAAAC AATCCAATGG GTCATTTTTT TAAAAAATTA 2580
AAATTACTAT CAAGTAGTTA AATAATTTAC CGGTATACGA GATATCTAAC GCCAAAACTT 2640
CGATTAAAAT CAGGTGAATT ACACAAAAAT ACATCATTAA TTTTAATTCC TCTCCATGGA 2700
CAATTCAATT AAAGTAAGCA CGGAAGGAAG CAGTCATCAG TGCGGTTTAG TTTTTCTTCA 2760
ACAAGGAGAG GTGCTGAGAT TATGGAAAGG ATTCAGCTAC AGGCACAATT CATTTCTCGG 2820
ACTACGGGTA GCGGGTAGCG GACGATCTGG GTAGCAGCAG CTAGAGAGAC AATCTAGCTT 2880
TATTCTAAGC CTCCCAGTCA ACCCACAGGG ACAGCAGCCG CCCAGTGTCC GGTTTTATGT 2940
AAATCACTGT CGGCTCCGGG CGTGGAGGGT GCTTCAGGAC GCTGGCCAGC CTGGCCCGCA 3000
ACACTCTAGT TTCTTAGTCC TCTTGCTCCA AGCGAAAATC GTTCGGAAAA GGCCTCAGTT 3060
GCATCAATTA GTTTGCGCAG AATGCTTCGG TGTTTAGCTT CGCCTTAACC CAATTAAGCC 3120
GCACAGCGAG CCCAGAAAGA TGCGCCACCT GCGCCTGGCT GCAGTCGGCG GCCGTGGGAT 3180
CCTGAGTCCT TCTGTTGGAC TGAGGGAACC AAGGCCTCGG CGTCGAAGCT ACATCGAGTC 3240
CCATAGTCCG GGGTGAGGCA CGGGGCGCGC GCTCACCCGG GAAGGTGAGG GCCAAGTATT 3300
CCTGGGTGTT CTGAGTACAG CACACGCTTG GCTGGGGCCA TTCGAGGGCG GGCAGGCGAT 3360
GAGAGCGAAG GGCACCGAGA GTGTTTTGCA GCGATGGATG TGAGTGGGGG TCATCCAGAC 3420
ACCCAGAAAG CTTTACAATT AGCCTGAGAG CAGATGAGCC AAGGAAGACA GCTGGGTGGG 3480
GTAGGGTATA CGCAAGGGTT GTGGGGAGAG CGCTTGCCCG TCGCACCCCA TCCTGGGGAA 3540
CTACGCGTCC CCAGCGGCTG CTCCCTGCCT GCCGCACAGC TCTTTCTTGT TGATCTGGCG 3600
CTCTGGGTTG CCTCTTCCAG CCCCTCTTCA GCTGCCAAAA GGTAGCTGCG CATTCACCCG 3660
CGATGCCTGC AAACTGGGGA GGGGCTTTGC AGGTCCCCAG TTCCCTCTCC CAAGGGAATG 3720
GTCTTGGGGA ATGGAGTAGG AGGCCATCTA AGCGCCAAAT GTGATGTACT ATTTTAATCT 3780
AATTCGGAAT CTATCACTCT TGGGTAACAA GAAACGAAAT TAGAGCTGGC CCTGTGATGC 3840
TTAAAAGGTG GGAGTCTTCA GCAGTAGCCC ATTAACAGTG CGTACACAGG TGCTACCATA 3900
CCCGGGCACT GAAAATTCTC TTAATTTGAA ATTAACAGAA CTTTGTACTA AAGGCAGAGA 3960
ACTGAAAACT ACGACATAAG CCCTAACTAC CCTATCTTTA GTTCATGTGC ACTGAGGACT 4020
CAACTGGTCA TGGTACTGGA AGGAAGAGCG ACCTATAAAA CCCTCCCTAG GGTTCCAAAA 4080
TCCAAAAGCT CCTCAGGTTC CAAAAAGAAA AGCTCATTTC TTTGAAATTT CCAAGATGAA 4140
ACTTAAATAA ATAATAAAAA TCCCTAACCT GAATGGTTAC AAATTATTTT TTTTGGAAGC 4200
CATTAGCCAT TTTCTCATAA TCAAATTATT ACATCCCATA AGATTAGGAA CCTACTGTTG 4260
GTCACCACTG AGGGTTTCTG AGGTGGAAGA TCCATCTTTA AGCCTGCAGG GGCAAACAAA 4320
CTGTAATGGC CACACCTTCC AGTGCCAAGC AAGCTCATCT CTGTGAATTC TCTAGATCCT 4380
TCTCTACAAG ACAGCTCACT ATGAGATGGC ACTCAAGCTT TCTCTAAATC TCAGAAAACA 4440
CCTTCAGGAA GTGTTTCCAC TACAGCATAC AGCCCTATCT GCTGTCTGGT ATTTCAGCAC 4500
TGGCCAATCT AGCTACAGAC AAGGGAAACT GCAAACAGGT GAACTTGTTT TAATTAAAAG 4560
GCTCCATTTT TAGTTGGGTA GATATCATCG ACTCCGTTGA GCAATACTTC TTAAATTCCT 4620
CTCAGCAAAT GCAAATGGGG AAAACCTAGG TTAAAAAGAG AAGAGACTCT GCCTAAGGTT 4680
TGGAAACATT CTGACTGCGA ACACGAACAC GAGTGAAGAC TAAAGAACTC CCCCAGCTGA 4740
AGCCAGCAGT CAGTCAGTAA GCAAAGTTCT AACTTGCACT AAAAAGACCC CAGGGATTAA 4800
CGGGCATTAA TTACCTTACT CTAAATGCAA GTTAGTGACT TTGTTCTAGA AGCCCCTTTG 4860
ACTTCGCTAA TTGGTGGATG ACCATTAGTA CAACTGGATA GCTCATCAGA GGTGAACAGA 4920
CAAGTGGGCT TTTCAGCAAA GAGAACCACT TGTCTTCACC AAGTCTTTTC CAAATGTCAA 4980
TATGCTTCAA GTTATACCAA AGCTGGGAGA TTTCATCTTG CTTTTCAACC TGTCTAGGTG 5040
GCCTGGGTGG GTTTCTGCCG GCAGCAGTTT CCTACCTTTG GTTTCTATGC TTCTATCCAC 5100
GAGGGGGGAT TAATTAGCCG GGCTGAAGCT GGAGGAGGCT GTCGTGACGA GCCCAGTGGC 5160
GATTGGCCGC CCGCCTGCCT GGCCCTGCCT TTATAATTTC CACACGAGTG CATCTGGGCT 5220