EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-07776 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr3:55329780-55334330 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr3:55331675-55331686AAGAGGATTAA+6.14
FOXB1MA0845.1chr3:55333281-55333292ATATTTACATT-6.32
Foxj3MA0851.1chr3:55333159-55333176AGAAAGTAAATAATCAC+6.01
LMX1BMA0703.2chr3:55332977-55332988TTAATTAAAAT-6.62
RUNX1MA0002.2chr3:55332522-55332533AAACCACAAAC-6.02
Enhancer Sequence
GCCTAAGTCC TCTCCCAAGT GGTATGAATT GAAAAGAGAG TCTATTCCTT TCTCTGGGGT 60
TCTGGACAAT TCAGTATCTG CTAAATACTC TTTGGTAGCT ATTTGTACTT CACTGTCCTT 120
CTTTTAAACT TTTTTTTAAA AAGCCTCAGT GATGTTTAAA ATGTTGTCCT TGAGAAGAGG 180
ATTTGCATGC TGCAACACAT GAGTGGAGCC TAGCCTTCTT CCTGTTTTAA TTTTAAAGTT 240
TTATTAGAAT ACAGCTACAT CCACTCATTG TCATGTTGTC TGTGGCTCCT TACGCCCTAT 300
TGTGATAAGC TGTATCAGAG AACCATAGCC TGAAACCCAA AACTTGCCTA TTTGGCCTGT 360
TGCAAAGTTT CCTCACCCCT GTGTTTAAGG GTGAAGGCTA GTTCTAAATT AAGAGCACCA 420
TCTATTAAAA ATGCAAATTT CATGAGAATA AGGATGGGAC TTATTTAAAG TGGTATTTTT 480
GCCAAAGTAA AAGTGAATAG TTGAACTCAA AAGAAGAAAT TTTGAGGTTG AATGTGTGTT 540
GTTCCCCCCC GCCCCCCGCC CATGGTTATA TAAAAGGAAG AGTTGGGGTA ACCAGACAAC 600
ATCTAAGATA GTCTGTAGGT TTTCATTTTT AACAACCCAG GAATAAATAA GCCTTTTGGC 660
TCAGCTAAAA TTGTACTTGC AGTAAAACCA CCCAGCCTGT GACACAGCTG TGAGACTTAG 720
TTTATGTTTT TAAATTTTTA CAGATTTGCC TAGGCTAAGC CCTGCCTGTG GGGATTGACT 780
GGCTCACTAC TATGATGAGG GGCAGCCACC TGGCTGTTCA GTTTCTCTTC CATAAGGAAA 840
CCAGGGGCTG CAGAGCAGAT GAAGGAAGTA TATTCAGCCT CCGGAAGCCT GATACTAACA 900
CCCTGCAAGG GCCACCACTG TAACTCCGCT GGAGGCTAGG AAGGTGACAG AGCCAGGCTG 960
GTTGAGACCC TTTTAAACAT TTAATCTCAA AGTCCTGTGT CGGATCAAGA TAGCTAGCAT 1020
AGAAGCACAC AGTCAGCCTT CCCAGGAAAG CAGGCCATGA TATCTCAGAG AGTCACCTTG 1080
AGGAAGTCAC ATGGAAGACT GGTTCTATCC TGGTGCAAGC CTCTTTTTTG CCATTTTAAG 1140
GGTGACTTTT ACTCTCGTGA AAATCCACAC TGTGTCTCCA GGAACTCTGG CAAGGCCCCC 1200
AAACGACACA ACAGCCAAAC AAAATAGAAC CGCACTAACC ATGACAATAA ACACAATGAA 1260
ACGAAGAGGG ATACCAGGAT CGATTTGTTA GTTTAATTTT AATGGCAAGC AAATTATAAC 1320
TTAGTCCCTA CAGAGTGAGG GTTAGCAAGG AGCGGGTTCC TGAGATTAAT GCCCCAGCCT 1380
CCTAGGTAGC ATGAATAATG GATGGACTAA AAGGCAAAAC GCACAATAAT GTTCTTTTAT 1440
TAATGAAATG AAGACTCGTT GTGATGGCTG GCAATAAATT AGGAAAAGCC AAAGAGGGAA 1500
AGTCATCAAC ACTTGCGCCT TTGAAAAATG TAGTTTCTTA AATCCAATAA TTACTGCCAT 1560
GACAGAAAAC ATCGCTGCAC AACAGAAATG AAGTACATCC CTTGCGAATC CTGCCTGTAT 1620
TGCAGAGAAA TATTTTTGAT CCATAGACTG TAAGGTCTAT TATTTGCTAA GAGAAAACAC 1680
AGTCCATTAC GGTGGATTGA TGGCGATGTT AAGCATTCTG GTGGCATTCC ATAGGTGAAC 1740
ACAATTTTTA CTGGGGCTCA GGCATTGGAA GACCTTCTTT AGTGCATGCT CATGGAATCT 1800
AGAAGACTGT GGGGTAGACA GCACGACCAA GGTCACATTA TTAGCTGGGC TAGGACAAAA 1860
GCTAATTCTC CCAACTTCTA CCCACTGCTG CTTCCAAGAG GATTAAGCTA AAGCTGTCAG 1920
ACAAGACAGG CTTTACAGAG CTATGTGGTG CCTACAAATA GCAAAGACAA AGCTGATTCT 1980
ATAATCCATA CTCCTGGATC TTGCCAGGGC TTCCCCTGGT AGTGTGGCAT TTCCCTGTTT 2040
AACCCTGCAC AGGGACCAGA TGCAGTTCAA GTTCATTTGT ACACCCTTCA AATTTAGATC 2100
CTTGTCAGAA ACAAGGATTT AAAACATCTG AGTAGAAGGT AGAATGTAGA CGTACTTCAT 2160
CAATAGAAGA GGTCATTGAC CAGGTAATTC TTCGGGTTAG GATTTCCTTA CGTGTCAGTG 2220
TGCCTGGTAC TGTGGTAGGC TCAGAGACAG GATAGATGTT AATTCCTTTA TATTCCCAGC 2280
TATATATGCT GTGTGCAGGG CCCTGAGTTG CTGGGCTAAC TGACATATTA CAACCATCTG 2340
TCACCTGCTA CAGTAGCAGC TAGAGGCTTT GTCAGAGTCA AAAAGCTAAC AGTTGGTGGT 2400
GGGTATTTGT GGTGATTCTT TTATAGAGGG CGGACGGGCT TACATTAGTC TGTTTCTCTA 2460
CATCATTTCA TTTTCCAATG ATAATGGTTT TTTTCAACCA AGCACCCCGT ACAGAGAGTG 2520
GGGACAGAGA CATACATACA GGCATCTGAA GTAAGTCATA CTTGGTTACC ACTGGTCTGC 2580
CTTGGAATCC TAAGGGCTCC TAGCTCACCT CTAACCTGTG GTAATTAACA TCAAAATGTG 2640
ATACTACAGC CTTGAGATTC TCTTAGGGGC TCTTAATGGG GTGGAGACTC TCTGAGGAGA 2700
CATTTGGGAT TTCAATAGCA GCAATACATG CTGGATCCAA CAAAACCACA AACACTGAGC 2760
AGAATAAATT ACAAAATAAA TCTGTCAGGA AGTCTTATGT GTTCATGGGA CATTCAGCCC 2820
ACACCTTAAG ACACATCCAC TTTGCAAAGG TAGGCAGTGA GGAGGAGACA CTGAGAATAT 2880
CTATGATATC TGATATCTGA ATCTTGTATG GGTGATAAAA AATAAATGAA TAAGTAAAGC 2940
CACCTCCCAG CCATTCAGAA ATGGCCTGGA GTTCAGACAC AGCATTTCAG AGCACAAATC 3000
ACGCTTCAAA TGCTTTTTTT TGGGGGGGGT GTTCTAGTTT GTTCACATTT GCATGACAAT 3060
CTGCTACGAA TACATCACTA GGAGTAGTTC TGTTTTCTTG CTGAATCCAT AAGTTCTGGA 3120
ATGCACAAGG GGGCTACAGA ATCAGGTTGT AAAAAGTAAA CGGTACATGT CTGAGAGGTG 3180
TGCCAATTGT GATAACCTTA ATTAAAATTC TAAAGAAATC ACAAAAGGCA GTACTAACTG 3240
TGATCAGACA CTGCAATGGG CAAATGTATG AATAACTGAG AAATAATTGT ATAAGATACA 3300
GGGATAATTT TGCTCATATT TGAAATGTAT TAGATTCTGA AGTAGTATCT CTATTCATTC 3360
CTTGCTATTT TATATTATTA GAAAGTAAAT AATCACCTAA AATAATTTTA GATTAGATGA 3420
GAAGTATGTG ATACATGCAC AGTCGATATG CCACAGTCAG ATAAATATTC TGAAGCTTCT 3480
GATTGTAGCA TGGAGAAATT GATATTTACA TTAACTTTGA GAAATCTGCC CATGAAAGGT 3540
GGTAGGAGTA CAGTGTGCAA TTAATAACAA AAGCTTTGGT CAGAAGGTTC TTGCCAGAGT 3600
GAGTTTAGTG GGTGATGTGT TACAGTAGGT TAATTGTGAT TTGGTCTTGG CTAGATACAT 3660
TGGGCTGGGC AGAGAAGAGG TCATGTCAGG TGGTGAGCAA CTTGAGCCAG GATGCAGATC 3720
TGAGGACAAC CAAGAGAAGT CCAAGACGTG GCAGTGACTG CTTTGGTATT TTGGGAAGAA 3780
AGCCCAGACT AGATTGGTTT AACCACAAAC ACTTATTATC GTCCATAACC AGCCATGGCT 3840
GTGGGTGAGT TCTAGTTTTG GTATTAGGTA GACTGAGCAC TTACTCAAAG CCCACTTTCC 3900
TTCTGGTCCC CACACTTGCC TCACTGAGCT ATCTCTGACT TCAAAATCAT GTGGTATATA 3960
AGATTAGAGA AGCCATCATC TGGAAAACTG GAATTCATTG TGAAGATAAA TTTCCAGAGA 4020
GAGAGTGTCA GGGTGTCCTG TTGACAGGGT AGGTGTCTAT CCTAAACCTG TCAGCTTAGG 4080
CTTGCTTCTC ATAGATACTC TCTCAAGCCT ACTGCTTCAC CTCTCATAGA TAGTGTAGGA 4140
CCCCCTCCCC TGGAGTCAGT GTGGGGATGG AAAGGCTTCC AAAAGGAAAC AAATGCAGAA 4200
TTGACTAAGG TAAGCAGGAC AAAGGGGTGT TATTCTAGAA GAGCCACTGT CTGATAGAGA 4260
TTCACAGTGG ATCTACTGAT GTTACCAATC AGTTTTGAGT AATAACAGGA ACTAGACACT 4320
GGAAAATTTT TACTGTCAGT CCTTTGCCAA GACTGGGACA AGGATTGAGA CTTTATGAGG 4380
AATTGTAAAT AAGCTGGACT TTGTGGAAAT TGACCTGTCA GCTGCTTGCA GGATGTACTA 4440
GAGACTGGGT ACCCCAGAGG GAAGTAGGTG ACCTCAGTTA GAACTCTTCA TATTTCGGTA 4500
GCCACAGAGT TCATAACGTA TCTATTGCGT GCTGTGAACT GTGGAGAATT 4550