EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-07656 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr3:9033160-9035590 
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr3:9034848-9034863GAAGGTCAAAGGTCA+6.4
NR2C2MA0504.1chr3:9034848-9034863GAAGGTCAAAGGTCA+7.28
Nr2f6MA0677.1chr3:9034849-9034863AAGGTCAAAGGTCA+8.12
RREB1MA0073.1chr3:9034894-9034914CGGGGGGGGGGGGGGGGGGG-6.07
RREB1MA0073.1chr3:9033245-9033265ACACACACCACACACACACA+6.16
RREB1MA0073.1chr3:9034895-9034915GGGGGGGGGGGGGGGGGGGG-6.38
RREB1MA0073.1chr3:9034896-9034916GGGGGGGGGGGGGGGGGGGG-6.38
RREB1MA0073.1chr3:9034897-9034917GGGGGGGGGGGGGGGGGGGG-6.38
RXRBMA0855.1chr3:9034849-9034863AAGGTCAAAGGTCA+7.82
RXRGMA0856.1chr3:9034849-9034863AAGGTCAAAGGTCA+7.82
RxraMA0512.2chr3:9034849-9034863AAGGTCAAAGGTCA+7.82
Sox3MA0514.1chr3:9035419-9035429CCTTTGTTTT+6.02
YY1MA0095.2chr3:9033731-9033743CAAGATGGCAGC+6.32
ZNF263MA0528.1chr3:9035171-9035192GGGGGAGAAGGGGAGGTGGGG+6
ZNF740MA0753.2chr3:9034895-9034908GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr3:9034896-9034909GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr3:9034897-9034910GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr3:9034898-9034911GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr3:9034899-9034912GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr3:9034900-9034913GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr3:9034901-9034914GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr3:9034902-9034915GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr3:9034903-9034916GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr3:9034904-9034917GGGGGGGGGGGGG-6.03
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02236chr3:9020060-9034372Macrophage
Enhancer Sequence
TTGCTGGCTT TGTGGTACAC ATCTGTGGTC TCAGGATTGG CAGGCTGAGT TTGAGTCAGC 60
CTGGGATATA GAGTGAGATA CTCCCACACA CACCACACAC ACACACACAC ACACACACAC 120
ACTCCACATA CCATACACAC ATACTCCTAC ACACACACAC ACCATACACA CACACACACA 180
CACACCACAT ACATACACAC ATACTCCTAC ACACACATAC ACCATACACA CATACCCCTA 240
CACACACACA CACACCACAT ACATACACAC ATACTCCTAC ACACACACAC ACCATACACA 300
CATACCCCTA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACTCAGACT GATCAGGAGA 360
CATTTCAATT AAAAGTCAAT TTGAAGGACC AAGCTGTACC TCAGTTGTAG AGTACTTGCC 420
TGGCATGCAT AAGACACTGG CTTCAATTCA GAGTACCACA CACACAAAAG TAAATAACTC 480
GGAGAACTAC TTTGTGACGG TGATCTAATA ACACATGCAA GGAGTTTCTC ATTGTATTTG 540
TCTGATTGAT GCTCCAAACA TGTCTGTTGT TCAAGATGGC AGCTCCCTAA AAGCCTGCCT 600
GCAGGCACAG TGAGTGGGGG TTCTTTCAGG ACGGCCGGCC CGTCATTCTT TAGTCTGCTG 660
GGAGGACTAG GTCAACACTT CAATTTAAAA GCTCTCTCTC CTGACCACAT GGCAACAGGC 720
AGAGCAGCAA GCAAGGTTTT ACGTTCTCTC CTGCAGGGTT TCAATTGTTG AAGTTCTGTT 780
GTTTATCATT TACGTCCGTT TTTAAAAAAT GCGTGAAATA GTTAGCAAAT ATTTCACTTC 840
AGCTGTGAAG CAAGGCAGAG GAATGACATC ACTCTGCCCG TCATTCACTG TCCCACTGGT 900
GTAGAAAGTG CTTTACAAGC TGGTAAGTGC GCTTTCCGGT TGCTGGTGCA GAGTCAGATG 960
AAGATAAATC TTCTCGAGGG AAGTTAGGGA AAGGCAGTGG GCCATTAGCT GATATTTCTG 1020
GAACACTATT CTCGTCTTCT CTAGAGGACT GAAAATGGGC ACGGCAGTGC CGGCAGGATG 1080
CATGGGTGAT TATCCAACAT AAAACCTCCG TGGTATCCCT TCTCTGTCTA TTGAGTCACA 1140
AGAAAACTAA ACAAAAGGCA TACCAGATTA TACACACCTT AATTGTGTTA CGAATACAAC 1200
TTGCGGCATG ATGATGTCTA CAAACAGGAA ATCACACTAC AGTTAAAAGC AAGAGTGCAA 1260
TTATTTTTCA AGCCATAAGC AGGGGCGGCT AAGCCGGGGA GCCACAGAGA GTATGGCAAG 1320
CTCCAAATCC AAGCAGACAA GACAATAATG GCTTCATTAT ATAAGCTGCA CGACAGATGG 1380
ATCTCTTTCT AAACACGTGG CCTTCTCCCA CCCCACCCCA AGGCGATTAT CCAATGTCAC 1440
GCCCTTCTAA AGTGGTACTA AACAGAGACA ACACTGACAG CCAGCAACAG CACTCTGACG 1500
TGCAGTGAGC TTTAGGGCTG ATTTCTCTCC CTCAGCAGGA GTTTCAGCTT CCGGTTTCTG 1560
TGGTATCTTC ACAGTTTCAG AGCACTGGGC CAAAGGGCAC TTTGCAGTCA GTGTCTGCAT 1620
ATACCTTTCA GACTTGCCAT CTGATCCTTC CAGAACAAAG TGTGGTGCTG AGCTTTGAGG 1680
TGTTCTATGA AGGTCAAAGG TCAACCAGCT AGCTCAGCAC CAGACTGTGG AAGTCGGGGG 1740
GGGGGGGGGG GGGGGGGCAA GCAGGGCTCT TGCTTTAAGA AGTTTCTTAC CTACTTCTGT 1800
TTCTCCTCCC TTCTTCTTCC ACTCTGTCAG TCCTCTTCAT ATGCTTTGTC TGTCGACAAC 1860
TGCATACAAG CATGCAATGT GTCGACAACT GCATACAAGC ATGCAGTGTG TCAACAATTG 1920
CACACATGCA TACATGGTAT TTTGATGATA CGTGGCCCAC TCTGCACTCA CTTTCTCTGA 1980
GCCTCTTCAT CTCCCAGATA GTTCTTGTTG TGGGGGAGAA GGGGAGGTGG GGTTTAGTTA 2040
AGTTTGTTTA TATATAAGTA TGGGTTGTTA TTTTTTAATT TATTCATTTT ATGTGCATTG 2100
GCATTTTGCT TGCATATCTG CCCGAGGATG TCAGATCCCT TGCAACTGGA CTTACAGGCA 2160
GTTGTGAGCC ACCATTTGGT TCCGGGAATT AAACCCAGGT CCTCAGGAAG AGCAATCAGT 2220
GTTCTCAAGC CCTCTCTCCG GCACCCCTCC CCCACATACC CTTTGTTTTT GTAACTGGAG 2280
CATGGGCTCC CTCATTTTAG CTGATTCTCA GCAACTCTAG GAGCCAGAAA CCAGCAGGAG 2340
AGATGTAGTG TGAAATATCA GTCCTAGATG GTTTAAACCT ATCTCATTTT TGAGACTGGA 2400
CCTTCCCTTG CTAGTACACT GTGGCGGGTG 2430