EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-07364 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr2:152629780-152633230 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr2:152629812-152629829GAGTTTGTTTACTCATA-6.03
JUN(var.2)MA0489.1chr2:152631886-152631900AGGAAATGACTCAC+6.62
Lhx3MA0135.1chr2:152630046-152630059AATAAATTAATTT-6
NR2F1MA0017.2chr2:152631944-152631957CTTGTGACCTTTG-6.29
Nr5a2MA0505.1chr2:152629939-152629954CAGTTCAAGGCCAGT+6.59
Nr5a2MA0505.1chr2:152632306-152632321GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
ZNF263MA0528.1chr2:152630438-152630459GGAGGAGAAGGAAGTGGGTGG+6.38
ZNF263MA0528.1chr2:152631010-152631031CCCTCTCTCTCCTCCTTCCTC-6.42
ZNF263MA0528.1chr2:152631011-152631032CCTCTCTCTCCTCCTTCCTCC-7.15
ZNF263MA0528.1chr2:152630435-152630456GGGGGAGGAGAAGGAAGTGGG+7.21
ZNF263MA0528.1chr2:152631007-152631028ACCCCCTCTCTCTCCTCCTTC-7.54
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01412chr2:152592131-152657762Th_Cells
mSE_03748chr2:152630067-152631721Cerebellum
mSE_06033chr2:152629823-152632433E14.5_Liver
mSE_06613chr2:152630369-152632744Heart
mSE_07422chr2:152630152-152632884Intestine
mSE_07962chr2:152629839-152633394Kidney
mSE_08596chr2:152629827-152633407Liver
mSE_08943chr2:152629844-152632802Lung
mSE_09429chr2:152629864-152633418MEF
mSE_10155chr2:152629801-152633352Embryonic_stem_cells
mSE_11201chr2:152629771-152633100Placenta
mSE_12832chr2:152629847-152631463Thymus
Enhancer Sequence
GTCCATATTC TGATTTTTAA AAGCTGGGTA AAGAGTTTGT TTACTCATAT CTTCTATTCT 60
TGAAACTATA CATATGCATT AGTTATTTTA TGTTGCCAGG CAAGTGGCAC ATATCATACA 120
AATACAGCAC TTGGAAGCTT GAAGCAGGAA GACTGTCTCC AGTTCAAGGC CAGTCTGAGC 180
CATATAGTAA ATTCCATGCC AAACTAGGCT ACCAATGAGA CCCTGTCTAA AAAGACTAAA 240
ACCAAGCAAT TCTCTGTTGT ATTTGCAATA AATTAATTTT ACAAAACAAT TCAGAGTGTA 300
CAGGGCCACT ACAGCAAACA CTGCAAGGAA GAACTGAGAC CATGAACAAC TACATGTGTG 360
GTACCTGAAG GGTTAAGCTA GTTTCTCCGC CAAAAGGACA GGAGGGCGGC AGCTGGGCCA 420
CAGTGGGAGT TCCTGGCTCC AGCTGGCTTG GCAGGGATCA AGCTCCACGC CCAGGAACAG 480
GCACCTGGGG GAGGGGTCTG GACAGGTGGT ACCTACAGTC CCTGGTGACC TGATCTATGT 540
GAAAGGCTGG ATCCAATCAG ATGTGGGCCT CCTGTTAGAG CTCTTCCAGC TGCTAAGTCT 600
TCCGGGTGGC AGCCTGAAGA TGGTGAGAAG GGGAAGAGAG TCTAGGTGGC AGGGTGGGGG 660
AGGAGAAGGA AGTGGGTGGG CTGGGCTCAG ATACCAGGGG AGGCTACTGG GATTATCACC 720
TGCTGAGAGT GAGATTAGGT TTCTTGGGAA GGGCTCTTCT ATCTAATGCT CCCTTGAAAG 780
CTGTCTCCCA GTGGCTTTTC TCTGCTGGAC AGATGGTGTC TGAGCTGTCT CCTGGAGGGT 840
GGGCTTCTTG AGGGAACGGT GGAAATGGAG TGGAGCCTGC TCCCTGCTCC TCAGAAGCCT 900
GCTTAGCCTT GGGATTCCCT CCTTCCAACA ACTGCAGCCT GTGTTACTCT TAGTCAGAGC 960
TTATTCAGAG TAGGCAGGGC CTGTAGTCTG TCATACAGGT TACTCCCATC TAGCTTTTAC 1020
AGCACCCAAC TGCTTAACAC TTACACACGA GTCTTACAAT TGAGGAAACT GAAGCTTGGT 1080
AAAGTTAAAC ACTTGTCCAG AGTCAAAGAG CAAGTAACTA ACACTTGAAT ACAAAAGGCC 1140
ACAGCCCCAG CAGAAAACAA TTATTTGCTA TAGTGTACTC TCCTTATGAG AGCAAGTACC 1200
TCCTCACTGT TCAGTCCAGA TGGCCGGACC CCCTCTCTCT CCTCCTTCCT CCCACCAAGC 1260
AGCAGCAAAA CCAGTGTATC AAGCTATGAC CACTGCTCCC CACGGCTGCC AGAAATCTGC 1320
ATGGTATAAG CAGCTCCCAC CATCTCGTTC CTGCTCATGC CTGAGGGCTT CATCCTCCAG 1380
AGCAGTGGTT CTCACCCTTC CTAACGAGCG ACCCTTTAAT GCAGTTCCTC ATGGTGTGGT 1440
GAGCCCCAAA CAAAATTATT TTCATTGCTA CTTCATAACT GTAATTTTGT TGCCATGAAC 1500
CATAGTGTAA ATATCTGATA TGCATACACT GTGAGAGGGC TGCTCGACCC CCACAGGGGT 1560
GGCAACTCAC AGGCTGAGAT CCCTGCTCCA GAGTGAGCAG AGCTTCTCTT GAAGCTTAAG 1620
TTGGATCTGA TCATCTTTTG GCTCAAAACC CCTCGATGCC TGTCAGAATA AAAACAGTGT 1680
TCTATGTGGC CTGCAGGAAG ACCTGGCTTC AGGTTACGTC AGGCTCAATT TCTACACACT 1740
CTTTGCCTCT CTCATATGAA CATGTCTGAA GTCTTTTTTG GACTTGCTGT TCTCTCTATT 1800
TCAATATTCT TTCCCCTAAT ACTTGCATGG ATCACACTAC TATACTCAGG CCCGAGGAAG 1860
CCCTTATCAA AGGCCTTCCT GACGAGTCTA GCTAGCAACA GAAAGTGTTC TTCTCTTGTA 1920
TTTTTCCTGT GGTCCTAAAT ACTACCTGCT ATGTTAGGTA CTTAGCCTCT CTCTCTCTTA 1980
CTAGAATGTC AGCTGAATGA CAAGACAGTG CTCACACTGT TTGCTCAAGC TCTAGCTCAA 2040
TGCCTGACAT ACAGCAGGAA CTCTGTATTT GTTAATGAAC AAATGAATGA ATGACCAACA 2100
TCCCTCAGGA AATGACTCAC TTTAGAGAGG AAGGCTGCCC AAATACCCTT GGCTTTTTCT 2160
TAGTCTTGTG ACCTTTGGTA GCCCCAGAGC AATGGTCAAT GTCCTTCCCT GTTACAAAAT 2220
GTCCTGGGTA CATACCATCA GCACATGTCA TCCTCTTATG CTTCCGGGCA TGTGTACACA 2280
CACGGGGATG GACATGAGAG CTGGAACACA AGACTGGTTC TAGGAGAGGG AGTGAGCATG 2340
GGCACTGAGA GATCAGGGAC AGTGAACTCT AGGGCACTTA TCTTGTTAGC TGCCCTGCCA 2400
AGGCCCCTAT ACCCCATACA CTCCAGCTTT CATCTTCATG AATAAAAAAA AAAAAATCAC 2460
TGGATAGTTG AGGGGGCTGA TACACACTTG TAATCACAGC ATTCAGGAGG CTGAGGCAGG 2520
ATGACTGAGT TCAAGGCCAG CCTGGGGTGT ATATCAAGGG TGTGTGTGGG GGAGGTGTAG 2580
AGAGAAAGTT AGTGGAAGAT TTTGAGTCAA GGAATCACAG TTTTTGACCT GTAATTTTAA 2640
AAGGCTCATG TCTGCTGTGT GAAGGGAGCC AGGGCAAAGC AGGGAGACCA TGGAGGAAGT 2700
TCCCTTGACT TGGTGAAAGA GAGAATGAGC AATAGCTGTT TAATTCCTAG CCTGGGCCTG 2760
GCTATTTCCA TTGCAGAAAA TGCATCCTGG GCTTCTATTC ATCTGTCCTC ACGTGTCTAT 2820
TCTACCAGCA CCTGGTGAGG TGAGGTCAGC AGAATCCACA CTTTACAGAG AAGAAACCTG 2880
AGGCTCTGAG ACACAAAGTC ACCTATTAAA GGTTATACAG AAAATCATCA AGAAATCTGA 2940
CAACAAATGC TGGCAAGGGT GTGGTGAGAA AGGAGCCCTT ACTGACTGTT GCTAAGGATG 3000
CATGCTAATA CAGCCATTAT GGAAATCATA GGAGGGTTCT CAACAACTTT AAAATAGAGG 3060
TACAGTATGA CCCAGCTATA GTACTGCTAG GCATCTGCCC AAAGAACTTC ATATCCTACC 3120
ACTGAAGTCC TTGTATATCC ACAGTCACTA CTGCTCTACT AACAAGGAAA TGGGGCTAGC 3180
CTATATGTCC ATCAACTAAA GAATGGATAA TGGAAGTGTG GTGTGTATAT GTGTACACAC 3240
AAATACATTA TGTGTGTGTA TGTGTGCAAG CGCGCGCGCA CACACACACA AATCAGGTCC 3300
TAAAGAAACC CAGGACAAGG CTCACTTAGG CCCTGAGGCT CCTTCCAGCA CTTCTTACCC 3360
TGTCCCCCAC CCTAAACCTC TCCAGCCTTC TCTTCACATC TCTTCCCCTA GCTTCTCATT 3420
CCATTTATAA CCATGCCATT TTGGCCACGT 3450