EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-07095 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr2:104411580-104414020 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr2:104411925-104411942CTCATTAATTAATTAAT+6.3
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:104413870-104413888TGAAGGGAGGAGGGAAAG+6.03
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:104413874-104413892GGGAGGAGGGAAAGAGGG+6.03
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:104413893-104413911GGGAGAAGGGAAGGAGGG+6.33
Foxj3MA0851.1chr2:104413975-104413992AAAAAGTAAACATAGAC+6
HNF1AMA0046.2chr2:104411935-104411950AATTAATAATTAAAA+6.51
Lhx3MA0135.1chr2:104411930-104411943TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr2:104411927-104411940CATTAATTAATTA-6.46
Nr5a2MA0505.1chr2:104411848-104411863GAGTCCAAGGCCAGC+7.02
POU6F1MA0628.1chr2:104411928-104411938ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:104411932-104411942ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:104411928-104411938ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr2:104411932-104411942ATTAATTAAT-6.02
ZNF263MA0528.1chr2:104413891-104413912GAGGGAGAAGGGAAGGAGGGA+6.05
ZNF263MA0528.1chr2:104413872-104413893AAGGGAGGAGGGAAAGAGGGA+6.52
ZNF263MA0528.1chr2:104413887-104413908GAGGGAGGGAGAAGGGAAGGA+7.3
ZNF263MA0528.1chr2:104413875-104413896GGAGGAGGGAAAGAGGGAGGG+8.73
Enhancer Sequence
GCTAGGCAGT GGTGGTTCAA GCCTTTAATT ATAGCCCTTG AAGACAGAGG CAGGGGGATC 60
TCTATGGGTT TGAGGCCAGC CTGGACTGCA GAGTGAGATC CAGGCCAACC AAGGCAATGT 120
AGAGAAACTC TGTCTTGAAA CAAAACAAAA CAAAACAAAA CAGTACAATA CAATACAATA 180
CAATACAAAG TTACAATCAC TGCTGGGCAT GGTGACACAA GCCTTTAATC CCAGCACTTG 240
GGAGGCAAAG GCAGGAGTGT GTCTCTCTGA GTCCAAGGCC AGCTTGGTTT GAATTTCAAG 300
TTCCAGAACT ACCAGGACTA CAGAGTGAGA CCTTGTCTCA AAAAGCTCAT TAATTAATTA 360
ATAATTAAAA AGTCTTGAGA AAAAGGAAGA AGATGGTAAA CTTTGTTAGC TTCTCAAATA 420
TCAGATCTTG TTACTTTCAA TAGAAAAAGG CTAGGACCTT ACCCTTCAAT ATTTCTTATG 480
TACTTTATAG TATTGTGTTT ATTTCTCTCC AAAACTCTAC ATACAAGTTC TAGGAAAACG 540
AGAATACGGG GACACCATAT TCTACTTCAT ATCCAAAATT TTGGAAAACT GATCTCTTCT 600
TCTCTTTTTT AGAGACACAC ATGGAAGGGT CATCCAGTGT GTGACATGAG AAGCAGCTAC 660
TCTGCAGCTG TACCTTAACC TGTCCTATGT CTCACACGTC CAAAGGCGTG AGAGGCAGAA 720
TGCTAGAATA ATTGTTTCTG ACGGAAAGAA AGCCATCCTG CGTGTAGCTG ATCAGTGAAA 780
ACAACACACT GAGCCTCTGG GTAGTGGTTA ATTACATGTA AGAAGATTTG CCTAATAAAT 840
CCTCTGATCG GGCTTCTCCT GATGCCCCCC TCATCCAAAT ACGCTGTTAG GTCACTGGAA 900
GGCACAGCCA GGGTTATTAA GTAGTTCTTG TTTTCTAAGA TGAAGTGAAA AATATTAATG 960
TGCTGCCAAA TTACTTAAGT AGAAGCCCCT TTTCAAAAAA AAAAAAAAAA ATGCTTTTCT 1020
TTGAAAGGAT TCACACTGCA TTACCAAAAG CCCTTCTAAC TAATCAAAAG CCAAAACTTA 1080
AAAATGTGGT AATTTTCTTA CAAAATAAAC TTAAGCAGTC GCCCTTTTTT AGATGCTTAG 1140
CAAATTGTGA TTTACGTATT AGAAATAGAT TTTGCTCAAG AAAAAAAAAA ATAAGTGCAT 1200
CGAATTTAAA ATATAGACAT TCCTTAAAGG TCTCTTTTTC TCTTGGATAA ATTTAAAAGA 1260
TTCCAGAATG TGGCAGGTGG GTGGCGCGTG TCGCCTTCCA GCCGAAGCAA AGCAAACTTA 1320
GGAACAGATT TTAAAAAATA GATTAAGTGT TTTCTAAGCC ACGGCTTGCC TACACTAGCC 1380
AGCTGAAAGC TTTAAATAAT TTAATCCCTA CGACAACTGC CAGCTCCAAC TGGAAGCCTT 1440
AAACAAGGAC TGGGCTCACG CTGGGTGCTG ACAGGTGCGG TCTGGAAGAT CCGTCAGTCA 1500
GGCAGCCGCT GCTGATCTGC GCTGTACATT CATTCGGAGG ACTCCGCACT CGAACGCGAC 1560
GGGGCATTGT CGCAATCCAT CAGTCTACCT TCTGCTTCTA AACTCTCGTG TTACGTGAGA 1620
CATTCTTCTG TTTTGTTTTG TTCTTTTCTG GAAGGACTTC AGCAAAAACG AGAGCATCTG 1680
GGATTATCTT CAGAATCCTG TCACAACTTC AGTTTTGGAG TTTATGTTTT TATTTAATAA 1740
CTTATTTGTT GCTATCTTTA CTGGAGGGGT GCTGAGTGTG CCACATGCTT ATGTGGAGGT 1800
TAGAGGACAG CCTTCTAGGG ACTGAACTTG GGGAGTCAGG CTTGCGAAGC ACCTTTACCC 1860
ATTCAGCCGT CTTGCTGGCT CTAGTGAATT ACTTTATTCC TATTATTATT GCTATTTTTT 1920
TATCCAACTG ACTTTTACAT ATTAATGCTT ACTGACAACC TTGAAAGCTA CTCAGAAAAA 1980
GTCCTTTTTT GTTTTTTCCA CATTTATCGG ATGTGTAAGA ATATACATGT CACAGATTTC 2040
TCCAATTATA TTTCCAGGGA AAATTGACAA ATACTTAGCT TTTATATTAT CAAGCAAGAT 2100
AACATTCTCT ATAAAGTTAA ATCAGAAAAT CAAACAGGAA ATGACTATAG CCAGGCATGG 2160
CGGTGCAAAC ATTTAATCCC GGCTCTCAGA AGGCAGAGGC AGGCAGATCT TTGTATGTTT 2220
GAGGCCAGCC TACACAGTGA GTTGCAGGAC AGTCAAAGCT TCACAGAGAG ACCCTGTCTC 2280
AAAAGGGAAG TGAAGGGAGG AGGGAAAGAG GGAGGGAGAA GGGAAGGAGG GATGGCACTC 2340
TTCAGGACTT TGAACTTGGT AAAACTGGGG TATGATACCA AAATCATGAG TAAAAAAAAA 2400
GTAAACATAG ACAAATGGAA TTGTATCAAA TTTTATATAT 2440